肿瘤二代测序分子检测与展望无数据

Part1：NGS为肿瘤化治疗提供

选择Part2：NGS肿瘤临床检测流程与产品介绍Part3：NGS肿瘤检测临床应用展望Part4：企业介绍2011-2015

Novogene

BioinformaticsInstitute.

sProprietary

&NGS为肿瘤

化治疗提供

选择2011-2015

Novogene

BioinformaticsInstitute.

sProprietary

&.NGS为肿瘤

化治疗提供

选择——精准医疗时代下的NSCLC治疗：多靶点多药物列表亚洲肺

患者突变频率靶向药物（FDA/CFDA批准）临床意义EGFR40%吉非替尼/厄洛替尼/埃克替尼/阿法替尼/AZD9291/CO1868同时检测敏感位点与耐药位点，综合提示临床用药HER22%阿法替尼MET3%克唑替尼KRAS6%曲美替尼/司美替尼突变信息提示EGFR

TKIs药物不敏感;

突变信息提示患者具有更差的预后PIK3CA3%替西莫司BRAF2%维罗突变导致EGFR

TKIs药物不敏感ALK8%克唑替尼/色瑞替尼/艾乐替尼同时检测融合突变与耐药位点，综合提示临床用药ROS13%克唑替尼融合突变提示临床用药RET2%卡博替尼/凡德他尼/舒尼替尼nFDA/CFDA批准用于肺癌；nFDA/CFDA批准用于其它癌种；n肺癌临床试验中;

nPMDA批准用于肺癌2011-2015

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&Institute.s.NGS为肿瘤

化治疗提供

选择——现有肿瘤分子病理检测方法的一个患者，多种biomarker的结果需要同时给出多种检测技术AMRS-PCR/IHC/FISH/RT-PCR….•需要配备多种检测流程、设备、空间、

培训需要多种验证(validation)、试剂盒和QC样本有限报告周期越来越多的标志物的发现，实验平台的可扩展性2011-2015

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&Institute.s.NGS为肿瘤

化治疗提供

选择——下一代（NGS）的机遇同时检测多种biomarker一套检测流程，检测多种变异类型（SNP,

indel,CNV,

fusion)科研和临床多次证明技术准确临床应用从外显子到多 多位点检测指南

的技术2011-2015

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&Institute.s二代 检测EGFR，ALK

突变.

NGS为肿瘤 化治疗提供 选择——

已成为 指南 技术2011-2015

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&公司富集技术富集方法DNA起始量Life

TechnologiesAmpliseqPCR-basedamplification10ng

DN r

primer

poolWell-suited

for

low ty

and

quality

DNAsamples

like

FFPE

samples多用于已知位点检测AgilentTechnologiesSureSelectHybridization

andcapture

using

cRNA-baits200ng-3ug

DNA

input多用于几百个

的全外显子检测.NGS为肿瘤

化治疗提供

选择——不同NGS实验方法的比较2011-2015

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&Institute.s公司仪技术备注Illumina

IncMiSeqNextSeqHiSeq边

边(reversible

terminator-based)光学Clonal

amplificationof

template

by

bridgeamplification

on

the

surface

of

glass

flowcellPaired-end

sequencing

ensures

high

confidence

ofmutation

detectionCapability：

ed

sequencing,

wholeexome,transcriptome

and

whole

genomeLife

TechnologiesPGMIon

ProtonS5边

边(semiconductor-based)半导体Clonal

amplification

on

microscopic

beadsHigh

false

positive

ratesat

homopolymer

areasCapability：

ed

sequencing,

whole

exome

andtranscriptome——不同的NGS平台的比较.NGS为肿瘤

化治疗提供

选择2011-2015

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&Institute.sHybrid

Capture+Illumina

(Nextseq500)Ampliseq+Life

technology(DA8600)通量(19G)（单次几十-成百样本）(10G)（几个-几十个样本）样本起始量中(200ng)5-10张FFPE白片（手术）20张FFPE白片（穿刺）低(10ng)2-3张FFPE白片（手术）10张FFPE白片(穿刺）报告时间10天5天检测 变异类型点突变(SNV)、 缺失(Indel)、融合(Fusion)、扩增(CNV)点突变(SNV)、 缺失(Indel)、融合(Fusion)、扩增(CNV)解决方案实验与信息分析自动化程度低，需花费较多人力实现完整临床报告解读，获取信息多集成了样本处理、数据分析到报告解读的整体自动化方案，可移植性高应用范围适合于大型独立医学检验所适合于医院.NGS为肿瘤

化治疗提供

选择——不同的NGS组合的比较2011-2015

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&Institute.sMedical5X Ion

ProtonScience10X HiSeq

X10X HiSeq

2000/25004X

Miseq1X HiSeq

40001X

NextSeq

500.

NGS为肿瘤 化治疗提供 选择——诺禾致源平台展示2011-2015

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&Institute.sNGS肿瘤临床检测流程与产品介绍2011-2015

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&Institute.s.NGS临床检测流程与产品介绍NGS类产品需要具体要求产品设计(Productdesign)应根据癌种、分期、临床治疗需求设计检测产品研发（Productdevelopment）在产品研发阶段，应对实验和信息分析流程的可靠性进行系统评估质量控制(Qualitycontrol)在临床应用时，应对每一份样本进行HE染色，评估肿瘤细胞比例；过程质控，包括 数据质控，成对样本（癌组织和对照）检测和临床有意义位点多平台验证解读(Variant

interpretation)应具备良好质控的数据库，并配合人工解读完成 及变异解读报告时间（Turn-around

time）应在临床可接受的范围内完成2011-2015

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&Institute.s.NGS临床检测流程与产品介绍—产品设计（Product

design）——以483产品为例细胞增殖通路23%肿瘤干细胞相关通路19%凋亡抑制相关通路11%炎症相关通路11%细胞周期相关通路8%组不稳定相关8%免疫相关通路4%侵袭和转移相关通路4%血管生成相关通路4%能量代谢相关通路4%表观遗传相关通路4%483个全部归类到11类信号通路全部7146个外显常发生重排的部分选择483个子和19个内含子调节

,76通路

,272药物代谢基因,70驱动

,1782011-2015

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&Institute.s——实验验证(validation)流程Validation

目标数据质控标准细胞系模拟突变丰度验证及优化流程标准品or

真实样本验证临床样本验证阈值临床样本验证.NGS临床检测流程与产品介绍—产品开发（Product

development）.

NGS临床检测流程与产品介绍—检测流程（Workflow）样本收取样本处理H&E染色文库文库库检上机数据质控信息分析2011-2015

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&Institute.s的hotspot突变目的发现与肿瘤相关的提高hotspot突变检出率from

thermo

fisher

publisheddata.

NGS临床检测流程与产品介绍—检测流程（Workflow）——病理染色与2011-2015

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&Institute.s.NGS临床检测流程与产品介绍—解读（Variant

interpretation）MutationDriver

mutationPassenger

mutationMini

driverLoss

of

functionGain

of

functionUnknownEtc.N-of-one.incineTMNovoDatabaseLiterature

researchDrug

related

information:Sensitive/Clinical

informationPathway

ysisBiomarker

summaryBiology

relevanceClinical

relevanceClinical

evidenceRelevant

therapiesClinicaltrailsReport2011-2015

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&Institute.s一份充分完整的NGS检测报告应包括突变 名称及变异突变对蛋白功能，信号通路的影响临床意义：靶向药物，临床实验，信号通路用药4.功能分析5.与肿瘤关系.NGS临床检测流程与产品介绍—解读（Variant

interpretation）.NGS临床检测流程与产品介绍—解读（Variant

interpretation）2011-2015

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&Institute.s.NGS临床检测流程与产品介绍—解读（Variant

interpretation）——The

solutions:

Key

differentiators变异上下游通路分析变异信号通路聚类分析多变异结果整合分析中国临床实验2011-2015

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&Institute.s.NGS临床检测流程与产品介绍—解读（Variant

interpretation）2011-2015

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BioinformaticsInstitute.

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&Mutation：SNVDriver

mutationGain

of

functionDrug

related

information:Clinical

informationPathway

ysis——单一通路：KRAS

p.Q61L（肺癌）.NGS临床检测流程与产品介绍—解读（Variant

interpretation）——The

solutions:

Key

differentiators变异上下游通路分析变异信号通路聚类分析多变异结果整合分析中国临床实验2011-2015

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&Institute.s.NGS临床检测流程与产品介绍—解读（Variant

interpretation）——通路聚类：TP53，WEE1TP53,KEAP1,MERTK,NCAM1,PDGFRB,WEE1

mutation细胞周期相关通路2011-2015

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&Institute.s2015

ASCO.NGS临床检测流程与产品介绍—解读（Variant

interpretation）——通路聚类：TP53，WEE12011-2015

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&Institute.s.NGS临床检测流程与产品介绍—解读（Variant

interpretation）——The

solutions:

Key

differentiators变异上下游通路分析变异信号通路聚类分析多变异结果整合分析中国临床实验2011-2015

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&Institute.s.NGS临床检测流程与产品介绍—解读（Variant

interpretation）双阳突变:EGFR

L858R,

T790M(肺癌)患者从确诊(2013.6)到检测(2015.8)，易瑞沙治疗，没有其他辅助治疗下一步：Osimertinib样本类型:cfDNA2011-2015

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&Institute.s.NGS临床检测流程与产品介绍—解读（Variant

interpretation）——The

solutions:

Key

differentiators变异上下游通路分析变异信号通路聚类分析多变异结果整合分析中国临床实验2011-2015

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&Institute.s.NGS临床检测流程与产品介绍—解读（Variant

interpretation）——中国临床实验2011-2015

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&Institute.s明确突变类型建立标准进行相关验证结合数据库进行分析肿瘤

解读解读率提升，68%的患者可能从变异提示的临床信息中获益.NGS临床检测流程与产品介绍—解读（Variant

interpretation）患者获得临床样本样本质控评估标准

提取样本进

序明确突变类型阈值下位点验证结合数据库进行分析解读生物信息

、临床、药厂互动设立临床实验快速启制临床研究开启患者入组完整的流程不应超过10天，理想时间为5天临床医生.NGS临床检测流程与产品介绍—报告时间（Turn-around

time）常规检测 ，NGS检测阳性患者信息：女性，68岁，非小细胞肺癌检测结果：RET与KIF5B

融合药物：凡德他尼、卡博替尼用药说明：凡德他尼、卡博替尼已被FDA

批准用于甲状腺髓样癌，是多靶点激酶抑制剂（靶点包括RET）。已有临床试验证明凡德他尼和卡博替尼可以治疗存在

RET

融合的肺癌患者。.

NGS临床检测流程与产品介绍—案例分析（Case

Study）.NGS临床检测流程与产品介绍—结论现有各种各样的NGScancer

panel适合多种中晚期/转移患者寻找产品暂无明确化治疗方法，但NGS技术下的临床检测的•推动二代

产品的规范化检测和变异结果的解读更符合临床需求自我完善（validation与QC）共同解读（信息分析工具，数据库， 解读团队及临床

）共同参与（检测公司、临床 和药厂）政策规范NGS肿瘤检测临床应用展望临床需求高通量CFDA三类医疗器械

卫计委第 医学检验所建立新的行业 模式的CAP模式产品高通量技术的高速发展CFDA相关政策 的滞后.NGS肿瘤检测临床应用展望DA8600

NIPT预计在2016年2月获批用于肿瘤FFPE样本的分子检测Nextseq500

NIPT.NGS肿瘤检测临床应用展望-仪器认证.产品及合作方式介绍-试剂盒特点1）目标区域扩增，能精准检测实体瘤药物治疗需求的 变异；缺失(INDEL)，一次检测完成多种变异类型:突变(SNP)、融合(FUSION)，拷贝数变异(CNV)国际团队合作设计和优化试剂盒

4）严格的实验验证(validation)过程

5）一种检测流程，灵活组合6）样本需求量：10ngDNA和RNA试剂盒的CFDA配套数据认证的CFDA

认证企业介绍诺禾致源生物信息科技成立：总部： 市海淀区金码B座17层.企业概况诺禾医学检验所成立：总部： 市武清区创业总部

B07公司创始人李瑞强大学生物学博士，10余年来专注于

组学与 研究，曾任华大

副

、主管生物信息部门， 生命科学学院研究员；现为大学计算机系荣誉助理教授。⮴

组学⮴

市海外 次人才、中关村高端⮴已

科研

68篇，Science、Nature系列

26篇.创始人诺禾致源员工人数达到861人，来自国内外各大院校，专业主要为生物学、医学、计算机、数学、物理学等。博士本科其他985高校海外其他.团队组成Medical5X Ion

ProtonScience.

国内最全的科研/临检 平台10X HiSeq

X10X HiSeq

2000/25004X

Miseq1X HiSeq

40001X

NextSeq

500n

内存容量：17

TBn

运算能力：73

T

flopsn

容量：3.2

PB每天可完成200个人类全组数据分析.国际领先的大数据处理能力Nature

GeneticsNature

BiotechnologyGenome

BiologyNat