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文档简介
1、生物工程专业专业实训教学大纲编 号14113006实践名称专业实训周 数2学 分2学 期7承担单位生工学院1. 专业实训目的和要求专业实训是生物工程专业非常重要的实践性教学环节之一,是培养学生运用生物工程相关软件设计和模拟具体某一工程和工艺过程的能力。专业实训目的是引导学生了解生物工程相关软件,熟悉并掌握常用软件的操作和使用,以培养学生独立设计生物工程试验,分析和模拟试验过程,总结和展示工程工艺结果的能力。为该专业学生在以后的工作、科研中具备使用软件、分析和设计工程案例打下基础。基本要求:(1)本专业实训是生工专业学生完成化工原理、发酵工程、基因工程、细胞工程、蛋白质工程等专业课程学习后,针对
2、本专业涉及的相关软件使用培训。(2) 了解生物工程相关软件及用途,掌握生物分离工艺流程图制作,蛋白质结构预测,系统进化树构建,引物设计,模拟分子克隆和统计分析等软件使用2主要实训内容2.1生物工艺流程图制作要求学生根据设计任务,利用Visio2007软件,制作一个完整的分离工艺流程图 主要内容:(1)了解Visio2007软件的功能;(2)学习Vision2007软件的使用(3)利用软件合理设计流程图;(4)利用软件优化流程图2.2 蛋白质结构预测和序列分析了解蛋白质序列数据库和结构预测在线软件,选择其中1-2个在线软件,完成不同性质蛋白质结构预测。主要内容:(1)通过数据库分析蛋白质序列(S
3、WISS-PROT 数据库、TrEMBL数据库、ExPASy数据库);(2)了解蛋白质结构数据库(PDB数据库、NRL-3D 数据库、NRL-3D 数据库);(3)利用上述数据可分析蛋白序列;(4)利用上述数据库预测蛋白结构和功能 2.3 系统进化树构建 MEGA软件的目的就是提供一个以进化的角度从DNA和蛋白序列中提取有用的信息的工具。了解系统进化树MEGA4.0软件,利用MEGA4.0编辑序列数据、序列比对、构建系统发育树、推测物种间的进化距离。基本要求:(1)了解系统进化树构建软件及其原理;(2)掌握MEGA4.0软件的使用;(3)利用Mega4.0构建进化树;(4)结合进化树分析物种间
4、的进化距离2.4 引物设计软件了解引物设计原则,选择合适的引物设计软件,利用Primer5.0设计引物主要内容:(1)学习引物设计原则;(2)学习Primer5.0软件的操作;(3)利用Primer5.0设计引物;(4)利用Primer5.0分析并优化引物设计2.5 模拟分子克隆了解分子克隆原理,利用Clone manager7.0软件,修饰DNA分子,查询酶切位点,模拟载体构建,搜索开放读码框以及DNA和蛋白序列比对。主要内容:(1)利用基因工程原理, 设计载体构建方案;(2)学习Clone manager7.0软件的使用;(3)利用Clone manager7.0,模拟载体构建;(4)利用
5、Clone manager7.0修饰DNA分子和酶切位点查询;(5)利用Clone manager7.0进行DNA和多肽的序列比对2.6 数据处理和绘图Origin软件功能强大,操作简单,提供直观的统计分析和绘图环境。数据分析包括:数据的排列、调整、计算、统计、曲线拟合等。提供直线图、散点图、向量图、柱状图、饼图、极坐标图、三维图表、统计图表等几十种二维和三维绘图模板。同时可以自定义数学函数,图形样式和绘图模板。了解Origin8.0软件的用途,利用Origin8.0分析数据,作图展示分析结果。主要内容:(1)学习软件Origin8.0的使用;(2)利用Origin8.0统计分析数据,绘图展示结果4完成地点校内。5考核与成绩评定 按课程设计要求,根据学生的完成情况,完成质量给出成绩。其中,平时成绩10%,软件使用和操作40%,总结报告50%;采用优秀、优良、良好、及格、不及格给出成绩,总成绩及格者给予学分。6主要教学参
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