软件在医学数据分析中的应用

SAS软件在医学数据分析中的应用,SAS软件简介,SAS是美国与西欧使用最为广泛的三大著名统计分析软件（SAS，SPSS和SYSTAT）之一，是目前国际上最为流行的一种大型统计分析系统，被誉为统计分析的标准软件。是国际上公认的最权威的统计软件。 以苛刻严格著称于世的美国FDA新药审批程序中,新药试验结果的统计分析规定只能用SAS进行,其他软件的计算结果一律无效!哪怕只是简单的均数和标准差也不行!由此可见SAS的权威地位。 2004年开始中国新药临床试验结果规定应用SAS软件分析。,SAS与SPSS比较,作为统计软件大家族里的“傻瓜相机” ，SPSS的功能是最弱的，但易用性排在所有统计软件之首。 不过SPSS的易用性也极大的限制了它的功能和可扩展性。除了SPSS本身的菜单提供的功能，用户无法通过编程或者插件来扩展它的功能，而且SPSS提供的都只是最基本的常用的方法。,SAS全球专业认证,SAS专业认证是一项拥有极高国际声誉的专业认证，在欧美等国的职场上流行的一句话“If you have a SAS certification, You will never lose your job ”。 销售模式：只租不售 （每5年一个周期） 财富500强中97%的企业都在使用SAS商业智能解决方案,2003年(301医院与军事医科院博士生）各统计软件使用情况,SAS窗口,PGM窗口（Program Editor)： 提供编写SAS程序的文本编辑器 LOG窗口： 显示执行程序过程中的相关信息 OUTPUT窗口： 显示程序运行的结果 命令窗口与探索者窗口,SAS程序的编写,一个完整的SAS程序一般由数据步（DATA步）和过程步（PROC步）两部分组成。 DATA步以DATA语句开始，通过指定数据集名称、定义变量名及类型和读入数据等建立SAS数据集。 过程步以PROC语句开始，通过调用不同的分析模块来分析SAS数据集。,其它格式的数据库直接导入转换： excel(.xls); dbase(.dbf); lotus(.wk)等 将数据读入系统，建立数据集（直接输入Editor窗口）。,SAS数据集建立,外部数据导入,例：有一批体检数据，包括受检者的姓名、性别、年龄、身高、体重信息。要求按性别分别计算身高、体重的描述性统计量：均值、标准差、最大值、最小值。 该数据以Excel.xls文件形式储存。 文件名称：tijiandata.xls,探索者窗口,在Editor 程序编辑窗口输入源程序,数据步：将数据读入系统，建立数据集 : DATA语句开始,后面加上数据库的名字。 INPUT语句描述数据变量 , 用$表示变量是字符型 CARDS语句指示后面是数据,每行为一个观测数据，数据间无分号。 数据最后以“；”开头的空行结束 。 每个语句都以“；”结束。,SAS程序数据步格式,Data ； Input $ .; Cards; . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ;,SAS过程步,对数据集中数据进行分析、处理。 以PROC语句开始，调用SAS过程。 每个语句都以“；”结束。 整个程序最后要有RUN语句。,SAS程序的书写格式,不分大小写 单个名称中不能空格，不同名称间必须空格 一行可写多条语句，用分号分割 一条语句可写多行 数据行后不加分号，数据最后单独加分号行 程序用“RUN；”语句结束,运行SAS程序,方式一：鼠标点击执行按钮 方式二：按功能键“F8” 方式三：执行菜单命令 RunSubmit 方式四：在命令框输入SUBMIT 命令并执行,SAS程序实例,例子 某学生上学期8门课程的分数分别为88，90，87，76，92，78，80，86。试用SAS编程求其平均分数。 （1） 在PGM窗口键入下列程序 data fenshu; input chengji; cards; 88 90 87 76 92 78 80 86 ; proc means; var chengji; run; 过程步,数据步,查看结果 （output 窗口）,Analysis Variable : chengji N Mean Std Dev Minimum Maximum - 8 84.6250000 5.8782286 76.0000000 92.0000000 - 从结果看出，该学生上学期8门课程的平均成绩为84.625。,查看运行过程及出错信息,激活LOG窗口( F6 ) 黑色文字：源程序及运行情况 蓝色文字：程序运行情况的说明信息 红色文字：出错信息 绿色文字：警告信息,保存SAS程序及其他窗口内容,激活相应窗口，然后选择： 方式一：鼠标点击“存盘”工具按钮 方式二：执行菜单命令【File】【Save】/ 【Save as】 可保存程序、数据文件、运行结果、日志等。 SAS保存成纯文本格式文件（.txt)。,在SAS系统内打开已保存的文件,只能在Program Edit窗口打开文件，选择： 方式一：鼠标点击“打开”工具按钮 方式二：执行菜单命令【File】【Open】 可打开以前保存的程序、数据文件、运行结果、日志等文件及其他文本格式的文件。,SAS程序主要关键词,means; (n, mean, std, Q1, Q3, CV, median, clm) univariate normal; (正态性检验，均数是否为0的 假设检验：参数与非参数检验） ttest; (两个样本均数比较的t检验） anova; (各样本含量相等的方差分析） glm; (各样本含量不等的方差分析） npar1way; (非参数检验） reg; (线性回归方程：单元或多元） corr; (线性相关：线性相关或秩相关） freq; (卡方、Fisher检验） logistic; (非线性回归） lifetest; (生存分析）,proc,定量资料的描述性分析,分析结果,定量资料的正态性检验,正态性检验结果,配对设计的t-test,为了比较两种方法对乳酸饮料中脂肪的含量测定结果是否不同，随机抽取了10份乳酸饮料制品，分别采用哥特里-罗紫法和脂肪酸水解法测定其结果，问两种方法检测结果是否不同？,成组设计资料的t-test,采用国产药物和进口药物治疗绝经后妇女骨质疏松症，试比较两种药物的疗效是否有差别,完全随机设计资料的方差分析,方差齐性检验,四格表资料的2-test,某医师欲比较胞磷胆碱与神经节苷脂治疗脑血管疾病的疗效，将78例脑血管疾病患者随机