版权说明:本文档由用户提供并上传,收益归属内容提供方,若内容存在侵权,请进行举报或认领
文档简介
1、Good is good, but better carries it.精益求精,善益求善。SSR相关基础知识-共显性:很多已图谱类分子标记都是共显性,简单说就是基因型AA,Aa,aa都能在图谱中区分开来,A和a是两条不同大小的带。复杂点说就自己查阅下文献吧。高度重复性:高度重复是,说重复单元的重复次数是多变的,因此多态性较强,可以用来进行多样性分析,群体遗传分析等(应该是指重复单元次数较多,所以为高度重复,卫星DNA都是这个特点,当然要说实验结果为高度重复也是有道理,但措辞不适应,实验结果只有重复性好或者重复性不好,基本不上实验结果高度重复,所以高度重复指前者的意思可能性更大。当然,像这种成
2、熟的分子标记技术实验结果肯定都是重复性好的。)可靠性:说试验的重复比较好,比较稳定。不想RAPD那样,今天出来了,明天就可能不行了期望杂合度He是理论计算得出的杂合度。观测杂合度是随机抽取的两个样本的HYPERLINK/s?wd=%E7%AD%89%E4%BD%8D%E5%9F%BA%E5%9B%A0&hl_tag=textlink&tn=SE_hldp01350_v6v6zkg6t_blank等位基因不相同的概率。计算公式如下:观测杂合度(Ho)=观察得到杂和个体数/样本个体数杂合度HYPERLINKjavascript:void(0)编辑本词条缺少概述、信息栏、名片图,补充相关内容使词条更
3、完整,还能快速升级,赶紧来编辑吧!1.一般杂合度是指由所有标记检测到的两亲本间的差异程度,而特殊杂合度是指根据单因子HYPERLINK/view/786804.htmt_blank方差分析所确定的对某一性状有显著效应的标记(阳性标记)计算的亲本间差异程度2.杂合度是指随机抽取的样本中其两个HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因不相同的可能性(Nei,1975)。期望杂合度主要是根据种群内当前优势等位基因的分布频率来推算的,稀有基因的贡献极其微弱3.遗传学上的杂合度,用H表示:杂合性的一种状态程度,反映一个位点具有两个以上等位基因的状态:H=1-pi期望杂合度是理
4、论计算得出的杂合度。观测杂合度是随机抽取的两个样本的等位基因不相同的概率。计算公式如下:观测杂合度(Ho)=观察得到杂和个体数/样本个体数总数。预期杂合度值(He)根据Nei(1978)提供的公式计算:nHe=1pi2i=1其中pi是第i个等位形式的频率,所有位点的等位形式频率由软件POPGENE32计算得出,n是等位形式的数目。He值的范围从0(说明无多态性)到1(说明无限多个等位形式具有相同的频率,是个极限值多态信息含量是指DNA的多态性指标等位基因数是反映群体遗传变异大小的一个指标,其数值越接近所检测到的等位基因的绝对数,表明等位基因在群体中分布越均匀。(最后一个是同源染色体上的)有效H
5、YPERLINK/s?wd=%E7%AD%89%E4%BD%8D%E5%9F%BA%E5%9B%A0&hl_tag=textlink&tn=SE_hldp01350_v6v6zkg6t_blank等位基因数是反映群体HYPERLINK/s?wd=%E9%81%97%E4%BC%A0%E5%8F%98%E5%BC%82&hl_tag=textlink&tn=SE_hldp01350_v6v6zkg6t_blank遗传变异大小的一个指标,其数值越接近所检测到的HYPERLINK/s?wd=%E7%AD%89%E4%BD%8D%E5%9F%BA%E5%9B%A0&hl_tag=textlink&tn
6、=SE_hldp01350_v6v6zkg6t_blank等位基因的HYPERLINK/s?wd=%E7%BB%9D%E5%AF%B9%E6%95%B0&hl_tag=textlink&tn=SE_hldp01350_v6v6zkg6t_blank绝对数,表明HYPERLINK/s?wd=%E7%AD%89%E4%BD%8D%E5%9F%BA%E5%9B%A0&hl_tag=textlink&tn=SE_hldp01350_v6v6zkg6t_blank等位基因在群体中分布越均匀。等位基因(allele):位于一对HYPERLINK/s?wd=%E5%90%8C%E6%BA%90%E6%9F%
7、93%E8%89%B2%E4%BD%93&hl_tag=textlink&tn=SE_hldp01350_v6v6zkg6t_blank同源染色体的相同位置上控制某一性状的不同形态的基因。不同的等位基因产生例如发色或血型等遗传特征的变化。等位基因控制HYPERLINK/s?wd=%E7%9B%B8%E5%AF%B9%E6%80%A7%E7%8A%B6&hl_tag=textlink&tn=SE_hldp01350_v6v6zkg6t_blank相对性状的显隐性关系及HYPERLINK/s?wd=%E9%81%97%E4%BC%A0%E6%95%88%E5%BA%94&hl_tag=textli
8、nk&tn=SE_hldp01350_v6v6zkg6t_blank遗传效应,可将等位基因区分为不同的类别。在个体中,等位基因的某个形式(显性的)可以比其他形式(隐性的)表达得多。有效等位基因数HYPERLINKjavascript:void(0)编辑本词条缺少信息栏、名片图,补充相关内容使词条更完整,还能快速升级,赶紧来编辑吧!中文名称有效等位基因数英文名称effectivenumberofallele定义理想群体中(所有等位基因频率相等),一个基因座上产生与实际群体中相同的纯合度所需的等位基因数。它等于实际群体的纯合度的倒数。等位基因频率HYPERLINKjavascript:void(0
9、)编辑本词条缺少信息栏、名片图,补充相关内容使词条更完整,还能快速升级,赶紧来编辑吧!HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因频率是群体遗传学的术语,用来显示一个HYPERLINK/view/43530.htmt_blank种群中基因的多样性,或者说是基因库的丰富程度。目录1HYPERLINK/view/553310.html1#1概念2HYPERLINK/view/553310.html2#2概念比较HYPERLINK/view/553310.html2_1#2_1相关计算HYPERLINK/view/553310.html2_2#2_2摘要HYPERLINK/
10、view/553310.html2_3#2_3理想状态HYPERLINK/view/553310.html2_4#2_4自然状态3HYPERLINK/view/553310.html3#3遗传平衡4HYPERLINK/view/553310.html4#4高考信息5HYPERLINK/view/553310.html5#5特殊情况1概念HYPERLINK/view/553310.html#o编辑本段编辑HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因频率是群体遗传学的术语,用来显示一个HYPERLINK/view/43530.htmt_blank种群中基因的多样性,或者说
11、是基因库的丰富程度。HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因频率的定义如下:如果1)一个染色体中存在某特定HYPERLINK/view/212451.htmt_blank基因座,2)该基因座上有一个基因,3)一个HYPERLINK/view/43530.htmt_blank种群中的每一个个体的体细胞都有n个该特定基因座(例如HYPERLINK/view/31204.htmt_blank二倍体生物的细胞中有两个该特定基因座),4)该基因有等HYPERLINK/picture/553310/553310/0/d1a20cf431adcbef4ed870acacaf2e
12、dda2cc9faf?fr=lemma&ct=singlet_blank位基因或变种;那么HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因频率为-等位基因在这个种群中所有该等位基因在特定基因座中所占的百分比。举例来说,如果在某HYPERLINK/view/43530.htmt_blank种群中一个等位基因的基因频率为20%,那么在种群的所有成员中,1/5的染色体带有那个等位基因,而其他4/5的染色体带有该HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因的其他对应变种可以是一种也可以是很多种。如人们熟悉的人的MN血型,它是由一对HYPERLINK/vi
13、ew/544143.htmt_blank共显性等位基因M和N所决定,产生3种基因型M/M、M/N和N/N,而相应的表型是M、MN和N,而且比例是1/4M、1/2MN和1/4N。这个原理可以推广到一般群体内婚配,如以群体中MN表型(HYPERLINK/view/142644.htmt_blank基因型)的具体样本数被所观察到总数相除即可得到(转换)相对频率数。2概念比较HYPERLINK/view/553310.html#o编辑本段编辑基因频率是某种基因在某个HYPERLINK/view/43530.htmt_blank种群中出现的比例。HYPERLINK/view/99532.htmt_bla
14、nk基因型频率是某种特定基因型的个体占群体内全部个体的比例。前者是某基因个体数占全部基因数的比例,后者是某基因型个体数占群体总数的比例。相关计算设二倍体生物个体的某一HYPERLINK/view/212451.htmt_blank基因座上有两个HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因A和a,假设HYPERLINK/view/43530.htmt_blank种群中共有N个个体,而AA、Aa、aa三种HYPERLINK/view/142644.htmt_blank基因型的个体数分别为n1、n2、n3,那么种群中A基因的频率和AA基因型的频率分别是:A基因的频率=A基因
15、的总数/(A基因的总数+a基因的总数)=(2n1+n2)/2N或n1/N+n2/2NAA基因型的频率=AA基因型的个体数/该二倍体群体总数=n1/N。基因频率与HYPERLINK/view/99532.htmt_blank基因型频率的计算关系,由上述推得:A基因的频率=n1/N+1/2n2/N=AA基因型的频率+1/2Aa基因型的频率。基因频率计算类型及其公式推导摘要生物进化的实质是HYPERLINK/view/43530.htmt_blank种群HYPERLINK/view/91738.htmt_blank基因库基因频率在环境选择作用下的定向改变。运用数学方法计算HYPERLINK/view
16、/43530.htmt_blank种群基因频率有利于理解种群进化情况,本文结合实例探讨种群在不同情况下种群基因频率计算类型和计算公式的推导过程。关键词:HYPERLINK/view/698262.htmt_blank遗传平衡基因频率基因频率是指在一个HYPERLINK/view/43530.htmt_blank种群基因库中,某个基因占全部HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因数的比例。HYPERLINK/view/43530.htmt_blank种群中某一HYPERLINK/view/1678151.htmt_blank基因位点上各种不同的基因频率之和以及各种H
17、YPERLINK/view/99532.htmt_blank基因型频率之和都等于1。对于一个HYPERLINK/view/43530.htmt_blank种群来说,理想状态下种群基因频率在世代相传中保持稳定,然而在自然条件下却受基因突变、HYPERLINK/view/242197.htmt_blank基因重组、自然选择、迁移和HYPERLINK/view/16508.htmt_blank遗传漂变的影响,种群基因频率处于不断变化之中,使生物不断向前发展进化。因此,通过计算某HYPERLINK/view/43530.htmt_blank种群的基因频率有利于理解该种群的进化情况。为了进一步加深对这部
18、分知识的理解和掌握,现将基因频率计算类型和计算公式推导归纳如下:理想状态理想状态下的HYPERLINK/view/43530.htmt_blank种群就是处于HYPERLINK/view/698262.htmt_blank遗传平衡状况下的种群,遵循“哈迪温伯格HYPERLINK/view/4619426.htmt_blank平衡定律”。遗传平衡指在一个极大的随机自由交配的HYPERLINK/view/43530.htmt_blank种群中,在没有突变发生,没有自然选择和迁移的条件下,种群的基因频率和HYPERLINK/view/99532.htmt_blank基因型频率在代代相传中稳定不变,保
19、持平衡。一个具有Aa基因型的大群体(处于遗传平衡状态的零世代或某一世代),A基因的频率P(A)=p,a基因的频率P(a)=q,HYPERLINK/view/551490.htmt_blank显性基因A的基因频率与隐性基因a的基因频率之和p+q=1,其雌雄个体向后代传递基因A型HYPERLINK/view/826358.htmt_blank配子的频率为p,与其相对应的传递隐性基因a型配子的频率为q,则可用下表1来表示各类配子的组合类型、HYPERLINK/view/2347746.htmt_blank子代基因型及其出现的概率:表1雄配子雌配子A(p)a(q)A(p)AA(p)Aa(pq)a(q)
20、Aa(pq)aa(q)由上表可知该HYPERLINK/view/43530.htmt_blank种群后代中出现三种HYPERLINK/view/142644.htmt_blank基因型AA、Aa、aa,并且三种HYPERLINK/view/142644.htmt_blank基因型出现的频率分别为P(AA)=pp=p=D;P(Aa)=2pq=2pq=H;P(aa)=qq=q=R。且它们的频率之和为p+2pq+q=(p+q)=1。其基因频率为A基因的频率P(A)=D+1/2H=p+pq=p(p+q)=p;a基因的频率P(a)=R+1/2H=q+pq=q(p+q)=q。可见HYPERLINK/vie
21、w/2347746.htmt_blank子代基因频率与亲代基因频率一样。所以,在以后所有世代中,如果没有突变、迁移和选择等因素干扰,这个群体的HYPERLINK/view/71511.htmt_blank遗传成分将永远处于p+2pq+qHYPERLINK/view/84757.htmt_blank平衡状态。伴性基因和多HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因HYPERLINK/view/698262.htmt_blank遗传平衡的计算仍遵循上述规律。运用此规律,已知HYPERLINK/view/99532.htmt_blank基因型频率可求基因频率;反之,已知基因
22、频率可求基因型频率。例题:已知苯丙酮尿症是位于常染色体上的隐性遗传病。据调查,该病的发病率大约为1/10000,请问在人群中该苯丙酮尿症隐性HYPERLINK/view/8482009.htmt_blank致病基因(a)的基因频率以及携带此HYPERLINK/view/808569.htmt_blank隐性基因的携带者(Aa)HYPERLINK/view/99532.htmt_blank基因型频率分别是()A1%和099%B1%和198%C1%和396%D1%和0198%解析:苯丙酮尿症是一种常染色体隐性遗传病。由于该病则发病HYPERLINK/view/142644.htmt_blank基因
23、型为aa,即aa=00001,a=001,A=1-a=1-001=099,携带者基因型为Aa的频率=2001099=00198。答案:B变式1在某个海岛上,每一万个人中有500名男子患红绿色盲,则该岛上的人群中,女性携带者的数量为每万人中有多少?(假设男女比为1:1)(B)A1000人B900人C800人D700人变式2:人的ABO血型决定于3个HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因I、I、i。通过抽样调查发现血型频率:A型=045,B型=013,AB型=006,O型=036。试计算I、I、i这3个HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等
24、位基因的频率。答案:I频率为03,I频率为01,i频率为06。自然状态对于生活在HYPERLINK/view/262972.htmt_blank自然界中的HYPERLINK/view/43530.htmt_blank种群来说,理想状态下的条件是不可能同时存在,种群基因频率不可能保持平衡,而是处于不断变动和发展的。这种非HYPERLINK/view/3874467.htmt_blank平衡群体常采用抽样调查的方法获得的数据来计算其基因频率,根据基因所在位置可分为两种类型。21关于HYPERLINK/view/3873846.htmt_blank常染色体遗传基因频率的计算由定义可知,某基因频率=某
25、基因的数目/该基因的HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因总数100%。若某二倍体生物的常染色体的某一HYPERLINK/view/1678151.htmt_blank基因位点上有一对HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因A、a,他们的基因频率分别为p、q,可组成三种HYPERLINK/view/142644.htmt_blank基因型AA、Aa、aa,HYPERLINK/view/99532.htmt_blank基因型频率分别为D、H、R,个体总数为N,AA个体数为n1,Aa个体数为n2,aa个体数为n3,n1+n2+n3=N。
26、那么:HYPERLINK/view/142644.htmt_blank基因型AA的频率=D=n1/N,n1=ND;基因型Aa的频率=H=n2/N。n2=NH基因型aa的频率=R=n3/N,n3=NR;基因A的频率P(A)=(2n1+n2)/2N=(2ND+NH)/2N=D+1/2H=p基因a的频率P(a)=(2n3+n2)/2N=(2NR+NH)/2N=R+1/2H=q因为p+q=1所以D+1/2H+R+1/2H=D+R+H=1由以上推导可知,HYPERLINK/view/773204.htmt_blank常染色体基因频率的基本计算式:某基因频率=(2该基因HYPERLINK/view/293
27、126.htmt_blank纯合子个数+1HYPERLINK/view/293127.htmt_blank杂合子个数)/2HYPERLINK/view/43530.htmt_blank种群调查个体总数常染色体基因频率的推导计算式:某基因频率=某种基因的纯合子频率+1/2杂合子频率例题:从某个HYPERLINK/view/43530.htmt_blank种群中随机抽出100个个体,测知基因型为AA、Aa和aa的个体分别是30、60和10个。求这对HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因的基因频率。解法一:先求出该HYPERLINK/view/43530.htmt_b
28、lank种群HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因的总数和A或a的个数。100个个体共有200个基因;其中,A基因有230+60=120个,a基因有210+60=80个。然后由常染色体基因频率的基本式计算求得:A基因的频率为:120200=60%a基因的频率为:80200=40%解法二:由题意可知,AA、Aa和aa的HYPERLINK/view/99532.htmt_blank基因型频率分别是30%、60%和10%,由HYPERLINK/view/773204.htmt_blank常染色体基因频率的推导式计算求得:A基因的频率为:30%+1/260%=60%a基
29、因的频率为:10%+1/260%=40%变式1:已知人眼的褐色(A)对蓝色(a)是显性,属常染色体上基因控制的HYPERLINK/view/71511.htmt_blank遗传。在一个30000人的人群中,蓝眼的有3600人,褐眼的有26400人,其中HYPERLINK/view/293126.htmt_blank纯合子有12000人,那么,这一人群中A和a基因的基因频率分别为(A)A64%和36%B36%和64%C50%和50%D82%和18%变式2:在一个HYPERLINK/view/43530.htmt_blank种群中随机抽出一定数量的个体,其中,HYPERLINK/view/1426
30、44.htmt_blank基因型为BB的个体占40%,基因型为Bb的个体占50%,基因型为bb的个体占10%,则基因B和b的频率分别是(B)A90%,10%B65%,35%C50%,50%D35%,65%22关于X或Y染色体遗传基因频率的计算对于HYPERLINK/view/225681.htmt_blank伴性遗传来说,位于X、YHYPERLINK/view/3874191.htmt_blank同源区段上的基因,其基因频率计算与HYPERLINK/view/773204.htmt_blank常染色体计算相同;而位于X、Y非同源区段上的基因,伴X染色体遗传,在Y染色体上没有该基因及其HYPER
31、LINK/view/87876.htmt_blank等位基因。同理伴Y染色体HYPERLINK/view/71511.htmt_blank遗传,在X染色体上也没有其对等的基因。所以在计算基因总数时,应只考虑X染色体(或Y染色体)上的基因总数。若某HYPERLINK/view/31204.htmt_blank二倍体生物的X染色体的某一基因位点上有一对HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因B、b,他们的基因频率分别为p、q,可组成五种基因型XX、XX、XX、XY和XY,HYPERLINK/view/99532.htmt_blank基因型频率分别为E、F、G、H和I,
32、个体总数为N,XX个体数为n1,XX个体数为n2,XX个体数为n3,XY个体数为n4、XY个体数为n5。且n1+n2+n3=n4+n5那么:E=n1/N、F=n2/N、G=n3/N、H=n4/N、I=n5/N;p(X)=(2n1+n2+n4)/2(n1+n2+n3)+(n4+n5)=(2n1+n2+n4)/15N=2/3(2E+F+H)q(X)=(2n3+n2+n5)/2(n1+n2+n3)+(n4+n5)=(2n3+n2+n5)/15N=2/3(2G+F+I)由以上推导可知,X染色体基因频率的基本计算式:某基因频率=(2该基因雌性纯合子个数+雌性杂合子个数+雄性含该基因个数)/(2雌性个体总
33、数+雄性个体数)X染色体基因频率的推导计算式:某种基因的基因频率=2/3(2某种基因雌性HYPERLINK/view/232382.htmt_blank纯合体频率+雌性杂合体频率+雄性该HYPERLINK/view/99532.htmt_blank基因型频率)(雌、雄个体数相等的情况下)例题:从某个种群中随机抽出100个个体,测知基因型为XX、XX、XX和XY、XY的个体分别是44、5、1和43、7。求X和X的基因频率。解法一:就这对HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因而言,每个雌性个体含有2个基因,每个雄性个体含有1个基因(Y染色体上没有其等位基因)。那么,
34、这100个个体共有150个基因,其中雌性个体的基因有2(44+5+1)=100个,雄性个体的基因有43+7=50个。而X基因有442+5+43=136个,基因X有5+12+7=14个。于是,根据X染色体基因频率的基本式计算求得:X的基因频率为:136150907%X的基因频率为:1415093%解法二:由题意可知,XX、XX、XX和XY、XY的HYPERLINK/view/99532.htmt_blank基因型频率分别44%、5%、1%和43%、7%,因为雌性、雄性个体的基因型频率各占50%,于是,由X染色体基因频率的推导式计算求得:X基因的基因频率=2/3(244%+5%+43%)907%X
35、基因的基因频率=2/3(21%+5%+7%)93%变式1:某工厂有男女职工各200名,调查发现,女性色盲基因的携带者为15人,患者5人,男性患者11人。那么这个群体中色盲基因的频率是(B)A45%B6%C9%D78%变式2:对欧洲某学校的学生进行遗传调查时发现,血友病患者占07%(男女=21);血友病携带者占5%,那么,这个HYPERLINK/view/43530.htmt_blank种群的X的频率是(C)A297%B07%C396%D32%解析:方法一:这里首先要明确2:1为患者中男女的比例,人群中男女比例为1:1。假设总人数为3000人。则男患者为300007%2/3=14,女患者为300
36、007%1/3=7。携带者为30005%=150。则X的频率=(14+72+150)/(15002+1500)=396%。方法二:人群中男女比例为1:1,根据X染色体基因频率的推导式计算求得:X的频率=2/3(07%1/32+07%2/3+5%)=396%。答案:选C。总之,尽管基因频率的计算类型复杂多样,其思维方法又迥然各异,但是我们只要把握住基因频率计算的条件和方法规律,弄清原委并灵活运用,就能准确地计算出正确的答案。主要参考文献1李难进化论教程北京:高等教育出版社,19909:2442762朱正威,赵占良普通高中课程标准实验教科书生物必修2遗传与进化北京:人民教育出版社,2007:115
37、3遗传平衡HYPERLINK/view/553310.html#o编辑本段编辑也称“定律”,1908年,英国数学家戈弗雷哈罗德哈代(GodfreyHaroldHardy)最早发现并证明这一定律;1909年,德国医生威廉温伯格(WilhelmWeinberg)也独立证明此定律,故得名哈代-温伯格定律。主要用于描述群体中HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因频率以及HYPERLINK/view/99532.htmt_blank基因型频率之间的关系。内容为:一个无穷大的群体在理想情况下进行HYPERLINK/view/1363602.htmt_blank随机交配,经过
38、多代,仍可保持基因频率与HYPERLINK/view/99532.htmt_blank基因型频率处于稳定的HYPERLINK/view/84757.htmt_blank平衡状态1。在一对HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因的情况下,基因p(HYPERLINK/view/1552488.htmt_blank显性)与基因q(隐形)的基因频率的关系为:(p+q)2=1二项展开得:p2+2pq+q2=1可见,式中“p2”为HYPERLINK/view/1457609.htmt_blank显性纯合子的比例,2pq为HYPERLINK/view/293127.htmt_b
39、lank杂合子的比例,“q2”为HYPERLINK/view/1457613.htmt_blank隐形纯合子的比例。哈代-温伯格定律在HYPERLINK/view/232535.htmt_blank多倍体等更加复杂的情况下也可应用。例1一个HYPERLINK/view/43530.htmt_blank种群中AA个体占30%,Aa的个体占60%,aa的个体占10%。计算A、a基因的频率。剖析A基因的频率为30%+1/260%=60%a基因的频率为10%+1/260%=40%答案60%40%4高考信息HYPERLINK/view/553310.html#o编辑本段编辑例2(2006河北高考)在豚鼠
40、中,黑色对白色是显性。如果基因库中90%是HYPERLINK/view/551490.htmt_blank显性基因B,10%是HYPERLINK/view/808569.htmt_blank隐性基因b,则HYPERLINK/view/43530.htmt_blank种群中基因BB、Bb、bb的频率分别是()A81%18%1%B45%40%15%C18%81%1%D45%45%10%解题思路BB频率为(90%)2=81%,bb频率为(10%)2=1%,Bb频率为290%10%=18%,故选A答案A某小岛上原有果蝇20000只,其中HYPERLINK/view/142644.htmt_blank基
41、因型VV、Vv、vv的果蝇分别占15%、55%和30%。若此时从岛外上入侵了2000只基因型为VV的果蝇,且所有果蝇均HYPERLINK/view/1363602.htmt_blank随机交配,则F1中V的基因频率约是多少?V基因频率=(20000*15%*2+20000*55%+2000*2)/44000=47.7%5特殊情况HYPERLINK/view/553310.html#o编辑本段编辑值得注意的是在HYPERLINK/view/31204.htmt_blank二倍体基因中,带有该HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因的个体最多可能有2/5。如果HYPE
42、RLINK/view/87876.htmt_blank等位基因HYPERLINK/view/3844979.htmt_blank随机分布的话,那么可以用HYPERLINK/view/392493.htmt_blank二项式定理来计算:HYPERLINK/view/43530.htmt_blank种群中32%的个体会是该HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因的杂合体(带有一个该等位基因和另一个变种),4%的个体为该等位基因的纯合体(带有两个该等位基因)。所以加起来就有36%的个体带有该等位基因。然而,等位基因的HYPERLINK/view/3844979.htmt
43、_blank随机分布是在选择不参与和其他前提下成立的。当这些前提成立时,一个HYPERLINK/view/43530.htmt_blank种群的状态被称为哈蒂温伯格平衡(en:Hardy-Weinbergprinciple)。一个基因中所有HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因的频率可以被绘制为等位基因分布HYPERLINK/view/663861.htmt_blank柱状图。HYPERLINK/view/33283.htmt_blank群体遗传学研究的内容包括影响HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因频率的因素换句话说,进化。除
44、了自然和HYPERLINK/view/321381.htmt_blank人工选择外,这些因素还包括HYPERLINK/view/16508.htmt_blank遗传漂变、突变和迁移。多态信息量用于连锁分析时对标志基因(或标志序列)的多态性估计,杂合度则用于群体遗传学上对群体多态性的描述;前者主要服务于基因定位和产前诊断,而后者则可对进化因子的效应予以分析,两者不仅含义不同,而且往往值也不同。本文对上述问题进行了分析提出了自己的一些看法。HYPERLINK/lemma/ShowInnerLink.htm?lemmaId=70158451t_blank多态信息含量(PICpolymorphismi
45、nformationcontent):在HYPERLINK/lemma/ShowInnerLink.htm?lemmaId=10625808t_blank连锁分析中一个遗传标记HYPERLINK/lemma/ShowInnerLink.htm?lemmaId=8437869t_blank多态性可提供的信息量的度量。它是一个亲本为HYPERLINK/lemma/ShowInnerLink.htm?lemmaId=355361&ss_c=ssc.citiao.link杂合子,另一亲本为不同基因型的概率。现常用来衡量座位多态性高低的程度。HYPERLINK/view/1900198.htm?fr=a
46、laddinl#32香农-威纳指数HYPERLINKjavascript:void(0)编辑本词条缺少概述、名片图,补充相关内容使词条更完整,还能快速升级,赶紧来编辑吧!中文名香农-威纳指数外文名ShannonWienerindex是用方法信息论方法提出者费歇尔和普雷斯顿目录1HYPERLINK/view/1900198.htm?fr=aladdinl1#1香农-威纳指数的公式及其含义2HYPERLINK/view/1900198.htm?fr=aladdinl2#2均匀性指数1香农-威纳指数的公式及其含义HYPERLINK/view/1900198.htm?fr=aladdinl#o编辑本段
47、编辑费歇尔和普雷斯顿的方法所表示的多样性指数仅包括种的多寡一方面。香农-威纳指数和辛普森指数则包括了测量HYPERLINK/view/43532.htmt_blank群落的异质性。香农-威纳指数借用了信息论方法。信息论的主要测量对象是系统的序(order)或无序(disorder)的含量。在通讯工程中,人们要进行预测,预测信息中下一个是什么字母,其不定性的程度有多大。例如,bbbbbbb这样的信息流,都属于同一个字母,要预测下一个字母是什么,没有任何不定性,其信息的不定性含量等于零。如果是a,b,c,d,e,f,g,每个字母都不相同。那么其信息的不定性含量就大。在群落多样性的测度上,就借用了这
48、个信息论中不定性测量方法,就是预测下一个采集的个体属于什么种,如果群落的多样性程度越高,其不定性也就越大。其中,H=样品的信息含量(彼得/个体)=群落的多样性指数,S=种数,Pi=样品中属于第i种的个体的比例,如样品总个体数为N,第i种个体数为ni,则Pi=ni/N下面用一个假设的简单数字为例,说明香农一威纳指数的含义,设有A,B,C三个群落,各有两个种所组成,其中各种个体数组成如下:物种甲物种乙群落A100(1.0)0(0)群落B50(0.5)50(0.5)群落C99(0.99)1(0.01)括号内数字即Pi因为群落A的所有个体均属于物种甲,没有任何多样性,从理论上说H应该等于零,其香农一威
49、纳指数是:H=(1.0log21.0)+0)=0由于在群落B中两个物种各有50个体,其分布是均匀的。它的香农指数是:H=0.50(log20.50)+0.50(log20.50)=l群落C的两个物种分别具有99和1个个体,则:H=一0.99(log20.99)+0.01(log20.01)=0.081显然,H值的大小与我们的直觉是相符的:群落B的多样性较群落C大,而群落A的多样性等于零。2均匀性指数HYPERLINK/view/1900198.htm?fr=aladdinl#o编辑本段编辑在香农-威纳指数中,包含着两个成分:种数;各种间个体分配的均匀性(equiability或evenness
50、)。各种之间,个体分配越均匀,H值就越大。如果每一个体都属于不同的种,HYPERLINK/view/3850035.htmt_blank多样性指数就最大;如果每一个体都属于同一种,则其多样性指数就最小。那么,均匀性指数如何来测定呢?可以通过估计群落的理论上的最大HYPERLINK/view/3850035.htmt_blank多样性指数(Hmax),然后以实际的HYPERLINK/view/3850035.htmt_blank多样性指数对Hmax的比率,从而获得均匀性指数,具体步骤如下:Hmax=S(1/Slog21/S)=log2S,其中Hmax=在最大均匀性条件下的种多样性值,S=群落中种
51、数如果有S个种,在最大均匀性条件下,即每个种有1/S个体比例,所以在此条件下Pi=1/S,举例说,HYPERLINK/view/43532.htmt_blank群落中只有两个种时,则:Hmax=log22=1这与前面的计算是一致的,因此,我们可以把均匀性指数定义为:E=H/Hmax,其中E=均匀性指数,H=实测多样性值,Hmax=最大多样性值=log2SSSR标记HYPERLINKjavascript:void(0)编辑SSR(SimpleSequenceRepeats)标记是近年来发展起来的一种以特异引物PCR为基础的HYPERLINK/view/938289.htmt_blank分子标记技
52、术,也称为HYPERLINK/view/365396.htmt_blank微卫星DNA(MicrosatelliteDNA),是一类由几个核苷酸(一般为16个)为重复单位组成的长达几十个核苷酸的HYPERLINK/view/119373.htmt_blank串联重复序列.由于每个SSR两侧的序列一般是相对保守的HYPERLINK/view/1457586.htmt_blank单拷贝序列中文名SSR标记外文名SimpleSequenceRepeats特征相关重复单位首尾相连、成串排列释义以PCR为基础的HYPERLINK/view/938289.htmt_blank分子标记技术分类两大类优点四大
53、优点应用HYPERLINK/view/87880.htmt_blank遗传图谱的构建、HYPERLINK/view/5628.htmt_blank指纹图的绘制等目录1HYPERLINK/view/628299.htm?fr=aladdinl1#1SSR标记HYPERLINK/view/628299.htm?fr=aladdinl1_1#1_1简介HYPERLINK/view/628299.htm?fr=aladdinl1_2#1_2特征HYPERLINK/view/628299.htm?fr=aladdinl1_3#1_3分类2HYPERLINK/view/628299.htm?fr=alad
54、dinl2#2特点HYPERLINK/view/628299.htm?fr=aladdinl2_1#2_1优点HYPERLINK/view/628299.htm?fr=aladdinl2_2#2_2应用1SSR标记HYPERLINK/view/628299.htm?fr=aladdinl#o编辑本段编辑简介生物的基因组中,特别是高等生物的基因组中含有大量的重复序列14,根据重复序列在基因组中的分布形式可将其分为HYPERLINK/view/119373.htmt_blank串联重复序列和散布重复序列。特征其中,HYPERLINK/view/119373.htmt_blank串联重复序列是由相关
55、的重复单位首尾相连、成串排列而成的。分类目前发现的HYPERLINK/view/119373.htmt_blank串联重复序列主要有两类:一类是由功能HYPERLINK/view/8563.htmt_blank基因组成的(如rRNA和HYPERLINK/view/837143.htmt_blank组蛋白基因);另一类是由无功能的序列组成的。根据HYPERLINK/view/113693.htmt_blank重复序列的重复单位的长度,可将HYPERLINK/view/119373.htmt_blank串联重复序列分为卫星DNA、HYPERLINK/view/365396.htmt_blank微卫
56、星DNA、HYPERLINK/view/3852020.htmt_blank小卫星DNA等3。微卫星DNA又叫HYPERLINK/view/3874643.htmt_blank简单重复序列,指的是基因组中由16个HYPERLINK/view/117213.htmt_blank核苷酸组成的基本单位重复多次构成的一段DNA,广泛分布于基因组的不同位置,长度一般在200bp以下。研究表明,微卫星在HYPERLINK/view/77362.htmt_blank真核生物的基因组中的含量非常丰富,而且常常是HYPERLINK/view/3844979.htmt_blank随机分布于核DNA中15,38。在植物中通过对拟南芥7、玉米35、水稻11、小麦28,32,33等的研究表明微卫星在植物中也很丰富,均匀分布于整个植物基因组中,但不同植物中微卫星出现的HYPERLINK/view/30964.htmt_blank频率变化是非常大的,如在主要的农作物中两种最普遍的二HYPERLINK/view/117213.htmt_blank核苷酸重复单位(AC)n和(GA)
温馨提示
- 1. 本站所有资源如无特殊说明,都需要本地电脑安装OFFICE2007和PDF阅读器。图纸软件为CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.压缩文件请下载最新的WinRAR软件解压。
- 2. 本站的文档不包含任何第三方提供的附件图纸等,如果需要附件,请联系上传者。文件的所有权益归上传用户所有。
- 3. 本站RAR压缩包中若带图纸,网页内容里面会有图纸预览,若没有图纸预览就没有图纸。
- 4. 未经权益所有人同意不得将文件中的内容挪作商业或盈利用途。
- 5. 人人文库网仅提供信息存储空间,仅对用户上传内容的表现方式做保护处理,对用户上传分享的文档内容本身不做任何修改或编辑,并不能对任何下载内容负责。
- 6. 下载文件中如有侵权或不适当内容,请与我们联系,我们立即纠正。
- 7. 本站不保证下载资源的准确性、安全性和完整性, 同时也不承担用户因使用这些下载资源对自己和他人造成任何形式的伤害或损失。
最新文档
- 监理期限合同范本
- 明星买房合同范本
- 外包安保合同范本
- 城市轨道交通工程完工检测合同
- 2024至2030年滑动轴承轴瓦项目投资价值分析报告
- 2024年楼梯立柱项目可行性研究报告
- 2024年双耳止动垫圈项目可行性研究报告
- 砂石资源采购合同细则
- 物业管理公司竞业限制协议书
- 办公设备包装设计制作合同
- 粒子物理基础
- 珠宝首饰制作倒模工艺流程
- 2023年象山县特殊教育岗位教师招聘考试笔试题库及答案解析
- YY/T 1760-2021一次性使用腹膜透析引流器
- GB/T 41365-2022中药材种子(种苗)白术
- GB/T 34570.1-2017电动工具用可充电电池包和充电器的安全第1部分:电池包的安全
- GB/T 12527-2008额定电压1 kV及以下架空绝缘电缆
- 一级建造师考试题库及答案(全国通用)
- 公司社会责任管理制度
- 思想政治工作和文化工作理论1
- 2022届北京市东城区高三语文一模语文试卷讲评课件
评论
0/150
提交评论