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文档简介
1、第四课哺乳动物总RNA提取及RNA琼脂糖凝胶电泳1第一部分 哺乳动物总RNA提取2实验原理异硫氰酸胍可将哺乳动物组织匀浆中蛋白质变性,十二烷基肌氨酸钠可使细胞裂解,并释放RNA,同时保持RAN的完整。苯酚也是蛋白质变性剂,加入氯仿后离心,溶液分为水相和有机相。酸性条件下DNA同蛋白质一起变性被离心下来,绝大部分RNA则保留于水相。水相的RNA可经异丙醇沉淀。3实验试剂裂解液(4M异硫氰酸胍,25mM柠檬酸钠 Ph7.0,0.1M-巯基乙醇,0.5%十二烷基肌氨酸钠)2M醋酸纳,pH4.0水饱和苯酚,pH5.0氯仿75%乙醇(用DEPC处理的去离子水配置)DEPC处理的去离子水4实验步骤取3克组
2、织,加30ml裂解液,匀浆。吸取500ul匀浆液于1.5ml微量离心管中.加50ul2M醋酸纳(pH4.0),500ul水饱和苯酚,100ul氯仿,震荡1分钟。冰上放置15分钟。13000rpm,4,5分钟。将上清转移至1.5ml无酶微量离心管中,加等体积的苯酚/氯仿(1:1),震荡1分钟。13000rpm,4,5分钟。将上清转移至1.5ml无酶微量离心管中,加等体积的氯仿,震荡1分钟。13000rpm,4,5分钟。将上清转移至1.5ml无酶微量离心管中,加等体积的异丙醇。0放置20分钟。13000rpm,4,10分钟。去上清。用1ml75%乙醇洗管壁。尽量去处乙醇。室温干燥。将RNA沉淀溶于
3、10ul经DEPC处理的去离子水中。-20保存。 5第二部分 RNA琼脂糖凝胶电泳6实验原理常用的变性剂甲醛或戊二醛可使蛋白质变性,也可破坏RNA分子的二、三级结构。因此在含有变性剂的琼脂糖凝胶中电泳,可防止RNA被降解,同时可以避免RNA高级结构对电泳结果的影响。7实验试剂琼脂糖10X MOPS(吗啉代丙烷磺酸 )(0.2M MOPS, 50mM NaAc, 10mM EDTA, Ph 7.0)37%甲醛RNA上样缓冲液(50%甲酰胺,1X MOPS,6%甲醛,7%甘油,0.3%溴酚蓝) 8实验步骤称取0.5克琼脂糖,加40ml去离子水。加热将琼脂糖充分融解。当溶液温度降至60左右,加5ml10X MOPS,5ml37%甲醛,2ulGoldView,混匀。倒入制胶板,室温静置至胶完全凝固。除去梳齿,将凝胶板放入电泳槽,加入1X MOPS至液面超过凝胶约2mm。取5ulRNA与10ulRNA上样缓冲液混匀。6510分钟,立即置冰上2分钟。上样,100V电泳40-50分钟。在紫外灯下观察电泳结果。9思考题如何处理玻璃器皿及金属器械,使之无RNA酶?如何配制DEPC水?如何配制无RNA酶试剂?在提取RNA的实验中,你认为操作上应注意那些地方能有助于防止R
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