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文档简介
1、一、显微镜技术1、分辨率(resolution):用于表示人眼和仪器,能够辨别两点之间最小距离的标志,是衡量显微镜性能的重要指标。人眼的分辨率由人眼的生理结构决定。光镜由光波波长和物镜数值孔径决定。电镜由电子束半波长决定。分辨率极限:人眼(0.1mm);光镜(0.2pm);电镜(0.2nm)显微镜技术优化核心是提高分辨率,体现在两个方面:(1)光源的采用(2)样品制备和信号呈现方法使信噪比提高。2、显微镜分类:(1)光学显微镜:普通光学显微镜;荧光显微镜(激光扫描共聚焦显微镜、超高分辨率荧光显微镜、活细胞荧光工作站);相差显微镜:观察活细胞;微分干涉相差显微镜(DIC):活细胞三维立体投影影像
2、(2)电子显微镜:透射电子显微镜(TEM);扫描电子显微镜(SEM);分析电子显微镜;高压电子显微镜;冷冻电子显微镜(3)扫描探针显微镜:原子力显微镜3、普通光学显微镜主要三部分:聚光镜、物镜、目镜;光源:可见光样品制备5步:固定(甲醛);脱水(乙醇);包埋(石蜡);冰冻切片(1-10pm);苏木精伊红染色(HE染色)4、荧光显微镜光源:高压汞灯、弧光灯荧光的来源:(1)细胞和组织自发荧光(2)外源导入荧光蛋白:动态检测、活体检测、长时间检测、容易融合(3)荧光染料:吖啶橙染色DNA(绿XRNA(橙)(4)荧光标记抗体:荧光染料与抗体共价结合(5)荧光探针:金属离子探针、细胞内pH值、细胞内活
3、性氧、线粒体跨膜电位。5、荧光素(Fluorphore):吸收能量后具有发光现象的物质,通常为吸收短波长的能量后发散出长波长的光,并随照射停止而消失。荧光素发射光减弱(光漂白)或消失(淬灭)。6、激光扫描共聚焦显微镜(LSCM):以激光作为激发光源,采用光源针孔与检测针孔共聚焦技术,对样本进行断层扫描,以获得高分辨率光学切片的荧光显微镜系统。7、简述激光扫描共聚焦显微镜的原理(光源点,物点,像点,三点共轭)以激光作为激发光源;结构上采用双针孔装置,形成物像共聚焦的独特设计;激光经过聚光镜焦平面上针孔形成点光源,再经物镜在焦平面对样品逐点扫描。样品上每个照射点经反射镜在像焦平面的探测针孔处成像,
4、被光电倍增管探测器接收,转为数字信号传输至计算机,最终在屏幕上聚合成清晰的整个焦平面共聚焦图像。8、激光扫描共聚焦显微镜的功能:(1)薄层断层扫描(光学切片)(2)多通道同时扫描:激光共聚焦显微镜可以多激光多通道同时扫描(3)ZOOM成像:在不变换镜头的情况下,对某幅图片的局部放大,并进行精细逐点扫描成像,获得高分辨率图像。(4)多维度扫描:Z轴扫描(垂直)或T扫描(时间)(5)荧光定量分析9、激光扫描共聚焦显微镜技术在医学及生物学研究中的应用(1)静态:分子定位、定量分析、分子间相互作用(2)动态:分子或细胞活动的动态变化:蛋白质的移位;蛋白质相互作用的研究(FRET);分子运动的测量(FR
5、AP);离子浓度变化趋势的检测10、简述激光扫描共焦显微镜与荧光显微镜的差别。LSCM的优缺点。类别LSCM荧光显微镜光源激光(紫外光、可见光、近红外)短波长光源(多为紫外光)照明方式点照明、逐点扫描落射式样本信号焦平面的样本信号几乎无次可有多个平面的样本信号伴级荧光干扰随相邻部位干扰图像采集系统荧光信号被PMT探测器接收实时观测擞字化图像,可以进行图像处理和定量分析照相机的原理LSCM的优缺点:LSCM优点:(1)高水平分辨率:0.18pm(2)高垂直分辨率:沿Z轴逐层扫描(3)高灵敏度,信噪比良好(4)能定时、定位、定性、定量缺点:(1)分辨率极限:0.15pim(2)观测厚度:50-10
6、0pim(3)逐点扫描,成像速度慢(4)伪彩色11、LSCM和电子显微镜的区别激光共聚焦显微镜电子显微镜工作原理光波的透射电子的透射成像效果微米级(荧光标记)纳米级研究目的观察分布、表达量观察细微结构12、超高分辨率荧光显微镜的原理:“突破”衍射极限,提高分辨率(50nm)(1)基于点扩展函数调制:点扩展函数变小(2)基于随机单分子定位:不会有两个靠的很近的点同时亮起来13、电子显微镜:以电子束为光源,电磁场为透镜,利用电子信号成像,具有高分辨率和放大倍数的显微镜,用于研究组织和细胞的超微结构。14、电子束:又称电子射线,电子束带负电荷,具有光的波动性、可折射性,电镜利用电子束作为“光源”成像
7、。15、透射电子:当样品厚度小于100nm时,部分电子可穿透样品,将穿透样品的电子叫做透射电子,利用透射电子信息成像的称为透射电镜。16、二次电子:在入射电子的轰击下,样品表面5-50nm深度激发出来的电子称为二次电子,利用二次电子信息成像的称为扫描电镜。17、TEM成像和工作原理:(1)电子束投射在样品上,部分电子直接穿透样品产生透射电子(2)带有样品信息的透射电子经成像系统放大,投射到荧光屏上(3)透射电子多,荧光屏亮;反之荧光屏暗,荧光屏的亮暗程度与样品微细结构一一对应,产生具有一定反差的黑白影像18、超薄切片:将环氧树脂包埋的组织块切成100nm以下的薄切片称为超薄切片,超薄切片经电子
8、染色后在TEM下观察组织细胞内部的超微结构。19、血管灌注固定:血管灌注固定是通过血管灌注适量的固定剂,在动物体内把活细胞在原位及时固定。血管灌注固定速度快,固定均匀,可减少离体或死亡后缺氧引起自发性的变化影响,特别是对脑、心肌、肾脏等对缺氧比较敏感的组织尤为重要。20、TEM的样品制备(1)超薄切片技术(9步):取材(1分钟内将新鲜标本放入固定液);预固定(新鲜配制2.5%戊二醛);后固定(1%锇酸);脱水(乙醇和丙酮);浸透;包埋聚合(环氧树脂);修块;切片(半薄切片:500nm;超薄切片:50-100nm);染色(甲苯胺蓝)(2)负染色技术:通过重金属盐在样品四周堆积,加强样品外周的电子
9、密度,衬托样品的形态和大小。(染色液:磷钨酸、醋酸双氧铀)(3)免疫电镜技术:是将免疫学方法与电子显微镜技术相结合,利用抗原与抗体特异结合的特性,在超微结构水平定位特异大分子的技术。A、包埋前法:先免疫标记,后包埋,制备超薄切片;包埋后法:先包埋,制备超薄切片,后免疫标记;冷冻超薄切片法:将标本直接切成超薄切片,进行免疫反应,电镜观察。B、推荐固定液:34%多聚甲醛+0.1%0.5%戊二醛;C、要求:免疫组化结果一定要好;固定液配制要新鲜;尽快处理标本。21、在样本制备过程中为什么要进行半薄切片定位?(1)选取超薄切片的部位,超薄切片的面积一般要小于0.5mm2,要经过半薄切片来选取有意义的部
10、位。(2)对同一部位进行光、电镜对比观察,在较大范围内了解组织结构、病变部位和病理性质,有利于更确切的认识超薄切片中的结构及其相互关系。22、要了解细胞内部的超微结构变化,选择哪种类型的电镜,为保证生物样品良好的超微结构,在样本取材及固定时应注意什么?了解细胞内部的超微结构变化应选择透射电子显微镜(TEM)为保证良好的超微结构,在样本取材及固定时应注意做到快、小、轻、冷。(1)快:在1分钟内固定组织,尽可能保持其活体状态,因为瞬间的拖延都会导致细胞超微结构的变化。(2)小:组织块必须切成1mm3的小块,组织块过大其中央得不到及时固定会发生细胞自溶现象。(3)轻:不要牵拉、锯、挤压组织。要用锐利
11、的刀片,避免细胞受到损伤。(4)冷:低温操作,49保存,降低酶的活性,避免组织发生自溶。23、在透射电镜样本取材时,样本不可大于1mm3,并在1分钟以内完成固定。请问如果组织块过大会出现什么后果?没有及时固定的组织电镜下会出现何种改变?由于电镜固定液戊二醛对组织的穿透能力较弱,如果组织块过大会造成组织中心得不到及时固定,在电镜下没有得到及时固定组织细胞的细胞器会发生变性,特别是对缺血乏氧十分敏感的线粒体会出现肿胀和空泡变性等改变。24、如何描述一张电镜图片。(1)细胞整体:大小、形状、细胞膜和突起以及细胞间的连接(2)细胞核:大小、形状、核仁、染色质等(3)细胞质:各种细胞器的数量、分布、形状
12、等(Mit、RER、Ri、Ly、Gol.)25、TEM在医学领域的应用(1)细胞器、组织器官的超微结构(2)原核细胞、病毒的超微结构(3)超微病理变化(病理诊断)(4)细胞成分定位(5)生物材料复合体26、扫描电镜的样品制备过程(6步):取材(充分暴露并保护观察面:5x5mm);清洗(用生理盐水仔细漂洗观察面);固定(2.5%戊二醛和1%锇酸固定);脱水(丙酮逐级脱水,醋酸异戊酯置换);干燥:(临界点干燥);镀膜(离子溅射镀膜或真空镀膜)27、扫描电子显微镜在生物医学领域的应用:(1)血细胞、细菌、培养细胞的整体形态、表面突起和细胞间相互关系(2)消化道,呼吸道,血管等空腔组织的表面结构(3)
13、植物、昆虫等(4)生物材料复合体28、扫描电镜用于观察组织表面结构,因此取材时必需要充分暴露组织表面结构,请问常用的方法和注意事项有哪些?在样品取材时必须保护好并充分暴露观察面,避免损伤要观察的部位,易卷曲的样品,如气管、胃、肠粘膜可固定在滤纸上展平,要将表面的血液、粘液用生理盐水或缓冲液仔细漂洗干净,对于粘稠附着物还可以使用酶消化法。29、请从成像信号、样品制备、图象特点和应用几方面对TEM和SEM做以比较。类别TMESEM分辨率0.1nm0.6nm放大100万倍80万倍成像信号透射电子信号利用二次电子信号成像样品制备制成超薄切片等,制备过程复杂方法较简单,标本可大而厚图像特点二维结构,平面
14、图像三维结构图像,立体感强应用观察组织细胞内部的超微结观察样品表面及其断面立体构形貌二、细胞化学技术1、原位观察化学成分,提供的信息:(1)推测化学成分(大分子)的可能性(2)观察生理、病理状态下大分子动态变化指示大分子所在的特异细胞,观察细胞在组织的分布2、细胞化学技术:在保持细胞结构完整的条件下,借助细胞中的化学反应在细胞原位确定化学成分的分布及这些成分在细胞活动中的动态变化的技术,用以阐明细胞化学成分、结构和功能的关系。包括酶细胞化学技术、免疫细胞化学技术、放射自显影技术和原位杂交等。3、细胞化学技术特点:(1)原位(保持组织细胞的天然结构)(2)细胞化学反应及可见性(3)细胞化学反应的
15、观察:显微镜、流式4、细胞化学技术主要包括:(1)酶细胞化学技术:1.酶+底物反应;2.显色反应。显示酶在细胞内的分布及酶活性强弱。(2)免疫细胞化学技术:1.抗原+抗体反应;2.显色反应(3)放射自显影:1.放射性同位素衰变和射线的释放反应;2.感光(4)原位杂交技术等:1.核酸杂交反应;2.显色反应5、细胞化学技术通用流程:(1)组织细胞固定(保持原位)(2)石蜡包埋或冷冻(3)切片(利于反应,利于观察)(4)化学反应(5)显色反应6、免疫组织化学、免疫细胞化学技术(IHC):把组织细胞中的特异分子作为抗原,利用抗原抗体特异性结合的特点,用显微镜下可见的标记物直接或间接标记抗体或抗原抗体复
16、合物,使之在显微镜下可见,从而间接地显示抗原,达到在细胞或细胞器水平定位特异分子的目的。特异蛋白质定位:1.大分子的组织和细胞水平定位2.细胞内大分子的固定亚细胞定位3.细胞内大分子的转运或移位4.细胞内定位固定的大分子的动态变化5.细胞内大分子的共定位7、免疫细胞化学技术原理一、抗原:凡能刺激机体产生抗体并能与抗体特异结合的物质称为抗原,酶、受体、抗体二、抗体:结合抗原、结合抗种属抗体:识别一抗的种属特异性,并能够因此结合一抗,称为二抗三、免疫反应的特异性四、免疫细胞化学反应:(1)直接法;(2)间接法优点:避免标记造成对抗体与抗原结合的影响;信号增强;标记物多。五、标记物的显色反应(光镜和
17、电镜):(1)免疫荧光;(2)免疫酶;(3)免疫胶体金颗粒8、免疫荧光技术(IF):免疫荧光技术将荧光素作为标记物使组织细胞中形成的抗原抗体复合物在荧光显微镜下可见,从而显示抗原物质的定位。(培养细胞、动物组织)9、免疫荧光技术优点:(1)双重或多重标记,同时比较不同分子的位置及量的关系。(2)双重或多重标记,同时染色细胞器和感兴趣分子,可显示分子的亚细胞定位信息。(3)根据荧光素的强度,进行半定量分析。10、免疫酶技术:是将酶作为标记物使组织细胞中形成的抗原抗体复合物得到标记,再通过酶细胞化学反应产生显微镜下可见的显色物质,间接显示抗原物质的定位。普通光学显微镜即可观察。(动物组织、多种类型
18、细胞)常用标记酶:辣根过氧化物酶(HRP);碱性磷酸酶(AKP)11、亲和物质:具有多价能力的物质,与另一种亲和物质有高度亲和力,又能与抗体、蛋白质及各种标记物(尤其是酶)结合。12、生物素系统标记酶和抗体:(1)LSAB法:标记链球菌亲和素-生物素技术特异性抗体(一抗)先与组织细胞中的抗原结合生物素化抗体(二抗)再与一抗结合链球菌亲和素联接的过氧化物酶与生物素化抗体结合(2)ABC法:亲和素-生物素-酶复合物技术亲和素与生物素偶联的过氧化物酶组合成亲和素生物素酶复合物特异性抗体(一抗)先与组织细胞中的抗原结合生物素化抗体(二抗)再与一抗结合复合物与生物素化抗体结合13、免疫亲和技术优点:(1
19、)观察定位信息时,可观察感兴趣分子在细胞中的相对定位,也可观察分子在组织中的细胞特异性;(在组织样品中应用较多)(2)同时观察阳性信号和阴性信号;(3)反应后标本材料可长期保存。14、免疫胶体金技术:以电镜下可见的胶体金作为抗体标记物,间接显示组织细胞中特异分子的技术。(培养细胞)15、原位杂交技术(ISH):利用核苷酸碱基配对原理,用含有特异序列、经过标记的核酸单链即探针,在适宜条件下与组织细胞中的互补核酸单链即靶核酸发生杂交,通过检测标记探针,从而在细胞原位显示特异的DNA或RNA分子。变性:双链DNA分子在一些因素作用下两条链解离的过程称为变性复性:变性的两条互补DNA单链在适当条件下重
20、新缔合成双链的过程称为复性杂交探针:经过标记的核酸单链,其序列已知,或序列未知但已知其针对何靶分子。主要有cDNA、RNA和寡核苷酸三种。盎靶分子:指所要探测的核酸分子或核苷酸序列严格度:在某些条件下,探针可以与含不相配碱基的核酸序列结合而形成不稳定的杂交体。决定探针是否与含不相配碱基的核酸序列结合的条件称为严格度。高严格度条件下,碱基完全互补的双链才可形成杂交体。低严格度条件下,碱基对不完全互补的双链也能形成杂交体。16、原位杂交技术中如何应用了其他几种细胞化学技术?为什么说原位杂交技术是分子生物学和细胞化学技术的结合?标记的核酸探针与组织细胞中靶核酸分子按碱基配对的原则结合形成杂交体这是分
21、子生物学技术检测杂交体的存在可选用放射自显影或免疫细胞化学技术,如探针标记的是同位素,则选用放射自显影技术;如用地高辛标记核酸探针,使用碱性磷酸酶联结的小鼠抗地高辛抗体与探针结合,这里应用的是免疫细胞化学技术为了使酶可见,再加入其底物四唑氮蓝和吲哚酚,最终形成蓝紫色物质,这就是酶细胞化学技术,最终产生的蓝紫色物质-酶的定位-探针-靶核酸17、原位杂交技术常常组合了其他组织化学技术。简述如果你使用其中一种组合你需要准备。(1)选择地高辛标记的特异性CDNA探针-用AKP标记的小鼠抗地高辛抗体与杂交体结合-在孵育液中加入AKP的反应与捕捉底物对NCIP/NBT-得到蓝紫色的沉淀。(2)使用光学显微
22、镜观察蓝紫色沉淀即可间接定位杂交体,验证靶核苷酸的存在。18、如果你的研究课题分别涉及到在培养细胞或组织切片上定位蛋白质的要求,你如何考虑对技术的选择。(1)组织和细胞水平定位:IHC+光镜(酶标)/荧光显微镜(荧光标)/共聚焦(荧光标)(2)亚细胞定位:IHC+电镜(胶体金标)荧光+共聚焦(3)细胞内大分子的转运或移位translocation实验处理+综合1/2/5(4)细胞内定位固定的大分子含量的动态变化dynamics实验处理+综合1/2/5(5)细胞内大分子的共定位co-localization免疫荧光+confocal共定位(转染+重组tag+免疫荧光;或转染+重组GFP);也可以
23、用连续切片也可用大小金标+电镜19、简述如何应用细胞生物学技术初步阐明一个新的蛋白质的定位和功能。(1)定位如上题(2)弄清了定位、动态及共定位之后,需要了解功能还可以了解生成:DNA水平:SouthernblotDNAchip;qPCRmRNA水平:northernblotq-rtPCR(不过这些好像都是分生的内容)(3)功能:作为酶的功能、作为递质的功能、作为转录因子的功能找出了相互作用的蛋白,再从这associate着手确定新蛋白的功能。:比如新蛋白是否影响已知蛋白的生成和降解,是否影响已知蛋白行使功能降解/转运。Plus寻找互相作用方式的分生方法cDNA文库+酵母双杂交,蛋白质体外结合
24、实验(pull-downassay)+质谱分析,CoIP首先按蛋白质组学的方法做蛋白指纹图谱比对数据库寻找类似结构域,对它的功能进行合理的预测;然后根据预测的结果设计实验设计实验大体可以由“过表达会怎样“”敲除会怎样”两个角度出发,从宏观上观察细胞的形状、功能改变,从微观上定性定量上下游分子量的改变,最后在活体环境中验证。20、定量检测一批光镜切片上含有某种蛋白质的细胞的数目首先对切片上的全部细胞进行针对目的蛋白的荧光探针特异性标记(荧光染料,荧光标记抗体,外源导入荧光蛋白),同时对细胞行核复染。再以荧光显微镜或激光扫描共聚焦显微镜观察。三、离心技术1、离心技术(Centrifuge):利用溶
25、液中颗粒密度、大小等特性,用旋转产生的离心力使不同特性颗粒从溶液中分离并沉降,从而达到分离、浓缩、提纯和鉴定的目的,称为离心技术。2、决定离心行为的主要因素:(1)颗粒的属性:颗粒大小、密度等特性(2)溶液和设备:离心机、离心介质“三要素”:颗粒的沉降系数、相对离心力(RCF)离心时间3、沉降系数:颗粒在单位离心力的作用下的移动速度。决定沉降速度的因素:颗粒大小;颗粒密度;溶液介质密度和粘度4、相对离心力:离心分离时,作用在悬浮颗粒上的力与其地球重力(平时质量)的比值。5、离心的适用范围:(1)分离细胞或其他的悬浮颗粒;(2)从组织或细胞匀浆中分离细胞器;(3)分离病毒和大分子,包括DNA、R
26、NA、蛋白质和脂类。6、差速离心法:通过一系列递增速度的离心,将不同大小颗粒分离。先在低速离心条件下把大的颗粒沉降到管底,其它颗粒留在上清液中;然后以较高的速度离心,把较大的颗粒沉淀于管底。这样依次把不同大小的颗粒逐级分离。用途:分离大小相差悬殊的细胞和细胞结构成分特点:介质密度均一;速度由低向高,逐级离心;操作简单;分离纯度不高。7、密度梯度离心法理想的溶液介质(蔗糖):形成的溶液密度范围大;粘度低;对细胞成分损伤小;离心分离后容易去除;浓度容易测定;便宜。(1)移动区带离心法原理:用梯度蔗糖或甘油作为介质,将要分离的样品放在介质表面,形成一个狭带,然后超速离心,使不同大小的颗粒以不同的速度
27、向管底方向移动,形成一系列区带,从管底小孔中分次收集各种颗粒成分。用途:分离有大小和密度差异的细胞或细胞器。特点:介质为密度梯度溶液,且密度较低,介质的最大密度应小于被分离生物颗粒的最小密度(rprm);必须注意离心时间(t),不能使所有颗粒都沉到管底。(2)等密度离心法原理:离心时采用包括各种颗粒密度范围的梯度介质,被分离颗粒达到与其相同的密度介质时不再移动,形成一系列区带,然后从管底收集。用途:分离密度不等的颗粒,适用于病毒、DNA、RNA、蛋白质等。特点:介质密度较高,陡度大,介质的最高密度应大于被分离组分的最大密度(rprm)。所需的力场通常比速率沉降法大10100倍,往往需要高速或超
28、速离心。8、细胞结构成分的分离:(1)细胞沉淀(2)细胞破碎(渗透压、超声波、机械力研磨或剪切、反复冻融)(3)细胞结构成分的分离离心技术(差速分离、梯度纯化)(4)分离细胞器的鉴定和评价(形态:显微镜;生化分析:细胞器标志酶)四、细胞培养1、细胞培养:从生物体内取出组织或细胞,在体外模拟体内生理环境,在无菌、适当温度和一定营养条件下,对这些组织或细胞进行孵育培养,使之生存和生长,并保持一定的结构和功能的技术。2、简述培养细胞和体内细胞的异同。培养细胞体内细胞无神经体液调节机体神经体液调节无其他类型细胞影响多种类型细胞相互影响细胞的许多外来信号被切断基因表达受到外来信号调节1特定分化基因表达减
29、弱或停止增殖过程中不断发生着分化2增殖活动维持(由一般到特殊)(由特殊到一般)与体内细胞结构和功能的差异高度特化的结构和功能特征:失去原有形态,分化特性减弱,形态特征:高度特化;细胞更新,干细胞来源的和功能趋于单一;一定代数后衰老死亡,或细胞分化发生转化,获不死性而成为能无限传代;对营养要求高;大部分贴壁生长3、培养细胞的生存条件:(1)高要求的营养物质:A、合成培养基:提供基本的、与体内相同的小分子营养物质,如:葡萄糖、氨基酸、无机离子、维生素、微量元素。B、添加物:血清(5-10%),提供多种生长因子等活性物质(大分子物质)(2)严格的环境条件:温度(35-37度);气体(5%CO2);酸
30、碱度(pH7.2-7.4酚红指示);支持物:玻璃、塑料、滋养层4、培养细胞的类型及其特点:(1)贴附型:贴附于支持物表面,单层生长;失去在体内原有形态;反映胚层起源情况;有接触抑制特征。大多数细胞属此型(2)悬浮型:不贴附在支持物表面,以悬浮状态生长;单个分散或成团。各种源自血液的细胞、骨髓、脾细胞。5、传代:培养容器中细胞增殖至一定密度后,生存空间及营养物质缺乏,需按一定比例分离,接种至新的培养容器并更新培养液的过程。6、生命期:细胞在体外培养中持续增殖和存活的时间。一般可分为原代培养期、传代期和衰退期。(1)原代培养:从体内取出细胞接种后到第一次传代。一般维持14周。(2)传代期:原代细胞
31、一经传代就成为细胞系(cellline),进入传代期。持续时间最长。一般传1050代(Hayflick极限)。(3)衰退期:细胞增殖缓慢、停止至死亡。7、Hayflick极限:体外培养细胞的增殖能力不是无限的,传代次数有一定的界限。8、细胞冻存(液氮罐):目的:(1)保存细胞株(2)保持尽量少的传代次数和较均一的细胞状态方法:培养基中加入保护剂:二甲基亚砜(DMSO);缓慢地冻结;贮存在-1809以下低温。(原理:在不加保护条件下直接冻存细胞时,细胞内和外环境中的水会形成结晶,影响细胞功能甚至死亡,冻存失败。)9、细胞复苏(慢冻速融):将冻存于液氮中的冻存管取出,迅速放入37-409水浴。1m
32、in内融化,去除冻存保护液,更换正常培养基。(胞外结晶很快融化,减少水分渗入细胞)10、培养细胞的优点及局限优点:(1)人工培养条件易于改变并能严格控制,便于研究观察各种因素对细胞的结构、功能和各种生命活动规律的影响;(2)细胞在体外培养环境中可以长期存活和传代,因此可以比较经济地、大量地提供在同一时期、条件相同、性状相似的细胞作为实验样本。局限性:(1)主要是细胞离体以后失去与体内环境的密切联系,失去了神经体液的调节和不同细胞间的相互作用,分化能力降低,增殖活动维持,细胞性状由特殊趋向一般,其形态功能与体内细胞存在差异(2)对环境适应力差;容易污染;对营养要求高;大部分需要附着载体生长11、
33、如果是培养细胞,细胞数量一定要达到多少?细胞数量一定要达到1x10-7五、细胞工程1、细胞工程:运用现代的细胞生物学、遗传学、分子生物学等手段,根据实践需要,对细胞、细胞器、生物大分子进行各种操作,重组/重塑细胞的结构、成分组成或特性,以达到研究基因功能、蛋白质和细胞性状,或获得特定的大分子、细胞或生物体的目的。(核酸导入技术、细胞重编程技术、基因编辑技术)2、核酸导入:将特异的核酸(DNA或RNA)导入到真核细胞中3、核酸导入方法分类:(1)化学方法:构建非病毒载体(脂质体载体、DEAE-葡聚糖法、磷酸钙法)(2)生物学方法:构建病毒载体(逆转录病毒、腺病毒、慢病毒)(3)物理方法:DNA直
34、接注射、颗粒轰击技术4、脂质体法:阳离子脂质体表面带正电荷,能与核酸的磷酸根通过静电作用将DNA分子包裹入内,形成DNA脂复合体,通过膜的融合或细胞的内吞作用进入细胞5、病毒感染:病毒进入宿主细胞复制周期:吸附、侵入、增殖、成熟(装配)、裂解(释放)。6、电转法:应用短暂的高压电流脉冲使多种哺乳动物与植物细胞质膜形成纳米级微孔,DNA通过这些微孔关闭时膜成分的再分布而直接进入细胞质。7、核酸导入方法比较类别脂质体法病毒法电转法转染方式稳定转染稳定/瞬时转染稳定转染瞬时转染瞬时转染靶细胞所有细胞宿主细胞所有细胞特点使用方法简单用于难转染的细胞,转染效率高可携带大片段DNA需考虑安全因素!但致死率
35、咼没有免疫原性转染效率高但有细胞毒性8、细胞重编程:细胞核移植;转录因子(在特定条件下,如:存在外源转录因子、mRNA、蛋白质,和/或化学小分子,将分化的细胞逆转成为具有全能性的细胞类型的技术。)9、细胞重编程基本步骤:载体构建、质粒转染、感染MEF、细胞培养、克隆鉴定、细胞冻存。10、CRISPR技术的原理和应用原理:CRISPR/Cas9是细菌和古细菌在长期演化过程中形成的一种适应性免疫防御,可用来对抗入侵的病毒及外源DNA。crRNA(CRISPR-derivedRNA)通过碱基配对与tracrRNA(trans-activatingRNA)结合形成tracrRNA/crRNA复合物,此
36、复合物引导核酸酶Cas9蛋白与crRNA配对的序列靶位点剪切双链DNA。应用:对基因进行定点的精确编辑、基因激活、疾病模型构建、基因治疗六、流式细胞术1、流式细胞术(FCM):是以流式细胞仪为检测手段的一项能快速、精确的对单个细胞理化特性进行多参数定量分析和分选的技术。(分析型、分选型)2、流式细胞术光信号检测(1)散射光信号:与标记荧光素无关,是细胞的固有参数。前向散射光(FSC);侧向散射光(SSC).(2)荧光信号:自发荧光(细胞色素因子、核黄素);微弱特异荧光:标记的荧光素分子发出的荧光,比自发荧光强很多倍。3、前向散射光:FSC信号方向与激光束平行,偏离度一般在1-6度范围内,亦称小
37、角度散射光,主要反映被测细胞的体积大小和活力。4、侧向散射光:SSC方向与激光束和液流形成的平面相垂直,亦称90度散射光,其信号强度反映细胞内部颗粒度和精细结构的变化。5、标记抗体的荧光素荧光素分子激发光波长(nm)发射光波长(nm)中文名FITC490520异硫氰酸荧光素PE488575藻红蛋白PerCP490675多甲藻叶绿素蛋白APC650660别藻青蛋白6、核酸荧光染料(1)PI(碘化丙啶535,623:可选择性的插入核酸双螺旋碱基对中。常用于DNA分析,需要用RNase处理细胞排除RNA对DNA荧光定量的影响;PI不能透过活细胞膜,常用于鉴定死细胞。(2)DAPI(358,456:可
38、以非嵌入方式与DNA链上的A-T碱基对特异性结合。变异系数明显小于其他染料,一种理想的DNA定量染料。(3)PY(派若宁560,573:RNA染料,能进入活细胞。(4)A0(吖啶橙509,525:DNA、RNA染料,染色后DNA呈黄绿色荧光,RNA呈橙黄色荧光,可进行DNA/RNA双参数分析。7、FCM的数据存储方式:流式细胞术采用ListMode方式存储数据。即用表格的方式将每一个被测细胞的众多原始测量数据全部记录下来,成为一个数据文件。8、FCM的显示方式:(1)单参数数据显示:以分布直方图来显示,横轴为该参数测量强度相对值,单位是道数。强度分布可以是线性的,也可以是对数的。纵轴一般是细胞
39、数或细胞出现的频数。(2)双参数数据显示:细胞双参数测定不仅能提供二个参数各自与细胞数量的关系,更重要的是获得了这二参数之间的相关关系,其中包含了更多的生物学信息。1)二维散点图:在二维图上,X轴代表第一个测量参数,丫轴代表第二个测量参数。每个点代表一个细胞.2)等高线图:在散点图的基础上,用等高线来表示细胞数,在一条等高线上细胞数相同,不同的等高线上细胞数不同。3)二维密度图:在散点图的基础上,用不同的颜色的点代表该点处不同的细胞数。4)假三维图:纵轴与横轴分别代表被测细胞的两个测量参数,Z轴为细胞数。(3)三参数及多参数数据的显示:三维坐标图:X、丫、z轴分别代表一测量参数。用若干个单参数
40、直方图及双参数图组合来显示数据。选取感兴趣的参数范围,调出该范围内细胞群体的其他参数即“设门”分析。可以是单参数设门,也可以是双参数设门。单参数设门调出双参数显示简称“一调二。”不难理解也有“一调一”和“二调一”和“二调二”等。9、FCM设门与数据分析(1)H(Gate,简写G)是流式细胞术中的一个重要术语,FCM数据分析过程实际上就是选门和设门的过程。(2)R(Region,区域)。门可以是单一区域(G=R1),也可以是几个区域组合在一起:G=R1andR2;G=R1orR2;G=R1notR2。10、流式细胞术操作流程:(1)培养细胞,血液骨髓,新鲜组织(2)单细胞悬液制备(3)荧光染色(
41、4)上机检测(表型测定、细胞分选)11、样品制备涉及到的:(1)制备单个分散细胞悬液的技术(2)选择性分离细胞亚群的技术(3)荧光细胞化学染色的技术12、FCM技术中常用的制备单细胞悬液的方法及各有哪些特点?方法:(1)单层培养细胞、血液、各种脱落细胞等样品,标本经过简单的制备悬液,离心分离处理,就可以得到分散较好的单个细胞悬液,是理想的流式细胞术检测对象。(2)对于不同组织来源的实体组织标本,采用酶消化法、机械法和化学试剂处理法来分散细胞。特点:(1)机械法往往常成严重的细胞损伤,制成的细胞悬液中细胞碎片、团块多,细胞产量低。需采用适当的方式去除影响FCM结果的细胞碎片与团块。如用低速离心去
42、碎片,用尼龙网过滤团块等,也可利用数据处理的方法排除团块和碎片的干扰。酶学法对实体组织的分散效果较理想,但会对所测化学成份造成不良影响。(3)化学试剂处理法:用化学法细胞存活率低、细胞产额低,细胞碎片和聚集量不稳定。总之FCM所测细胞是单个分散状态;要求细胞团块,细胞碎片尽可能少;细胞的活性不受损害,以保证下一步的荧光染色处理不受影响。所以在实际应用时,一个理想的单个细胞分散的细胞悬液样品的制备往往是两种或多种方法的结合使用,才能获得理想的细胞悬液。13、酶消化法应注意哪些条件:(1)配制酶溶液试剂时要兼顾酶反应的适宜条件与活细胞要求的生理环境,其中包括渗透压,pH值(缓冲液),各种离子浓度,
43、酶激动剂等。(2)根据标本种类和实验要求选择适宜的酶及浓度:胃蛋白酶0.5%;胶原酶0.1%;胰蛋白酶0.25%(含1-10pg/mlDNase)。(3)作用温度作用时间与酶的用量:一般选择379,15-20分钟,每克组织10-15ml。具体操作时根据组织类型与选用的酶进行调整。一次消化未彻底可反复数次,直至组织块完全消失。终止酶消化反应的方法和措施:加酶抑制剂(如大豆胰蛋白酶抑制剂等);降低酶反应温度,将细胞悬液管移至冰水浴中;反复离心漂洗,移去酶消化液,彻底终止酶消化过程等。对于蛋白酶,加入少量血清以减弱酶对细胞的不利影响。14、荧光标记物:荧光染料、荧光素偶联抗体、荧光蛋白。通过荧光染色
44、,FCM可检测下列细胞成分:(1)表面标记物(2)胞浆标记物(3)核内标记物15、荧光细胞化学的2个评价标准:(1)特异性:所用荧光染料与所感兴趣的细胞成份的特异性结合。(2)化学定量关系:在相同的条件下,标记的荧光强度与被标记的生化成份的含量或活性之间有严格的化学定量关系。16、对照的设置:(1)空白对照:细胞内物质自身也发出荧光,能被FCM灵敏的检测到,这种未染色的细胞自身发出的一些荧光称为自发荧光。(2)阳性对照:设置阳性对照是为了检测荧光抗体是否有效,并不是每次分析时都必须设置(3)单标对照:两色或多色实验时须设置单标对照,用于补偿的调节;单标实验时不需要。17、光谱重叠:目前使用的各
45、种荧光染料都是宽发射谱性质,虽然它们之间各自发射的峰值各不相同,但发射谱范围有一定的重叠,因而少量的荧光信号会被另一通道检测到的现象。18、FCM荧光补偿:因为荧光光谱彼此之间有重叠,为排除多信号相互之间的干扰,利用电子技术或计算机软件等方法将串入相邻荧光通道的信号加以扣除的技术。19、叙述层流及其在FCM中的应用.层流是流体的一种流动状态。若流体在管内流动时,其质点沿着与管轴平行的方向作平滑直线运动,此种流动称为层流。在管道中液体稳定流动时是以管道的轴线为中心分层流动的。中心轴处液流速度最快,中心轴外流速递减。层流只出现在雷诺数Re(Re=dpV/n)2300的情况中,即流体密度p、平均流速
46、V和管径直径d都较小,或流体粘度n很大的情况中。流式细胞术中所用的流动室就是根据层流技术设计的。它采用液体动力学分层鞘流技术,以鞘液包围在样品流周围,保证样品中的每一细胞都沿流动室的中心轴运动。从而实现每一细胞以相同的速度、相同方向、相同的轨迹逐个依次通过检测区,流动室也可称为单细胞流发生器。20、流式细胞术的应用(1)检测细胞周期:处于不同细胞周期的细胞DNA含量不同,G0/G1期细胞含有二倍体量的DNA,G2/M期细胞含有四倍体量的DNA,而S期细胞DNA含量处于二倍体和四倍体量之间。DNA荧光染料能与DNA结合,DNA含量的多少与荧光染料的结合量成正比,荧光强度反应了DNA吸收荧光分子的
47、多少。(PI标记法)(2)检测细胞凋亡:1)凋亡细胞核小体崩解,DNA含量减少,加之由于DNA的降解,与荧光染料的结合减少,因此DNA染料的着色能力下降,荧光强度降低,表现在G1峰前出现亚二倍体峰,即亚G1峰(凋亡峰)。2)AnnexinV/PI双染法:早期凋亡时,PS外翻到胞外侧。AnnexinV是一种Ca2+依赖性的对PS有高度亲和力的磷脂结合蛋白,可作为探针识别膜表面是否有PS,从而识别凋亡细胞。PI常用于鉴别死细胞。凋亡细胞的细胞膜仍然是完整的,所以PI不能进入早期凋亡细胞核内。(3)免疫细胞亚型检测:CD分子是细胞(包括白细胞、红细胞、血小板、内皮细胞等)在分化为不同谱系(linea
48、ge)、不同阶段以及活化过程中或疾病状态下出现或消失的细胞表面标记。(4)检测细胞因子:细胞因子(cytokine)是一类能在细胞间传递信息、具有免疫调节和效应等功能的蛋白质或小分子多肽。根据功能可以分为6大类:白细胞介素、干扰素、集落刺激因子、肿瘤坏死因子、生长因子和趋化因子。(ELISA、流式)(5)流式分选:免疫细胞亚群分选:GFP阳性稳转株分选;干细胞分选(造血干细胞分选、肿瘤干细胞分选、侧群细胞分选)21、侧群细胞(SP细胞):广泛分布于胚胎、成体组织以及肿瘤细胞系中,具有自我更新和多向分化潜能,因此代表了一种新的干细胞类型,SP特征可能作为干细胞功能性标记。22、侧群细胞产生的分子
49、机制:(1)干细胞表面高表达ABC(ATPbindcassette)运输蛋白Bcrpl/ABCG2,能将Hoechst333452泵出细胞外,所以SP细胞染色较低,而其他细胞没有这种能力。(2)转运蛋白的抑制剂维拉帕米,能够阻断SP细胞将细胞内的Hoechst33342泵出细胞外,可以作为SP检测的对照组。23、简要叙述下列图形这是一张显示细胞DNA含量的单参数分布直方图,使用PI对细胞DNA染色。PI染色剂插入DNA双螺旋结构之间。其荧光强度与DNA分子量成正比横轴以PI荧光强度的相对值代表DNA含量,纵轴代表细胞数目第一峰代表2倍体细胞。,细胞数目最多,荧光染料的强度相对值约为230。代表
50、G0G1期细胞第二峰代表4倍体细胞。荧光染料强度相对值约为460。代表G2M期细胞两峰之间为S期细胞,其荧光染料强度及其代表的DNA含量逐渐增加第一峰之前为亚二倍体细胞或细胞碎片第二峰之后为细胞团块或非特异性染色DNA含量分布直方图可用于细胞周期DNA含量变化的分析这是一张同时显示细胞样本FITC及PI荧光强度的二维双参数散点图。横轴为FITC荧光强度相对值的对数。当细胞发生凋亡时,细胞膜磷脂双分子层中PS(磷酸酰丝氨酸)分子外翻,可被annexin-V结合。使用FITC标记annexin-V即可定量显示细胞膜表面PS分子量。纵轴为PI荧光强度的相对值,由于PI染料可插入DNA双螺旋结构之间,
51、其荧光强度与细胞DNA分子量成正比。当胞膜完整时,PI不能进入核内,此时细胞拒染。LL:PI及FITC双阴性细胞。为正常细胞。LR:FITC阳性,PI阴性。即磷脂双分子层PS外翻而胞膜完整,为凋亡早期的细胞。UR:PIFITC双阳性。即磷脂双分子层PS外翻而且细胞膜通透性改变,PI进入核内,DNA着色,为凋亡晚期细胞。UL:PI阳性,FITC阴性。为坏死细胞,其胞膜崩解,仅余裸核,仅PI着色。该方法可用于研究理化因素对细胞凋亡的影响。24、定量检测几十万个分散的细胞的DNA含量应用流式细胞检测技术(FCM)(1收集单细胞悬液(1X106个)缓慢加入1ml预冷的70%乙醇于49固定过夜或-209
52、长期固定。(2离心收集细胞,再以1mlPBS彻底洗去乙醇;(3)去上清后加入染色液(包含50ug/mlPI,100ug/mlRNaseA,0.2%TritonX-100),37C染色30min后上机检测。(4)DNA荧光染料能与DNA结合,DNA含量的多少与荧光染料的结合量成正比,荧光强度反应了DNA吸收荧光分子的多少。通过流式检测就能反映细胞内DNA的含量。七、观察和分析分子间相互作用的技术1、细胞信号通路的基本组成:(1)细胞外信号分子(2)受体蛋白(3)细胞内信号转导分子(4)效应蛋白(5)细胞反应。2、观察和分析分子间相互作用的技术(1)蛋白质-蛋白质:酵母双杂交技术、GSTpull-
53、down实验、免疫荧光(IF)、免疫共沉淀技术(Co-IP)、荧光共振能量转移(FRET)(2)蛋白质-核酸:电泳迁移率实验(EMSA)染色质免疫沉淀(ChIP)报告基因assay3、酵母双杂交系统原理:酵母转录因子GAL4在结构上是组件式的,其中有DNA结合功能域(DNA-BD)和转录激活结构域(DNA-AD)这两个结合域将它们分开时仍分别具有功能,但不能激活转录,只有当被分开的两者通过适当的途径在空间上较为接近时,才能重新呈现完整的GAL4转录因子活性,并可激活上游激活序列的启动子,使启动子下游基因得到转录。在酵母双杂交系统中“诱饵”蛋白X克隆至DNA-BD载体中,表达DNA-BD/X融合
54、蛋白;待测试蛋白丫克隆至AD载体中,表达AD/Y融合蛋白。一旦X与丫蛋白间有相互作用,则DNA-BD和AD也随之被牵拉靠近,恢复行使功能,激活报告重组体中LacZ和HIS3基因的表达。4、GSTpull-down实验是一个行之有效的验证酵母双杂交系统的体外试验技术。其基本原理是将靶蛋白-GST融合蛋白固化在谷胱甘肽亲和树脂上,充当一种“诱饵蛋白”当目的蛋白溶液过柱,可从中捕获与之相互作用的“捕获蛋白”(目的蛋白),洗脱结合物后通过SDS电泳分析,从而证实两种蛋白间的相互作用或筛选相应的目的蛋白,“诱饵蛋白”和“捕获蛋白”均可通过细胞裂解物、纯化的蛋白以及体外翻译等方法获得。5、免疫共沉淀技术(
55、co-IP):以抗原和抗体的专一性作用为基础,用一种特定蛋白质的抗体与总蛋白质样品溶液混合,将抗原-抗体复合物沉淀下来,在此过程中与抗原相互作用的蛋白质也共同沉淀下来。co-IP操作流程:(1)细胞裂解(2)沉淀抗体:孵育得到沉淀复合物(3)蛋白A/G-琼脂糖珠:洗脱(4)蛋白质SAS电泳:分离蛋白质(5)免疫印迹(6)检测抗体6、荧光共振能量转移(FRET):荧光能量共振转移是距离很近的两个荧光分子间产生的一种能量转移现象。当供体荧光分子(D)的发射光谱与受体荧光分子(A)的吸收光谱重叠,并且两个分子的距离在10nm范围以内时,就会发生能量转移,使得供体的荧光强度比它单独存在时要低的多(荧光
56、猝灭),而受体发射的荧光却大大增强(敏化荧光)。检测FRET的效率,代表分子之间的距离,指示分子间是否有相互作用。7、FRET的条件:(1)D/A距离:1-10nm(2)D的Emi光谱和A的Exi光谱必须有显著的重迭,一般大于30%.8、常用的荧光分子对:FITC-TRITC;Cy3-Cy5;EGFP-Cy3;CFP-YFP;EGFP-YFP9、检测FRET效率的方法:(1)敏化荧光:共振能量转移后,受体发射能量的增强(2)受体光漂白:受体漂白后,由于共振能量不能转移,供体能量的增强(3)供体荧光时长的缩短10、凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA):也称GelShift,是一种研究核酸结合蛋白
57、和其相关的核酸结合序列相互作用的技术。将目的蛋白与同位素标记的核酸分子共同孵育,结合的复合物进行电泳时较未结合的核酸分子移动得更慢。在实验组与对照组反应物数量相同的条件下,还可以根据复合物条带的浓淡对蛋白质核酸结合能力进行半定量分析。11、EMSA原理:(1)蛋白质:细胞核蛋白粗提物(2)探针标记DNA:32P标记的DNA(感兴趣蛋白质特异识别的已知序列)(3)1与2孵育(体外)(4)凝胶电泳分离(5)放射自显影结果判定:(1)游离探针和DNA-蛋白质复合物条带位置;(2)复合物条带强度12、染色质免疫沉淀技术(CHIP):研究体内DNA与蛋白质相互作用的方法。它的基本原理是在活细胞状态下固定
58、蛋白质-DNA复合物,并将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段,然后通过免疫学方法沉淀此复合体,特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,通过对目的片断的纯化与检测,从而获得蛋白质与DNA相互作用的信息。该技术主要应用:(1)组蛋白修饰研究(2)转录调控分析(3)药物开发研究(4)有丝分裂研究(5)DNA损失与凋亡分析13、ChIP实验流程:(1)甲醛交联,固定蛋白质-DNA复合物(2)超声或核酸酶将染色质水解为小的片段(3)蛋白质的抗体沉淀复合物(4)检测复合物中DNA的序列或结合的量14、负显性突变:对影响蛋白质功能的关键位点进行突变,所得突变体不仅丧失了原有功能,并且可以抑制内源性蛋白质
59、的功能。15、DNA微阵列(DNAmicroarray):是一种用于分子生物学和医学领域的高通量技术它由一系列成千上万个精微的DNA寡核苷酸点排列而成。它们被作为探针,在非常严格的条件下和一个叫做靶分子的cDNA或cRNA样本杂交。由于靶分子带有荧光标记,因此通过探针-靶分子的杂交,并根据杂交后荧光的有或无,强或弱,对靶分子中特定核酸序列的丰度进行检测。16、共激活因子:是一种蛋白,本身不能与DNA结合,但能够通过与具有DNA结合结构域的激活因子(或转录因子)结合来增强基因的表达。共激活因子可调节转录的许多其他过程,如转录的延长、终止、RNA剪接以及激活因子和共激活因子复合体的降解等。17共激
60、活因子(co-activator)或共抑制因子(co-repressor)往往就是通过调节组蛋白的翻译后修饰实现其功能的。这些修饰会影响组蛋白的构象,从而影响转录复合体与DNA的结合。组蛋白可以有多种翻译后修饰形式:磷酸化、乙酰化、泛素化、甲基化18、报告基因:是一种编码可被检测的蛋白质或酶的基因,也就是说,是一个其表达产物非常容易被鉴定的基因。把它的编码序列和基因表达调节序列相融合形成嵌合基因,或与其它目的基因相融合,在调控序列控制下进行表达,从而利用它的表达产物来标定目的基因的表达调控。19、报告基因来检测转录因子的活化:(1)绿色荧光蛋白(2)半乳糖苷酶(3)荧光素酶20、siRNA(s
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