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文档简介
一、项目来源
根据《广西标准化协会关于下达2023年第四十一批团体标准制
修订项目计划的通知》(桂标协〔2023〕140号)文件精神,由南宁
壮博生物科技有限公司、广西扬翔股份有限公司、金陵农牧集团有限
公司、巨星农牧有限公司、深圳市京基智农时代股份有限公司、济凡
生物科技(常州)有限公司、广西农业职业技术大学等单位共同起草
的团体标准《污水中猪蓝耳病病毒的快速筛查RT-PCR法》(项目编
号:2023-4102)获批立项。
二、项目背景及目的意义
农业部关于印发《国家高致病性猪蓝耳病防治指导意见(2017—
2020年)》的通知指出,各地要加大疫情监测力度,及时准确掌握病
原分布和疫情动态,科学评估发生风险,及时发布预警信息。要选择
一定数量的养殖场户、屠宰场和交易市场作为固定监测点,持续开展
监测。
2021年,农业农村部关于印发《非洲猪瘟等重大动物疫病分区防
控工作方案(试行)》的通知指出,强化技术支撑,及时通报和共享动
物疫病检测数据和资源信息,推动检测结果互认。完善专家咨询机制,
组建大区重大动物疫病防控专家智库,定期组织开展重大动物疫病风
险分析评估,研究提出分区防控政策措施建议。
猪蓝耳病是常见于家猪和野猪群体间的传染性疾病,因其可通过
直接接触在群体之间传染,因此这种疾病的出现对我国的养猪业带来
了极大的影响。猪蓝耳病又称猪流行性流产和呼吸综合征。此种疾病
传染不但会威胁猪的健康,还会影响母猪的繁殖,造成流行性流产情
况的发生。
广西开展猪蓝耳病病毒检测,主要进行检测的场所包括猪场种畜
场等,其中分布在南宁壮博生物科技有限公司、金陵农牧集团有限公
司种畜场、京基智农种畜场、巨星农牧种畜场等场所。
2022年7月3日,华南地区某生猪养殖场采集15个养殖单元的
污水样品;2022年12月1日,华南地区某生猪养殖场采集2个养殖
单元的污水样品;2022年12月6日,华南地区某生猪养殖场采集6
个养殖单元的污水样品;2022年12月15日,华南地区某生猪养殖
场采集2个养殖单元的污水样品;2023年1月12日,华南地区某
生猪养殖场采集1个养殖单元的污水样品;2023年2月9日,华南
地区某生猪养殖场采集3个养殖单元的污水样品,分布进行猪蓝耳病
病毒检测,均检测出阳性。经污水检出阳性后对养殖单元内进行个体
观察和采集唾液拭子到实验室进行核酸检测,部分猪存在发热、精神
沉郁、咳嗽、食欲不振现象,存在有蓝耳病的病症,实验室也在采集
的唾液拭子中检测出阳性。
在感染猪蓝耳病后,猪的生殖能力受到了很大限制。公猪在感染
猪蓝耳病后一般不会有明显的症状出现,有少数公猪会伴有发烧、食
欲减退、精液量减少的情况发生。相对于公猪感染的反应,母猪感染
后症状更明显,会突然放弃进食,并伴有嗜睡的情况出现,对于已经
怀孕的母猪来说,会出现严重的流产情形。母猪在怀孕初期因为胚胎
的保护作用,可对此种病毒有效的进行阻隔,但在母猪的怀孕后期,
由于自身抵抗力下降导致感染病毒的几率增强,引发母猪早产、流产
以及胎死腹中的情形发生。
由于母猪在妊娠过程中抵抗力的下降导致感染率增加,造成幼猪
的死广率明显增高,很多幼猪在没有出生前便胎死腹中,即使母猪顺
利的生产,也会造成幼猪身体素质差且伴有呼吸困难的症状,同时幼
猪的身体较弱容易引发其他疾病从而造成幼猪的死亡。育肥猪在感染
猪蓝耳病后生长速度缓慢,营养无法吸收导致体重增长迟缓,并会陆
续发生死亡的现象,给养猪者带来严重的经济损失。
与常规PCR检测方式相比,以10%抽样,5:1混检,试剂盒费用
80元为例,10000头猪进行一次抽检的费用是1.6万元。假如每周抽
检一次,即一年抽检52次,全年的检测费用为83万元,平均83元/
头。根据石家庄市动物疫病预防控制中心2022年8月的招标成交公
告显示,采用荧光定量PCR方法检测3500头猪,中标检测费用为
591150元,折合169元/头。2021年该项目中标单价为180元/头。
污水监测费用是常规抽检荧光定量PCR的10%,大大减少了成
本。污水检测发现阳性后,及时定位养殖单元,对养殖单元内进行个
体观察和检测,可实现早发现、早防控。建立全时段的防疫体系,实
现低费用、高效率的疫情预警及防控。
因此,通过制定团体标准《污水中猪蓝耳病病毒的快速筛查
RT-PCR法》,以标准为抓手,统一规范污水中猪蓝耳病病毒快速筛查
的检测技术,为猪蓝耳病的预防、监测提供重要依据。
三、项目编制过程
(一)成立标准编制工作组
团体标准《污水中猪蓝耳病病毒的快速筛查RT-PCR法》项目
任务下达后,南宁壮博生物科技有限公司牵头组织成立了标准编制工
作组,制定了标准编写方案,明确任务职责,确定工作技术路线,开
展标准研制工作,具体由南宁壮博生物科技有限公司、广西扬翔股份
有限公司、金陵农牧集团有限公司、巨星农牧有限公司、深圳市京基
智农时代股份有限公司、济凡生物科技(常州)有限公司、广西农业
职业技术大学相关人员配合。
(二)收集整理文献资料
标准编制工作组收集了国内有关污水中猪蓝耳病病毒快速筛查的
相关技术文献资料。主要有:
GB19489-2008实验室生物安全通用要求
GB/T35912-2018猪繁殖与呼吸综合征病毒荧光RT-PCR检测
方法
WST799-2022污水中新型冠状病毒富集浓缩和核酸检测方法
标准
DB45∕T2138-2020水体中诺如病毒的核酸检测方法实时荧光
RT-PCR法
专利《用于检测猪蓝耳病病毒的富集浓缩试剂盒》
(三)研讨确定标准主体内容
标准编制工作组在对收集的资料进行整理研究之后,标准编制工
作组召开了标准编制会议,对标准的整体框架结构进行了研究,并对
标准的关键性内容进行了初步探讨。经过研究,标准的主体内容确定
为原理、试剂和材料、仪器设备、样品采集及前处理、实时荧光RT-PCR
检测、结果评价、检出限。
(四)调研及形成草案、征求意见稿
2023年7月,在前期工作的基础之上,通过理清逻辑脉络,整合
已有的参考资料中有关污水中猪蓝耳病病毒的快速筛查RT-PCR法的
要求,并结合污水中猪蓝耳病病毒的快速筛查RT-PCR法实际要求的
基础上,按照简化、统一等原则编制完成团体标准《污水中猪蓝耳病
病毒的快速筛查RT-PCR法》(草案)。
2023年8月-10月,标准编制工作组对前期的研究和数据进了整
理并结合前期技术咨询会、征求意见会的内容针对污水中猪蓝耳病病
毒快速筛查进行多次讨论、研究,最终形成团体标准《污水中猪蓝耳
病病毒的快速筛查RT-PCR法》(征求意见稿)和编制说明。
四、标准制定原则
(一)实用性原则
本文件是在充分收集相关资料和文献,分析污水中猪蓝耳病病毒
的快速筛查当前现状,调研污水中猪蓝耳病病毒的快速筛查的分析方
法情况,在现有国家、行业标准相关污水中各种病毒测定方法要求的
基础上,结合多年经验而总结起草的。符合当前使用RT-PCR法测定
污水中猪蓝耳病病毒的方向与需求,有利于行业的长远发展,具有较
强的实用性和可操作性。
(二)协调性原则
本文件编写过程中注意了与污水中猪蓝耳病病毒的测定相关法律
法规的协调问题,在内容上与现行法律法规、标准协调一致。
(三)规范性原则
本文件严格参照GB/T1.1—2020《标准化工作导则第1部分:
标准化文件的结构和起草规则》的要求和规定编写本标准的内容,保
证标准的编写质量。
(四)前瞻性原则
本文件在兼顾当前区内采用污水中猪蓝耳病病毒的快速筛查现实
检验情况的同时,还考虑到了污水中猪蓝耳病病毒的测定方法快速发
展的趋势和需要,在标准中体现了个别特色性、前瞻性和先进性条款,
作为对污水中猪蓝耳病病毒快速筛查的指导。
五、标准主要章节内容及确定依据
团体标准《污水中猪蓝耳病病毒的快速筛查RT-PCR法》主要
内容包括原理、试剂和材料、仪器设备、样品采集及前处理、实时荧
光RT-PCR检测、结果评价、检出限。
(一)原理
参考DB45∕T2138-2020《水体中诺如病毒的核酸检测方法实时
荧光RT-PCR法》。向污水中加入富集浓缩试剂,富集浓缩试剂可使
病毒颗粒形成多聚体,通过离心作用将水溶液与病毒颗粒多聚体分开,
收集病毒颗粒多聚体形成的沉淀,采用核酸提取和实时荧光RT-PCR
检测。
(二)试剂和材料
除另有说明外,所用试剂均为分析纯,实验用水应符合GB/T6682
中一级水的要求。
用到的试剂和材料有:磷酸盐缓冲液(1mol/LPBS,pH值7.2)、
富集浓缩试剂、病毒核酸提取试剂盒、无核酸酶水:分子生物学级、
离心管(1.5mL、50mL)、无菌移液器吸头(10μL、200μL、1mL,
带滤芯,无核酸酶)、无菌聚乙烯瓶、透明薄壁PCR管(0.2mL)。
仪器设备:冰箱(0℃~20℃)、电子天平(精度0.01g)、高速
台式冷冻离心机(可控温至-4℃,离心速度≥13000g)、低速离心
机(离心速度12000r/min)、金属水浴锅、振荡混匀器、高压灭菌器、
实时荧光PCR扩增仪、二级生物安全柜。
(三)样品采集及前处理
水样采集、运送和保存:
根据采样场所排水系统分布情况,重点选取污水排水口、内部管
网汇集处等关键位置,对未经消杀处的污水进行采样。根据现场条件
和检测需求确定水样采集方式,如瞬时水样或混合水样。用无菌聚乙
烯瓶采集污水样本,采样体积为200mL~300mL。样本采集后,应
在现场使用75%酒精对采样瓶外表面进行消毒,并及时将样本送至实
验室,运输过程中水样温度保持在0℃~4℃。实验室接到水样后应
尽快进行检测,如未及时检测,应将水样置于-4℃冰箱保存待检。
对比其它行业标准中离心温度是4℃,本标准是-4℃,因为病
毒会在低温下生存,不会冻死,低温下停止活动并进入休眠状态。大
多数病毒耐低温,但不耐高温,在低于0℃的温度下可以存活很长时
间并保持其传染性,用-4℃离心能确保病毒的活性。
病毒富集浓缩:
病毒富集浓缩是本标准中较为关键的步骤,具体提操作如下:
——将污水样品混合均匀,取同一厂各3管40mL的污水分别置
于3个50ml离心管中,在-4℃、2500r/min的条件下离心30min。
剩余污水样本作为备份。
——将7.2.1中所得上清液分别转移至试剂盒提供的预混试剂离
心管中,充分混合,震荡摇匀30min。
——在-4℃、12000r/min的条件下离心120min,离心机降速
时不应使用制动力。将离心管从离心机上取出,倾倒并弃除离心管中
的上清液,至无上清液倒出。该过程需减少沉淀的溶解与损失,以提
高病毒浓缩富集效率。
——在-4℃、12000r/min的条件下离心5min,离心机降速时
不应使用制动力。将离心管从离心机上取下,用移液器从每个离心管
中吸出剩余的上清液。注意避免吸管尖端接触沉淀。
——将200uL磷酸盐缓冲液(5.1)加入至离心管中,反复吹吸
沉淀,最终形成混悬液(该水样的浓缩液),同一厂3管污水悬混液合
为1管浓缩液。
——将浓缩液转移至1.5mL离心管中,于0℃~4℃条件下保
存,并于24h内完成核酸提取和扩增。
(四)实时荧光RT-PCR检测
核酸提取:
在二级生物安全柜中打开装有污水样本浓缩液的离心管,按照病
毒核酸提取试剂盒说明,取适量浓缩液进行核酸提取,提取完成后应
立即封盖并进行实时荧光RT-PCR检测。剩余的浓缩液和核酸样本应
于-4℃条件下冻存。
核酸扩增:
参照猪繁殖与呼吸系统综合征(蓝耳病)荧光PCR检测试剂盒
说明书(见附页)进行。每个样本设置3个平行。
(五)结果评价
阳性结果评价:
——阳性对照FAM通道与VIC通道Ct值均<35且出现特异性扩
增曲线。阴性对照应无Ct值,且无特异性扩增曲线,试验结果有效;
否则应重新进行试验。
——FAM通道Ct值≤38且出现特异性扩增曲线,判定为病毒核
酸阳性。
——FAM通道Ct值38<Ct≤45,判定为可疑,应对样本进行复测,
若复测结果Ct值仍在38~45之间有明显指数增长,则判定为阳性,
否则为阴性。
阴性结果评价:
——通道无Ct值或无典型S型扩增曲线,同时VIC通道CT值
<38,判为阴性,表明样品中未检出病毒核酸。
——FAM通道无Ct值或无典型S型扩增曲线,同时VIC通道CT
值>38或无CT值,则该样本检测结果无效,应重新安排采样检测。
(六)检出限
检出限按本标准的试验方法进行验证,选取10个空白平行样品,
通过分析,计算得出猪蓝耳病病毒的方法检出限为1copies/mL。具体
试验验证数据如下表所示:
广西农业职业技术大学检出限测试数据表
金陵农牧集团检出限测试数据表
广西扬翔股份检出限测试数据表
南宁壮博生物科技有限公司检出限测试数据表
(七)精密度
定性分析的精密度通常表现为假阳性或假阴性。依据RT-PCR法
进行测定,判断污水样品的测定结果为阴性或阳性。三家实验室的精
密度测试数据如下:
广西农业职业技术大学精密度测试结果
金陵牧业集团有限公司精密度测试结果
广西扬翔股份有限公司精密度测试结果
南宁壮博生物科技有限公司精密度测试结果
(八)实验室间方法确认
根据方法标准验证要求,选择3家实验室进行实验室间方法确认,
确认方法的“选择性”、“检出限”和“精密度”。
1、确定4家实验室参加。分别是广西农业职业技术大学、金陵牧
业集团有限公司、广西扬翔股份有限公司。
2、实验室方法确认的污水样品共7份(每家实验室的污水样品相
同),污水样品编号为01至07。
3、通过3家实验室的数据比对(验证方案见附页),4家实验室对
7份污水样品的判定结果一致。
通过以上实验数据,4家实验室都对方法的“选择性”、“检出限”、
“精密度”都进行了确认,说明污水中猪蓝耳病病毒的快速筛查
RT-PCR法可行、稳定,满足污水中猪蓝耳病病毒的快速筛查。
六、国内外同类标准制修订情况及与法律法规、强制性标准关系
经查阅,与“污水中猪蓝耳病病毒快速筛查”有关的标准有:GB/T
18090-2023猪繁殖与呼吸综合征诊断方法(即将实施);GB/T
18090-2008猪繁殖与呼吸综合征诊断方法(现行);GB/T
36875-2018猪瘟病毒RT-nPCR检测方法;GB/T34729-2017猪
瘟病毒阻断ELISA抗体检测方法;GB/T27540-2011猪瘟病毒实时
荧光RT-PCR检测方法;GB/T35912-2018猪繁殖与呼吸综合征病
毒荧光RT-PCR检测方法;NY/T3237-2018猪繁殖与呼吸综合征
间接ELISA抗体检测方法;DB33/T822-2010高致病性猪蓝耳病
RT-PCR检测技术;DB65/T3899-2016高致病性猪蓝耳病RT-PCR
检测方法;DB13/T5345-2021猪繁殖与呼吸综合征病毒和猪圆环病
毒2型二重PCR检测方法;DB21/T2827.1-2017畜禽疫病防治与
净化技术规范第1部分:猪繁殖与呼吸综合征病毒经典株与高致病性
变异株RT-PCR鉴别检测方法;DB21/T3257-2020猪繁殖与呼吸
综合征病毒抗体酶联免疫检测方法辽宁省市场监督管理局
2020-05-30现行;DB32/T3775-2020猪繁殖与呼吸综合征病毒
RT-LAMP检测方法;DB35/T1335-2013猪繁殖与呼吸综合征抗体
检测方法免疫金试纸法;DB35/T1852-2019猪繁殖与呼吸综合征
病毒实时荧光RT-PCR检测方法;DB37/T3085-2017高致病性猪
繁殖与呼吸综合征病毒株和经典毒株的RT-PCR鉴别检测技术;
DB45/T1010-2014美洲型及欧洲型猪繁殖与呼吸综合征病毒的检
测多重荧光定量反转录聚合酶链反应法;T/CVMA12-2018猪繁殖
与呼吸综合征病毒实时荧光RT-PCR检测方法;T/CVMA6-2018
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