树脂型基因组DNA提纯试剂盒

树脂型™基因组DNA提纯试剂盒操作方法将全血轻轻混匀，转移0.5ml全血到1ml纯化树脂中，颠倒混匀5~6次。室温下放置3分钟，其间颠倒混匀一次，5,000rpm离心3秒，收集沉淀。用1mlGN结合液将纯化树脂悬浮，颠倒混匀，5,000rpm离心3秒，收集沉淀。用0.5ml漂洗液漂洗纯化树脂两次，颠倒混匀，5,000rpm离心3秒，收集沉淀。如果纯化树脂仍然呈现黄色或褐色，重复第3步一次。用0.8ml无水乙醇悬浮纯化树脂，装入离心纯化柱，13,000rpm离心1分钟，倒掉废液收集管中的乙醇，13,000rpm再离心1分钟，尽量除尽乙醇。将离心纯化柱套入一个干净的1.5ml或2ml离心管中，开盖放置2~3分钟使乙醇挥发干净。加入100µlTE缓冲液于纯化树脂上（不能粘在管壁上），室温下放置3分钟，13,000rpm离心2分钟。如果对基因组DNA的需求量较大的话，则重复第5步1~2次，这样可以获得高产量的基因组DNA。TE缓冲液的用量视用户对浓度的要求而定。离心柱放入离心管中，若盖不上盖子，亦没有关系，可开盖离心。离心管中收集的液体即是洗脱下来的基因组DNA，取2µl电泳（1%琼脂糖，120V，20分钟）检测。-20℃补充说明本系统不仅用于从全血中快速提纯基因组DNA，而且还可以从细菌培养液、动物组织培养细胞、动物组织、植物细胞中提纯基因组DNA。从细菌培养液中提纯基因组DNA对于革兰氏阴性菌，将1.5ml培养过夜的菌液（约5×106培养细胞）13,000rpm离心30秒，收集菌体，将菌体悬浮于0.5mlPBS缓冲液或TE缓冲液中，然后与1ml纯化树脂混匀。后续实验操作与从全血中提纯基因组DNA的操作方法相同。对于革兰氏阳性菌，由于革兰氏阳性菌细胞壁比较厚，肽聚糖含量很高，破壁比较困难，从而影响基因组DNA的得率，甚至提纯失败。因此，对于革兰氏阳性菌要进行特殊的破壁处理。将1.5ml菌液（收集过多会影响破壁效果）离心收集菌体，将菌体重悬于400µl50mMEDTA溶液，加入50μl溶菌酶（100mg/ml）（溶菌酶的质量和浓度会影响破壁效果）混匀，37℃温育30~60分钟，其间缓慢摇动，然后加入250μlSTEP溶液，50℃缓慢摇动至少2小时，后续实验操作与从全血中提纯基因组DNA的操作方法相同。（若离心管容量不够可分两管操作）葡萄球菌株要用溶葡萄球菌素（MalatestaM.L.et.al.,1992,Biotechniques12,70）处理，处理这类菌株一般不能仅用溶菌酶。为使革兰氏阳性菌株有效裂解，建议将这两种酶混合使用。从动物组织（肝脏、脾脏、脊髓等）与动物组织培养细胞中提纯基因组DNA对于动物组织，将约20mg~50mg的动物组织置于匀浆器中，用1ml的纯化树脂使其匀浆化；或者用液氮将约20mg~50mg的动物组织研磨为细粉后，与1ml的纯化树脂混匀。后续实验操作与从全血中提纯基因组DNA的操作方法相同。对于动物组织培养细胞，将1.5ml培养细胞（约5×106培养细胞）13,000rpm离心30秒，收集培养细胞，将培养细胞重悬于500µlPBS缓冲液或TE缓冲液中，与1ml纯化树脂混匀。后续实验操作与从全血中提纯基因组DNA的操作方法相同。从植物细胞中提纯基因组DNA将约50mg~100mg的植物组织置于预冷匀浆器中，用0.5mlCTAB萃取缓冲液使其匀浆化；或者用液氮将50mg~100mg的植物组织研磨为细粉，转移到已预热至65℃的0.5mlCTAB萃取缓冲液中。65℃温育15~20分钟，其间颠倒混匀几次，然后与缓冲液的配制TE缓冲液：总体积100ml将1ml1mol/LTris-HCl（pH7.6）和0.2ml0.5mol/LEDTA（pH8.0）混匀，补超纯水至100ml，高压灭菌，室温保存。PBS缓冲液：总体积100ml在80ml超纯水中溶解0.8gNaCl、0.02gKCl、0.144gNa2HPO4和0.024gKH2PO4，用HCl调节溶液的pH值至7.4，补超纯水至100ml，高压灭菌，室温保存。CTAB萃取缓冲液：总体积100ml将10ml1mol/LTris-HCl（pH7.6），14ml5mol/LNaCl，4.0ml0.5mol/LEDTA（pH8.0），1gDTT和1gCTAB混匀，补超纯水至100ml，过滤灭菌，室温保存。STEP溶液：SDS 0.5%Tris－HCl（pH8.0） 150mMEDTA 400mM蛋白酶K 0.25mg/mL常见问题及参考意见常见问题可能原因参考意见血样中存在血凝块未加抗凝剂去除血凝块，将全血混匀采血后，立即用EDTA、肝素或柠檬酸钠等各种抗凝剂处理血样基因组DNA产量低血样中白细胞数太低重新收集血样血样保存的时间过长最好从新鲜血样中抽提DNA纯化树脂（于GN结合液中）与GN结合液有结晶出现将纯化树脂（于GN结合液中）与GN结合液置于37℃温浴30min洗脱温度过低加入TE浸透树脂后，于37℃温育2基因组DNA易降解DNA在酸性环境中脱嘌呤用pH>7.0的TE洗脱核酸酶污染使用灭菌的玻璃及塑料制品基因组DNA已降解血样的收集与保存存在问题最好收集新鲜血样抽提基因组DNA加入抗凝剂后，4℃保存不要超过2月。若要长期保存，置于-70℃操作过于剧烈悬浮离心后的纯化树脂