2023儿童呼吸道感染病原体核酸检测专家共识解读(全文)

2023儿童呼吸道感染病原体核酸检测专家共识解读（全文）急性呼吸道感染是儿童最常见的感染性疾病，其病原复杂多样，包括病毒、细菌、非典型病原体、真菌等，近年来，新型冠状病毒、禽流感病毒等新发再发呼吸道感染病原体也对儿童生命健康造成了严重威胁。快速准确的病原学诊断对于该类疾病的临床诊疗及防控具有重要意义。核酸检测方法因具有较高的灵敏度和特异性，得以快速地在临床推广应用，成为呼吸道感染病原体诊断的主要方法。为规范儿童呼吸道感染病原体核酸检测的临床应用、指导儿童呼吸道感染病原体的核酸检测并整体提升儿童呼吸道感染病原体的诊断能力，19位相关领域专家共同撰写《儿童呼吸道感染病原体核酸检测专家共识》（以下简称《共识》），并发表于中华实用儿科临床杂志。该《共识》首先概述了常见的病原体核酸检测方法，随后针对不同检测方法推荐了适用的人群，并介绍了不同情况、不同病原体应选择的合适标本类型。检测完成后，《指南》详细描述了检测结果解读及注意事项，并介绍了该结果对于指导临床用药的意义。

图一.《指南》内容概述—、呼吸道病原体核酸检测方法以是否依赖于基因组序列特征分为基因组序列依赖性和非依赖性两类方法，前者是根据已知的病原体基因组序列设计特异性引物，靶向性地进行病原体核酸扩增和检测的方法，如聚合酶链反应 (polymerasechainreaction，PCR);后者以mNGS为代表，是对样本中的病原体序列进行高通量测序，将获得的序列与数据库中序列进行比对分析而确定病原体的方法。病原体核酸检测方法按照技术原理又可分为核酸扩增、核酸杂交、基因测序、CRISPR(clusteredregularlyinterspacedshortpalindromicrepeats)技术等。常见的核酸检测方法概述见图二。PCR等温扩增高皴時异使币灵活、抿作相对简单且咸木何..初当前呼吸逍病原体核麒检测鈕普遍的方注PCR等温扩增]. 、、可设计參重備.进疔病偉悴多圭快谨检测’可瞳蔷呼吸漬感染幣见病康休尺耐斑基因噪作简单、快逢、高敢*特异*无需专席设箫的优点，较适用于現层和现场检测旷塔体系的稳左注相方了去的成黠度不贬传蜿PCR方法.对扩■培靶序列的氏度有眼制「成本也较高图二.常见的核酸检测技术噪作简单、快逢、高敢*特异*无需专席设箫的优点，较适用于現层和现场检测旷塔体系的稳左注相方了去的成黠度不贬传蜿PCR方法.对扩■培靶序列的氏度有眼制「成本也较高呼吸道病原体核酸检测推荐人群《共识》根据各种核酸检测方法进行优缺点分析，对呼吸道病原体核酸检测适用的人群推荐如下图三:图三.核酸检测试验推荐人群三、呼吸道病原体核酸检测的标本类型及选择《共识》对呼吸道病原体核酸检测的适宜标本类型进行了介绍，以及分别对不同病原体检测的标本类型选择做出建议，如图四。对于不同标本的采集和转运方式，《共识》中弓I用了美国传染病学会和美国微生物学会2018年更新的“用于传染病诊断的微生物实验室使用指南”的表格，见表一。

機酸检测的适宜

标本类型不同病原劇测

标本类型上呼啜道标本：剧拭子、口咽拭子.轨咽拭子、翼咽吸取物、鼻腔洗液咽洗液等機酸检测的适宜

标本类型不同病原劇测

标本类型下呼呱道标本：痰、气管吸取物、肺泡灌洗液、保护性毛刷标本等翼也血液、胸腔按液、组织或局灶穿剌物等标本商壽：上、下砰吸道标本及血液、胸腔积被尊标不妞菌：诱导痰、气陰吸取物和EALF等下呼吸逍标本及无菌邮液或组织标■本是逬行细菌NAAT的适宜标本WE典型病原林：上、芋呼吸直标本均适宜于肺炎支原体、肺炎衣原休和军团菌的NMT（但下呼吸道标本的结果更亮病原学诊断价值頁菌：怀疑下呼吸道畀菌感染时「建议采集BALF、无菌休液或组织标本进行真MNAAT;怀疑真菌性员窦炎时可酌情采枭易奚分泌韧和组奴标本图四.核酸检测的标本选择憾病原掠本 转运介质和时间常见呼吸道病毒如HR弭、HIF认HRV*HPIV.HAdV,HMPV等鼻闊拭子或■鼻咽吸砸撫鼻拭子載幕空WM或无苗容器「空潟下2h内或4-C下洙瓯咽洗極或口咽抗子，肺炎患儿还24h内或苣于-7（KT^存可选择支円管瞬册耐巨细胞病毒 血浆，支汽管肺泡灌洗叛 支气管.肺泡灌洪液：参眼常见呼吸道病毒血浆:EDTA管,室温下2h内单纯疱疹病毒女=管劇取组织械本*肺组织 参照常见呼吸道病毒肺炎支原商肺炎衣鼻咽拭子或鼻咽吸取物.口咽拭子或咽M4转运培养基或其他专属培祥墨室温下原协 洗疫肺粪患JU5可瞬支运管擬获取2h内或4笙:下2d内或畫于-巾兀下惺存BW$军团菌诱导痰.气管内抽吸物、支气管镜获取无菌容器，室遍下2h内或4弋下24h内碎百日咳匏特菌鼻咽轼子或鼻咽吸取飙口咽拭子 无菌容器-室遍下24h内结核分枝杆画和非结檢分枝杆菌胃滋痰液、诱导痰支汪管镜获取标无菌容器，室温下2h内或4壬下24h内本具也细菌 肺炎患儿可选择支汽管t械取閔标本 无菌容證室遍下2h内或4爻下24h内真菌痰菠或诱导战支气管镜获®啲标本无菌容器室温下2h内或4VF24*1内；1：HRSV:人呼吸道合抱病毒；HIFH：人济感病毒；HRV:人鼻病毒；HPIV:人謝流感病毒；HAdy：人腺病毒；HMPW人偏肺底哥VTM:病毒袴运痕EDTA:乙二胺四乙酸NAAT:核酿扩曙聶f;怀疑配瞬球菌、匚组和G组片落血性链球就淋病奈瑟氏菌导致削急性咽炎时”可以采集口圈拭子行细菌NAAT;M4转运培养基含有谕胶、万古辱素、两性莓素B和多黏菌素匚用于运送病毒、衣原体、關原休和支原体；拭子条应采用聚酯纤维、愿鑒或尼曲材料的拭子,.避免采用海藻酸珂海錦）抗子表1呼吸道感染病原核酸检测

推荐标本及转运注意事项

四、检测结果解读及注意事项4.1常规核酸检测同一份标本可能检出多种病原体，需要明确哪一种是主要病原体，同时也需要警惕样本污染的可能，应结合临床表现、病原体流行特征进行区分。上、下呼吸道标本的病原体核酸阳性结果在病毒、细菌、非典型病原体以及真菌感染中的诊断价值有一定区别，详见下图五。病原学诊断价病原学诊断价-病毒：一般为轻症/无症状.下呼吸道样本（十）价值更大；•址菌：下呼吸道样本I血液（+）,以及百日咳匏待菌的上呼吸道祥本（+）可以诊断；・非鈕型病原体：上、下呼吸道样本可诊断月市炎支IH体、肺炎衣原体和军团菌」但下呼吸道祐本（T价值克大；•真菌：下呼吸逍样本、无菌体液或组织标本、鼻窘分泌物（巧均可以诊断：图五.常规核酸检测结果解读另外，检测结果为阴性时，一方面可以考虑排除某种病原体感染；若结合临床高度怀疑某病原体及感染时，要考虑标本或检测问题，临床及时与实验室沟通。4.2mNGS目前，mNGS技术（病原宏基因组测序）的标准操作、数据分析、结果判读等尚无标准化流程。但随着其在临床上的不断推广，国内临床和检验领域发布了一系列专家共识，对mNGS技术中存在的某些共性问题，尤其是结果报告和解读提出建议。□胆告病原岭□胆告病原岭［1袁：建址按配的輒病乱闻理和哥生由諄鬲區评次型以丘出床关注程摩分鏗呈取1,便于快速嵋左目标病原；病原1®佶倒直进确到种佶息.同时应含相应的IS佶息.□序列数：即匹配到谨病顒协的序列救目,其寒少与标本中為原体本身戎人孫序列比例有关；基因俎糊盖度：画示绘测到的遨朋生物取釀序列醉盍對诛織生物至节基因序列的出値.盟盖匿坯表示该微主皱全垦因组到爭舶比率売；□鉴罡国低度：岸电捷序列曲朗S-览因堀丈＜1闻］凍因堀保舒性”判新样本中存在谖微生皈杓可信愴；□相对丰腫：腳^说田函.真菌、輛科奇生虫逬厅分炎”结舍魁囚戦小，计■算岀谨橢原祥在相曲分鸭中的昭对比樹O样本质鼠：舉集的并齐业杲濟跆险的亦液或担纭,幷严賂执行样本采集的无菌勰.□对照底控：曲批飲丈验中均应说立內善帆、盘性对嗚胡和阳性对质扁.□椅出询値：目前尚无統TtiR性或标准的检岀闽值■基于基因库捌教虽的耕读：根丸测底浪理.插咗体的基因序列敎誡努，相对丰13越焉.表示:样本中检测到谏病原轴1可信度就掘也.卓本中杲一沖濒生物橙出的rea出救越爭』具为级届病縣俸的可删世丸；"威于翔氐表证符合雄的瞇渎：若mNGS测序览果符合甜儿的临乐丟迎和為他实崟宜检奇”惟荐氏据茨妨结舉播讨帛滋决黄；若缺乏除m忖石¥测序结M的具他实強宣盍持证斑，应采用兀買技术SamNGS所桂出碣原迸行黨感耀迎临球进一歩开展嗨城女验室栓通进行瞪证；若临床轰睨前真瞪這嗤兰堆果不袁持mN/结果.阳不能仅瑣堀吊^石百駅序结刪行诊斷，而应1哉传塢实验亜检奁结霸首典临沛诊断售禺豳・图六.mNGS检测结果解读五、检测结果对临床用药的指导价值以病原学检测结果为参考，应结合具体临床表现及病原体的流行病学资料，进行临床综合评估，谨慎地选择抗病毒药物。进行治疗时，也要充分考虑患儿对治疗的实际反应。抗呼吸诲病壽药物的应用原则-目前特异性抗呼吸道病毒的药栩革辜.只有盍感病痺*疱攜病再等有明瞒的社对性對物；-丿L科医师应尽童胆确病帚感染的病原学「严柜拿握抗病将药枸的适应证"根据患儿病栄轻歪及鏑物本号理代性质-按照5礦则（正确的慝者、正确的时直k正确的商物*正确的剂曲及正确的给商逮径）逬行抗病毒飭*-各种细鬲、夏菌.亞原馆和衣原CS茅的祓酸（刊时；・致病病原体：具怵航菌坯期需根据当地朋药监测数据和可及■性进行选择.通过核戢验测耐药拥因/屈药宴娈的存在：如耐肯霉翕肺炭拂球菌、琪青薪烯类谢药芮兰阴性杆菌•耐大环内囂的肺炎支原体/臣日驰待菌、耐利鬲平的结樓分枝杆苗等」对抗罢药物的诜攝