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文档简介
1、2021-11-19用基因工程方法用基因工程方法获得胰岛素获得胰岛素第四组12021-11-19胰岛素是由胰岛B细胞受内源性或外源性物质如葡萄糖、乳糖、核糖、精氨酸、胰高血糖素等的刺激而分泌的一种蛋白质激素。胰岛素是机体内唯一降低血糖的激素,同时促进糖原、脂肪、蛋白质合成。外源性胰岛素主要用来糖尿病治疗。胰岛素这类活性蛋白多肽和细胞因子具有高度生物活性,分子量很大,立体结构异常复杂,体外难以人工合成。所以过去糖尿病患者只能服用从牛、猪体中提取的胰岛素来治疗;但牛、猪胰岛素结构上与人胰岛素有差别,如与猪胰岛素B链第30个氨基酸残基不同,长期服用会引起肾和眼的疾病,故必需要用基因工程方法获得重组人
2、胰岛素进行治疗。22021-11-193基因工程制胰岛素三种方法一、A链和B链分别表达法化学合成A链和B链的编码序列2021-11-194基因工程制胰岛素三种方法一、A链和B链分别表达法表达产物的后期处理路线:2021-11-195基因工程制胰岛素三种方法二、人胰岛素原表达法基因工程菌的构建战略:2021-11-196基因工程制胰岛素三种方法二、人胰岛素原表达法表达产物的后期处理路线:2021-11-197基因工程制胰岛素三种方法三、A链和B链同时表达法2021-11-198方法一: 由于A链和B链上共存在六个半胱氨酸残基,体外二硫键的正确配对率较低,通常只有10% - 20%,因此成本高。方
3、法二: 胰岛素原能形成良好的空间构象,三对二硫键的正确配对率提高,折叠率高。工艺路线依然繁琐。方法三: 需体外折叠。基因工程制胰岛素三种方法三种方法比较:2021-11-19基因工程获取胰岛素的步骤基因工程获取胰岛素的步骤一、获取外源目的基因片段二、选择与获取表达载体三、重组目的DNA片段与表达载体四、选择与获取表达细胞五、重组体导入表达细胞六、对重组体细胞进行筛选纯化鉴定七、工程菌产物鉴定和保存八、发酵培养92021-11-19一、获取外源目的基因片段1选择实验材料2提取RNA,分离RNA3逆转录mRNA,得cDNA第一链4得双链DNA5DNA序列纠错6. 目的基因通过细胞克隆扩增7. 目的
4、基因回收及DNA测序,最终目的基因获取102021-11-19一、获取外源目的基因片段1选择实验材料胰岛素是一种蛋白质类激素,体内胰岛素是胰岛B细胞(即胰岛细胞)受内源性或外源性物质如葡萄糖、乳糖、核糖、精氨酸、胰高血糖素等的刺激而分泌的。胰岛素基因只有在胰岛B细胞中才能转录出信使RNA,所以用基因工程方法生产胰岛素时,选用胰岛B细胞为获取目的基因的实验材料。112021-11-19一、获取外源目的基因片段2提取RNA,分离RNA 21 总RNA的提取 22 mRNA的纯化 23 mRNA的保存122021-11-19一、获取外源目的基因片段21 总RNA的提取 总RNA的抽提方法有多种,TR
5、Izol试剂是使用组广泛的RNA抽提试剂,主要由苯酚和异硫氰酸胍组成,可以迅速破坏细胞结构,使存在于细胞质及核内的RNA释放出来,并使核糖体蛋白与RNA分子分离。苯酚虽可有效地变性蛋白质,但不能完全抑制RNA酶活性,因此TRIzol中还加入了8羟基喹啉、异硫氰酸胍、-巯基乙醇等来抑制内源和外源RNase(RNA酶)。TRIzol是从细胞和组织中提取总RNA的即用型试剂,在样品裂解或匀浆过程中,TRIzol能保持RNA完整性。提取RNA时,首先用液氮研磨材料,匀浆,加入TRIzol试剂,进一步破碎细胞并溶解细胞成分。然后加入氯仿抽提,离心,分离水相和有机相,收集含有RNA的水相,通过异丙醇沉淀,
6、可获得比较纯的总RNA,用于下一步mRNA的纯化。132021-11-19一、获取外源目的基因片段211 TRIzol法提取流程(1)样品处理 培养细胞:收获细胞1-5*107,移入1.5ml离心管中,加入1ml TRIzol,混匀,室温静置5min。 组织:取50-100mg组织(新鲜或-70及液氮中保存的组织均可)置1.5ml离心管中,加入1ml TRIzol充分匀浆,室温静置5min。(2)加入0.2ml氯仿,振荡15s,静置2min。(3)4离心,12000g*15min,取上清液。(4)加入0.5ml异丙醇,将管中液体轻轻混匀,室温静置10min。(5)4离心,12000g*10mi
7、n,弃上清液。(6)加入1ml 75%乙醇,轻轻洗涤沉淀。4,7500g*5min,弃上清液。(7)晾干,加入适量的DEPCH2O溶解(65促溶10-15min)。142021-11-19一、获取外源目的基因片段211 TRIzol法提取流程图152021-11-19一、获取外源目的基因片段22 mRNA的纯化该方法利用mRNA 3端含有PolyA(多聚腺苷酸)的特点,当RNA流经寡聚dT纤维素柱时,在高盐缓冲液的作用下,mRNA被特异性的结合在柱上,再用低盐溶液或蒸馏水洗脱mRNA。经过两次寡聚纤维柱后可得到较高纯度的mRNA。162021-11-19一、获取外源目的基因片段2 22 21
8、1 寡聚(寡聚(dTdT)纤维素柱纯化)纤维素柱纯化mRNAmRNA(1 1)试剂准备:)试剂准备: 3M3M醋酸钠(醋酸钠(pH5.2pH5.2);); 0.1M NaOH0.1M NaOH; 上样缓冲液:上样缓冲液:20mM Tris-HCl20mM Tris-HCl(pH7.6pH7.6),0.5M NaCl,1M ,0.5M NaCl,1M EDTA (pH8.0),0.1%SLS(EDTA (pH8.0),0.1%SLS(十二烷基氨酸钠十二烷基氨酸钠) )。配制时可先配制。配制时可先配制Tris-HClTris-HCl(pH7.6pH7.6)、)、NaClNaCl、EDTAEDTA(
9、pH8.0pH8.0)的母液,经高压)的母液,经高压消毒后按各成分确切含量,经混合后再高压消毒,冷却至消毒后按各成分确切含量,经混合后再高压消毒,冷却至6565,加入经,加入经6565温育(温育(30min30min)的)的10%SLS10%SLS至终浓度为至终浓度为0.1%0.1%; 洗脱缓冲液:洗脱缓冲液:10mM Tris-HCl10mM Tris-HCl(pH7.6pH7.6),),1mM EDTA1mM EDTA(pH8.0pH8.0),),0.05%SDS0.05%SDS; 无水乙醇、无水乙醇、70%70%乙醇;乙醇; DEPCDEPC(0.1%0.1%焦炭酸二乙酯)焦炭酸二乙酯)
10、 172021-11-19一、获取外源目的基因片段221 寡聚(dT)纤维素柱纯化mRNA(2 2)操作步骤:)操作步骤: 将将0.5-1.0g0.5-1.0g寡聚(寡聚(dTdT)纤维悬浮于)纤维悬浮于0.1M0.1M的的NaOHNaOH溶液中。溶液中。 用用DEPCDEPC处理的处理的1ml 1ml 注射器或适当的细管,将寡聚(注射器或适当的细管,将寡聚(dTdT)纤维素装柱)纤维素装柱0.5-1ml0.5-1ml,用,用3 3倍柱床体积的倍柱床体积的DEPCH2ODEPCH2O洗柱。洗柱。 使用使用1 1* *上样缓冲液洗柱,直至洗出液上样缓冲液洗柱,直至洗出液pHpH值小于值小于8.0
11、8.0。 将将RNARNA溶解于溶解于DEPCH2ODEPCH2O中,在中,在6565中温育中温育10min10min左右,冷却至室温后加入等体左右,冷却至室温后加入等体2 2* *上样上样缓冲液,混匀后上柱,立即收集流出液。当缓冲液,混匀后上柱,立即收集流出液。当RNARNA上样液全部进入柱床后,再用上样液全部进入柱床后,再用1 1* *上样上样缓冲液洗柱,继续收集流出液。缓冲液洗柱,继续收集流出液。 将所有流出液于将所有流出液于6565加热加热5min5min,冷却至室温后再次上柱,收集流出液。,冷却至室温后再次上柱,收集流出液。 用用5-105-10倍柱床体积的倍柱床体积的1 1* *上
12、样缓冲液洗柱,每管上样缓冲液洗柱,每管1ml1ml分步收集,分步收集,OD260OD260测定测定RNARNA含量。含量。前部分收集管中流出液的前部分收集管中流出液的OD260OD260值很高,其内含物为无值很高,其内含物为无polyApolyA尾的尾的RNARNA。后部分收集管。后部分收集管中流出液的中流出液的OD260OD260值很低或无吸收。值很低或无吸收。 用用2-32-3倍柱容积的洗脱缓冲液洗脱倍柱容积的洗脱缓冲液洗脱polypoly(A+A+)RNARNA,分步收集,每部分为,分步收集,每部分为1/3-1/21/3-1/2柱柱体积。体积。 OD260OD260测定测定polypol
13、y(A+A+)RNARNA分布,合并含分布,合并含polypoly(A+A+)RNARNA的收集管,加入的收集管,加入1/101/10体积体积3M 3M NaAcNaAc(pH5.2pH5.2)、)、2.52.5倍体积的预冷无水乙醇,混匀,倍体积的预冷无水乙醇,混匀,-20-20放置放置30min30min。 44离心,离心,10000g10000g* *15min15min,小心吸弃上清。用,小心吸弃上清。用70%70%乙醇洗涤沉淀。乙醇洗涤沉淀。44离心,离心,10000g10000g* *5min5min,弃上清,室温晾干。,弃上清,室温晾干。 用适量的用适量的DEPCH2ODEPCH2
14、O溶解溶解RNARNA。182021-11-19一、获取外源目的基因片段221 寡聚(dT)纤维素柱纯化mRNA(3 3)注意事项)注意事项 整个实验过程必须防止整个实验过程必须防止RnaseRnase的污染。的污染。 步骤中将步骤中将RNARNA溶液置溶液置6565中温育然后冷却至室温再上样的目的有中温育然后冷却至室温再上样的目的有两个,一个是破坏两个,一个是破坏RNARNA的二级结构,尤其是的二级结构,尤其是mRNA polymRNA poly(A+A+)尾处的二)尾处的二级结构,使级结构,使polypoly(A+A+)尾充分暴露,从而提高)尾充分暴露,从而提高polypoly(A+A+)
15、RNARNA的回收率;的回收率;另一个目的是能解离另一个目的是能解离mRNAmRNA与与rRNArRNA的结合,否则会导致的结合,否则会导致rRNArRNA的污染。所的污染。所以此步骤不能省略。以此步骤不能省略。 十二烷基肌氨酸钠盐在十二烷基肌氨酸钠盐在1818以下溶解度下降,会阻碍柱内液体流动,以下溶解度下降,会阻碍柱内液体流动,若室温低于若室温低于1818最好用最好用LiClLiCl替代替代NaClNaCl。 寡聚(寡聚(dTdT)纤维素柱可在)纤维素柱可在44贮存,反复使用。每次使用前应该依贮存,反复使用。每次使用前应该依次用次用NaOHNaOH、灭菌、灭菌ddH2OddH2O、上样缓冲
16、液洗柱。、上样缓冲液洗柱。 一般而言,一般而言,107107哺乳动物培养细胞能提取哺乳动物培养细胞能提取1-5g poly1-5g poly(A+A+)RNARNA,约相当于上柱总约相当于上柱总RNARNA量的量的1%-2%1%-2%。192021-11-19一、获取外源目的基因片段23 mRNA的保存用少量水溶解mRNA,即可用于cDNA合成或保存在70%乙醇中并于-70下贮存。202021-11-19一、获取外源目的基因片段胰岛素基因胰岛素基因mRNAmRNA序列序列212021-11-19一、获取外源目的基因片段胰岛素基因胰岛素基因mRNAmRNA序列序列NCBINCBI中搜索得2220
17、21-11-19一、获取外源目的基因片段3逆转录mRNA,得cDNA第一链 mRNAmRNA在反转录酶的作用下由引物引导合成在反转录酶的作用下由引物引导合成cDNAcDNA。加入高浓度的加入高浓度的 OligoOligo(dTdT)引物,)引物, ,OligoOligo(dTdT)引)引物与物与 mRNAmRNA 的的 33 末端的末端的 polypoly(A A)配对,引导反转)配对,引导反转录酶以录酶以 mRNAmRNA 为模板合成第一链为模板合成第一链 cDNAcDNA 。这种这种 cDNAcDNA 合成的方法在合成的方法在 cDNAcDNA 文库构建中应用极为文库构建中应用极为普遍,其
18、缺点主要是由于普遍,其缺点主要是由于 cDNAcDNA 末端存在较长末端存在较长的的 polypoly(A A)而影响)而影响 cDNAcDNA 测序。(原因:测序。(原因:oligo oligo ( dT dT )结合在)结合在 mRNA mRNA 的的 3 3 端,因此合成全长的端,因此合成全长的 cDNA cDNA 需要反转录酶从需要反转录酶从 mRNA mRNA 分子的一端移动到另一分子的一端移动到另一端,有时这种全合成难以达到)端,有时这种全合成难以达到)232021-11-19一、获取外源目的基因片段4得双链DNA 4.1合成cDNA第二链得双链DNA 4.2将DNA双链通过PCR
19、技术进行扩增 242021-11-19一、获取外源目的基因片段4.1合成cDNA第二链得双链DNA mRNAmRNAcDNAcDNA 杂合双链中的杂合双链中的 mRNAmRNA 链在链在 RNARNA 酶酶 HH 作用下先形成很多切作用下先形成很多切口,口, mRNAmRNA 链就被切割成很多的小片段,这些小片段为大肠杆菌链就被切割成很多的小片段,这些小片段为大肠杆菌 DNADNA 聚聚合酶合酶 提供了合成第二链的引物。大肠杆菌提供了合成第二链的引物。大肠杆菌 DNADNA 聚合酶聚合酶 以第一以第一链链 cDNAcDNA 为模板合成一段段互补的为模板合成一段段互补的 cDNAcDNA 片段。
20、这些片段。这些 cDNAcDNA 片段进而片段进而在在 DNADNA 连接酶的作用下连接成一条链,即连接酶的作用下连接成一条链,即 cDNAcDNA 的第二链。遗留在的第二链。遗留在 5-5-末端的一段很小的末端的一段很小的 mRNAmRNA 也被大肠杆菌也被大肠杆菌 DNADNA 聚合酶聚合酶 的的 5533 核核酸外切酶和酸外切酶和 RNARNA 酶酶 HH 降解,暴露出与第一链降解,暴露出与第一链 cDNAcDNA 对应的对应的 3-3-端部分端部分序列。同时,大肠杆菌序列。同时,大肠杆菌 DNADNA 聚合酶聚合酶 的的 3-53-5 核酸外切酶的活性可核酸外切酶的活性可将暴露出的第一
21、链将暴露出的第一链 cDNAcDNA 的的 3-3-端部分消化掉,形成平端或差不多的平端部分消化掉,形成平端或差不多的平端端优点优点: : a) a)合成合成cDNAcDNA的效率高的效率高 b)b)直接利用第一链的反应产物直接利用第一链的反应产物, ,不需纯化不需纯化 c)c)避免使用避免使用S1S1核酸酶来切割双链核酸酶来切割双链cDNAcDNA252021-11-19一、获取外源目的基因片段4.1合成cDNA第二链得双链DNA 262021-11-19一、获取外源目的基因片段4.2将DNA双链通过PCR技术进行扩增 4.2.14.2.1模板模板DNADNA的变性的变性向离心管加入模板、引
22、物、耐热的向离心管加入模板、引物、耐热的DNADNA聚合酶、聚合酶、PCRPCR缓冲液(缓冲液( 500mm01500mm01L KClL KCl;100mmol100mmolL TrisL Tris一一HCl(pH8.4)HCl(pH8.4),150mmol150mmolL L MgCl2MgCl2,lmglmgm1m1明胶)、明胶)、5mmo15mmo1L dNTPL dNTP贮备贮备液,然后加热至液,然后加热至9393左右一定时间后,使模左右一定时间后,使模板板DNADNA双链或经双链或经PCRPCR扩增形成的双链扩增形成的双链DNADNA解离,解离,使之成为单链,以便它与引物结合,为下
23、轮使之成为单链,以便它与引物结合,为下轮反应作准备反应作准备272021-11-19一、获取外源目的基因片段4.2将DNA双链通过PCR技术进行扩增 4.2.24.2.2模板模板DNADNA与引物的退火与引物的退火( (复性复性) )模板模板DNADNA经加热变性成单链后,温度降至经加热变性成单链后,温度降至5555左右,引物与模板左右,引物与模板DNADNA单链的互补序列配对结单链的互补序列配对结合合;282021-11-19一、获取外源目的基因片段4.2将DNA双链通过PCR技术进行扩增 4.2.34.2.3引物的延伸引物的延伸DNADNA模板模板-引物结合引物结合 物在物在TaqDNAT
24、aqDNA聚合酶的作聚合酶的作用下,以用下,以dNTPdNTP为反应原料,靶序列为模板,为反应原料,靶序列为模板,按碱基配对与半保留复制原理,合成一条新按碱基配对与半保留复制原理,合成一条新的与模板的与模板DNA DNA 链互补的半保留复制链,重复链互补的半保留复制链,重复循环变性循环变性-退火退火-延伸三过程,就可获得更延伸三过程,就可获得更多的多的“半保留复制链半保留复制链”,而且这种新链又可,而且这种新链又可成为下次循环的模板。每完成一个循环需成为下次循环的模板。每完成一个循环需 2 24 4分钟,分钟,2 23 3小时就能将待扩目的基因扩小时就能将待扩目的基因扩增放大几百万倍。增放大几
25、百万倍。292021-11-19一、获取外源目的基因片段5.目的基因回收纯化及DNA测序纠错 5.1 将目的基因进行回收纯化 5.2 对目的基因进行测序 5.3 DNA序列纠错302021-11-19一、获取外源目的基因片段 5.1 将目的基因进行回收纯化1) 1) 在在PCRPCR试管中加入凝胶缓冲液进行琼脂糖凝胶电泳电泳到试管中加入凝胶缓冲液进行琼脂糖凝胶电泳电泳到适当位置后在目的适当位置后在目的DNADNA条带的前端挖一长方形槽,向槽中条带的前端挖一长方形槽,向槽中加入融化的低熔点胶,待凝固后进行电泳。加入融化的低熔点胶,待凝固后进行电泳。2 2)当)当DNADNA进入低熔点胶中心时停止
26、电泳。紫外灯下切下目的进入低熔点胶中心时停止电泳。紫外灯下切下目的条带的低熔点胶。条带的低熔点胶。 3) 3) 将切下的胶放到离心管中,加入将切下的胶放到离心管中,加入200200的缓冲液,的缓冲液,6565温浴温浴3 3分钟以融化低熔点胶。分钟以融化低熔点胶。4) 4) 然后分别用酚然后分别用酚/ /氯仿,氯仿抽提一次。取上清,加入氯仿,氯仿抽提一次。取上清,加入2 2倍体倍体积的无水乙醇,积的无水乙醇,-20-20沉淀沉淀DNA 2hDNA 2h以上,以上,12 000rpm12 000rpm离心离心15min15min,弃上清,用,弃上清,用70%70%乙醇洗涤,吹干后溶于乙醇洗涤,吹干
27、后溶于10l10l无菌无菌水中。水中。注意事项:在紫外灯下切出含有目的注意事项:在紫外灯下切出含有目的DNA DNA 片段的琼脂糖凝胶片段的琼脂糖凝胶时应注意要快速操作,以免损伤。时应注意要快速操作,以免损伤。312021-11-19一、获取外源目的基因片段 5.2 对目的基因进行测序利用利用DNADNA聚合酶,以待测单链聚合酶,以待测单链DNADNA为模板,以为模板,以dNTPdNTP为底为底物,设立四种相互独立的测序反应体系,在每个反应物,设立四种相互独立的测序反应体系,在每个反应体系中加入不同的体系中加入不同的ddNTPddNTP作为链延伸终止剂。在测序作为链延伸终止剂。在测序引物引导下
28、,按照碱基配对原则,每个反应体系中合引物引导下,按照碱基配对原则,每个反应体系中合成一系列长短不一的引物延伸链,通过高分辨率的变成一系列长短不一的引物延伸链,通过高分辨率的变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,放射自显影检测后,从性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,放射自显影检测后,从凝胶底部到顶部按凝胶底部到顶部按55至至33方向读出新合成链序列,方向读出新合成链序列,由此推知待测模板链的序列。由此推知待测模板链的序列。322021-11-19一、获取外源目的基因片段 5.2 对目的基因进行测序332021-11-19一、获取外源目的基因片段 5.3 DNA序列纠错1 1、将待突变基因克隆到突变载体上;、将待突
29、变基因克隆到突变载体上;2 2、制备含突变基因的单链模板;、制备含突变基因的单链模板;3 3、人工合成一段改变了碱基顺序的寡核苷酸片段,、人工合成一段改变了碱基顺序的寡核苷酸片段,以此作为引物,在体外合成互补链,获得含有错配碱以此作为引物,在体外合成互补链,获得含有错配碱基的完整双链基的完整双链M13DNAM13DNA4 4、转化和初步筛选异源双链、转化和初步筛选异源双链DNADNA分子转化大肠杆菌后,分子转化大肠杆菌后,产生野生型、突变型的同源双链产生野生型、突变型的同源双链DNADNA分子。分子。5 5、用诱变的寡核苷酸引物作为探针,通过杂交即可、用诱变的寡核苷酸引物作为探针,通过杂交即可
30、鉴定出突变体鉴定出突变体 342021-11-19一、获取外源目的基因片段6、目的基因通过细胞克隆扩增6.1 目的基因与运载体结合6.2 将目的基因导入受体细胞并使之扩增6.3 筛选获得了重组DNA分子的受体细胞克隆352021-11-19一、获取外源目的基因片段6.1 目的基因与运载体结合用与提取目的基因相同的限制酶切割质粒使之出现一用与提取目的基因相同的限制酶切割质粒使之出现一个切口;将目的基因插入切口处,让目的基因的黏性个切口;将目的基因插入切口处,让目的基因的黏性末端与切口上的黏性末端互补配对;在连接酶的作用末端与切口上的黏性末端互补配对;在连接酶的作用下连接形成重组下连接形成重组DN
31、ADNA分子。分子。362021-11-19一、获取外源目的基因片段6.2 将目的基因导入受体细胞并使之扩增要让目的基因表达,必须将它导入受体细胞并进行扩要让目的基因表达,必须将它导入受体细胞并进行扩增。为获得目的基因的表达产物时,通常以大肠杆菌增。为获得目的基因的表达产物时,通常以大肠杆菌等无害易得的细菌为受体。等无害易得的细菌为受体。注意:注意:为改进某种生物时,将欲改进的生物细胞为受为改进某种生物时,将欲改进的生物细胞为受体。为使重组的体。为使重组的DNADNA分子更容易进入受体细胞,通常分子更容易进入受体细胞,通常还要用一些物质对受体细胞进行处理,使受体细胞具还要用一些物质对受体细胞进
32、行处理,使受体细胞具有更大的通透性,例如改变有更大的通透性,例如改变PHPH值,加入氯化钙等。值,加入氯化钙等。372021-11-19一、获取外源目的基因片段6.3 筛选获得重组DNA分子的受体细胞克隆前几步的处理十分繁锁,为保证目的基因得到有效利前几步的处理十分繁锁,为保证目的基因得到有效利用,通常用大量的受体细胞来接受不多的目的基因。用,通常用大量的受体细胞来接受不多的目的基因。这样,处理的受体细胞中真正摄入了目的基因的很少,这样,处理的受体细胞中真正摄入了目的基因的很少,必须将它从中检测出来。细菌的检测,将每个受体细必须将它从中检测出来。细菌的检测,将每个受体细胞单独培养形成菌落,检测
33、菌落中是否有目的基因的胞单独培养形成菌落,检测菌落中是否有目的基因的表达产物。淘汰无表达产物的菌落,保留有表达产物表达产物。淘汰无表达产物的菌落,保留有表达产物的进一步培养、研究。多细胞生物的检测,将每个受的进一步培养、研究。多细胞生物的检测,将每个受体细胞单独培养并诱导发育成完整个体,检测这些个体细胞单独培养并诱导发育成完整个体,检测这些个体是否摄入目的基因,摄入的基因是否表达(是否表体是否摄入目的基因,摄入的基因是否表达(是否表现出相应的性状)。现出相应的性状)。382021-11-19一、获取外源目的基因片段7、目的基因回收及DNA测序,最终目的基因获取7.1 7.1 内容物释放内容物释
34、放将培养物加入试管,加入将培养物加入试管,加入EDTAEDTA及去污剂(),及去污剂(),用碱处理细菌,使细菌的细胞壁破裂,释放出细胞内用碱处理细菌,使细菌的细胞壁破裂,释放出细胞内容物(在强碱环境下,宿主菌的线性双链容物(在强碱环境下,宿主菌的线性双链DNADNA片段中片段中的氢键断裂,双链解离变性,而质粒的氢键断裂,双链解离变性,而质粒DNADNA共价闭合环共价闭合环状的双链并不完全分离)。状的双链并不完全分离)。392021-11-19一、获取外源目的基因片段7、目的基因回收及DNA测序,最终目的基因获取7.2 7.2 加酸、离心加酸、离心然后加入高浓度酸性盐,然后加入高浓度酸性盐,PH
35、PH恢复至中性(变性的染色恢复至中性(变性的染色体体DNADNA与变性的蛋白质以及细胞碎片凝聚成网络状大与变性的蛋白质以及细胞碎片凝聚成网络状大分子不溶性沉淀物,而质粒分子不溶性沉淀物,而质粒DNADNA又恢复天然构型,能又恢复天然构型,能溶解在上清液中),通过离心把染色体溶解在上清液中),通过离心把染色体DNADNA,蛋白质,蛋白质- -SDSSDS复合物等一起除去。复合物等一起除去。402021-11-19一、获取外源目的基因片段7、目的基因回收及DNA测序,最终目的基因获取7.3 7.3 切割、电泳切割、电泳利用限制性内切酶特异的识别利用限制性内切酶特异的识别DNADNA特异的核苷酸序列
36、,特异的核苷酸序列,并切割并切割DNADNA,产生一定长度的,产生一定长度的DNADNA片段,通过电泳对酶片段,通过电泳对酶切前后产物分析可以鉴别目的基因切前后产物分析可以鉴别目的基因412021-11-19一、获取外源目的基因片段7、目的基因回收及DNA测序,最终目的基因获取7.4 7.4 回收纯化、测序回收纯化、测序对目的基因进行回收纯化,再测序对目的基因进行回收纯化,再测序422021-11-19二.表达载体的构建 pET28apET28a(含有T7噬菌体启动子、乳糖操纵子、核糖体结合位点、His6标签序列、凝血酶切割位点、多克隆位点、T7噬菌体终止子、乳糖阻遏序列、pBR322复制子o
37、ri、fl噬菌体复制子、卡那霉素筛选标记序列等。)432021-11-19二.表达载体的构建44原因: 1.T7噬菌体启动子、核糖体结合位点等引导目的基因高效转录和翻译。 2.乳糖操纵子和乳糖阻遏序列存在的意义主要在于,当目的蛋白对大肠杆菌有毒性的时候,可以通过添加阻遏物,控制目的蛋白以较低水平表达。 3.His6标签序列、凝血酶切割位点存在的意义主要在于方便利用针对His6的整合层析分离纯化蛋白、然后利用凝血酶去除切割标签蛋白。 4.卡那霉素抗性基因编码的氨基糖苷磷酸转移酶,对卡那霉素进行修饰,阻断其与核糖体结合作用。2021-11-19二.表达载体的构建452021-11-19三.重组目的
38、DNA片段和表达载体 用用T7T7噬菌体噬菌体DNADNA连接酶将质粒连接酶将质粒载体载体pET28apET28a经经EcoREcoR和和BamHBamH 酶切的片段与目的基因经酶切的片段与目的基因经EcoREcoR和和BamHBamH 酶切的片段酶切的片段连接起来,构成重组连接起来,构成重组DNADNA分子。分子。 使用双酶切:使用双酶切:DNADNA分子重组时分子重组时为了保证目的片段以正确的方为了保证目的片段以正确的方向连接进入载体,往往尽可能向连接进入载体,往往尽可能选择两种具有不同黏性末端的选择两种具有不同黏性末端的酶分别酶切目的酶分别酶切目的DNADNA分子和载分子和载体,这种双酶
39、切虽然使载体和体,这种双酶切虽然使载体和目的目的DNADNA都产生两种不同的黏都产生两种不同的黏性末端,但是连接酶会选择把性末端,但是连接酶会选择把相同的黏性末端连接起来,从相同的黏性末端连接起来,从而保证目的基因只以一个方向而保证目的基因只以一个方向连接入载体。连接入载体。46四、选择与获取表达细胞1、选择大肠杆菌2、培养大肠杆菌2021-11-1947四、选择与获取表达细胞1、选择大肠杆菌原因:1)繁殖迅速、培养简单、操作方便、遗传稳定2)基因克隆及表达系统成熟完善3)全基因组测序完成,共有4405个开放性阅读框架4)被美国FDA批准为安全的基因工程受体生物2021-11-1948四、选择
40、与获取表达细胞 开放阅读框(ORF)是生物个体的基因组中,可能是蛋白质编码序列的部分。基因中的ORF包含并位于开始编码与终止编码之间。由于一段DNA或RNA序列有多种不同读取方式,因此可能同时存在许多不同的开放阅读框架。开放阅读框包含一段可以编码蛋白的碱基序列,不能被终止子打断。2021-11-19492、大肠杆菌的培养(1)LB(Luria-Bertain)液体培养基配制精解蛋白胨(bacto-tryptone)1.0%酵母浸出粉(bacto-extract)0.5%氯化钠1.0%搅拌使之完全溶解,用5molNaOH(about0.2ml/1000ml培养基)调pH至7.0,如用进口试剂可不
41、必调, 高压灭菌20min(120 0.1Mpa) 四、选择与获取表达细胞2021-11-1950四、选择与获取表达细胞2021-11-1951(2)牛肉膏蛋白胨培养基 组成成分:牛肉膏 3g,蛋白胨 10g,Nacl 5g,琼脂 1520g,水1000mL,PH7.47.6。具体配置步骤: 1.称药品 按实际用量计算后,按配方称取各种药品放入大烧杯中.牛肉膏可放在小烧杯或表面皿中称量,用热水溶解后倒入大烧杯;也可放在称量纸上称量,随后放入热水中,牛肉膏使与称量纸分离,立即取出纸片.蛋白胨极易吸潮,故称量时要迅速。四、选择与获取表达细胞2021-11-1952具体配置步骤: 2.加热溶解 在烧
42、杯中加入少于所需要的水量,然后放在石棉网上,小火加热,并用玻棒搅拌,待药品完全溶解后再补充水分至所需量.若配制固体培养基,则将称好的琼脂放入己溶解的药品中,再加热融化,此过程中,需不断搅拌,以防琼脂糊底或溢出,最后补足所失的水分。 3. 调pH 检测培养基的pH,若pH偏酸,可滴加lmol/L NaOH,边加边搅拌,并随时用pH试纸检测,直至达到所需pH范围.若偏碱,则用lmol/L HCl进行调节.pH的调节通常放在加琼脂之前.应注意pH值不要调过头,以免回调而影响培养基内各离子的浓度。四、选择与获取表达细胞2021-11-1953具体配置步骤: 4.过滤 液体培养基可用滤纸过滤,固体培养基
43、可用4层纱布趁热过滤,以利培养的观察.但是供一般使用的培养基,这步可省略。5.分装 按实验要求,可将配制的培养基分装入试管或三角瓶内.分装时可用漏斗以免使培养基沾在管口或瓶口上而造成污染. 分装量:固体培养基约为试管高度的l/5,灭菌后制成斜面.分装入三角瓶内以不超过其容积的一半为宜.半固体培养基以试管高度的1/3为宜,灭菌后垂直待凝。四、选择与获取表达细胞2021-11-1954具体配置步骤: 6.加棉塞 试管口和三角瓶口塞上用普通棉花(非脱脂棉)制作的棉塞.棉塞的形状,大小和松紧度要合适,四周紧贴管壁,不留缝隙,才能起到防止杂菌侵入和有利通气的作用.要使棉塞总长约3/5塞入试管口或瓶口内,
44、以防棉塞脱落.有些微生物需要更好的通气,则可用8层纱布制成通气塞.有时也可用试管帽或塑料塞代替棉塞。 7.包扎 加塞后,将三角瓶的棉塞外包一层牛皮纸或双层报纸,以防灭菌时冷凝水沾湿棉塞.若培养基分装于试管中,则应以5支或7支在一起,再于棉塞外包一层牛皮纸,用绳扎好.然后用记号笔注明,培养基名称,组别,日期。 四、选择与获取表达细胞2021-11-1955具体配置步骤: 8.灭菌 将上述培养基于121.3湿热灭菌20min.如因特殊情况不能及时灭菌,则应故人冰箱内暂存。 9.无菌检查 将灭菌的培养基放入37温箱中培养2448h,无菌生长即可使用,或贮存于冰箱或清洁的橱内,备用。 四、选择与获取表
45、达细胞2021-11-1956大肠杆菌培养:采用划痕接种法。用接种环从菌种中沾取少量菌液,划线。37摄氏度,恒温培养48到72小时,因为接种时和具体培养条件的不同,其生长一般都在2天外才能长出明显的菌落。 菌落特征:乳白色,圆形,菌落边缘整齐,表面光滑,表面和背面颜色一致。 五、重组DNA导入表达细胞 氯化钙转化法氯化钙转化法 对数生长期的大肠杆菌经冰浴的氯化钙低渗溶液处理,其细胞膜通透性增加,成为感受态细胞(感受态是指受体细胞处于容易吸收外源DNA的一种生理状态),加入重组质粒,重组质粒与钙离子形成复合物并粘附于细菌细胞膜表面,经42热休克处理,细胞膜通透性增加,重组质粒DNA进入感受态细胞
46、(导入重组体)。细菌在不含抗生素的培养基中培养一定时间,使含有重组质粒的细胞复原并表达抗生素抗性基因,涂布于含有抗生素的培养板上,生长得到转化子。2021-11-1957氯化钙法转化的原理机制:氯化钙法转化的原理机制:在0 的CaCl2 低渗溶液中,细菌细胞发生膨胀, Ca2+ 使细胞膜磷脂层形成液晶结构,促使细胞外膜与内膜间隙中部分核酸酶解离,诱导形成感受态。此外,Ca 2+ 能与加入的DNA分子结合,形成抗脱氧核糖核酸酶的羟基磷酸钙复合物,黏附在胞膜的外表面;42 热激处理,细胞膜的液晶结构发生扰动,出现间隙。五、重组DNA导入表达细胞2021-11-1958氯化钙转化法要点:氯化钙转化法
47、要点:1. 氯化钙(二价钙离子)的作用:提高细胞壁(膜)的通透性;2. 热激后迅速转移到冰上:促使质粒DNA转移进入胞内;3. 这种转化方法适用于双链环状DNA(质粒),线型DNA不能采用此法。(在自然界自然发生的转化过程中,进入细菌细胞中的为单链DNA。)五、重组DNA导入表达细胞2021-11-1959标准质粒DNA、重组质粒DNA、大肠杆菌JM109、离心机、0.1mol/L CaCl2 、LB培养基、微量移液器、微量离心管、抗生素、20mmol/L MgSO4、微孔滤膜及滤器、培养皿、三角瓶、恒温水浴箱 、恒温摇床 、超净工作台 、玻璃涂布棒、95% 乙醇 实验材料:实验材料:五、重组
48、DNA导入表达细胞2021-11-1960注意事项:注意事项:质粒的质量和浓度。用于转化的质粒DNA应主要是超螺旋DNA。转化效率与外源DNA的浓度在一定范围内成正比,但当加入的外源DNA的量过多或体积过大时,转化效率就会降低。试剂的质量。所用试剂均需要最高纯度的,并用超纯水新鲜配制,灭菌备用。防止杂菌和杂DNA的污染。五、重组DNA导入表达细胞2021-11-1961二价钙离子对转化效率的影响热激温度对转化效率的影响五、重组DNA导入表达细胞2021-11-1962感受态细胞的制备感受态细胞的制备:1、从新活化的E.coli DH5平板上挑取一单菌落,接种于35ml LB液体培养中,37振荡
49、培养至对数生长期(12h左右);2、将该菌悬液以1:1001:50转接于100ml LB液体培养基中,37振荡扩大培养,当培养液开始出现混浊后,每隔2030min测一次OD600,至OD600为0.30.5时停止培养,并转装到1.5 mL离心管中;3、培养物于冰上放置20min;4、 04,4000g离心10min,弃去上清液,加入1 mL冰冷的0.1mo1L CaCl2溶液,小心悬浮细胞, 冰浴20分钟;五、重组DNA导入表达细胞2021-11-19635、04, 4000g离心10min,倒净上清培养液,再用1.0 mL冰冷的0.1mo1L CaCl2溶液轻轻悬浮细胞,冰浴20min;6、
50、 04, 4000g离心10min,弃去上清液,加入100 L冰冷的0.1mo1L CaCl2溶液,小心悬浮细胞,冰上放置片刻后,即制成了感受态细胞悬液; 制备好的感受态细胞悬液可直接用于转化实验,如果在4放置1224h,其转化效率可以增高46倍;也可加入占总体积15左右高压灭菌过的甘油,混匀后分装于1.5ml离心管中,置于-70条件下,可保存半年至一年。五、重组DNA导入表达细胞2021-11-19642021-11-19六、重组体细胞的筛选纯化鉴定 在重组DNA导入受体细胞的实验中,由于重组率很低,因此需要从这些细胞中筛选出期望重组子,将转化后的细胞涂布于特定的固体培养板,生长出的单菌落或
51、噬菌斑进一步筛选和鉴定。652021-11-19 1、载体遗传标记法载体遗传标记法(抗生素抗性筛选法、营养缺陷型筛选法、噬菌斑筛选法、互补筛选法) 2、核酸分子杂交法核酸分子杂交法 菌落原位杂交:制备与目的基因某一区域同源的探针序列,根据核酸杂交原理,探针序列特异性的杂交目的基因,并通过放射性同位素或荧光基团进行定位检测。六、重组体细胞的筛选纯化鉴定662021-11-19 3、目的基因表达产物测定法目的基因表达产物测定法 如果重组DNA的目的基因能在宿主细胞中编码蛋白质,且宿主细胞本身不含该蛋白质,那么可以通过检测蛋白质的生物功能或结构来筛选和鉴定重组子。六、重组体细胞的筛选纯化鉴定67 用
52、荧光原位标记筛选重组体 1、制备核酸探针,通过数据库查询所需的寡核苷酸探针的资料,用合成仪合成,然后用荧光素进行标记。 、将样品进行打碎、离心、清洗等步骤,使微生物细胞与杂质进行分离,同时增大细胞壁的通透性,保证探针算例进入与杂交。 、配置杂交液,其中杂交液中的甲酰胺的浓度直接影响杂交的特异性,将杂交液与样品之一杂交炉(避光、密封),杂交完成后用洗脱液(或)将多余的探针除去。 、加少量的苯二胺甘油溶液覆盖样品,防止荧光淬灭,再封片,用荧光显微镜观察、照相进行分析。六、重组体细胞的筛选纯化鉴定2021-11-1968荧光原位杂交技术 荧光原位杂交是一种非放射性原位杂交方法,将荧光标记的探针与待测
53、序列进行杂交,根据杂交信号的有无及类型达到诊断的目的。 原理:基于碱基互补配对的原则,用荧光素标记的已知外源DNA或RNA作探针,与载玻片上的组织切片等杂交,与待测核酸的靶序列专一性结合,通过检测杂交位点荧光来显示特定核苷酸序列的存在、数目和定位。六、重组体细胞的筛选纯化鉴定2021-11-19692021-11-19产物1 1. .菌种菌种RRhPIZpQE-40 Ecoli M15菌株70七、工程菌产物鉴定和保存2021-11-192 2. .材料与试剂材料与试剂 DEAE-Sepharose FF(琼脂糖快流速阴离子交换剂)为杭州争光树脂有限公司产品,SephadexG-25为Sigma
54、公司产品,Superdex75为GE公司产品,溶菌酶、脱氧核糖核酸酶、胰蛋白酶和羧肽酶B均为Sigma公司产品,谷胱甘肽氧化型(GSSG)和还原型(GSH)为上海博奥生物科技有限公司产品,二硫苏糖醇(DTY)为Organics Inc产品,13-巯基乙醇和异丙基-13-D-巯基吡喃半乳糖苷(IPTG)为BB1分装,胰蛋白胨、酵母粉(英国Oxiod公司),氨苄青霉素(美国Sigma公司),其余试剂均为国产分析纯产品。71七、工程菌产物鉴定和保存2021-11-19培养基:()LB培养基(g/L):胰蛋白胨10.0,酵母提取物5.0,NaCl 10.0,pH 7.0;()发酵培养基(g/L):葡萄
55、糖4,甘油15,酵母粉30,蛋白胨30,Na2HPO4 12,KH2PO4 6,NH4C l1,NaCl 2,MgSO4 0.48,pH 7.0;()甘油补料培养基(g/L):甘油300,酵母汁150,MgSO4 10,pH 7.0。所有培养基使用前均加入氨苄青霉素至终浓度50mg/L。水平恒温摇床(德国Therma公司);BiostatB发酵系统(德国Braun公司);蛋白质电泳凝胶自动成像系统(英国Syngene公司)。72七、工程菌产物鉴定和保存2021-11-193 3. .细菌培养和细菌培养和RRhPIRRhPI的表达的表达 采用二级发酵的方式,用正交法优化培养条件,并将优化条件用于
56、发酵罐进行发酵,收获湿菌体。RRhPIZpQE-40 Ecoli M15的发酵罐培养:将lO lId经过活化的RRhPIpQE-40 Ecoli M15转移至100 ml培养基中进行培养,培养一段时间后,将其转移至含有1.5L培养基的发酵罐中,培养一段时间(转速为300r/min,通气量为1:1.5-1:1.8),过程中加人一定量新鲜的培养基并用NaOH调节pH,之后加入IPTG并升温诱导RRhPI的表达,转速随即调为400-500rmin,增大通气量至1:1.8-1:2.0,继续培养一段时间后,收集菌体。73七、工程菌产物鉴定和保存2021-11-194 4. .包涵体的收集和洗涤包涵体的收
57、集和洗涤 将收集的湿菌体冻存于-2O ,然后悬浮于缓冲液A(50mmol/L rifs-HC1,0.5mmol/L EDTA,50mmol/L NaC1,5 甘油,0.1-0.5mmol/LDTY,pH7.9)(5-6ml/g湿菌)中,加入溶菌酶(5mg/g湿菌体),室温或37振荡2h。冰浴超声10S30次,其间每次间隔20S,功率为200W。10条件下1000g离心5min去除细胞碎片。上清液中的包涵体(Inclusion body,IB)在4条件下27000g离心15min收集,然后用含2mol/L尿素的缓冲液A充分悬浮,室温静置30min后4条件下17000g离心15min,收集沉淀。沉
58、淀再用含2脱氧胆酸钠的缓冲液A充分悬浮,4条件下17000g离心l5min,收集沉淀。最后沉淀用10mmol/L rifs-HC1,pH7.3洗涤两次(4,17000g离心15min)。74七、工程菌产物鉴定和保存2021-11-19 注意事项:细胞内表达的最大问题就是容易形成不溶性的包涵体,它的形成对表达产物的活性不利。75七、工程菌产物鉴定和保存2021-11-19 包涵体(inclusionbody)是细菌表达的蛋白质在胞内互相凝集而形成的无活性固体颗粒。具有很强的折光性。正常的大肠杆菌基因以重组方法使其在大肠杆菌内表达也会形成包涵体。说明不仅仅是外源蛋白才能形成包涵体,同时也发现有表达
59、量较低的基因产物也是以不可溶形式存在的。包涵体的形成不仅仅与宿主细胞、表达基因有关,还与培养外环境有关系。其形成的原因多数认为:目的基因的过度表达使蛋白质无足够时间进行肽链折叠,产生凝集。重组蛋白所处的环境条件对包涵体也有较大影响,如当温度超过某一种蛋白质的变性温度时,随着温度的增加凝集量也增加。当环境PH接近某一种蛋白的等电点时,蛋白的凝集增加,包涵体的形成也增多,此外,离子组成和强度、辅助因子、氧化还原电位等均可影响包涵体的形成。76七、工程菌产物鉴定和保存2021-11-19 应对方案: 改变发酵条件,如发酵温度、培养的PH值等来减少重组蛋白的凝集,进而有效控制包涵体的形成,给下游纯化工
60、作创造有利条件。77七、工程菌产物鉴定和保存2021-11-195 5. .RRhPIRRhPI的初步纯化的初步纯化 将收集的IB用含有0.1-0.313-巯基乙醇的缓冲液B(30mmol/L HC1,8mol/L尿素,pH8.0)溶解,上于已用缓冲液B平衡的DEAE-Sepharose FF柱,用合适的氯化钠梯度洗脱,收集含RRhPI的洗脱液。6 6. .RRhPIRRhPI的重组复性的重组复性 将初步纯化后的RRhPI通过Sephadex G-25脱尿素,转换缓冲液为不同pH的50mmol/L Gly-NaOH重组液,或含有适量GSSG的Gly-NaOH缓冲液中,使蛋白终浓度为0.1-0.
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