302医院生物样本资源库与临床研究

1、汇 报 提 纲一、生物样本库科学发展趋势二、国内外代表性生物样本库三、302医院生物样本库建设四、302医院临床与转化研究生物样本库定义据经济合作与发展组织（OECD）的定义，生物样本库（Biobank）是一种集中保存各种人类生物材料（Human biological material），用于疾病的临床治疗和生命科学研究的生物应用系统。标准化收集、处理、储存和应用 健康和疾病生物体的生物大分子、细胞、组织和器官等样本，包括人体器官组织、全血、血浆、血清、体液或经处理过的生物样本，如DNA、RNA、蛋白等； 与这些生物样本相关的临床、病理、治疗、随访、知情同意等资料及其质量控制、信息管理与应用系

2、统。生物样本库主要形式单个研究人员或单个科室因其研究需要将其搜集的生物样本单独保存而建立的生物样本库1234医院或研究机构建立的生物样本库，进行内部生物样本资源统一保存和分配使用多个医院或研究机构联合组成的生物样本库，实现各单位生物样本集中保存和共享使用第三方机构从社群中搜集大型的队列生物样本库，集中保存Biobank相关的杂志和论文逐年递增杂志数量论文数量研究题目中含“生物样本相关类型和关键词”逐年递增7个代表性关键词9种生物样本类型生物样本学科近年来获得飞速发展，作为一种特殊的资源，得到了各国政府、各级卫生组织的高度重视。国际生物和环境样本库协会（ISBER） 通过建立规范和标准，利用培训

3、等方式影响发展中国家的样本库建设，使其达到一定的质量和标准 下辖6个不同类型的生物样本库，分别是动物样本库、环境样本库、人体样本库、微生物样本库、博物馆样本库、植物/种子样本库 设置了若干个专门性的工作组，逐步推进ISBER在生物样本库建设过程中各个领域内的专业性和权威性美国国家癌症中心生物样本库和生物样本研究办公室(OBBR) 确立生物样本库研究新领域，确定高效保存生物样品使其适用于基因组和蛋白质组研究的各种搜集和处理协议； 推广普及最佳操作规范，以协调各机构政策和程序。 促进发展生物样本的质量标准，建立专业第三方标准监督机构 ； 发展生物样本库业务的新技术；与国际社会协调，以协调政策和程序

4、，促进多国研究。国内标准化标本库5年前建立，标准化建设、通过了国际、国内认证首席单位特色宁光上海交大瑞金医院内分泌陈香美王秋菊301医院301医院肾病聋病李宁贾伟平杜详北京佑安医院上海交大第六人民医院复旦大学肿瘤医院北大人民医院慢性肝炎和HIV代谢性疾病肿瘤刘玉兰肠病王伟业周伟平聂勇战上海交大新华医院东方肝胆病医院四军大肿瘤肝癌消化道疾病.问题和挑战如何建立一个高效、有序的管理系统？如何建立合理的科学技术标准及质量监控体系？国际合作设计到的标准兼容问题？合理的医学伦理和法律框架的规定？资金投入、使用、维持？汇 报 提 纲一、生物样本库科学发展趋势二、国内外代表性生物样本库三、302医院生物样本

5、库建设四、302医院临床与转化研究总体定位 基于医院传染病特色，重点建立“前瞻性队列牵引的生物样本库”。 建成标准化、规范化、网络化的传染病大样本生物样品库以及生物信息提取、生产、储存和应用平台。 搭建转化医学研究的基地，促进我院转化医学研究的深入开展，整体提升我院的竞争实力。管理与组织结构解放军第302医院医院管理生物样本库专家委员会医学伦理委员会临床队列设计PI-1PI-2PI-3生物样品库样品保存质控采集运输加工保存信息录入质控医院标准化生物样本库建设三部曲建设转化规划 专职人员 信息整合 出入库管理 合作、转化 门户网站 标准认证 备案 人员培训 组织管理框架 顶层设计 规章制度（SO

6、P） 保存方法、程序 试剂、耗材 质量控制 硬件（环境/设施） 网络、信息 伦理、法律建设样本库的基本原则样本生物样本信息设备运行安 全准 确工作人员样本信息生物样本库样本存放取出位置建立的基本原则工作流程软件系统操作信息交流快 捷耗材供应及技术支持1. 硬件建设 样本库面积800平米，可容纳超低温冰箱120台，液氮存储系统40台 基本设备：-80冰箱43台；气相液氮系统3套 监控设备：低温冷链监测系统、环境监测系统、视频监测系统、液氮容器液位监控、远程报警等。2. 生物样品库规范管理 SOP文件： 编写制定样本库的样本采集管理、储存、使用及储存设备管理和人员管理等SOP文件并汇编成册（6册）

7、。 管理规定：初步制定302医院的样本管理规定：样本库的质量管理规定、信息管理规定和出入库管理规定等有关样本库运行的方案。3. 软件建设：三位一体生物样本库管理系统患者病历信息患者随访信息生物样本信息生物样本库管理系统的主要特点和功能采用病案、随访、样本三层树形数据存储结构可实现不同科室、不同课题数据同时显示对EMR电子病历文本进行结构化处理安全完整保存生物样本及相关信息快捷准确查询和导出数据按科研需要进行数据统计分析和挖掘患者随访信息系统的功能随访计划的制定随访内容的制定到期随访的提醒患者随访信息系统随访信息的采集录入随访信息的查询统计分析4. 立足于我院的行业优势，建立特色库1. 军队医院

8、规范化管理：利于建设高质量随访队列；2. 网络化的对口支援传染病医院：利于建立全国多中心、更全面、更具有代表性的队列和样品库3. 较为雄厚的肝病/AIDS病转化医学研究：有利于后期的成果转化4. 特色诊疗技术：生物治疗、中医诊疗、儿童肝病、其它新发/突发传染病等逐渐形成覆盖HBV感染全病程的特色临床队列和标本库妇产科新生儿科青少年科门诊、各科各科室肝纤科肝衰竭外科肝移植HBV感染耐受肝炎 肝硬化/衰竭 HCC死亡母婴传播、病毒库建立免疫耐受发生免疫耐受形成、维持、打破慢性乙肝抗病毒疗效、sAg清除肝纤维化转归、终末期肝病预警外科术后预警、转归5. 前瞻性队列牵引的样本库提出临床问题建立临床队列

9、 建成样本库 成立“临床队列及其样本库研究计划”项目组 专家咨询委员会和伦理委员会审查 子队列建立及权益分享 样本出入库管理、信息管理、质量管理已构架出“以队列为牵引”特色生物样本库运行1年，已建立研究队列12项，共纳入肝病/艾滋病患者4500余例，血清、血浆、PBMC、组织等；各类样本共4.6万份牵头人队 列王福生赵 平艾滋病患者长期随访队列及生物样本库建设慢性乙肝抗病毒队列及生物样本库建设HBV慢性感染免疫耐受长期随访队列及生物样本库酒精性肝病队列及生物样本库建设邹正升自身免疫性肝病队列及生物样本库建设药物性肝病队列及生物样本库建设张 政张 敏慢性乙型肝炎患者急性发作的临床观察和免疫学发病

10、机制研究青少年疑难肝病长期随访队列及生物样本库建设慢性乙肝病毒感染青少年患者抗病毒治疗队列及生物样本库肝炎干眼症患者队列及生物样本库建设何宏宇刘振文陆荫英肝移植患者队列及组织生物样本库建设肝脏肿瘤不同治疗方式长期随访队列及生物样本库建设6、多种类样本标准化处理、保存病原学基因组学免疫组学免疫组学蛋白质组学基因组学病理学其他传染病特色样本库前期血清库 目前保有20多万份的传染病血清标本细胞库 保存常用细胞株 51 种，10多种肝细胞病毒库 目前保存225株常见病毒株，110种抗病毒血清HBV基因数据库 收录了2.7万例乙肝患者HBV序列/克隆、4800多例耐药患者随访样本和诊疗信息网址：www.

11、HBV汇 报 提 纲一、生物样本库科学发展趋势二、国内外代表性生物样本库三、302医院生物样本库建设四、302医院临床与转化研究生物样本库是转化医学研究的关键源头临床向科研科研向临床临床信息生物学信息生物样本库1.风险因素评估分析；1. 临床病例转化为科研队列2. 临床数据转化为科研数据2.预警预后指标、模型3.疾病进展机制、治疗靶标；4.新治疗方法目标人群确定研 究 思 路产品转化推广应用前瞻性队列验证建立预警模型预警靶标临床问题 预测？ 治疗？机制研究基于临床队列的生物样本库治疗靶标锁定目标人群动物模型（人源化小鼠）临床试验实例 1中国慢性乙肝患者肝纤维化无创诊断模型的建立（Chronic

12、 Hepatitis B Score, CHBScore）入组大样本人群所有患者：1. 40种临床指标完整；2. 具有肝穿组织；3. 病理诊断明确；4. METAVIR system；UnpublishedCHBScore诊断特异性和敏感性高Unpublished基于CHBScore的慢性乙肝肝纤维化诊断流程CHB patientLSM-FS, P LT, Age, HAStep 1: S1Step 2: S2Step 3: S3 cut-off-1F2-F4 cut-off-1F0/F1F2 cut-off-2 cut-off-2F3-F4 cut-off-3 cut-off-3F3F4Un

13、published实例 2我国首个多功能共享HBV基因数据库建立了我国首个多功能共享HBV基因数据库HBV前C变异是ACLF患者死亡的独立风险因素发现HBV基因型和BCP/前C区多个位点特征性变异发现BCP/前C区多个位点变异率随病情加重递增HBV基因数据库共享成果北京基因组研究所曾长清课题组：中科院微生物所高福、孟颂东课题组：揭示了我国患者HBV多种变异和基因鉴定了新的HBV CTL表位型与疾病进展的相关性实例 3传染病组织样本库的建立及其应用建立了微量人体组织保存技术福尔马林固定病理学分布Sci Rep, 2016淋巴细胞提取技术免疫学特性研究Sci Rep, 2016基因组保存-人组织mRNA表达谱分析/信号通路分析448 genes up-regulated; 631 genes down-regulatedHC: healthy control; CHB: chronic hepatitis B.Hepatology, 2011, 2014免疫细胞组织分布差异分析-区域免疫特性Gated on CD45+Lin- cellsBMLPSILISpleenPBMC11 611 411 5NDNDCD117BM, bone marrow; LP, liver perfusion; SI, small intes