软件学习总结

1、CASTAP学习总结CASTAP计算是要进行的三个任务中的一个，即单个点的 能量计算，几何优化或分子动力学CASTAP计算是要进 行的三个任务中的一个，即单个点的能量计算，几何优化 或分子动力学.CASTAP几何优化任务允许改善结构的几何，获得稳定结 构或多品型物.CASTAP动力学任务允许模拟结构中原子在计算力的影 响下将如何移动。CASTAP性质任务允许在完成能量，几何优化或动力学运 行之后求出电子和结构性质。不是很明白的地方：自洽计算与非自洽计算的定义域意义 所在【好好看看CASTAP计算是要进行的三个任务中的 一个，即单个点的能量计算，几何优化或分子动力学 CASTAP计算是要进行的三

2、个任务中的一个，即单个点的 能量计算，几何优化或分子动力学.CASTAP几何优化任务允许改善结构的几何，获得稳定结 构或多品型物.CASTAP动力学任务允许模拟结构中原子在计算力的影 响下将如何移动。CASTAP性质任务允许在完成能量，几何优化或动力学运 行之后求出电子和结构性质。不是很明白的地方：自洽计算与非自洽计算的定义域意义所在【好好看看DFT方面量于计算的知识】如果存在的话，CASTEP使用的则是格子的全部对称。既 包含有两个原子的原胞和包含有8个原子的单胞是相对 应的。不论单胞如何定义，电荷密度，键长，每一类原子 的总体能量都是一样的，并且由于使用了较少的原子，使 计算时间得以减少。

3、（这句话没有理解，是什么意思？）有的不仅要优化几何结构有时还要优化品格，在more的 选项中有这个优化。AlAs Trajectory.xtd轨线文件，包含每一个优化步骤后的结构。（为什么没有这个文件）用castap可以进行计算态密度和能带结构，而且可以分别 表示出来！MS学习总结LDA适合的体系:（1）密度变换比较缓慢的体系（例如金 属体系）（2）高密度体系（例如过渡金属）（3）大多数结构 优化过程LDA不适合的体系:（1）对电子非常少的体系（例如化学 反应中的过渡态）（2）对于结合能的绝对值GGA在结合能（粘附能）方面更具优势CASTEP采用平面波的展开形式来描述电子波函数。按照原子动能的

4、类型来选择相关的平面波。CASTEP使用赝势来重置真实原子势能，能够有效减少平面波的数量Doml31.请问过渡态虚频的物理意义该怎样理解？答：其实，这个问题是个数学问题。要搞懂过渡态虚频的物理意 义，首先要搞懂到底什么是频率。其实这一点经常有人忽视。中学的时候我们学过简谐振动，对应的回复力f=-kx,对应 的能量曲线，是一个开口向上的二次函数E=(k/2)x2.这样的振 动，对应的x=0的点是能量极小值点(简单情况下也就是最小值 点)。这时的振动频率我们也会求3 = (2n )sqrt(k/m)。显然它是 一个正的频率，也就是通常意义下的振动频率。然后，从频率的概念引出虚频的概念。一维情况下，

5、如果能量曲线是一个开口向下的二次曲线呢？ 首先，从能量上看，这是个不稳定的点，中学的物理书上称为“不 稳平衡”。用现在的观点看，就是这个点的一阶导数是零(受力为 0)，且是能量极大值。如果套用上面的公式，“回复力”f=-kx (实际上已经不是回复，而是让x越来越远了)，这里k是个负数，3 =2n sqrt(k/m)显然就是一个虚数了，即所谓的虚频。 Gaussian里面给出一个负的频率，就是对应这个虚频的。实际情况下，分子的能量是一个高维的势能面，构型优化的 时候，有时得到了极小值点，这样这个点的任意方向上，都可以 近似为开口向上的二次函数，这样这里对应的振动频率就都是正 的。对于极大值点，在每个方向都是开口向下的二次函数，那么 频率就会都是负的一一当然一般优化很少会遇到这样的情况。对 于频率有正有负的情况，说明找到的点在某些方向上是极大值， 有些方向上是极小值。如果要得到稳定的能量最低构型，显然需 要通过微调分子的构型，消去所有的虚频。如何微调？要看虚频 的振动方向。想象着虚频对应的就是开口向下的二次函数，显然， 把分子坐标按照振动的方向移动一点点，分子应该就可以顺着势 能面找到新的稳定点，但是也不能太小。而所谓的过渡态，则是 连接反应物和产物之间的最低能量路径上的能量极大值。好比山 谷中的A，B两点，它们之间的一