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文档简介
第二章
核酸的结构和功能StructureandFunctionofNucleicAcidThebiochemistryandmolecularbiologydepartmentofCMU核酸(nucleicacid)
是以核苷酸为基本组成单位的生物大分子,携带和传递遗传信息。核酸的分类及分布存在于细胞核和线粒体内。存在于胞核、胞液和线粒体。(deoxyribonucleicacid,DNA)(ribonucleicacid,RNA)脱氧核糖核酸核糖核酸携带遗传信息,决定细胞和个体的遗传型(genotype)。参与遗传信息的复制与表达。某些病毒RNA也可作为遗传信息的载体。核酸的基本组成单位是核苷酸(nucleotide)。碱基戊糖磷酸核苷酸核苷核酸DNA的基本组成单位是脱氧核糖核苷酸。RNA的基本组成单位是核糖核苷酸。嘌呤嘧啶碱基腺嘌呤(A)鸟嘌呤(G)胞嘧啶(C)胸腺嘧啶(T)尿嘧啶(U)DNA、RNA均有DNA有RNA有一、核苷酸的结构每种核酸都含有四种碱基。嘌呤(purine)腺嘌呤(adenine,A)鸟嘌呤(guanine,G)碱基
五种碱基都能形成酮式-烯醇式或氨基-亚氨基的互变异构。这两种异构体的平衡关系受介质酸碱环境的影响。
戊糖(构成RNA)核糖(ribose)(构成DNA)脱氧核糖(deoxyribose)碱基和核糖(或脱氧核糖)通过糖苷键连接形成核苷(nucleoside)(或脱氧核苷)。
多磷酸核苷酸:
NMP,NDP,NTP环化核苷酸:cAMP,cGMP二、核酸的一级结构定义核酸中核苷酸的排列顺序。由于核苷酸间的差异主要是碱基不同,所以也称为碱基序列。书写方法
DNA与RNA的区别核酸碱基戊糖DNAA、G、C、T脱氧核糖RNAA、G、C、U核糖第二节DNA的空间结构与功能DimensionalStructureandFunctionofDNA(一)DNA双螺旋结构的研究背景碱基组成分析Chargaff
规则:[A]=
[T][G]=
[C]碱基的理化数据分析A-T、G-C以氢键配对较合理
DNA纤维的X-线衍射图谱分析已知的核酸化学数据(二)DNA双螺旋结构模型要点1.两条链反向平行,围绕同一中心轴构成右手双螺旋(doublehelix)。螺旋直径2nm,表面有大沟和小沟。2.磷酸-脱氧核糖骨架位于螺旋外侧,碱基垂直于螺旋轴而伸入内侧。每圈螺旋含10个碱基对(bp),螺距为3.4nm。3.两条链通过碱基间的氢键相连,A对T有两个氢键,C对G有三个氢键,这种A-T、C-G配对的规律,称为碱基互补规则。4.维持双螺旋稳定的因素:横向为氢键,纵向为碱基间的堆积力。碱基互补配对TAGC意义DNA超螺旋结构整体或局部的拓扑学变化及其调控对于DNA复制和RNA转录过程具有关键作用。(三)DNA在真核生物细胞核内的组装真核生物染色体由DNA和蛋白质构成,其基本单位是核小体(nucleosome)。核小体的组成DNA:约200bp组蛋白:H1H2A,H2BH3H4串珠状核小体结构串珠状核小体DNA双螺旋片段染色质纤维伸展形染色质片段密集形染色质片段整个染色体核小体螺线管真核生物染色体DNA组装三、DNA的功能DNA的基本功能是以基因的形式荷载遗传信息,并作为基因复制和转录的模板。它是生命遗传的物质基础,也是个体生命活动的信息基础。基因从结构上定义,是指DNA分子中的特定区段,其中的核苷酸排列顺序决定了基因的功能。肺炎双球菌的转化实验OswaldAvery(1944)
实验二,噬菌体的标记实验
第三节
RNA的结构与功能StructureandFunctionofRNA动物细胞内主要RNA的种类及功能一、信使RNA的结构与功能hnRNA内含子(intron)mRNA*mRNA成熟过程
外显子(exon)*mRNA结构特点1.大多数真核mRNA的5´末端均在转录后加上一个7-甲基鸟苷,同时第一个核苷酸的C´2也是甲基化,形成帽子结构:m7GpppNm-。2.大多数真核mRNA的3´末端有一个多聚腺苷酸(polyA)结构,称为多聚A尾。帽子结构mRNA核内向胞质的转位mRNA的稳定性维系翻译起始的调控帽子结构和多聚A尾的功能mRNA的功能:作为蛋白质合成的模板。*
tRNA的一级结构特点含稀有碱基较多
3´末端为—CCA-OH5´末端大多数为G
由70~90个核苷酸组成二、转运RNA的结构与功能稀有碱基*tRNA的二级结构——三叶草形氨基酸臂额外环*tRNA的三级结构——倒L形*tRNA的功能活化、搬运氨基酸到核糖体,参与蛋白质的翻译。*rRNA的结构三、核蛋白体RNA的结构与功能*rRNA的功能参与组成核蛋白体,作为蛋白质生物合成的场所。核糖体的组成原核生物真核生物小亚基30S40SrRNA16S18S蛋白质21种33种大亚基50S60SrRNA23S5S28S5.8S5S蛋白质33种49种核糖体70S80S四、其他小分子RNA及RNA组学除了上述三种RNA外,细胞的不同部位存在的许多其他种类的小分子RNA,统称为非mRNA小RNA(smallnon-messengerRNAs,snmRNAs)。
snmRNAssnmRNAs的种类核内小RNA(snRNA)核仁小RNA(snoRNA)胞质小RNA(scRNA)催化性小RNA小片段干扰RNA(siRNA)snmRNAs的功能参与hnRNA和rRNA的转录后加工和转运以及基因表达过程的调控等。是研究细胞中snmRNAs的种类、结构和功能的科学。同一生物体内不同种类的细胞、同一细胞在不同时间、不同状态下snmRNAs的表达具有时间和空间特异性。RNA组学(RNomics)核酸的理化性质ThePhysicalandChemicalCharactersofNucleicAcid第四节一、核酸的一般理化性质核酸为多元酸,具有较强的酸性;DNA是线性高分子,粘度极大;在260nm波长有最大吸收峰,是由碱基的共轭双键决定的。这一特性常用作核酸的定性、定量分析。1.DNA或RNA的定量OD260=1.0相当于50g/ml双链DNA40g/ml单链DNA(或RNA)20g/ml寡核苷酸2.判断核酸样品的纯度DNA纯品:OD260/OD280=1.8RNA纯品:OD260/OD280=2.0OD260的应用二、DNA的变性(denaturation)定义:在某些理化因素作用下,DNA双链解开成两条单链的过程。变性因素:过量酸,碱,加热等。变性后理化性质的主要改变:OD260增高 粘度下降DNA变性的本质是双链间氢键的断裂DNA的紫外吸收光谱增色效应:DNA变性时其溶液OD260增高的现象。解链曲线:在连续加热DNA的过程中以温度对A260值作图,所得的曲线称为解链曲线。
Tm:紫外光吸收值达到最大值的50%时的温度称为DNA的解链温度,又称融解温度(meltingtemperature,Tm)。其大小与G+C含量成正比。三、DNA的复性与分子杂交
DNA复性(renaturation)的定义在适当条件下,变性DNA的两条互补链可恢复天然的双螺旋构象,这一现象称为复性。减色效应DNA复性时,其溶液OD260降低。热变性的DNA经缓慢冷却后即可复性,这一过程称为退火(annealing)。
热变性的DNA在复性过程中,具有碱基序列部分互补的不同的DNA之间或DNA与RNA之间形成杂化双链的现象。核酸分子杂交(hybridization):变性复性复性核酸分子杂交的应用研究DNA分子中某一种基因的位置定两种核酸分子间的序列相似性检测某些专一序列在待检样品中存在与否是基因芯片技术的基础第五节
核酸酶
Nuclease核酸酶是指所有可以水解核酸的酶依据底物不同分类DNA酶(deoxyribonuclease,DNase)RNA酶(ribonuclease,RNase)依据切割部位不同分类核酸内切酶:
限制性核酸内切酶非特异性核酸内切酶核酸外切酶:
5´→3´或3´→5´核酸外切酶。参与DNA的合成与修复及RNA合成后的剪接等重要基因复制和基因表达过程负责清除多余的、结构和功能异常的核酸,同时也可以清除侵入细胞的外源性核酸在消
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