2016年杯数学建模挑战赛题-测试数据修订8.16附件-d说明_第1页
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文档简介

一、数据说明DNA直接以变异位点表示,记录在sample.var.0(0)sample.var.1(组别1)中。变异位点文件中包含变异位点坐标,变异碱基,变异类型,变异所在RNA直接以表达量表示,记录在sample.exp.0(组别0)及(组别1)中表型以,病程,及组别表示记录在.txt中二、格式说明#SampleGender FEMALEStage 说明该文件以tab间隔4列Sample列为样本编号Gender列为样本。未知用“.”表示Stage列为样本患病严重程度。未知程度用“.”表示Type列为批次。分0批次1批次。以下文件命名后缀中的1也表示批次RNA-seq表达矩阵文件:sample.exp.0示例说明矩阵每列为一个样本,每列的第一行为样本编号 变异文件:sample.var.0示例说明该文件共有12列第一列为标准名称。第二列为编号 nnsensennstop_MnRN,SilentSplice_Site十种类型。第七列为变异类型,此处有SNP,INS,DEL和DNP四类 第八列为reference参考序列碱基型,第九列为第一碱基型,第十第十一列为变异的

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