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文档简介

1、关于实验五转基因植物的检测第1页,共29页,2022年,5月20日,22点11分,星期三1、检测外源基因在植物细胞中的转录,对外源基因表达调控进行研究,掌握引物的选择、cDNA的合成、RT-PCR检测的原理与方法。实验目的第2页,共29页,2022年,5月20日,22点11分,星期三第3页,共29页,2022年,5月20日,22点11分,星期三第4页,共29页,2022年,5月20日,22点11分,星期三第5页,共29页,2022年,5月20日,22点11分,星期三第6页,共29页,2022年,5月20日,22点11分,星期三第7页,共29页,2022年,5月20日,22点11分,星期三第8页

2、,共29页,2022年,5月20日,22点11分,星期三第9页,共29页,2022年,5月20日,22点11分,星期三第10页,共29页,2022年,5月20日,22点11分,星期三第11页,共29页,2022年,5月20日,22点11分,星期三第12页,共29页,2022年,5月20日,22点11分,星期三第13页,共29页,2022年,5月20日,22点11分,星期三第14页,共29页,2022年,5月20日,22点11分,星期三第15页,共29页,2022年,5月20日,22点11分,星期三1、材料: 转基因植物的RNA或mRNA制备物。 非转化的植株材料总RNA或mRNA制备物2、设备

3、:PCR仪、移液器、PCR管等。3、试剂:10RT缓冲液、dNTP、逆转录酶、 引物(随机引物,Oligo dT; 特异引物)、 10One Step RNA PCR Buffer、25 mM MgCl2、10 mM dNTP、RNase Inhibitor (40 U/l)、AMV-Optimized Taq1 l、AMV RTase XL (5 U/l)、上游特异Primer (20 M)*1、下游特异Primer (20 M)*2、RNase Free H2O。实验材料、设备及试剂第16页,共29页,2022年,5月20日,22点11分,星期三实验操作步骤:1)RNA提取: 关键 防止R

4、NA降解RNA提取的成功与否是RT-PCR检测中最重要的步骤。第17页,共29页,2022年,5月20日,22点11分,星期三2、cDNA第一链的合成: 取1个0.2ml的PCR管,依次加入下列试剂:10PCR Buffer 1 l RNase Free dH2O 5.75 l dNTP 1 l RNase Inhibitor 0.25 l AMV RTase Transcriptase 0.5 l oligo dT-Adaptor primer 0.5 l RNA 1l Total 10l实验步骤第18页,共29页,2022年,5月20日,22点11分,星期三反应条件: 42 30min 9

5、9 5min 5 5min第19页,共29页,2022年,5月20日,22点11分,星期三3、PCR反应取一个0.2ml的PCR管,依次加入下列试剂:10PCR Buffer 4 l灭菌蒸馏水 9l 10 mM dNTP .5 lTaq酶 0.1 l 上游特异Primer (20 M)*1 0.2 l下游特异Primer (20 M)*2 0.2l Total 16 l将(1)的反应结果稀释20倍,取10 l 加入到(2)管中,轻轻摇匀。第20页,共29页,2022年,5月20日,22点11分,星期三反应条件:94 2min94 30s55 30s 72 1min72 7min30Cycles

6、第21页,共29页,2022年,5月20日,22点11分,星期三目前研究转基因植物外源基因转录表达的常用方法1、RT-PCR (RNA) 2、Northern blot (RNA) 3、real-time PCR (RNA ) 第22页,共29页,2022年,5月20日,22点11分,星期三结果与分析利用凝胶成像分析仪对电泳结果进行拍照和结果记录;观察胶上是否有预扩增的主要产物带。对比目的基因产物的电泳谱带分子量和谱带的特异性,确定和描述谱带特征。 RT-PCR扩增得到的810bp的目的基因产物的电泳结果第23页,共29页,2022年,5月20日,22点11分,星期三1、将实验结果粘到实验报告

7、上。2、 如何选择RT-PCR的反转录引物。3、结合实验结果,试论应用RT-PCR研究外源基因转录表达的优缺点。 实验报告第24页,共29页,2022年,5月20日,22点11分,星期三实验一、质粒三种提取方法的比较为什么要用对数期的菌液提取质粒 ?因为对数期菌的 生长状况和数量最佳,有利于提取质粒 溶液、溶液的作用?溶液 50mM 葡萄糖 / 10mM EDTA / 25mM Tris-HCl,pH=8.0 葡萄糖增稠,使悬浮后的大肠杆菌不会快速沉积到管子的底部;EDTA 抑制DNase的活性。这一步溶液中还可以加入RNase,不受EDTA影响,并且可以在后续步骤中被除去 溶液 0.2M N

8、aOH / 1% SDS 破细胞的主要是碱,而不是SDS,所以才叫碱法抽提。 溶液 3M 醋酸钾 / 2M 醋酸 这一步的K置换了SDS(十二烷基磺酸钠)中的Na,得到PDS(十二烷基磺酸钾)沉淀;SDS易与蛋白质结合,平均两个氨基酸上结合一个SDS分子,钾钠离子置换所产生的大量沉淀自然就将绝大部分蛋白质也沉淀了,同时基因组DNA也被PDS共沉淀 第25页,共29页,2022年,5月20日,22点11分,星期三溶菌酶的作用作用?沸水加热的作用?利用溶菌酶和TritonX-100破坏细胞壁,加热可使蛋白质和染色体DNA变性.将实验电泳结果粘到实验报告上,并对结果分析。比较三种提取方法的区别?第2

9、6页,共29页,2022年,5月20日,22点11分,星期三实验二、醋酸锂法转化酵母细胞观察并描述培养状况,统计单菌落个数。比较酵母细胞转化与大肠杆菌细胞转化的区别。酵母菌属于真核生物 ,大肠杆菌是细菌属于原核生物 .酵母转化在室温,大肠杆菌转化在冰上酵母转化用醋酸锂,大肠杆菌转化用氯化钙酵母转化用穿梭质粒,大肠杆菌转化用普通质粒穿梭质粒是指一类人工构建的具有两种不同复制起点和选择标记,因而可以在两种不同类群宿主中存活和复制的质粒载体。 比如说通常能够在哺乳动物,酵母或者其他细菌复制表达的质粒,同时可以在大肠杆菌内复制。这样利于对质粒的分子生物学操作和大量制备。 第27页,共29页,2022年,5月20日,22点11分,星期三实验三、侵染菌种对除菌抗生素的敏感性头孢酶素100200300400500600头孢唑啉钠-头孢哌酮钠-头孢曲松钠-+头孢噻肟钠-+-:表示无抑制作用;+:表示抑菌圈

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