ABI 3500操作手册 基因测序

1、ABI 3500 操作手册3500/3500XL 简易操作手册空间定位和光谱校正Dye Set library Dye Sets CreateDye Set Name 中输入“AGCU_E5”作为我公司Dye Set 名称，从Chemistry Matrix StandarDye Set TemplateE5 TemplatSave 保存设置。空间定位 进入3500 Data Collection Software主界面选择Maintenance 菜单，在Maintenance界面中点击Calibrate下拉菜单中的Spatial按钮，选合适的空间定位参数即可开始空间定位。 3500系列遗传分

2、析仪空间定位与3100、3130 系列类似。x/xABI 3500 操作手册1.2a10ul5 Dye Matrix Standard 的比例配制甲酰胺和光谱校正标准品混合物，轻轻震荡96 进行光谱校正时仪器默认第一个 Run，即前三列953 min ，立即冰浴 3 min96b、点击Calibrate下拉菜单中的Spectral图示选择各种参数点击Start Run 即可进行光谱校正。注意在Dye Set 1.1中设置好的与AGCU 试剂盒相匹配的Dye 器会自动重复跑样三次，并自动选择各次跑样中质量最好的通道作为此次光谱校正的最后C3500 系列遗传分析仪与 31003130 系列遗传分析

3、仪最大的区别之一就是光谱校正。它不需要编写 protocolrun module 等软件栏目及其相应参数设置，直接按照仪器默认的参数进行即可，因此操作更为简单、快捷。x/xABI 3500 操作手册软件参数设置创建Instrument Protocol进入library界面，选择InstrumentProtocols菜单点击Create按下图所示选择或设置各个参数设置完成后点击Save 保存注意将Protocol Name 命名为“AGCU_E5_STR，进样电压设置为3k，进样时间可设置为610 sec，Dye Set 选择1.1 步骤中已设置好的“AGCU_E5，其他参数设置请参照下图。x

4、/xABI 3500 操作手册创建Size Standard进入library 界面，选择Size Standards 菜单，点击Create。在Size Standard中输入“AGCU_SIZ500，Dye Color 下拉菜单中选Orange在左侧对话框中依次输入75100139150160200300、 340350400450490500，每次输入结束后点击中间菜单即可将所输数字加入右侧对话框中。待全部输入结束后点击Save保存。x/xABI 3500 操作手册创建QC Protocol进入library界面选择QC Protocols菜单点击Create在Protocol Name

5、 中输入AGCU_QC，Size Standard下拉菜单中选择在2.2中已创建的AGCU_SIZ500，将Use Baselining改为38。其他参数均按下图所示进行设置，设置完成后点击Save 保存。x/xABI 3500 操作手册Assay libraryAssaysCreateAssay Name AGCU_STRApplicationTypeHIDProtocol下拉菜单中选择 2.1AGCU_E5_STRQC Protocol 2.3 AGCU_QSaveAssayCreate Instrument ProtocolQC Protocol Library中，其效果与前面创建现在调

6、用一样。x/xABI 3500 操作手册创建 File Name Convention 进入 library 界面， 选择 File Name Conventions 菜单，点击Create。在Name AGCU_Samplename他参数按下图进行设置，也可根据个人喜好进行更改。注意在 Select File Location 中选择 Custom File Location，可以先在硬盘新建文件夹，此处点击Browse Save 保存。x/xABI 3500 操作手册创建Result Group进入library 界面，选择Result Groups 菜单，点击Create。在Name 中

7、输入 ，其他参数按下图进行设置也可根据个人喜好进行更改。注意在 Select File Location 应与 2.5 中选择CustomFileLocation位置相同。待所有设置完成后点击Save保存。PlateTemplate a、进入library界面，选择AssignPlateContents菜New Plate Create Plate from Template，在该界面中选ABI样品表模板“5dye_36_POP4bABI样品表AssaysFileNameConventionsResultscAssaysFileNameConventionsResults Groups Add

8、 from libraryAGCU_STR、AGCU_Samplename 和 AGCU_Resultgroup。d、各栏目选项加入完成后点击Save Plate菜单，选择Save asAGCU_Platetemplateok保存即可。x/xABI 3500 操作手册x/xABI 3500 操作手册产物检测打开软件进入主界面，见下图x/xABI 3500 操作手册点击主界面左上方导航键（蓝色箭头，打开Define Plate Properties New Plate按钮中选择Create Plate from Create Plate from 。从已有的样品表模板中选择“ AGCU_Platetemplate”打开。输入本次检测样品表名称，如“ 20110328_AGCUTESTAssign Contents 进入下一界面。x/xABI 3500 操作手册Assign Plate Contents 界面点击Import Plate View 中编写待检测的样品名。x/xABI 3500 操作手册选中相应的待检测区域后（点击加样板左上角白色空格即可选中整版下方的 Barcode 框中单击即可分别选中 Assay