生物信息学6二级数据库及数据库的格式课件

36、“不可能”这个字(法语是一个字)，只在愚人的字典中找得到。--拿破仑。37、不要生气要争气，不要看破要突破，不要嫉妒要欣赏，不要托延要积极，不要心动要行动。38、勤奋，机会，乐观是成功的三要素。(注意：传统观念认为勤奋和机会是成功的要素，但是经过统计学和成功人士的分析得出，乐观是成功的第三要素。39、没有不老的誓言，没有不变的承诺，踏上旅途，义无反顾。40、对时间的价值没有没有深切认识的人，决不会坚韧勤勉。生物信息学6二级数据库及数据库的格式生物信息学6二级数据库及数据库的格式36、“不可能”这个字(法语是一个字)，只在愚人的字典中找得到。--拿破仑。37、不要生气要争气，不要看破要突破，不要嫉妒要欣赏，不要托延要积极，不要心动要行动。38、勤奋，机会，乐观是成功的三要素。(注意：传统观念认为勤奋和机会是成功的要素，但是经过统计学和成功人士的分析得出，乐观是成功的第三要素。39、没有不老的誓言，没有不变的承诺，踏上旅途，义无反顾。40、对时间的价值没有没有深切认识的人，决不会坚韧勤勉。生物信息学6二级数据库及数据库的格式二级数据库简介二级数据库的形式:大多以web界面为基础,具有文字信息、表格、图形、图表等方式显示数据库内容;Q一级数据库与二级数据库之间并无明确的界限。(例如:GDB、AceDB、SCOP、CATH等都已经具有二级数据库的特色)一、前言随着我国经济的不断发展，科技水平也有了很大的提升，互联网行业在当今是热门行业，催生出一系列新鲜事物，比如微博、微信、微小说等。社会教育和教学领域也将进入微观时代。微观课堂在初中思想政治教育教学中的应用，可以进一步使学生加深对初中道德与法治这门课的理解，更加了解这门课的本质。使教学更加生动活泼。这使得教学不再灌输空虚和机械的理论，而是以学生为中心，使学生主动地去吸纳知识。基于直觉材料的启发式教学可以激发学生的学习积极性，这更有利于学生对抽象知识和形象认知的理解。二、制作微型课程（一）让学生参与到微课的制作中来以学生为中心是新课程改革的核心理念。面对新课程改革，初中道德与法治教学基本改变了传统的以教师为中心的机械灌输，重视学生的积极参与和积极探索。所以在制作微课的过程中，也要反映学生的主要地位，而不是以教师为中心。否则，微观课只能是“随机”的，与传统的灌输教学没有本质区别。教师应该让学生积极参与到微课制作中来。在解释知识点的过程中，有的地方可以插入一些学生的反思，包括学生对知识的质疑与交流，学生与教师之间的互动。这样可以提高教学的真实性，更贴近教学实际，更能激发学生参与的积极性，更有利于学生对知识点的理解。（二）选材要贴近学生的生活思想道德进程是与现实生活息息相关的课题。因此，在做微观课堂的时候，要充分体现主体与生活的关系，要重视学生教学资源的开发。虽然目前的教科书对于教学和生活的关系上的安排是非常重要的，但这是一般性的，而且这个地区也有一些不同的学生，所以微课的生成不能机械地复制课本，而是从学生现有的生活经验中选择最具代表性，最有针对性，最熟悉的生活材料进行制作。真正实现思想道德教育与现实生活的同步，使微观课程更加生动，更加突出，更重要的是贴近学生，贴近生活。用熟悉的生活来缩短学生与课堂教学之间的距离，激发学生的强烈探索热情，激发学生的生活记忆。从丰富而直观的生活信息到抽象的认知，再回归生活，用于指导实践，更有利于学生对知识的理解，更好地引导学生进行学习和生活。三、微课程的应用（一）指导学生预习，提高学生的自主学习能力新课程改革倡导自主学习与合作，充当学习的代理人，注重学生的知识获取，注重学生对知识的掌握。教师应从传授知识给学生转化为对学生学习进行指导，引导学生自主探索，参与到初中道德与法治的课堂教学中来。本课程将抽象知识转化为一些简单而具体的知识，从容易到困难，更符合初中生的认知规律和思维方式，更有利于学生自主学习活动的发展。例如要引导学生用小班进行预习，这样更贴近学生的学习情境，更加个性化的学习。学生对同一知识有不同的理解，使用微型课程可以实现自主学习和个性化学习。学生可以根据自己的实际情况来决定学习的重点，有的知识难以理解，学生可以重点学习这部分的知识。学生可以掌握数字视频课程的数量，进度和回放选择的速度。这样，微型课程可以成为学生学习的重要工具，更有利于学生个性化和自主学习，使学生能够参与到学习中来。这样可以实现以学生为中心的学习。（二）突破教学难点，提高学生的认知水平教学重点和难点的突破已经成为制约课堂教学效果的重要因素。关键是在学习其他客观知识的基础上，困难在于学生认识知识的难度，不同的学生对于知识的认知程度是不同的。如果盲目地遵循课本和机械的解释，学生只能记忆死记硬背，无法深刻理解课本中的知识，难以把握教学重点和难点，只能达到记忆浅层知识的程度。微观教学可以有效地解决这个问题，使学生集中精力思考，从而达到对抽象知识本质的理解。在对“不可暴力”内容的研究中，一般违法行为与严重违法（犯罪）之间的差异与联系是教学的重点。对于教师来说，这个部分可以及时制定和发挥教学过程，突出教学难点，让学生通过微观教学把握违法行为与严重犯罪的区别和联系。在此基础上，引导学生结合现实生活中的情况，根据两者的差异和关系进行充分的交流与讨论，使学生可以从图像抽象到形象，使学生有深刻的理解，掌握问题。（三）拓展课外空间，提高学生的综合素质学习的延伸是生命的延续，道德课程本身就是植根于生活的课题，这是主体存在和发展的基础和前提。因此，在德育教学中，要把生活作为教学的发展，引入水流，把课外延伸和主体教学延伸到广阔的现实生活空间，引导学生在生活的大课堂上学习道德，这可以提高学生的知识能力，促进学生道德水平和思想情感水平的全面提高。微课是联系课堂和课外的重要途径。它使学生进入一个新的学习平台，让学生思考丰富的生活，从生活中提取材料，化抽象的问题为生活中具体的问题，并用知识解决实际问题，这更有利于知识领域的扩大和学生知识与能力的转移。因此，教师可以利用微型课堂的小平台搭建到学科大厅的桥梁，让学生在生活中学习。在本节“消费者权益保护”中，学生和教师收集的消费者权益中的实际情况，让学生进行分析和交流，让学生充分调查，搜集生活中遇到的情况，获得使用知识的合法权利。使教学不再局限于教科书和课堂，而是在广阔的生存空间，拓展了学生的积极参与的思维，结合学习与生活，这是德育的有效教学，促进学生认知水平和实践水平提升。四、结束语利用微观课程使初中道德与法治教学进入新的发展阶段，教学内容更丰富，教学形式更加灵活，能够帮助学生营造真正愉悦的学习环境，学生自主探究学习，让学生参与探索的过程，掌握知识，提升技能和综合发展的能力，有力地推动了课程改革的步伐。教学效果与学生的学习兴趣、情感等多方面因素相关，结合工作实际可总结为以下几个方面：一、建立良好的师生关系，做一名学生喜欢的英语教师在英语教学中，我感受最深的是，学生在成长过程中需要知识，更需要关爱。关爱是一份情感，也是一份责任，作为英语老师，除了要有精湛的业务水平、敬业的精神、全面的知识，更重要的是传道授业解惑时做到爱生如子。人与人之间的感情是相互的，小学生年龄比较小，但他们有一颗敏感而真诚的心，只要你真心关爱，他们一定能感受到。只有让学生喜欢你，他们才会信任你，才会向着你引导的方向发展。在这么多年的教学工作中，我学会了善于倾听每一位学生的心里话。班级里的学生来自五湖四海，个别学生来自其他省份，他们都是农村的孩子，这些孩子都有一个共同点，他们都是单亲或者是双亲留守儿童。留守儿童缺乏的正是父母的关爱。作为一名教育工作者，我们应该给予学生更多的关心和疼爱。二、创设愉悦的课堂气氛，激发学生学习英语的兴趣美国著名心理学家布鲁纳说：“学习的刺激力量乃是对所学教材的兴趣。”可见，兴趣是最好的老师，也是使学生能持之以恒学习的催化剂，没有兴趣就没有求知欲。善于创设英语情景，激发学生的学习兴趣，是英语教学的原则之一。布鲁姆认为：“成功的外语课堂应当在课内创设更多的情境，让学生有机会运用已学到的语言材料。”只有如此，学生才能够进一步认识所学语言，深刻体会所学语言的真正用处，从而激发他们学习的巨大热情。运用直观的教具或者生动的多媒体创设情景，营造课堂气氛，尽快让学生从课间十分钟回归到课堂的四十分钟来，这是关键。教师把学生带入“情景”后进行教学，可直观吸引学生的兴趣，这也有利于教学活动的开展和深入，拓展学生的思维，提高学生的理解能力和口头表达能力。三、挖掘教材运用多种教学手段，让学生乐于学习在实践教学当中，只有深入挖掘教材，“吃透”教材，运用多种教学手段，才能激发学生的兴趣，新改版的小学英语教材蕴含着大量幽默风趣的情景片段和动漫，这就需要我们教师学会活化教材，充分挖掘“吃透”教材。教师在课前认真备好课，合理安排教学内容，用新颖、灵活多样并富有启发性的教学方法，让学生自己动脑、动手、动口，使他们的心理活动一直处于主动活动的状态，在轻松愉快的气氛中掌握新知识。四、培养兴趣，改革教学方式作为英语教师，应该精心设计课堂教学，采取有效的、多样化的教学手段，创造一种轻松、和谐的教学环境。只有这样，才能更好地激发学生的学习兴趣，调动学生的学习积极性，从而取得事半功倍的效果。对于农村小学生来说，张口说英语难，说一口地道流利的英语更是难上加难。而我们学习语言的最终目的就是与人交流，因此教师应该进一步提高学生的语言交际能力。例如，可以开展roleplays，everydayEnglish，guessinggames等活动。也可以就学过的短文组织学生进行情景对话表演或编排英语小做事等，使学生在实际运用中体验到学习英语的乐趣。运用多媒体技术，为课堂教学注入新的元素。多媒体技术集声音、图像、文字于一体，将抽象、枯燥的教?W内容转化为形象、鲜活的动感内容，能创设一个图文并茂、有声有色、生动逼真的教学情境，满足学生的好奇心、求知欲，激发学生的学习兴趣。英语阅读一向是学生的难点，因而课外的阅读活动就尤其重要。教师可以选择一些适合学生水平的课外阅读材料，如幽默故事、人物传记、民俗介绍、科普知识之类的文章让学生多了解。通过多媒体的观看，生动形象。既可以丰富学生的知识，提高学生的阅读能力，又有助于激发他们的阅读兴趣。学习兴趣是推动学生以饱满的热情、愉悦的心境去积极主动学习的一种最实际、最有效的内部动力，与学生的学习效果息息相关。因此，给学生传授语言知识并使他们掌握学习技能只是教师的职责之一，更重要的是培养学生对这门学科的兴趣与自信。有了兴趣与自信，学生才能充分发挥自身的积极主动性，快乐学习英语。只有这样才能真正感知“知之者不如好之者，好之者不如乐之者”的真谛。二级数据库简介二级数据库的形式:大多以web界面为基础,具有文字信息、表格、图形、图表等方式显示数据库内容;Q一级数据库与二级数据库之间并无明确的界限。(例如:GDB、AceDB、SCOP、CATH等都已经具有二级数据库的特色)萎因组信息二级数据库Transfac(真核生物基因转录调控因子数据库)德国生物工程研究所开发维护,始建于1988年。包括顺式调控位点、基因、转录因子、细胞来源、分类和调控位点核苷酸分布6个子库Transfac的网址transfac.mirroredu文件病曰查收6工红桁助山前进孙到NTRANSFACTRANSFAC-TheTranscriptionFactorDatabaseThetRANSFaCdatabaseisfreeforfromnonprofitorganizationsonly,UsersfromcommercialrpriseshavetothetRanSFAcdatabasesandaccompanyingprograms.PleasereadtheDISCLAIMEOTRANSFACfRelease4.0Search+DeRANS点C2?2reportsTRANSPATHTbaseongeneregulatorypathwaysS/ARtDBThesMaRtransactiondatabQPrDgrausarchforpotentyouIs,FasthPatSearchV,iarchforpotentialtranscripaaVi.4YoucannowruninteractivelyStrAnalysiswithGencticalgorithms厂厂N本地Iae2、蛋自质序列二级数据库eprosite蛋白质序列功能位点数据库)始建于1990年代初,由瑞典生物信息学研究所SIB负责维护基于对蛋白质家族中同源序列多重序列比对得到的保守区域,这些区域通常与生物学功能相关。数据库包括两个数据库文件:数据文件Prosite;说明文件PrositedocoProsite的网址:/prositel到m4冲幽ExPASyHomepageSitelapSearchExPASyContact"「Swiss-ProtHostedbyPKUChinairrorsites:BoliviakenadaSwitzerlandkoreaUsA2fmr□parAsitePrOSiteDatabfproteinfamiliesanddess[Moredetails1212documentationentriesdescribe1649differentpatternsITEROSITEbyAC,iDorcociearch.BragePROSITedocumentationentriescitationToolsforPROSITEthaSwiss-Prot/TrEMBLACheboxbelow(formoreoptions,usePEUSITErapatternagainstSwiss-ProtorIiNtarnetB3、蛋白质结构二级数据库oDSSP(DefinitionofSecondaryStruetureofProteins)蛋白质二级结构构象参数数据库DSSP的网址cmbi.kun.nl/gv/dssp/oFSSP(FamiliesofStructuralSimilarProteins)蛋白质家族数据库FSSP的网址www2.embl-ebi.ac.uk/dall/fssp/oHSSP(HomologyDerivedSecondaryStructureofProteins同源蛋白质数据库HSSP的网址:cmbi.kun.nl/gv/hssp/K)收积工且切粘秸王页打印打印此日标到|dA品CRCentreforMolecularandBiomolecularInformaticswasdesignedbyWolfgangKabschardChrisSaoertostandardizesecondaystructureassignment.TheDSSPdatabaseisadatabaseofsecondarystructureassignments(andmuchmore]fcrallproteinentriesintheproteinDataBark(DBInformationThehelpdocumentforhwThedssparticlehelicenseformforanacademicdsspsourcecodeThelicenseformfaracommercialDssPsourceoodealuesAFTERfaxingthelicenseformbotheFAXnumberindicatedattheform(+31(0)243652977)youcanextractthedsSPdistributonflp,cmbikun,nl,Doaddbopub/molbio/softwareandd55ccmbizipInanycase,typeunzipdsspambiziptoupackthenlcakatREACMETXT.vlingw32hasneverWindowsenvironmentadshculdtusbevirus-free,Downloadthre)UnderWindowsthedSSPoutputdoesnotmakeittothecreole,soredirectittoafileinstead:dsspcmbiSeveralchangeshavebeenmadetotheDsSPprogramtosolveproblemswithrecentPDBfiles.ThesearedocumentedinthesourceCommercialurersarerequestedtotransferEuro1000toaocountnumberoftheStchtingWHATIFno54.5AMROinNijmegen.PleasementicnDSSP.Pleasetrasferthemoneybeforedown-loadingthesoftwa