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文档简介
WHONET5.6软件使用以及全国耐药监测网新版系统的使用说明,杨永清2014.10.20,Whonet5.6的使用全国细菌耐药监测网新版系统的,Whonet软件的发展,1989年,2011年,4,WHONET软件简介,世界卫生组织独立开发的用于管理细菌实验结果的数据库软件目的是管理实验室常规实验结果,进行耐药监测数据的统计分析。具有动态性、高效性、广泛性和共享性等特点。已成为全球广泛使用的病原菌耐药监测的有力工具,5,WHONET分析软件主要用途,加强实验室数据在当地的应用管理实验室常规药物敏感性试验结果进行数据统计分析,尤其是抗生素药敏试验结果。临床选择抗生素,指导临床合理用药。发现医院感染暴发发现实验室中的质量控制问题确定耐药机制通过数据交换,促进不同实验室间的协作,耐药监测网的建立,6,WHONET软件特征,标准化的windows操作,操作简单。支持多国语言(支持中文)强大的数据分析能力开放的代码结构。自定义代码汉化细菌名称、标本种类等导入其它数据文件,可避免重复输入无缝连接Microsoft Office软件,7,WHONET系统的安装,程序获取(最广泛的用途)世界卫生组织网站./drugresistance/whonetsoftware/en/WHONET中文官方网/index.html微生物之家论坛中国感染与化疗杂志网站CDRom光盘安装(很少使用)软盘安装(8张软盘)(已淘汰),主要内容,WHONET系统的功能、应用及注意事项数据输入实验室设置数据统计分析统计参数的保存耐药监测资料分析前处理及统计要求输入错误纠正药敏结果错误纠正补充Etest等MIC数据,高手之路,WHONET软件的主界面,不同实验室设置共存,多语言版本转换,10,WHONET主界面,如何进行实验室设置-最主要的工作,输入资料前,必须提供实验室的某些信息药敏试验所用的抗生素医院或病区设置信息数据段:可对WHONET所提供的数据段进行添加或删除,标本信息区,药敏数据区,抗生素设置,提示语设置,数据字段设置设置,科室设置,实验室设置,13,14,15,药敏组合的作用:输入药敏结果时,快速定位,16,无细菌时的界面包含所有抗菌药物,输入细菌时的界面只显示“药敏组合”选择的抗菌药物,专家系统的应用,18,数据输入注意点,所有信息均具有可选择性(不需必须输入)日期格式:一定要按日期格式输入,否则将影响统计日/月/年 日-月-年月/日/年 月-日-年 推荐格式质控菌株的输入:在病例号中输入菌株名如:ATCC 22922,系统会自动将标本种类改为“qc”。若系统无法认识上标准菌株,可将标本种类改为“qc”有设置药敏组合的输入时,按“ENTER”会自动跳到组合中的下一个抗生素。药敏结果:可用“RIS”方式输入,但推荐使用定量输入如在纸片法中:18MM 等,文本格式与数字格式的差别,由于日期格式的不规范而导致的统计中断,所谓“类型不匹配”是指在本该为日期格式一栏中输入了非日期格式的数据,如20060607,而规范的格式应为2006-06-07.,即”类型不匹配“,数据文件格式,WHONET数据文件以dBASE格式保存,其内容由实验室设置所决定数据文件的命名标准样式为:年+W+月+国家代码+实验室代码如14W05CHN.gsy为甘肃省人民医院14年5月的数据13W01CHN.GSY 13W05CHN. GSY 13W09CHN. GSY12W02CHN. GSY 12W06CHN. GSY 12W10CHN. GSYW0398CHN. GSY W0798CHN. GSY W1198CHN. GSYW0498CHN. GSY W0898CHN. GSY W1298CHN. GSY数据文件可以用EXCEL软件打开、编辑并保存!,合适的文件格式,不合适的文件格式,合并数据库,可将多个数据文件合并为单个大的数据文件,目的文件,14W01chn.gsy14W02chn.gsy14W03chn.gsy14W04chn.gsy14W05chn.gsy14W06chn.gsy,14W0106chn.GSY,23,合并文件后的提示,成功合并,数据分析界面,分析类型及附加项,选择要分析的细菌,分析中包括的菌株信息,要分析的数据文件,输出格式,数据分析分析类型及选项,1、菌株行列表及总结2、耐药、中敏及敏感率3、多文件敏感率4、散点图5、耐药分析组合6、Bactrack,菌株行列表及总结甘肃省人民医院医院2011年菌种分布,27,耐药率,注意判断标准的差异,28,编辑显示于屏幕的图形,29,图形美化,散点图不同抗菌药物的比较,肺炎克雷伯菌,31,多文件耐药/敏感率的比较,耐药分析组合,识别可能发生的感染爆发或不常见的表型定期进行耐药分析组合,可提示某些克隆菌株的频率增加或传播与否。感染控制人员可利用耐药分析组合对某一细菌的耐药机制特征进行进一步的研究可有效地定义耐药酶的优先底物,由此可推测具体的耐药机制。输出格式首先列出敏感菌株,最后为多重耐药株。,耐药分析组合输出,有字母耐药或中敏 空格敏感 “”未做实验,鲍曼不动杆菌,PDR,XDR,MDR,34,耐药分析组合的作用,同一耐药克隆菌株出现于不同时间,35,耐药分析组合的作用,同一耐药克隆菌株出现于病房,36,统计头孢呋辛敏感但亚胺培南耐药的肠杆菌科细菌,选择不同的组合得出我们所需要的分析结果,37,Bactrack提示功能,亚胺培南耐药的大肠埃希菌,宏的应用,“宏”是通过一次点击就可应用的命令集。它几乎可以自动完成程序执行过程中的任何操作,甚至可以执行某些认为不可能完成的任务。使用宏可以节省时间可避免由于多次的重新选择二导致抗菌药物漏选的问题,宏的设置,宏的应用,41,细菌耐药监测数据的处理及应对措施,42,日期格式错误导致数据不能统计,43,时间跨度:至3000年,直径跨度:6-80mm,输入超范围的数据,44,出生日期超过年限范围仪器导入错误,45,抑菌圈直径过大,所谓“溢出”是指输入了超过软件设置最大限度的数据,如“日期”一项最大为3000年,但却错误地输入了超过3000年的数据,如4723年,5981年。,由于超范围数据而导致的统计中断,47,原始顺序,从大到小,从小到大,标本类型未输入,48,标本类型大写、无标本类型或错误的标本类型的影响,标本类型大写,49,输入错误,50,细菌类型对统计结果的影响,导致结果,G+菌与G-菌相加与数据总数不一致,51,药敏数据方面的错误,判断标准的差异葡萄球菌属替考拉宁:11-13mm利奈唑胺:21mm肠球菌属:万古霉素:14-17mm替考拉宁:10-14mm利奈唑胺:20-23mm链球菌属万古霉素:17mm利奈唑胺:21mm,更改设置,加入新的抗菌药物种类后打开原来的文件不显示加入新的数据段后打开原来的文件不显示 原因何在?,增加“替加环素”,54,无“TGC-ND”一项,打开原有数据,56,“TGC-ND” 项,57,轻松拷贝WHONET设置,如何升级WHONET软件,在“控制面板”中删除旧版本的WHONET软件重新安装新版本的WHONET软件 注意:资料备份!,全国耐药监测网新版系统的使用说明,新版系统的简介如何上传高质量的数据,60,软件版本划分,重点,61,系统形式,使用主流最新版浏览器直接登录无须完装任何软件,系统软硬件要求,计算机必须连接互联网(Internet)网速至少达到2M(推荐4M)使用兼容性较好的最新版浏览器由于微软宣布从2014年4月开始,不再对 Windows XP 操作系统进行补丁更新,同时对 IE8 以下版本的浏览器也不再提供更新。因此,对于还在使用 XP 操作系统的用户,我们强烈建议您升级为更加安全的 Windows 7 或者 Windows 8。否则,连接互联网之后,很有可能瞬间被入侵或者被植入木马,这会对您的数据安全造成极大威胁。,系统浏览器要求,火狐浏览器【Firefox】(最新版)谷歌浏览器【Chrome】(最新版)苹果浏览器【Safari】(最新版)Opera浏览器(最新版)遨游浏览器(最新版)百度浏览器(最新版)360极速浏览器(最新版)微软IE11浏览器(仅支持 Windows 7 以上操作系统,不支持低内核版本的IE浏览器:微软 IE6 浏览器,即 Windows XP 操作系统自带的浏览器微软 IE7 浏览器微软 IE8 浏览器不支持使用低版本IE内核的浏览器或者双核浏览器:360安全浏览器猎豹安全浏览器世界之窗浏览器搜狗浏览器QQ 浏览器,如果您本机已经安装了微软IE10以上版本的浏览器,那在这台机器您可以使用任意浏览器登录本系统。,64,官方网站访问地址,官方网站的永久域名为:/,65,数据上报相关要求,上报频率:目前系统要求1个季度上报一个文件,不允许提前上报。系统能接收的数据文件格式:WHONET 5.6 标准DBF格式的数据文件,对文件扩展名无具体要求。Office 2003 Excel 格式,文件扩展名必须为(.XLS)Office 2007/2010 Excel 格式,文件扩展名必须为(.XLSX),66,数据文件校验的相关术语-1,字段名:我们把数据文件中的表头称为字段名,一个数据文件可以有多个字段,例如:FIRST_NAME、SEX、SPEC_TYPE、AMX_NM等等记录:我们把每一行的横向数据称为记录,例如:第3行记录、第9行记录等等字段值:我们把每一行记录的某个字段所填写的值称为字段值,例如:第3行记录的FIRST_NAME的字段值为【张飞】。,67,数据文件校验的相关术语-1(图示),68,数据文件校验的相关术语-2,必填字段:顾名思义,必须填写值不能空的字段。字段最低校验通过率:代表一个字段中所填写全部值的最低正确率。比如:某字段的最低校验通过率要求达到90%,当此字段填写了100个值,那么这100个值中至少要填对90个,这个字段才可以通过校验,否则该字段就无法通过校验,直接导致整个数据文件无法上报成功。高质量记录:就是一条记录中,所有字段填写的值均是正确的值,没有产生任何警告信息或者错误信息。高质量记录占比:就是所有上报成功的数据中高质量记录所占的比重,这个指标并不影响您的数据上报,即使高质量记录占比为0%,也有可以上报成功。,69,*数据文件的整体校验规则,系统如何判断一个文件能够上报成功?系统对数据文件中的每一个字段都有一个最低校验通过率的要求,当所有的字段都达到这个最低要求,就可以上报成功;达不到就算上报失败。例如:系统要求【WARD】的最低校验通过率为100%,其实也就是要求该字段不能出现任何错误,如果您上传了100条记录,其它的字段都填写正确,只有【WARD】字段发现了1个错误,那么这个字段的通过率为99%,未达到系统所要求的100%,因此整个文件都不会被接收,如果100个全填写对了,就可以上报成功,至于【WARD】字段本身的校验规则,在后面会有详细介绍。,70,系统不接收的特殊数据,系统目前只接收革兰阳性菌与革兰阴性菌的监测数据,除此以外的其它细菌类型的监测数据系统均不接收,例如:真菌、厌氧菌等。系统不接收质控类标本数据,即【SPEC_TYPE】为【qc】并且【SPEC_CODE】为【75】或者【SPEC_TYPE】为【ex】并且【SPEC_CODE 】为【99】的数据。以上两类数据,如果在上报的数据文件中出现,系统会把这些数据忽略,根本不去分析和检验。这并不影响每一个字段的最低校验通过率。也就是说,这些被忽略掉的数据对文件能否上报成功一点影响都没有。,71,各字段的最低校验通过率清单,黑色:不会导致数据上报失败;蓝色:不填写或者填写错误系统可以自动填写或者更正,不会单独导致数据上报失败;红色:填写不正确会导致数据上报失败,72,*对数据上报是否成功有直接影响的字段清单,* 注 * 数据文件无法通过校验,96%以上都是由于这些字段无法校验通过引起的,而由于【WARD】字段导致数据文件无法通过校验的情况要占到75%以上。,73,K-B 法字段填报规则,非必填项,最低校验通过率为90%对应的字段名应为:抗生素英文代码+“_ND”+抗生素含量例1:阿米卡星应表示为 AMK_ND30例2:阿莫西林应表示为 AMX_ND25填写结果只能为6至80之间的整数,否则视为填写错误,系统会将错误值忽略掉,这会影响该列的通过率。切记:不能填写(S、I、R)不能有小数点不能带任何符号(例如:、4、=4、4.0、=4.0小于或者小于等于上述两类数字:4、=4、4.0、=特殊符号和将自动转换为 全角特殊符号将自动转换为 4/32、4.0/32、4.032、4.032,容错后的结果分别为:4、4.0、4、4.0例3:=4/32、=4.0/32、=432、=4.032,容错后的结果分别为:=4、=4.0、=4、=】符号。切记:不能填写(S、I、R)目前系统允许接收的 Etest 法字段仅有三个,其它Etest法药敏值均不接收:PEN_NE青霉素G(Etest法)VAN_NE万古霉素(Etest法)CTX_NE头孢噻肟(Etest法),78,细菌类型字段【ORG_TYPE】值为【-】时即细菌类型是革兰阴性菌时,如下药敏字段如果填值,无论是何值,都将视为错误,影响通过率,79,细菌类型字段【ORG_TYPE】值为【+】时即细菌类型是革兰阳性菌时,如下药敏字段如果填值,无论是何值,都将视为错误,影响通过率,80,国家字段【COUNTRY_A】,非必填字段,但系统要求校验通过率100%如果不填写,系统会自动生成【CHN】如果填写了,并且填写的不是【CHN】,则系统会自动将其替换为【CHN】,同时产生警告信息,影响高质量数据占比。此字段无论填与不填,都不会影响整个文件是否校验通过建议不填写,81,来源字段【ORIGIN】,非必填字段,但系统要求校验通过率100%如果不填写,系统会自动生成【h】如果填写了,并且填写的不是【h】,则系统会自动将其替换为【h】,同时产生警告信息,影响高质量数据占比。此字段无论填与不填,都不会影响整个文件是否校验通过建议不填写,82,医院字段【INSTITUT】,非必填字段,无最低通过率要求此字段为系统内部统一分配的国家标准代码,标准6字符前两位为国家标准省级代码(如北京为11,云南为53等),后4位为流水编码(从0001开始),例如:昆明医科大学第一附属医院可能为(530001)此字段无须填写,数据上传后系统会自动填写,不影响通过率若填写则必须与本院的代码一致,否则系统会自动替换为正确代码,同时产生警告信息,影响高质量数据占比,但不影响通过率。此字段无论填与不填,都不会影响整个文件是否校验通过建议不填写,83,实验室字段【LABORATORY】,非必填字段,无最低通过率要求最长3个字符系统不将此作为医院标识,且无具体格式要求如果填值,只要不超长,系统就会接收,不影响通过率。如果超长,则系统会给出报错信息并清空该值,影响高质量数据占比,也影响通过率。此字段无论填与不填,都不会影响整个文件是否校验通过建议不填写,84,*病历号字段【PATIENT_ID】,此字段仅对住院病历有要求,系统要求最低通过率为 95%,也就是说住院病历的病历号至少要填写 95%。对于门诊病历,系统要求尽量填写,但无论填与不填,系统都不做校验,并且不影响通过率。此字段最长可以填写16个英文或者数字字符,如果超出这个长度,系统会提示错误信息,影响通过率。系统如何辨别门诊病历和住院病历?当【DEPARTMENT】字段填写的值为【out】(代表门诊)或者【eme】(代表急诊)时,系统会认为是门急诊病历,可以不填写【PATIENT_ID】字段。当【DEPARTMENT】字段所填写的值不为上述两个值时,系统会认为是住院病历,要求必须填写【PATIENT_ID】字段,如果不填写,会影响通过率,系统在住院病历中允许有5%的病历不填写病历号,用来应对特殊情况的出现。,85,*病人姓名字段【LAST_NAME】、【FIRST_NAME】、【FULL_NAME】,系统要求【FULL_NAME】字段必填,并且最低填报率要达到95%【FULL_NAME】字段的最大填写长度为50个字,中英文不限。系统不要求【FIRST_NAME】和【LAST_NAME】必须填写。【FIRST_NAME】如果填写,则其最大长度不能超过20个字,中英文不限。【LAST_NAME】如果填写,则其最大长度不能超过30个字,中英文不限。容错处理:当系统发现【FULL_NAME】字段没有填写的时候,系统会自动将【LAST_NAME】与【FIRST_NAME】相加,将相加之后的结果写入【FULL_NAME】字段,这并不影响高质量数据占比,且不影响校验通过率。例如:【LAST_NAME】填写为【张】,【FIRST_NAME】填写为【飞】,则相加后的结果【张飞】将写入【FULL_NAME】字段。本质上系统是要求这三个字段至少填写1个,整体校验通过率为95%。因此,通常情况下,这三个字段任选一个填写即可,尤其是使用WHONET软件录入数据的老师,可以任选【FIRST_NAME、LAST_NAME】字段,不需要去考虑填写【FULL_NAME】字段。,86,*性别字段【SEX】,此字段要求必填,最低校验通过率为 95%最长1个字,中英文不限系统要求只能填写小写的“f”或者“m”容错处理:如果填写了【男、男性、男人、大写M、大写全角、小写全角】,系统会自动将其替换成小写的纯英文字母“m”如果填写了【女、女性、女人、大写F、大写全角、小写全角】,系统会自动将其替换成小写的纯英文字母“f”当系统发现上述情况,进行自动替换后,会产生警告信息,影响高质量数据占比,但不影响数据校验通过率。,*年龄字段【AGE】,此字段要求必填,最低通过率为 95%最长3个字符,必须为半角数字级纯小写英文字母。具体格式要求如下:不带任何后缀的13位整数或者12位整数+“y”后缀,代表年龄是按岁计算,例如:1、1y、25、25y、103。12位数字 + d 即代表年龄按天计算,例如:1d、28d、99d。12位数字 + w 即代表年龄按周计算,例如:1w、2w、10w、99w。12位数字 + m 即代表年龄按月计算,例如:1m、2m、10m、99m。不符合上述规则的值均为非法值,系统会提示错误信息,并影响通过率如下特殊情况也算做非法数据:当填写
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