《生物信息学》课程教学大纲

1、生物信息学实践教学大纲 一、课程基本信息1课程编号：1117004072课程类别：个性拓展类3课程性质：专业选修课程4学时/学分：8学时/0.5学分5先修课程：大学计算机基础，分子生物学6适用专业：生物工程二、课程目标及学生应达到的能力本课程设计是生物工程专业生物信息学课程的课内实验。生物信息学不仅是一门科学学科，更是一种重要的研究开发平台及工具。因此本实验课程的开展有助于锻炼学生应用数据库等信息资源解决实际生物学问题的能力。通过上机操作，强化学生在课堂上所学的理论知识，能够掌握常用生物信息学数据库的使用，掌握生物信息学常用的软件，可以对DNA或蛋白序列进行结构预测与功能分析，为后续解读实验结

2、果、分析生命现象所包含的深层原理提供帮助，能够有较强的软件操作能力，并为学生将来从事与生物信息学相关的科研学习与工作奠定基础。具体课程目标及能力要求如下：课程目标1：能够熟练运用数据库进行所需文件的检索、掌握特殊的关键词检索方法、下载所需数据等，具备通过数据库进行知识获取的能力；课程目标2：能够运用适合的软件及在线分析网站对序列进行比对、结构分析，进化树构建等常见生物信息分析；课程目标3：能够对分析结果进行正确解读，理解分析结果中所蕴含的深层生物学意义，并用于后续科研或试验的指导。课程目标对毕业要求的支撑关系毕业要求毕业要求指标点课程目标对毕业要求的支撑关系2.问题分析2.3能够应用生物工程专

3、业相关基础理论知识，并通过文献研究分析复杂生物工程问题，提出解决方案并获得有效结论。35.使用现代工具5.2能够使用生物工程专业常用的分析软件、生物信息分析软件等工具，对复杂生物工程问题进行预测和模拟，并理解其使用条件；1,2,3三、课程教学内容与学时分配知识单元知识点学时课程目标教学方式序号描述描述要求1数据库的检索使用GenBank数据库访问熟悉21，3过程指导特殊关键词检索掌握GBFF文件格式解读熟悉数据下载及FASTA格式文件保存掌握2序列分析核酸、蛋白序列检索掌握22，3过程指导序列基本性质分析掌握结构分析掌握3序列比对及系统发生树的构建下载物种序列掌握41,2,3过程指导多序列比对

4、掌握进化树构建掌握四、课程教学方法本课程为生物信息学的课内实验，已通过理论课程讲授了实验所涉及的理论知识及软件操作要点。每次课程由简单的理论知识回顾及上机操作两部分组成。上机以学生动手操作为主，老师指导及解疑为辅，实验内容设计可采用学生文献检索、老师指定特定基因等多种方式进行。五、课程的考核环节用上机操作和实验报告写作相结合的考核方法，实验设计，课堂操作表现占50%，实验报告成绩占50%，合计总成绩计入学生生物信息学课程的平时成绩中。成绩评定标准：（1）认真预习实验指导并书写实验预习报告；（2）实验态度认真，遵守实验室管理规定，操作规范；设计性实验有实验过程的详细记录；（3）验证性实验结果符合

5、预期，设计性实验数据准确结果可信；（4）实验报告书写规范，内容完整正确，文字图表清晰美观。本课程为考查课，以学生对上述4点的符合程度，成绩采用五级制，可以按照等价原则依据评分规则对成绩进行转换得到相应的数值。六、本课程与其它课程的联系与分工先修课程和教学环节：大学计算机基础，分子生物学，后续课程和教学环节：基因工程本课程的学习涉及了生物化学，分子生物学，遗传学等生物专业的理论知识，并借助数学，物理，计算机，统计学等理工学科理论知识，通过计算机、软件，网络资源等对生物学数据进行解读分析，解释数据内部所蕴含的原理，解释生命学现象。通过分析结果，可以总结规律、指导实验设计，从而具备解决问题的能力，为后续毕业设计等教学环节打下坚实基础。七、建议教材及教学参考书推荐教材：生物信息学（第3版），