山东师范大学生科院生物信息学题库

1、一、单选题（题数：105，共20.0分）1限制性片段长度多态性标记是（）A、RFLPB、SNPC、SSRD、RAPD2从cDNA文库中获得的短序列是A、STSB、UTRC、CDSD、EST3orthologs的意思是（）A、并系同源B、旁系同源C、直系同源D、横向同源4LCR的含义是A、编码区B、非编码区C、低复杂度区域D、开放阅读框5HTGS的含义是A、表达序列标签B、序列标签位点C、高通量基因组序列D、人工合成序列6（）年美国国会批准正式启动人类基因组计划?（）年发表草图?A、19902004B、19902001C、19882004D、198820017在使用动态规划进行序列比对时，比对结

2、果是唯一的吗？（）A、唯一B、不唯一8Blast结果中HSP的含义是（）A、空位B、期望值C、过滤D、高计分配对片段9RGP是（）A、在线人类孟德尔遗传数据B、国家核酸数据库C、人类基因组计划D、水稻基因组计划10一种替换在自然界中越容易发生，则这种替换在打分矩阵中对应的数值（）A、越小B、越大11如：我要查找RaoY在Nature或Science上发表的论文，哪一个检索语言是正确的？A、RaoYauANDNatureORScienceJournalB、RaoYauAND（NatureJournalORScienceJournal）C、RaoYauANDNatureJournalORScien

3、ceJournalD、RaoYauAND（NatureORScience）Journal12spanstyle=font-size:14px;font-family:OpenSans;color:#333333序列比对算法哪年出现（）年A、1977B、1988C、1970D、199113微卫星标记是（）A、RFLPB、SNPC、SSRD、RAPD14CDS的含义是A、编码区B、非编码区C、低复杂度区域D、非调控区下列哪一个是基于字母特征的系统发生分析的算法A、Kimura算法B、邻接法C、最大似然法D、PAUP序列比对算法哪年出现（）年A、1977B、1988C、1970D、199117PIR

4、是（）A、核酸数据库B、mRNA数据库C、启动子数据库D、蛋白质数据库18下列属于没有同义密码子编码的氨基酸是（）A、精氨酸B、亮氨酸C、甲硫氨酸D、丝氨酸19用遗传学算法对蛋白质序列进行比对软件是（）A、ProbConsB、SAGAC、ClustalWD、T-CoffeeE、MAFFT20DDBJ的含义是A、美国国家生物信息中心B、欧洲分子生物学实验室C、日本DNA数据库D、中国基因组研究中心21如：我要查找RaoY在Nature或Science上发表的论文，哪一个检索语言是正确的？A、RaoYauANDNatureORScienceJournalB、RaoYauAND（NatureJour

5、nalORScienceJournal）C、RaoYauANDNatureJournalORScienceJournalD、RaoYauAND（NatureORScience）Journal22Proteomics的含义是A、生物信息学B、基因组学C、蛋白质组学D、表观遗传学23目前应用于基因芯片表达数据统计分析的主要方法是（）。A、卡方检验B、相关分析C、聚类分析D、正态性分布检验24Proteomics的含义是A、生物信息学B、基因组学C、蛋白质组学D、表观遗传学25Genomics的含义是A、生物信息学B、基因组学C、蛋白质组学D、表观遗传学26病毒在进化研究中很重要，下列选项中错误的是

6、A、病毒经常处于强大的选择压力下B、高突变率，许多病毒的复制速度也极其惊人C、病毒生命力是很脆弱的，对复杂环境要求很高D、病毒基因组的进化速度没有其他细胞的基因组快27mRNA5端有（）结构A、帽子B、尾巴C、帽子和尾巴D、多聚核苷酸28人基因组大约有多少是编码蛋白的基因区间（）A、90%B、10%C、不足5%D、30%29GenBank中分类码PLN表示是A、哺乳类序列B、细菌序列C、噬菌体序列D、植物、真菌和藻类序列30有两个最基本的构建系统发生树的方法：基于距离的和基于字母特征的方法。它们之间的基本差异是A、基于距离的方法含有一个用于定义分支顺序的中间数据矩阵，而基于字母特征的方法却没有

7、B、基于距离的方法只应用于DNA的数据，而基于字母特征的方法可以应用于DNA或者蛋白质数据C、基于距离的方法利用简约算法而基于字符特征的方法却没有D、基于距离的方法所产生的进化分支与进化时间长短成比例，而基于字母特征的方法却没有31国际三大核酸数据库多长时间就互相交换数据库里的数据A、1天B、7天C、10天D、30天没有直接参与完成人类基因组计划的国家是（）A、英国B、中国C、俄罗斯D、德国根据分子时钟假说，下列叙述正确的是（）A、所有的蛋白质都保持一个相同的恒定的进化率B、所有的蛋白质进化速率都与化石记录相符合C、对于每一个给定的蛋白质，分子进化的速率是逐步减慢的，就像一个不准时的时钟一样D

8、、对于每一个给定的蛋白质，其分子进化速率在所有的进化分支上是大致恒定的34人基因组大约有多少是编码蛋白的基因区间（）A、90%B、10%C、不足5%D、30%35accessionnumber的含义是A、登录号B、算法C、比对D、类推36在Genbank中使用的序列文件格式为（）是一种最简单的格式，第一行以“”表示一个先序列的开始A、FASTAB、GBFFC、BLASTD、ORIGIN37在真核生物的一个基因内含子两端，即外显子/内含子拼接边界处，其符合（）规则A、KozakB、AU.AGC、SDD、Poly（A）n38RGP是（）A、在线人类孟德尔遗传数据B、国家核酸数据库C、人类基因组计划

9、D、水稻基因组计划39EST的含义是A、表达序列标签B、序列标签位点C、高通量基因组序列D、人工合成序列下列软件中哪个能进行蛋白质和蛋白质之间的相似性比较A、BlastnB、BlastpC、BlastxD、Tblstn下列不能进行碱基组成分析的软件是（）A、BioEditB、DNAMANC、DNASTARD、GENSCAN序列数据库包括核酸序列数据库和蛋白序列数据库。下列哪个不属于核酸列数据库A、GenbankB、GenPeptC、NCBID、DDBJ43PDB是蛋白质的（）A、分类数据库B、结构数据库C、模体数据库D、结构域数据库44基于一致性的比对方法的强项是（）。A、它们包含了基于位置相

10、关记分矩阵的信息B、它们包含了蛋白质的三维结构信息C、它们的速度非常快D、它们利用多序列比对过程中产生的信息来指导比对45ORF的含义是A、调控区B、非编码区C、低复杂度区域D、开放阅读框46高通量测序错误率和传统Sanger测序相比（）A、低B、差不多C、高47（）是欧洲分子生物学网EMBLnet的主要检索工具，也是一个开放的数据查询系统A、QueryB、SRSC、PDBD、PIR人基因组大小约为（）A、3.1*10A9bpB、3.1*10A7bpC、3.1*108bpD、3.1*10T0bp序列数据库包括核酸序列数据库和蛋白序列数据库。下列哪个不属于蛋白质序列数据库？A、PIRB、Unip

11、rotC、SWISS-PROTD、OMIM50从cDNA文库中获得的短序列是（）。A、STSB、UTRC、CDSD、EST51人基因组大小约为（）A、3.1*10A9bpB、3.1*107bpC、3.1*10A8bpD、3.1*10T0bp52从cDNA文库中获得的短序列是（）。A、STSB、UTRC、CDSD、EST下列属于高度串联重复序列的是（）A、酵母tRNA基因B、小鼠的珠蛋白基因C、rRNA基因D、异染色质上的卫星DN限制性片段长度多态性标记是（）。A、RFLPB、SNPC、SSRD、RAPD55EMBL的含义是A、美国国家生物信息中心B、欧洲分子生物学实验室C、日本DNA数据库D、

12、中国国家基因组研究中心56隐马尔科夫模型的代号是（）。A、HMMB、CDDC、HTGSD、GSS构建系统发生树，应使用A、BLASTB、FASTA.C、UPGMAD、FTP在氨基酸的序列比对结果中，一个“：”表示什么意思：（）A、相同的残基B、两个相似的残基比对到一起C两个不相似的残基比对到一起D、一个空位下列表示没有密码子偏好性的是（）A、RSCU值=1B、RSCU值1C、RSCU值1D、CAI值=160mRNA5Z端有（）结构A、帽子B、尾巴C、帽子和尾巴D、多聚核苷酸61在真核生物中，一个基因cDNA的5端起始密码子AUG的前后序列符合（）规则A、Kozak.B、AU.AGC、SDD、P

13、oly（A）n62NCBI的含义是A、美国国家生物信息中心B、欧洲分子生物学实验室C、日本DNA数据库D、中国基因组研究中心63contig的含义是（）。A、基序B、跨叠克隆群C、碱基对D、结构域64（）年美国国会批准正式启动人类基因组计划?（）年发表草图?A、19902004B、19902001C、19882004D、1988200165现有如下一条蛋白序列，请通过BLAST，对其进行分析，寻找与其相似的蛋白序列：ProteinSequenceMVRAPCCEKMGLKKGPWTPEEDQILISYIQSNGHGNWRALPKLAGLLRCGKSCRLRWTNYLRPDIKRGNFTREEE

14、DSIIQLHEMLGNRWSAIAARLPGRTDNEIKNVWHTHLKKRLKNYQPPQSSKRHSKNKDSKAPCTSQIALKSSNNFSNIKEDGPGLGSGPNSPQLSSSEMSTVTADSLAVTMDISNSNDQIDSSENFIPEIDESFWTDGLSTSGGGEELQVQFPFHDMKQENVEKDVGAKLEDDMDFWYSVFIKSGDLLELPEFBLAST： HYPERLINK 参数设置：Database:Non-redundantproteinsequences（nr）Algorithm:blastpWordsize:3Matrix:BLOSUM62Ga

15、pCosts:Existence:11Extension:1其他参数默认.为了完成上述分析，应选择BLAST主页上的哪个程序?（）A、tblastxB、proteinblastC、blastxD、nucleotideblastE、tblastn66采用不同的方法构建系统发生树的计算速度不同，下列描述正确的是（）：距离法最大简约法MP最大似然法MLA、最大似然法ML距离法最大简约法MPB、最大简约法MP距离法最大似然法MLC、距离法最大简约法MP最大似然法ML67alignment的含义是（）。A、登录号B、算法C、比对D、类推68目前应用于基因芯片表达数据统计分析的主要方法是（）。A、卡方检验

16、B、相关分析C、聚类分析D、正态性分布检验69（）是计算机注释的蛋白质序列数据库，也是SWISS-PROT蛋白质序列数据库的辅助数据库A、TrEMBLB、GBFFC、UniprotD、PIR70Bioinformatics的含义是（）。A、生物信息学B、基因组学C、蛋白质组学D、表观遗传学71SRA数据库存储的数据是（）A、存储基因芯片的数据B、存储Sanger测序数据C、存储新一代测序技术的数据72高通量测序错误率和传统Sanger测序相比/span（）/pA、低B、差不多C、高73在第12题的BLAST结果中，所获得的相似度最高的序列来自于（）物种？A、Capsicumannuum辣椒B、

17、Daturametel洋金花C、Petuniaxhybrida矮牵牛D、Solanumlycopersicum番茄74GenBank是A、在线人类孟德尔遗传数据B、国际核酸数据库C、人类基因组计划D、水稻基因组计划75在第10题的BLAST结果中，所获得的相似度最高的序列来自于（）物种？A、pCapsicumannuum辣椒/pB、pDaturametel洋金花/pC、pPetuniaxhybrida矮牵牛/pD、pSolanumlycopersicum番茄/p76如果一个基因完全使用高表达基因中所用的密码子，则其CAI值为（）A、-1B、0C、1D、277STS的含义是A、表达序列标签B、序

18、列标签位点C、高通量基因组序列D、人工合成序列78PAM250矩阵定义的进化距离为两同源序列在给定的时间约有（）的氨基酸发生改变A、1%B、20%C、80%D、250%79蛋白质磷酸化位点分析的主要位点是（）A、丝氨酸，苏氨酸，酪氨酸B、丝氨酸，甘氨酸，酪氨酸C、亮氨酸，苏氨酸，丙氨酸D、甘氨酸，色氨酸，酪氨酸80国际三大核酸数据库多长时间就互相交换数据库里的数据A、1天B、7天C、10天D、30天81NCBI上提供检索用的三维结构数据库是下列哪个数据库A、EMBLB、ChimeC、MMDBD、DDBJ82indel代表的含义A、缺失B、插入C、插缺D、罚分83basepair的含义是A、基序

19、B、跨叠克隆群C、碱基对D、结构域84一种替换在自然界中越容易发生，则这种替换在打分矩阵中对应的数值A、越小B、越大85基于结构的比对指的是（）。A、仅凭序列的结构进行比对B、利用序列的结构信息进行比对C、用于比较序列相似而结构不相似的序列D、用于比较序列不相似而结构相似的序列86pPIR是（）/pA、p核酸数据库/pB、pmRNA数据库/pC、p启动子数据库/pD、p蛋白质数据库单核苷酸多态性标记是（）。A、RFLPB、SNPC、SSRD、RAPD数据库存储的数据是（）A、存储基因芯片的数据B、存储Sanger测序数据C、存储新一代测序技术的数据低度重复序列包括（）A、.酵母tRNAB、tR

20、NA基因C、rRNA基因D、异染色质上的卫星DN90UTR的含义是A、编码区B、非编码区C、低复杂度区域D、开放阅读框91mRNA3端有（）结构A、帽子B、尾巴C、帽子和尾巴D、多聚胞嘧啶92（）是NCBI提供的集成检索工具，通过一次检索可查询NCBI多个子数据库中的相关信息A、RetrieveB、SRSC、EntrezD、PIR93在真核生物中，一个基因cDNA的5端起始密码子AUG的前后序列符合（）规则A、KozakB、AU.AGC、SDD、Poly（A）n94contig的含义是（）。A、基序B、跨叠克隆群C、碱基对D、结构域95mRNA3端有（）结构A、帽子B、尾巴C、帽子和尾巴D、多

21、聚胞嘧啶96在真核生物的一个基因内含子两端，即外显子/内含子拼接边界处，其符合（）规则A、KozakB、AU.AGC、SDD、Poly（A）n97accessionnumber的含义是A、登录号B、算法C、比对D、类推98Bioinformatics的含义是（）。A、生物信息学B、基因组学C、蛋白质组学D、表观遗传学下列不属于信号肽分析工具的是（）A、Signal-BLASTB、PhobiusC、SigCleaveD、EMBL下列哪个数据库属于生物大分子结构数据库A、GenbankB、PDBC、NCBID、DDBJ102pPDB是蛋白质的（）/pA、分类数据库B、结构数据库C、模体数据库D、结

22、构域数据库103基本局部比对搜素工具是（）。A、MegaB、ClustalWC、BLASTD、GCG104p在Genbank中使用的序列文件格式为（）是一种最简单的格式，第一行以“”表示一个先序列的开始/pA、FASTAB、GBFFC、BLASTD、ORIGIN105basepair的含义是（9.6分）A、基序B、跨叠克隆群C、碱基对D、结构域二、填空题（题数：73，共20.0分）1n信号肽中包含至少一个（）和（）以通过细胞膜。2Bulgeloop、Interiorloop、hairpinloop、Multi-branchedloop分别代表（）、（）、（）和（）3生物信息数据库中的核苷酸代码

23、表中代码H代表的是4生物信息数据库中的核苷酸代码表中代码W代表的是5生物信息数据库中的核苷酸代码表中代码N代表的是6生物信息数据库中的核苷酸代码表中代码B代表的是HGP选择作为研究人类的四大“模式生物”有()、()、()、()多序列比对方法9生物信息数据库中的核苷酸代码表中代码C代表的是10生物信息数据库中的核苷酸代码表中代码D代表的是11生物信息数据库中的核苷酸代码表中代码B代表的是12转录起始位点的英文缩写是()13空位罚分分为14生物信息数据库中的核苷酸代码表中代码A代表的是15GBFF格式的特性表格式包括16()年，人类基因组计划正式启动。人类基因组计划的具体任务可以概括为建立四张图谱

24、：分别是遗传图谱、()、序列图谱和()17分子数据库根据数据来源分为()和()18数据库常用的数据检索工具和19真核基因识别的主要方法()和()。其中，基因特征分两类()和()。20NCBI检测原核生物ORF的程序：分析密码子使用偏好性的方法主要有三种：()、()和()。蛋白质磷酸化的主要位点是()、()和()。按比对序列条数分为两类，分别是24RNA的三级结构元件主要有()、()、()和()。25转录起始位点的英文缩写是()26生物信息数据库中的核苷酸代码表中代码N代表的是生物信息学主要研究两种信息载体：()和()。生物信息学主要研究两种信息载体：()和()。29生物信息数据库中的核苷酸代码

25、表中代码G代表的是30生物信息数据库中的核苷酸代码表中代码A代表的是建立人类遗传图谱的关键是要有足够的高度多肽的遗传标记。第一代遗传标记为()，第二代遗传标记为()，第三代遗传标记为()。基因组测序的基本策略有()和()。33生物信息数据库中的核苷酸代码表中代码M代表的是34HGP选择作为研究人类的四大“模式生物”有()、()、()、():35HGP由()个国家完成，我国完成了HGP的()，即()号染色体上3000万个碱基的测序工作36三个大型公共核酸数据库有37生物信息数据库中的核苷酸代码表中代码V代表的是38序列比对按比对序列条数可分为39基因组测序的基本策略有()和()。在蛋白质的合成过

26、程中，同义密码子的使用概率并不相同。某一物种或某一基因通常倾向于使用一种或几种特定的同义密码子，这些密码子被称为()，此现象被称为()。可用于量化两条序列的相似程度42生物信息数据库中的核苷酸代码表中代码S代表的是43生物信息数据库中的核苷酸代码表中代码H代表的是44生物信息数据库中的核苷酸代码表中代码U代表的是4520世纪90年代（）事件大大促进了生物信息学的发展？1970年，Needleman和Wunsch提出了著名的（），是生物信息学发展中最重要的贡献。请根据拉丁文写出下列物种名称Homosapiens（）4820世纪90年代（）事件大大促进了生物信息学的发展？49生物信息数据库中的核苷

27、酸代码表中代码T代表的是50双序列比对方法51目前由NCBI维护的大型文献资源是52生物信息数据库中的核苷酸代码表中代码R代表的是1970年，Needleman和Wunsch提出了著名的（），是生物信息学发展中最重要的贡十卜献。建立人类遗传图谱的关键是要有足够的高度多肽的遗传标记。第一代遗传标记为（），第二代遗传标记为（），第三代遗传标记为（）。55请根据拉丁文写出下列物种名称Musmusculus（）,56生物信息数据库中的核苷酸代码表中代码K代表的是57（）年，人类基因组计划正式启动。人类基因组计划的具体任务可以概括为建立四张图谱：分别是遗传图谱、（）、序列图谱和（）选择压力的分分类数据库

28、常用的数据检索工具和核酸打分矩阵分为61NCBI检测原核生物ORF的程序：62CAI该指数以一组具高表达水平的基因为参考，测量某一个基因的密码子偏好情况和这些高表达基因密码子偏好情况的接近程度。如果一个基因完全使用高表达基因中所用的密码子，则其CAI值为（）。63生物信息数据库中的核苷酸代码表中代码Y代表的是64目前由NCBI维护的大型文献资源是65请根据拉丁文写出下列物种名称Homosapiens（）66生物信息数据库中的核苷酸代码表中代码M代表的是67生物信息数据库中的核苷酸代码表中代码D代表的是68请根据拉丁文写出下列物种名称Musmusculus（）,69生物信息数据库中的核苷酸代码表

29、中代码V代表的是70HGP由（）个国家完成，我国完成了HGP的（），即（）号染色体上3000万个碱基的测序工作。71生物信息数据库中的核苷酸代码表中代码K代表的是72原核基因是DNA分子的一个片段，具有连续编码的结构特征。原核基因识别任务的重点是识别（）。73生物信息数据库中的核苷酸代码表中代码R代表的是（5.6分）三、简答题（题数：90，共20.0分）1简述鉴定直系同源的实际操作标准（practicalcriteria）2如何处理BLAST后过少或过多的结果？3BLAST应用有哪些？4双序列比对方法有哪些？5下列数据库分别是什么类型的数据库？PIR、PDB、SWISS-PROT、NDB、Tr

30、EMBL、GenBank、DDBJ、SCOP、CATH、EMBL6BLAST应用有哪些？7系统发生树的构建方法有哪些？8如何处理BLAST后过少或过多的结果？9蛋白质序列比对中如何选择合适的评分矩阵？10简述鉴定直系同源的实际操作标准(practicalcriteria)11直系同源的定义是什么？12什么是分子系统发生学？分子系统发生基本原理是什么？13简述系统发生树的种类14什么是动态规划算法？15简述什么是PHI-BLAST。16常用的核酸和蛋白质的打分矩阵或代价矩阵有哪些？17简述可用于量化两条序列的相似程度的两种方法？18简要介绍UniProt组成。19数据库应满足的主要需求有哪些20

31、序列比对按数学模型分为哪两种类型，简述一下21BLAST算法的三个步骤22序列比对按数学模型分为哪两种类型，简述一下23直系同源的定义是什么？24简述什么是PSI-BLAST25指出下列GBFF格式中特性表含义？(23.45).600145T77Complement(join(2691.4571,4918.5163)26为了保证核酸数据库的内容在全世界范围的同步性GenBank数据库每天与哪些数据库进行数据交换？27常用的核酸和蛋白质的打分矩阵或代价矩阵有哪些？28真核生物基因识别的主要方法有哪些？29什么是经典系统发生学？它的局限性有哪些？30系统发生树的构建方法分为哪两大类，简述一下31B

32、asicBLAST有哪些？它们的查询序列类型和数据库类型是怎样的？32简述分子进化的中性学说33按序列比对的条数序列比对分类有哪些？34EntrezGene记录的全文报告包括哪些主要内容35分析密码子使用偏好性的方法主要有哪几种？36GBFF格式的特性表格式包括哪三个部分37真核生物基因识别的主要方法有哪些38什么是经典系统发生学？它的局限性有哪些？39什么是分子系统发生学？分子系统发生基本原理是什么？40简述PAM矩阵与BLUSUM矩阵的关系41蛋白质序列比对中如何选择合适的评分矩阵？42简述人类基因组研究计划的历程。43蛋白质二级结构有哪些44数据库应满足的主要需求有哪些45如何获取访问号

33、为U49845的genbank文件？解释如下genbank文件的LOCUS行提供的信息：LOCUSSCU498455028bpDNAlinearPLN21-JUN-199946简述选择压力的分类47简述可用于量化两条序列的相似程度的两种方法？48简述什么是PSI-BLAST49分子进化的主要特点有哪些？50简述选择压力的分类51双序列比对方法有哪些？52简述人类基因组研究计划的历程。53分子进化的模式有哪些？54EBI的含义是什么？主要包含哪些数据库？55简述GenBank数据库中GBFF格式的结构56什么是动态规划算法？57重复序列是指真核生物基因组中重复出现的核苷酸序列，可按其组织形式分为

34、哪两大类？58与DNA相比RNA的序列特征有哪些？59简述PAM矩阵与BLUSUM矩阵的关系61为了保证核酸数据库的内容在全世界范围的同步性GenBank数据库每天与哪些数据库进行数据交换？62BasicBLAST有哪些？它们的查询序列类型和数据库类型是怎样的？63简述分子进化的中性学说64简述系统发生树的种类65指出下列特殊标识符的格式？序列辨认号(GI):GenBank/EMBL/DDBJ序列接受号：RefSeq序列接受号：PDB序列接受号：66什么是系统发生、系统发生学、系统发生树？67系统发生树的构建方法有哪些？68如何进行BLAST结果显著性判断？69下列数据库分别是什么类型的数据库

35、？PIR、PDB、SWISS-PROT、NDB、TrEMBL、GenBank、DDBJ、SCOP、CATH、EMBL70如何获取访问号为U49845的genbank文件？解释如下genbank文件的LOCUS行提供的信息：LOCUSSCU498455028bpDNAlinearPLN21-JUN-199971分子进化的主要特点有哪些？72GBFF格式的特性表格式包括哪三个部分73BLAST算法的三个步骤74按序列比对的条数序列比对分类有哪些？75蛋白质二级结构有哪些76什么是系统发生、系统发生学、系统发生树？77简述什么是PHI-BLAST。78简要介绍UniProt组成。79指出下列GBFF

36、格式中特性表含义？(23.45).600145A177Complement(join(2691.4571,4918.5163)80迭代法多序列比对为什么理论上效果好于渐进多序列比对？81真核生物基因识别的主要方法有哪些82请写出真核基因识别的两大类主要方法。83请写出DNA分子主要携带的两类遗传信息。84简述GenBank数据库中GBFF格式的结构85EBI的含义是什么？主要包含哪些数据库？86EntrezGene记录的全文报告包括哪些主要内容87分子进化的模式有哪些？88系统发生树的构建方法分为哪两大类，简述一下89简述三干六界学说90Entrez的主要功能有哪些(2.2分)四、名词解释(题

37、数：141，共20.0分)lEntrez2二级数据库3遗传漂变(Geneticdrift)4中性学说5序列比对(SequenceAlignment)6序列片段对(segmentpair)7BLAST8多序列比对9自展法(BootstrapMethod10PAM1(PointAcceptedMutation1)11TSS:转录起始位点(TranscriptionStartSites)12直系同源(orthologous)13低度重复序列14命中点15最大简约法(maximumparsimony,MP)16FASTA格式17系统发生树(phylogenetictree)18点矩阵(dotmatri

38、x)19信号肽20中性选择(Neutralselection)21打分矩阵(scoringmatrix)22脱氧核糖核酸(DNA,deoxyribonucleicacid)23选择压力(Selectivepressure)24EfectiveNumberofCodon,Nc25序列片段对(segmentpair)26高记分片段对(high-scoringpair,HSP)27不变位点28起始密码子(initiationcodon)29SRS30查询序列(querysequence)31非标度树32DNA的一级结构33GenBank34核糖核酸(RNA,ribonucleicacid)35单一位

39、点36PAM250矩阵37BLOSUM矩阵38距离法(distance)39有根树40系统发生树(phylogenetictree)41同义密码子42点矩阵(dotmatrix)43Bioinformatics44邻接法(neighbor-joiningmethod)45相似性(Similarity)46一致性(identity)47旁系同源(paralogous)48限定词(Qulifier)49GC含量50PositionspecificiterativeBLAST(PSI-BLAST)51物种树52EST53同源性(Homology)54空位罚分(GapPenalties)55基因树56空位开放罚分Gapopeningpenalty)57空位开放罚分Gapopeningpenalty)58启动子59Unigene60最大简约法(maximumparsimony,MP)61简约信息位点62分子系统发生学63FASTA格式64起始密码子(initiationcodon)65核苷酸(nu