天津大学《计算机辅助药物设计》期末考试必备通关指导

PAGEPAGE5计算机辅助药物设计复习题一、名词解释1mRNADNA2、碎片连接法：是一种从头药物设计方法，它将受点区域划分为不同子区域，将不同的形状和性质分子碎片（如，单一官能团）对接上去，再将子区域的碎片连接起来，就得到一个完整的分子。3、药动基团：指药物中参与体内药物的吸收、分布、代谢和排泄过程的基团。药动基团本身不具有显著的生物活性，只决定药物的药动学性质。4、计算机辅助药物设计：用计算机处理并在屏幕上显示生物大分子和药物分子模型，特别是计算机辅助设计技术与合理药物设计过程的结合则称为计算机辅助药物设计。5、锁和钥匙学说：酶与底物结构上的互补性，用锁与钥匙的关系来描述酶与底物的关系。但此学说不能解释酶的逆反应。6、拟肽药设计（模拟肽学进行改造或是结构替换。7、拮抗剂：能使受体结合，阻碍内源性物质与受体结合而导致其生物作用的抑制，也称抑制剂。只有较强的亲和力，无内在活性的药物。8、先导化合物：通过各种途径、方法或手段获得的，具有一定生物活性的新的结构类型化学物。活性不高、特异性差、副作用大、药代药动性质差。9、软药：本身具有生物活性的药物，在体内产生特定药理作用后，经预计的可控速率进一步代谢转变为无活性无毒性的化合物。10、速率学说：药物与受体相接触即产生生物效应，药物作用与其占有受体的速率成正比，而与其占有的多少无关。11、药物潜伏化：利用药物代谢动力学知识，改变化合物的结构，从而改变其理化性质，调节分子在体内的代谢途径，可能使药效增强，毒副反应降低，生物利用度增加，该过程称为药物潜伏化。12、生物电子等排：电子等排体指电子数目及排布情况相同的化合物或基团构成的电子等排体，它们具有相似的物理性质。在生物领域里电子等排体表现为生物电子等排。13、同源建模：是利用已知的蛋白质三级结构(模板）为参照，通过序列的类比分析和结构关联的方法来实现氨基酸序列相近的新蛋白三维结构预测。14、模板定位法：是一种从头药物设计方法，它是指在受体活性部位使用模板构建出一个性质互补的骨架，再根据其他作用性质把分子骨架转化为具体分子。15、药效团模型方法：从一组活性化合物的结构出发，确定化合物共同的药效作用模式，构建一个药效基团之间特定的三维排列方式，并依此设计新的化合物。16制剂。只有较强的亲和力，无内在活性的药物。17（致癌性、致突变性，这些基团称为毒性基团。18、先导化合物结构优化：对先导化合物做进一步的结构修饰和改造，提高活性和特异性，改善药代动力学特性，衍生出选择性高、安全性好。19、占领学说：受体只有与药物结合才能被激活并产生效应，而效应的强度与被占领的受体数量成正比。2021自动构造出形状和性质互补的全新配体分子。它所构建的分子在空间和电性上与受体的三维结构互补，所以可能属于一种新的结构类型。22、药物虚拟筛选：也称药物计算机筛选，即在进行生物活性筛选之前，利用计算机上的分子对接软件模拟目标靶点与候选药物之间的相互作用，计算两者之间的亲和力大小，以降低实际筛选化合物数目，同时提高先导化合物发现效率。23、内在活性学说：药物与受体结合不仅需要亲和力，而且还需要有内在活性才能激动受体而产生效应。24、硬药：为避免有害代谢物的产生，设计不受任何酶攻击的有效药物，称为“硬药”。25、构效关系：是指从定性的角度讨论药物的化学结构和生物活性的关系，即分子结构和构象的变化与生物活性的有无及强弱之间的关系来推测药物的作用方式和机理。26、前药：用化学方法将具有活性的原药与某种基团相连接，转变成无活性的新化合物。27、高通量筛选技术：是指以分子水平和细胞水平的实验方法为基础，以微板形式作为实验工具载体，以自动化操作系统执行试验过程。28、比较分子场分析方法CoMFA：采用化合物周围的静电场、范德华力场等的空间分布作为化合物结构描述变量，通过最小二乘法建立化合物生物活性与化合物周围各种力场空间分布3D-QSAR二、单项选择题1、下面关于“计算机辅助药物设计的意义”的描述，哪一个选项不是正确的？（C A.加快研制新药的速度B.节省新药开发工作的人力、物力、财力C.使药物设计成功率达到80%以上D.进行合理的药物设计，避免了盲目性。2、下面关于有机化合物结构的说法哪个是错误的？（C A.有机物中，只发现为数有限的几种元素。B.所有的有机物都含有碳。C.所有的有机物都含有氢。D.很多有机物含有O,N,卤素等原子。3、反密码子存在下面哪类RNA中？（ D ）4、下面哪个氨基酸含有吲哚环？（A ）A.色氨酸 B.苯丙氨酸 C.精氨酸 D.丝氨5、下面哪个软件是进行量子化学研究的？（A）软件 软件软件 软件6、下面哪个分子力场适用于研究计算高分子体系？（B 力场 力场力场 力场7、在研究靶标蛋白与配体相互作用时，常常采用的是下面哪个系综？（CA.正则系综 B.微正则系综 C.等温等压系综 D.等压等焓系综8、模板定位法属于下面哪个CADD方法类型？（ AA.