人类群体遗传学第一讲课件

s/s中国科学院上海生命科学研究胱研究生课程人类群体遗传学人类群体遗传学基本原理和分析方法徐书华金力◎中科院马普学会计算生物学伙伴研究所s/s中国科学院上海生命科学研究胱研究生课程人类群体遗传学1008-2009学年第二学期《人类群体遗传学分析方法》课程表上课时间:每周四上午10:00-11:50上课地点:中科大厦4楼403室第7教室果程内容授课教师Hardy2Weinberg衡检验原理及其应用徐书华遗传多态性统计最3月12日进化树的构建方法及应用徐书华3月19日cale原理及应用李海鹍53月26日遗传漂变效应及有效群体大小的估计徐书华64月2目人群遗传结构分析(I徐书华4月9口单倍型估计及连锁不平衡分析徐书华4月16日基因组中的连锁不平衡模式及标签位点的选择5月14日某因表达数据的分析方法135月21日人群史的遗传学研究徐书华5月28日端午节6月4日法医学检测及分析方6月11日自然选择检验原理和方法徐书华6月18日全基因组基因型数据正选择检验方法徐书华6月25日课程考试教育某地008-2009学年第二学期《人类群体遗传学分析方法》课程表2第一讲Hardy-Weinberg平衡检验及其应用Hardy-WeinbergEquilibrium(HWE定律HWE的偏离(固定指数)HWE的偏离(Wahlund定律)HWE在单基因遗传疾病研究中的应用HWE在多基因复杂疾病研究中的应用检验HWE的常用方法和软件全基因组数据中的HWE检验问题第一讲3WhydostudentsneedtoknowHardy-WeinbergEquilibrium?AsThomasMerten(1992)states:Ifyouhaveeverbeenaskedquestionssuchastheonesthatfollow,youbegintowhystudyingpopulationgeneticsmightbeuseful1Imconfused!howcanobethemostcommonofthebloodtypesifitisarecessivetrait?2.IfHuntington'sdiseaseisadominanttrait,shouldrthree-fourthsofthepopulationhaveHuntington'swhileone-fourthhavethenormalphenotype?3.Shouldn'trecessivetraitsbegradually'swampedoutfromtheWhydostudentsneedtoknow4基本概念>突变(mutation)>遗传多态性(geneticpolymorphism)遗传座位(locus)位基因(allele)>核苷酸位点(nucleotide)序列(sequence)位点(ste)分离位点(segregatingsite)基本概念5人类群体遗传学第一讲课件6人类群体遗传学第一讲课件7人类群体遗传学第一讲课件8人类群体遗传学第一讲课件9人类群体遗传学第一讲课件10人类群体遗传学第一讲课件11人类群体遗传学第一讲课件12人类群体遗传学第一讲课件13人类群体遗传学第一讲课件14人类群体遗传学第一讲课件15人类群体遗传学第一讲课件16人类群体遗传学第一讲课件17人类群体遗传学第一讲课件18人类群体遗传学第一讲课件19人类群体遗传学第一讲课件20人类群体遗传学第一讲课件21人类群体遗传学第一讲课件22人类群体遗传学第一讲课件23人类群体遗传学第一讲课件24人类群体遗传学第一讲课件25人类群体遗传学第一讲课件26人类群体遗传学第一讲课件27人类群体遗传学第一讲课件28人类群体遗传学第一讲课件29人类群体遗传学第一讲课件30人类群体遗传学第一讲课件31人类群体遗传学第一讲课件32人类群体遗传学第一讲课件33人类群体遗传学第一讲课件34人类群体遗传学第一讲课件35人类群体遗传学第一讲课件36人类群体遗传学第一讲课件37人类群体遗传学第一讲课件38人类群体遗传学第一讲课件39人类群体遗传学第一讲课件40人类群体遗传学第一讲课件41人类群体遗传学第一讲课件42人类群体遗传学第一讲课件43人类群体遗传学第一讲课件44人类群体遗传学第一讲课件45人类群体遗传学第一讲课件46人类群体遗传学第一讲课件47s/s中国科学院上海生命科学研究胱研究生课程人类群体遗传学人类群体遗传学基本原理和分析方法徐书华金力◎中科院马普学会计算生物学伙伴研究所s/s中国科学院上海生命科学研究胱研究生课程人类群体遗传学48008-2009学年第二学期《人类群体遗传学分析方法》课程表上课时间:每周四上午10:00-11:50上课地点:中科大厦4楼403室第7教室果程内容授课教师Hardy2Weinberg衡检验原理及其应用徐书华遗传多态性统计最3月12日进化树的构建方法及应用徐书华3月19日cale原理及应用李海鹍53月26日遗传漂变效应及有效群体大小的估计徐书华64月2目人群遗传结构分析(I徐书华4月9口单倍型估计及连锁不平衡分析徐书华4月16日基因组中的连锁不平衡模式及标签位点的选择5月14日某因表达数据的分析方法135月21日人群史的遗传学研究徐书华5月28日端午节6月4日法医学检测及分析方6月11日自然选择检验原理和方法徐书华6月18日全基因组基因型数据正选择检验方法徐书华6月25日课程考试教育某地008-2009学年第二学期《人类群体遗传学分析方法》课程表49第一讲Hardy-Weinberg平衡检验及其应用Hardy-WeinbergEquilibrium(HWE定律HWE的偏离(固定指数)HWE的偏离(Wahlund定律)HWE在单基因遗传疾病研究中的应用HWE在多基因复杂疾病研究中的应用检验HWE的常用方法和软件全基因组数据中的HWE检验问题第一讲50WhydostudentsneedtoknowHardy-WeinbergEquilibrium?AsThomasMerten(1992)states:Ifyouhaveeverbeenaskedquestionssuchastheonesthatfollow,youbegintowhystudyingpopulationgeneticsmightbeuseful1Imconfused!howcanobethemostcommonofthebloodtypesifitisarecessivetrait?2.IfHuntington'sdiseaseisadominanttrait,shouldrthree-fourthsofthepopulationhaveHuntington'swhileone-fourthhavethenormalphenotype?3.Shouldn'trecessivetraitsbegradually'swampedoutfromtheWhydostudentsneedtoknow51基本概念>突变(mutation)>遗传多态性(geneticpolymorphism)遗传座位(locus)位基因(allele)>核苷酸位点(nucleotide)序列(sequence)位点(ste)分离位点(segregatingsite)基本概念52人类群体遗传学第一讲课件53人类群体遗传学第一讲课件54人类群体遗传学第一讲课件55人类群体遗传学第一讲课件56人类群体遗传学第一讲课件57人类群体遗传学第一讲课件58人类群体遗传学第一讲课件59人类群体遗传学第一讲课件60人类群体遗传学第一讲课件61人类群体遗传学第一讲课件62人类群体遗传学第一讲课件63人类群体遗传学第一讲课件64人类群体遗传学第一讲课件65人类群体遗传学第一讲课件66人类群体遗传学第一讲课件67人类群体遗传学第一讲课件68人类群体遗传学第一讲课件69人类群体遗传学第一讲课件70人类群体遗传学第一讲课件71人类群体遗传学第一讲课件72人类群体遗传学第一讲课件73人类群体遗传学第一讲课件74人类群体遗传学第一讲课件75人类群体遗传学第一讲课件76人类群体遗传学第一讲课件77人类群体遗传学第一讲课件78人类群体遗传学第一讲课件79人类群体遗传学第一讲课件80人类群体遗传学第一讲课件81人类