化学化工常用化学办公软件的分析与应用

化学化工常用化学办公软件的分析与应用

作为一种重要的化学教材和研究工具，计算机在当今社会中起着不可替代的作用。在信息技术的快速发展中，有许多关于化学教材和化工的软件，它们涵盖了化学教材和化工的各个方面。它简要介绍了使用化学办公软件、图纸、数据处理、图像分析和其他软件。有关化学办公软件市面上很多,各有其优缺点,当前国内外流行的ChemOffice系列软件,美国剑桥公司最新版本ChemOfficeUltra2008是世界上最优秀的桌面化学办公软件,集强大的应用功能于一身,该软件主要包括ChemDraw(化学绘图),Chem3D(化学分子模拟及仿真)、ChemFinder(化学信息搜寻整合系统)等一系列完整的软件。此外还加入了E-NotebookUltra10.0,BioAssayPro10.0,量化软件MOPAC、Gaussian和GAMESS的界面,ChemSAR,ServerExcel,CLogP,CombiChem/Excel等等,ChemOfficePro还包含了全套ChemInfo数据库,有ChemACX和ChemACX-SC,Merck索引和ChemMSDX。其中ChemDraw具有简单易懂、画图快、结构精确特点,是世界上最受欢迎的化学结构绘图软件之一,是各种期刊杂志要求的化学结构绘图软件,可以将化合物名称直接转为结构图,省去绘图的麻烦;也可以对已知结构的化合物命名,给出正确的化合物名称;Chem3D分子轮廓及分子轨道特性分析,可以和多种离子化软件结合使用;提供工作站级的3D分子轮廓图及分子轨道特性分析,并和数种量子化学软件结合在一起。由于Chem3D提供完整的界面及功能,已成为分子仿真分析最佳的前端开发环境。ChemFinde模块-化学信息搜寻整合系统,可以建立化学数据库、储存及搜索,或与ChemDraw、Chem3D联合使用,也可以使用现成的化学数据库。ChemFinder是一个智能型的快速化学搜寻引擎,所提供的ChemInfo信息系统是目前世界上最丰富的数据库之一,包含ChemACX、ChemINDEX、ChemRXN、ChemMSDX,并不断有新的数据库加入。ChemFinder可以从本机或网上搜寻Word、Excel、Powerpoint、ChemDraw和ISIS格式的分子结构文件。还可以与微软的Excel结合,可连结的关连式数据库包括Oracle及Access,输入的格式包括ChemDraw、MDLISISSD及RD文件。Visio2003是一种专业的化工绘图软件,它可以帮助用户创建系统的业务和技术图表,说明复杂的流程或设想,展示结构或空间图,此软件可将用户的信息形象化、并能简单有效的输出。Visio2003中文版软件可以直接读入的图件(笔者将图形和图像合称为图件)类型主要有vsd(Visio文件)、svg(可缩放的向量图形)、dwg(AutoCAD绘图)、jpg(JPEG文件交换格式)、tif(Tag图像文件格式)、bmp(Windows位图)、png(可移植网络图形)、gif(图形交换格式)、emf(增强型图元文件);但在实际操作中,由于不同版本软件不完全兼容,并且许多作者常将各种类型的图件混排于Word文档中,而Visio与Word软件之间具有良好的兼容性,所以常用“复制粘贴法”把图件读入到Visio中。此外,由于系统共用一个剪贴板,所以对于只能用其他专业软件打开的图件也可用“复制粘贴法”将选中的图件直接读入到Visio中,在任何图件被读入Visio后,右键点击图件,将指针指向快捷键对话框中的“形状”,并在下一级选项中选择“取消组合”,将该图件各元素分开,以便于逐个编辑。Visio自带的图形模板库绘制,点击标题栏中的“文件”指向“新建”,在其下一级选单中可看到各种模板,选中所需要的模板图形,按住鼠标左键直接将其拖曳到工作区界面,就可很方便地进行绘制或修改各类图件。化学化工数据处理软件种类繁多,不同的数据可采用不同的处理软件,如Origin、SigmaPlot等,其中应用最广泛的是Origin系列,目前,Origin最新版本为8.0。该软件主要特点:使用简单,采用直观的、图形化的、面向对象的窗口菜单和工具栏操作,全面支持鼠标右键、支持拖方式绘图等。两大类功能:数据分析和绘图。数据分析包括数据的排序、调整、计算、统计、频谱变换、曲线拟合等各种完善的数学分析功能。准备好数据后,进行数据分析时,只需选择所要分析的数据,然后再选择响应的菜单命令就可。Origin的绘图是基于模板的,Origin本身提供了几10种二维和三维绘图模板而且允许用户自己定制模板。绘图时,只要选择所需要的模版就行。用户可以自定义数学函数、图形样式和绘图模板;可以和各种数据库软件、办公软件、图像处理软件等方便的连接;可以用C等高级语言编写数据分析程序,还可以用内置的LabTalk语言编程等。红外、核磁、质谱及晶体等专用的解析软件,如SHELXL、Wingx、ChemNMR等,SHELXL是为晶体结构精修而编写的程序,虽可以解析尺寸在0.25nm及更大的大分子化合物数据的结构,但主要是为了处理小分子结构而编写的。由于采用综合结构因子评价方法,因而在解析大分子结构时比传统的基于FFT法的大分子解析方法要慢得多,适于所有的空间群和各种类型的结构。极性轴限制与特殊位置限制可以自动的产生。该程序可以处理孪晶、复杂无序、绝对构型判定、CIF和PDB文件输出,还可以为困难精修控制提供大量不同的限制方法。SHELXPRO界面程序可以输出大分子的PS格式图片产生map和其他广泛大分子程序采用的格式。辅助程序CIFTAB利用cif文件产生小分子结构精修结果列表。在收集参考文献过程中,采用文献管理系统可有效的收集、整理、插入参考文献,提高文献利用率,常用的有EndNote4、ReferenceManager和ProCite等。EndNote4是著名的参考文献查找和引用管理软件,拥有上百万用户。能实现主题书目在线查找,灵活的图片管理。该软件支持PalmOS,以灵活移动收集的参考文献。此软件的优点:根据杂志的要求自动生产参考文献,所以在写文章的时候你再也不要考虑如何根据杂志的要求进行排版了;随时调整参考文献的格式。使用这些软件可以在需要的时候随时调整参考文献的格式;方便自己查找文献。可以把自己读过的参考文献全部输入到Endnote里头,这样