医学信息资源资料

1、医学信息资源中国医学科学院医学信息研究所本章学习目标2了解内容医学信息资源的定义医学信息资源的类型医学信息资源应用的分类循证医学研究的证据分级掌握内容循证医学资源的检索模型临床类医学信息资源常用类型及检索步骤临床类医学信息资源常用数据库及检索步骤转化医学类医学信息资源常用类型及检索步骤公共卫生类医学信息资源常用数据库药学领域医学信息资源常用类型课程内容 医学信息资源应用3.医学信息资源类型2.医学信息资源概述1.3本章小结4.1 医学信息资源概述4临床医生学习医学信息资源的重要性信息资源定义及特点医学信息资源定义及特点临床医生学习信息资源重要性5网络环境下临床医生对信息的需求更加迫切临床医生对

2、资源类型需求转变从传统期刊文献向网络、电子资源转变需要掌握何种资源提供何种知识需要掌握不同数据库资源的特定检索技能医学信息资源重要性分析6现代医学科学技术的快速发展 ,知识更新速度加快临床医生需要快速更新自己的知识结构如何快速更新自身的知识结构？不断学习吸收医学领域中的新理论、新技术、新方法 ,使自己学到的医学知识与医学科学的发展同步合格的医生能快速检索、评价和获得可靠的最新医学资讯掌握医学文献检索方法和培养文献信息资源的获取兴趣和能力信息资源定义及特征 信息资源定义 以文字、数据、编码、图形、图像、动画和视频等形式存储在一定的载体上并能利用和交流、存储的所有文献的总和，包括以实体形式出版发行

3、的文献和以虚拟形式传播交流的网络信息资源。 信息资源特点7知识性再加工性时效性可共享性目标性8医学信息资源定义 经过人类组织、加工，可以存取并能够满足人类需求的各种医学信息的集合。它首先是有关医学信息的，其次是经过组织、序化、可存取的信息集合，包括各种载体形式，如印刷型、缩微型、视听型及网络信息等。 医学信息资源特点数量急剧增长，总量居各学科首位 类型多种多样， 文种复杂学科交融渗透，内容重复分散半衰期最短，信息更新速度加快医学信息资源定义及特点2 医学信息资源类型9医学信息资源文献型数字型图书期刊缩微型文献数据库电子图书网络信息资源文摘数据库全文数据库引文数据库网络搜索引擎医学专业网站文摘数

4、据库10PubMed 由美国国立医学图书馆的国立生物技术信息中心研制开发生物医学领域最重要、最权威的数据库之一截止2013年12月，共收录文献记录22,376,811条Embase由荷兰Elsevier公司于2003年研制开发 截止2013年12月，共收录来自7,600多种期刊（其中有几千种未被PubMed收录的期刊）的文献记录2500万条BIOSIS Previews由美国生物科学信息服务社编辑出版包含Biological Abstracts和Biological Abstracts/RRM目前，该数据库整合在Web of Knowledge平台和Ovid平台上SciFinder由美国化学会

5、下属的化学文摘服务社出版发行化学化工、药学、生物化学等领域重要信息检索工具11中国学术期刊网络出版总库 国家知识基础设施众多数据库之一；内容覆盖自然科学、工程技术、农业、哲学、医学、人文社会科学等各个领域；截至2013年3月，收录国内期刊8 000余种，全文文献总量3 690多万篇。SpringerLink有Springer出版社于1996年推出 ；截止2013年12月，共收录信息资源记录828万余条，其中文章类493万余篇。Wiley Online Library由Wiley & Sons出版公司于1807年在美国创建；覆盖生命科学、健康科学、自然科学、社会与人文科学等；检索、浏览题录信息和

6、开放信息全球免费，但阅读全文需要权限。EBSCOhost由EBSCO研制推出的综合性检索平台；数据库内容涉及理、工、农、医等多个学科，有近60个数据库，其中全文数据库10余个。全文数据库12 Thieme出版社是德国著名的科学和医学出版社 2004年初推出电子图书平台E-BOOK Library，首批上网的是Thieme出版社享誉学术界的Color Atlas系列图书。 E-BOOK Library主要领域 神经外科学、医学影像学、耳鼻咽喉科学、整形外科学、眼科学、听力学、听力与语言学、互补医学和化学。Color Atlas系列图书涵盖了医学院校开设的课程和多学科基础科学学科的内容Oxford

7、 University Press电子图书Thiemehttp:/bookshelf13引文即引用文献，指论文作者在科学研究过程、撰写论文过程中参考、继承前人研究成果而特地注明的文献信息。引文索引按文献之间引证关系，收录和报道来源文献及其引文的检索工具。引文数据库作用作用提供查阅原文献的可能性， 便于了解论著中引用内容；为论著的审阅者、编者和读者评估论著价值和水平提供客观依据；揭示科技文献之间引证与被引证的关系展示科技文献内容之间联系降低检索结果的不相关性获取更多相关文献引文数据库141997年，由美国科学情报研究所（ISI）编辑出版科学引文索引数据库（SCI）的网络版涵盖自然科学、工程技术、

8、生物医学、社会科学、艺术与人文等领域Web of Science由爱思唯尔（Elsevier）出版社研发涵盖生命科学、自然科学、社会科学、医学四大门类27个学科领域收录生命科学（4,300余种）、社会科学与人文艺术（5,300余种）、自然科学（7,200余种）、医学（6,800余种），全面覆盖MedlineScopus1994年，解放军医学图书馆研制发行2008年，CMCI与中国生物医学期刊文献数据库整合到一个检索系统以局域网络服务，只能在订购单位的局域网络范围内使用每月更新，一年出版12期光盘中国生物医学期刊引文数据库网络信息资源概述15定义 网络信息资源（network informati

9、on resources）是指通过计算机网络可以利用的各种信息资源的总和。 具体是指所有以电子数据形式把文字、图像、声音、动画等多种形式的信息存储在光磁等非纸质介质的载体中，并通过网络通信、计算机或终端等方式再现出来的资源。 1 罗爱静.医学文献信息检索.第2版.北京:人民卫生出版社，2010. 特点信息量大传播广泛信息层次多品种多样信息传播速度快变化频繁自由发布交流直接检索方便实用性强分散无序缺乏管理内容庞杂良莠不齐共享程度高使用成本低网络信息资源获取工具网文快捕16主要功能 收集和整理网页在各种浏览器内保存正在浏览的网页批量保存关心的网页管理各种资料 例如：Office文档（doc，xls

10、，ppt）、图片、PDF文件、程序源代码等网页保存形式网页（完整或选中部分）网页文字（纯文本，全部或选中部分）单独保存图片（单一图片，选中图片，或全部图片）Flash动画（全部或部分）将网页捕捉为图片网络信息资源获取工具为知笔记17特点 网文快捕的升级版，采用云存储所有采集的信息或记录 采集的网页以“笔记”形式同步保存在网络上 建立不同的“文件夹”，实现文档分类管理保存形式 完整网页，分页网页 正文，文字，选中的文字 链接或选中部分的链接 图片或作为图片保存分享 在文档的阅读编辑页面，可以对当前文档进行快速的分享 分享：好友、邮件、博客为知笔记网页采集对话框18网络搜索引擎19学术搜索引擎Go

11、ogle学术 Google提供的专门针对学术期刊网络应用SCIRUS Elsevier 开发的、专门面向科研人员的学术信息检索工具图像搜索一个电脑浏览的系统，从一个大型的数字图像数据库去检索图像 医 搜 学 索 专 引 业 擎HON http:/www.hon.ch OminMedicalSearch http:/Medical Matrix http:/学术搜索引擎Google学术20 Google提供的专门针对学术期刊网络应用 可检索的学术期刊世界上绝大部分出版的学术期刊 学术著作出版商、专业性社团、预印本、各大学及其他学术组织的经同行评论的 文章、论文、图书、文章摘要。 使用方法（与通用

12、google一样，但其结果显示略有差异）提供查找学术信息时常用的筛选限制和关联链接可限定时间范围、定制邮件通知、查询参考文献、被引用次数及具体文献、相关文献以及多个全文链接（全文链接包括收费和免费，文件格式有PDF、HTML）Google学术查询结果页面21图像搜索概述22定义 又称图像检索系统，是一个电脑浏览的系统，从一个大型的数字图像数据库去检索图像。方式以文搜图 基于上下文本的图片检索，输入图片的关键字直接搜索想要的图片。 基本思路：先用文本注释图像信息，再利用基于文本的数据库管理系统检索文献的信息。以图搜图 按照图片自身包含的图像的色彩、形状、纹理等原始信息内容作为检索信息，查找相似性

13、图片。图像搜索CNKI学术图片知识库23图片来源： CNKI收录的各类学术文献提供功能： 根据图片语义和视觉信息，提供相似图表的检索、对比和分析功能等。依照关键词搜索出图片给出某一图片为核心的图片知网节给出语义相似图片、读者推荐图片、同文图片肝炎病毒CNKI学术图片知识库相似性检索24相似性检索医学专业搜索引擎HON 25成立 1996年，由瑞士日内瓦的非盈利性组织“网络健康基金会”（The Health on the Net Foundation）建立作用 专门诊断因特网所提供的信息的正确性和可靠性，并提倡网络伦理提供服务 HONtopicHONtoolHONsearchHONcode医学专

14、业搜索引擎HONsearch 26 HON搜索引擎的主要服务提供服务经过其认证的信誉度高的医学专业网站信息检索服务；其它医学网站信息检索服务。 检索图片、PubMed、罕见疾病数据库、分子生物学、眼科疾病、临床试验、医学词典缩略语http:/www.hon.ch医学专业搜索引擎OmniMedicalSearch 27 被A和华盛顿报推荐为最好的医疗搜索引擎之一可搜索信息 网页、图片或论坛、医学专业文献、参考工具书等http:/医学专业搜索引擎Medical Matrix 28美国医学信息学会主办一个以医学主题词为基础的智能型搜索引擎分类目录 疾病、临床实践、文献、教育、卫生保健人员和专家、计算

15、机技术应用与网络、医药市场常用医学专业网站29医学综合网站NLM网站群 MedScapeOncolink美国疾病控制与 预防中心公众健康类网站MedlinePlusWebMDMedicine NetGO ASK ALICE！其它医学资源网站少见病、罕见病资源医学图谱、影像学资源临床操作、诊疗常规、临床指南医生交流社区医学综合网站NLM网站群30医学图书馆的楷模门户网站：http:/提供信息：据库检索、研究探索、馆藏资源获取等指引信息News&EventsFindReadLearNLM for youDatabaseNLMExploreNLMReasearch at NLM医学综合网站NLM网站

16、群31Datebase:PubMedMeSH词表一体化医学语言系统临床试验信息网站MedlinePlus毒性化合物数据中心医学史图片储藏系统医学综合网站Medscape32提供资源 免费网络资源、临床医学文献全文、医学继续教育资源、继续教育课程，专业网站和医学新闻参考资料栏目提供多种数据库检索 Medline、疾病和症状知识库、药品使用说明、手术操作、解剖、图片、MerriamWebsters医学词典等数据库http:/参考资料栏目公众健康网站MedlinePlus33美国国立医学图书馆创建目标用户 病人、病人家属以及其他个体提供资源 最新的治疗方案和药物信息、了解专业术语、查看视频或图谱栏目

17、健康主题（health topics）药物（drugs&supplements）视频与工具（videos & cool tools）http:/medlineplus/公众健康网站WebMD34美国最大的医疗健康服务网站拥有全球最丰富的健康医疗资讯全球医师最愿意付费上网的专业网站特点汇集全美医师的临床报告最新最完整的各种医疗资料库栏目健康主题（health topics）药物（drugs&supplements）视频与工具（videos&cool tools）http:/少见病、罕见病资源35中国罕见疾病网遗传与罕见病信息中心欧洲罕见疾病网医学知识就医指南患者之友论坛 美国国家罕见病组织网针对

18、罕见病家庭、罕见病患者、企业、医学专业人士等不同对象的信息服务NIH建立和维护提供信息罕见疾病的常识问答有关罕见疾病的研究信息非政府组织欧洲罕见病联盟建立维护“About Rare Diseases”栏目中设有许多国家和组织关于罕见病的网站联机信息医学图谱、影像学资源36提供影像诊断、解剖、病理等基础知识；可视人数据库人体断层解剖浏览医学影像园以读片为特色 医影在线提供北美放射学会主办的放射学有关杂志，提供与放射有关的网络资源 链接北美放射学会提供大量可下载人体可视人计划的站点链接美国国家可视人计划项目提供用于教育目的的2D和3D人体模型浏览密歇根大学可视人项目提供大量有关影像学操作的信息医学

19、影像信息提供包括肌肉、血管、骨骼和多个器官的3D模型展示和热点链接YAHOO人体虚拟解剖提供三维展示的男女解剖结构和相应部位的疾病常识、动画视频等多媒体三维生物数字人平台可检索收藏的近7万张医学历史图片NLM医学史图片库临床操作、诊疗常规、临床指南37Springer实验室指南优酷临床操作视频专辑/v_playlist/f1496175o1p6.htmlWiley实验室指南/Medscape的临床技能操作资源http:/a-to-z-guides/tests/default.htm/http:/clinical_proceduresWebMD的医学检验和工具资源马里兰急诊医学服务指南http:

20、/home/EMSProviders/EMSProviderProtocols/tabid/106/Default.aspx医生交流社区38国内较早，也是目前国内最大医生交流社区丁香园医纬达提供二维、三维解剖图谱、医学图谱、临床用药参考、诊疗指引参考等生物医学专家社区查找被PubMed收录的文献，同时通过查找感兴趣的研究机构、研究人员、研究主题和会议信息，寻找合作者研究之门科学家可以分享研究成果、学术著作，以及参加一些科研论坛或兴趣小组医学论坛网源于中国医学论坛报生物谷论坛生物360提供的有关生物医学前沿信息拥有包括生物谷，生物在线，医药生物人才网，制药在线，中国生命科学论坛，生物汇展网等多个

21、平台1234563 医学信息资源应用临床医学文献资源资源概述资源类型案例分析公共卫生信息资源资源类型案例分析药学信息资源资源类型案例分析生物信息学资源资源类型案例分析中医药学信息资源资源类型案例分析转化医学信息资源资源类型案例分析临床医学文献资源40 临床医学信息资源概述 临床医学证据基本知识 循证医学实践步骤 循证医学信息资源类型询证医学专业数据库临床实践指南数据库循证医学期刊资源其它循证医学网络资源 案例分析 临床医学信息资源概述41循证医学出现的背景传统的临床医学以经验医学为主现代医学模式是在经验医学的基础上，同时强调循证医学采集病史和体格检查基础上，要求临床医生进行精确的文献检索运用评

22、价临床文献的正规方法发现最有效地证据根据证据解决临床问题，制定疾病的治疗方案和预防措施。循证医学信息资源的作用提供疾病在治疗、预防、诊断、病因等多方面的研究证据帮助医生更加精准的找到解决临床问题的证据 循证医学证据基本知识42临床研究证据的分类循证医学证据级别循证医学证据检索5S模型临床研究证据的分类43按研究方法按研究问题按用户需要按获得渠道原始临床研究证据 随机对照试验 队列研究 病例 - 对照研究 无对照的研究 二次临床研究证据 系统评价 Meta分析 临床实践指南 卫生技术评估病因临床研究证据诊断临床研究证据预防临床研究证据治疗临床研究证据预后临床研究证据系统评价临床实践指南临床决策分

23、析临床证据手册卫生技术评估健康教育资料公开发表的临床研究证据灰色文献在研的临床研究证据网上信息循证医学证据级别44推荐分级证据类别病因、治疗、预防的证据A1aRCTs，系统评价1b单项RCT，95%可信区间1c全或无（传统治疗全部无效）B2a队列研究的系统评价2b单项队列研究及质量差的RCT2c结局研究3a病例对照研究的系统评价3b单项病例对照研究C4病例分析或质量差的病例对照研究D5没有分析评价的专家意见循证医学证据检索5S模型45SystemsSummariesSynopsesSynthesesStudies系统总结摘要综述研究例如：Computerized decision suppor

24、t计算机决策支持系统Evidence-based textbooks循证教科书Evidence-based Journal abstracts循证期刊摘要Systematic Reviews系统评价Original journal articles期刊原始研究1、确定拟弄清的问题人群/病人干预措施比较结局指标检索策略电子检索手工检索3、严格评价证据真实性重要性适应性4、得出结论肯定的最佳证据：推荐临床应用无效或有害：建议停止或废弃临床应用尚无证据：建议进一步研究5、后效评价Evidence is never enough不断更新终身教育2、全面查找证据循证医学实践步骤46收集证据证据评价提出问

25、题临床决策后效评价循证医学实践步骤47针对所提出的临床问题开始设计、收集相关证据收集证据的途径 文献检索科学研究收集证据的来源 期刊专业数据库医学网站48收集证据循证医学专业数据库49 Cochrane Library http:/ 提供高质量科学证据的数字化文献库 OVID循证医学数据库 汇集了主要的循证医学资源Best Evidence: ACP Journal Club, Evidence Based Medicine, Cochrane CDSR, Cochrane DARE及Cochrane Controlled Trials Register BMJ Best Practice h

26、ttp:/bestpracticeClinical Evidence、患者教育和药物数据库三方面的资源 Uptodate /home提供实时循证医学及临床医疗信息的数据库 Pier http:/ 为临床医师提供权威的临床研究证据来提高医疗保健水平 Clin-eguide 为临床医师提供权威的临床研究证据来提高医疗保健水平Cochrane Library 概述50 由国际Cochrane 协作网（Cochrane Collaboration）开发，是一个提供高质量科学证据的数字化文献库。 包括Cochrane各实体组织，如系统评价小组、各Cochrane中心的简介和联系信息等Cochrane 协

27、作网相关信息提供Cochrane协作网51个系统评价小组在统一工作手册指导下完成的系统评价Cochrane 临床试验注册数据库收录了卫生保健干预措施经济学评价研究的摘要NHS经济学评价数据库提供Cochrane协作网51个系统评价小组在统一工作手册指导下完成的系统评价Cochrane 系统评价数据库目前唯一收录经过评选的系统评价摘要数据库Cochrane 有效评价文摘库目前收录了60多万项临床试验数据文献摘要Cochrane 方法学注册数据库收录国际卫生技术评估网络成员单位和其他卫生技术评估机构提供的结构式摘要卫生技术评估数据库 主要包括七个独立数据库51Cochrane Library 检索

28、页面http:/ 临床实践指南数据库52国别指南库名称网址美国美国国立指南库National Guideline Clearinghouse , NGC加拿大加拿大临床实践指南库CMA Infobase: Clinical Practice Guidelineshttp:/mdm.ca/cpgsnew/cpgs英国英国国家卫生图书馆指南库National Library for Health, Search Guidancehttp:/www.library.nhs.uk/guidance新西兰新西兰指南库New Zealand Guidelines Group.nz澳大利亚澳大利亚医学临床实

29、践指南库Australian National Health and Medical Research Council: Clinical Practice Guidelines.au循证医学期刊资源53刊名ISSN出版商出版地ACP Journal Club1056-87511539-8560 (E)American College of Physicians-American Society of Internal MedicineUnited StatesClinical Evidence1752-8526 (E)*1462-3846BMJ Pub. GroupEnglandEviden

30、ce Based Library and Information Practice1715-720X(E)University of Alberta LibrariesCanadaEvidence Report/Technology Assessment1530-4396 Agency for Health Care Policy and ResearchUnited StatesEvidence Report/Technology Assessment (Summary)1530-440X U. S. Dept. of Health and Human Services, Public He

31、alth ServiceUnited StatesEvidence-Based Medicine1356-5524 1473-6810 (E)BMJ Publishing GroupEnglandEvidence-Based Nursing1367-6539 1468-9618 (E)RCN Pub. Co.EnglandJournal of Evidence-Based Social Work1543-37141543-3722 (E)Informa HealthcareEngland其它循证医学网络资源54搜索引擎： SUMSearch http:/提供多个国家临床实践指南一站式检索功能

32、Trip Database 国内外常用的临床试验研究数据库国家/区域数据库名称网址国际 WHO:International Clinical Trials Registry Platform (ICTRP)/trialsearchCochrane Library/cgi-bin/mrwhome/106568753中国中国临床试验注册中心(CHICTR)美国美国临床试验数据库ClincalT英国NHS：The National Research Registerhttps:/portal.nihr.ac.uk/Pages/NRRArchiveSearch.aspx日本UMIN Clinical

33、Trials Registryhttp:/www.umin.ac.jp/ctr案例分析55案例：一名内科医生在临床实践中提出问题：是否能够将溶栓联合冠状动脉介入治疗急性心肌梗塞，目前有无充分的相关证据？检索提示该医生检索文献的目的并非广泛收集信息，进行科学研究，而是希望能够获取解决临床问题的最佳证据，因此属于循证医学实践范畴。从查全率和查准率的角度看，查准更为重要在检索时应首先查看是否有相关的高质量的临床实践指南、系统评价和Meta分析。若无，再查看其他等级证据，如单个样本量足够的随机对照实验、设对照组但未用随机方法分组的研究等。56选词 急性心肌梗塞（Acute myocardial inf

34、arction） 血栓溶解疗法（Thrombolytic therapy） 急诊冠状动脉介入治疗（Primary coronary intervention） 经皮经腔冠状动脉血管成形术（Percutaneous coronary transluminal angioplasty）检索提示57Sumsearch检索步骤Sumsearch() 该系统可同时检索PubMed、Cochrane系统评价摘要（DARE）、临床实践指南数据库（NGC）等数据库，并将检索结果分别列出。 581.将检索词用逻辑运算符连接，输入检索框中，点击Search。在进行其他检索时，可根据需要，对下列相应选项进行选择。5

35、9检索结果分类列出。然后对获得的文献进行严格评价，以解决其临床问题，指导临床实践。602.点此进入检索界面Cochrane协作网HTA检索步骤1./index5.htm61简单检索窗口3.点此进入高级检索界面624.输入检索词5.选择欲检索数据库6.点此进行检索63检索结果界面64公共卫生信息资源65公共卫生专业数据库GIDEON 公共卫生数据和统计数字资源CDC Wonder 数据库国家卫生和计划生育委员会统计信息中心统计数据中国公共卫生科学数据中心公共卫生相关信息资源食品法典委员会标准信息国家农业安全数据库公共卫生专业数据库66卫生管理信息合辑 目前为数不多的全球性卫生管理专业检索工具之一

36、GIDEON流行病及传染病事实型及决策诊断数据库 当今较为完整的全球传染病与流行病在线数据库 ProQuest Public Health 公共卫生全文资源 专注于提供公共卫生领域的有针对性、关联性的结果 Global Health 针对国际公共卫生研究人员开发的专业性文摘型数据库 国际公共事务信息数据库主要收录公共政策和公共事务有关的资源 HealthSTAR主要涉及卫生保健服务的临床与非临床方面的文献 人口及计划生育文献数据库 关于人口、计划生育和相关的卫生保健、法律以及政策等相关文献 GIDEON流行病及传染病事实型及决策诊断数据库概述67 1992年由Mr. Uri Blackman与

37、Dr. Stephen Berger共同创立GIDEON Informatics, Inc，总部位于美国洛杉矶，成立初期目标为收集全球公共卫生与传染病资源。 GIDEON为收费数据库。GIDEON收录内容不断更新，截止目前该数据库包含349种疾病、231个国家、1297种微生物与333种抗菌药物与疫苗。另有14000条信息描述在各个国家的各传染病状况，超过45000张照片、图表、电子图与附录。 GIDEON的数据遵循循证医学的标准（Standards of Evidence-Based Medicine） 三大模块Infectious Disease诊断、传染病、旅游、药物、疫苗等信息 Mic

38、robiology细菌、分枝杆菌、酵母菌等信息Toxicology诊断、疾病、辨识、媒介等信息GIDEON流行病及传染病事实型及决策诊断数据库检索页面68/PHMC健康与医学大全概述69ProQuest健康与医学大全（ProQuest Health & Medical Complete，PHMC）信息资源种类收录了1 500多种重要的基础医学、临床医学及卫生健康方面的专业期刊1 300余种期刊含有完整的全文和图像900多种含有MEDLINE索引PHMC收录的期刊许多来源于著名的出版商或协会Springer Ver-LagOxford University PressCambridge Univ

39、ersity PressPHMC健康与医学大全检索页面70公共卫生数据和统计数字资源71 WHO全球卫生观察站 http:/gho世卫组织关于世界各地卫生相关统计数据的网站 世界银行公开数据库 http:/列出了世界银行数据库的八千多个指标，所有用户都可以免费使用和分享数据CDC Wonder 数据库 http:/美国疾病预防控制中心（CDC）一个内容广泛的流行病学研究在线综合数据库美国犹他州基于指标的公共卫生信息系统 /home美国犹他州卫生局更新维护的基于互联网的公共卫生数据资源查询系统国家卫生和计划生育委员会统计信息中心统计数据提供了中国卫生统计提要 和中国卫生统计年鉴 中国公共卫生科学

40、数据中心 国家人口健康科学数据共享平台的主要数据中心之一 CDC Wonder 数据库概述72 美国疾病预防控制中心的一个内容广泛的流行病学研究在线综合数据库。 覆盖CDC网站数据与统计信息服务的全部内容 Wonder 网络在线数据库（Online Database）艾滋病公共信息数据库美国人口出生报告数据美国癌症统计信息数据环境数据（每日空气温度热指数、每日地表温度、每日细颗粒物、每日阳光、日降水量）死亡数据（根本死因的死亡率、多因死亡数、婴儿死亡数）肺结核信息系统（OTIS）数据库人口数据库（美国人口普查数及美国疾控中心卫生统计中心的跨种族人口数据）性传播疾病发病率和疫苗不良反应事件报告C

41、DC Wonder 数据库检索主页73/国家卫生和计划生育委员会统计信息中心统计数据概述74 提供中国卫生统计提要 和中国卫生统计年鉴 中国卫生统计提要按年度提供，可以下载文件中国卫生统计年鉴是一部反映中国卫生事业发展情况和居民健康状况的资料性年刊。 年鉴收录了全国及31个省、自治区、直辖市卫生事业发展情况和目前居民健康水平的统计数据，以及历史重要年份的全国统计数据。国家卫生和计划生育委员会统计信息中心统计数据检索页面75以获取2010年全国疾控机构数为例：http:/mohwsbwstjxxzx/s8208/list.shtml中国公共卫生科学数据中心概述76国家人口健康科学数据共享平台的主

42、要数据中心之一建设目标集成分布在公共卫生领域、高等院校、科研院所以及科学家个人手中的公共卫生数据资源以及科研项目所产生的数据，在此基础上进行数据整合、挖掘，并通过本项目建立的网络平台向社会发布，以推动中国科学数据的共享，促进科技进步。1.传染性疾病生命登记信息慢性非传染性疾病2.3.健康危险因素信息4.图1 公共卫生科学数据中心提供的数据77中国公共卫生科学数据中心检索页面 78 食品法典委员会标准信息 食品法典委员会由粮农组织和世卫组织于1963年设立，负责制定统一协调的国际食品标准、准则和行为守则，保护消费者健康并确保食品贸易中的公平贸易实践。食品添加剂通用法典标准 (GSFA) 在线数据

43、库 提供食品法典委员会采纳的所有食品添加剂的规定食典食品兽药残留在线数据库 获取有关某种或某些兽药对某物种或某生物组织的食典最高残留限量（MRLs）的信息食典食品农药残留在线数据库 获取某种或某些农药以及某种或某类商品的食典最高残留限量（MRLs）和食典再残留限量（EMRLs） 国家农业安全数据库 由美国职业安全与卫生研究所（NIOSH）与佛罗里达大学合作的在线数据库，提供农业安全和健康出版物或资源的网络参考指南，包括科普材料、培训材料、演示材料、视频连接以及完整的在线视频等。公共卫生其他相关信息资源药学信息资源79新药研发事实数据库Thomson Reuters Integrity Phar

44、mProjects 化学物质及反应事实数据库Reaxys PubChem 专利数据库Derwent Innovations IndexPATENTSCOPE 临床药学信息资源 Uptodate 国家食品药品监督管理总局网站 国家药学科学数据中心 MICROMEDEX Healthcare 系列数据库Thomson Reuters Integrity概述80Thomson Reuters公司出版的生物医药信息综合数据库资源特色：丰富的、精炼的药理/毒理、药代/药动、及临床实验数据；疾病相关的综合性评述 全面介绍各种疾病的发现历史、发病原理、流行病学调查数据、治疗费用、诊断方法、防治方法、涉及的靶

45、点、相关药物、最新发布的相关重要文献概要相关重要网站，相关学会指南等；靶点信号通路与通路图 多媒体演示靶点参与信号通路的过程，掌握其中参与的每一个生物分子；不同靶点在通路图中的相互作用。Thomson Reuters Integrity主要内容 8130多万种上市和在研药物化学药和生物药，及其相关的结构信息关于这些药物的77多万个实验药理学和毒理学数据40多万个药物动力学和药物代谢数据9万多个临床实验记录2000多个药物靶标分布以及这些靶点间的相互关系图100多份疾病的相关综合性评述疾病的流行病学调查数据疾病的所有可能的治疗方法近2万个药物合成方法，并且区分出没有专利保护的合成方法10多万药物

46、专利家族40多个药物/疾病/临床试验/诊断相关的生物标记物8000多种药物/疾病相关的基因组学信息PharmProjects概述82英国 Informa Healthcare 出版的智能型数据库主要内容 研究开发中的药物信息 自1980年以来超过30,000个处于开发阶段的药物，数据每周更新 主要信息：药物名称、开发阶段、各国上市情况。 开发厂商及科研项目信息 公司概况、该公司研究开发的药物、业务活动、主要子公司及其附属机构、与其他子公司、学术机构的重要合同、协议、最近的财经状况、与产品许可转让负责人联系的途径、厂商的地址、电话、传真等。 治疗领域药品信息 研究开发中的药物信息 广泛上市或中止

47、开发的药品及许可转让信息 被中止研究开发、撤销或长久未见研究开发报道的药物或化合物的信息，提供中止开发的药物曾经达到的阶段以及新药许可转让机会。 化学结构及化合物的药理活性信息 化合物结构图,分子式、分子质量、美国化学文摘化学物质登记号及创制者。 PharmProjects检索页面83Derwent Innovations Index概述84Thomson Derwent与Thomson ISI公司共同推出的基于ISI Web of Knowledge（SCI）平台的专利信息数据库收录来自全球40多个专利机构（涵盖100多个国家）的1300万条基本发明专利，3000万项专利每周增加2万5千多个

48、专利，数据可回溯至1963年。图 Derwent Innovations Index主要特点重新编写及标引的描述性专利信息特点可查找专利引用情况建立专利与相关文献之间的链接可查找专利引用情况Derwent Innovations Index检索界面85国际专利分类号德温特分类号德温特手工代码德温特分类代码主题专利权人发明人专利号Uptodate概述86 Uptodate创建于1992年，是一个提供实时循证医学及临床医疗信息的数据库，为医生及临床药师日常遇见的问题提供基于循证基础的诊疗方案以及药物治疗方案。该库由4000多名国际著名的临床医学专家合作，以科学方法对7700个临床研究主题进行系统综

49、述。系统综述文献中附有图片、图表、X光片、影像文件以及参考文献摘要等，并提供Lexi-Comp的药物信息及药物交互作用信息。该库为商业型数据库，目前在国内可免费使用其病患教育信息。Uptodate检索页面87Uptodate应用实例88长期使用华法林（Warfarin）对预防肺栓塞的复发有无疗效？ Warfarin and pe鼠标触碰专题名称，右侧出现该篇专题提纲Uptodate检索结果89长期使用华法林（Warfarin）对预防肺栓塞的复发有无疗效？ “Anticoagulation in acute pulmonary embolism” 专题综述全文绿色高亮部分：1、药物名称Drug

50、Informaition 点击后显示Lexi-comp药物资讯中该药品的详细介绍2、相关主题Related Topic 点击后显示该部分内容的相关主题综述3、图表Graphics 点击后，另打开一窗口，显示图表4、证据等级Evidence Grading 在文章RECOMMENDATIONS部分，推荐的治疗方法附有证据等级。Uptodate进入Lexi-Comp药物相互作用查询页面90UpToDate可以帮助医生、临床药师查询药物间是否产生相互作用。 点击 “药物相互作用”，进入Lexi-Comp药物相互作用查询页面UptodateLexi-Comp药物相互作用查询页面91UpToDate可以

51、帮助医生、临床药师查询药物间是否产生相互作用。 输入两种以上的欲查询药品，以Aspirin、Grape Seed、Lasix、Orlistat为例，输入后点击“Analyze”按钮，页面右边出现分析结果点击超链接“risk rating”显示相互作用的等级说明，分成5个等级，分别是A、B、C、D、XUptodateLexi-Comp药物相互作用查询结果92生物信息学资源93生物信息学资源概述生物信息学资源类型 核酸序列数据库 单核苷酸多态性数据库 PDB OMIM 生物信息学资源应用基因、RNA和蛋白质序列信息搜集生物信息学资源概述94 涵盖生命科学的各类数据 包括核苷酸序列、基因变异、基因表

52、达谱、微小RNA、 蛋白质序列、蛋白质三维空间结构等 生物信息学资源的分类根据访问权限公开访问数据库（open accessible database）订阅数据库（subscription database）根据收录内容特定内容数据库（specific database）整合数据库（integrated database）生物信息学资源类型95核酸序列数据库 GenBank /genbank ENA (European Nucleotide Archive) www.ebi.ac.uk/ena/ DDBJ (DNA Data Bank of Japan) http:/www.ddbj.nig.

53、ac.jp/ 单核苷酸多态性数据库 http:/SNP/ 基因表达数据库GEO http:/geo/ 疾病基因数据库OMIM / 蛋白质数据库 UniProt PDB / 生物分子网络数据库 Pathway Commons http:/ KEGG http:/www.kegg.jp/ 96INSDC的数据规模核酸序列数据库世界三大核酸序列数据库美国的GenBank /genbank欧洲的ENA（European Nucleotide Archive） www.ebi.ac.uk/ena/日本的DDBJ（DNA Data Bank of Japan） http:/www.ddbj.nig.ac.

54、jp/共同构成国际核酸序列数据库联盟 （International Nucleotide Sequence Database Collaboration，INSDC）每日同步更新、数据共享97单核苷酸多态性数据库 (dbSNP)概述NCBI创建并维护创建于1998年 包括大规模人类基因组计划测得的SNP数据、不同物种在不同实验条件下的基因变异信息 数据获取方式限定SNP所属物种、所在染色体、所在染色体位置范围、功能分类、标注信息，批量查询通过关键词或SNP唯一标识符查询FTP下载dbSNP中记录的SNP基本信息98Sherry, S.T., Ward, M.H., Kholodov, M.,

55、et al., dbSNP: the NCBI database of genetic variation. Nucleic Acids Res, 2001. 29(1): p. 308-311.该SNP所属物种、参考文献、等位（allele）信息及其临床显著性（clinical significance）、人类基因组变异研究协会（HGVS，Human Genome Variation Society）对该SNP的命名以人类APOE基因相关的SNP（rs769452）为例：dbSNP提供SNP在基因上分布的可视化99Bhagwat, M., Searching NCBIs dbSNP data

56、base. Curr Protoc Bioinformatics, 2010. Chapter 1: p. Unit 1 19.包括该SNP所参照的基因序列，所在基因序列的位置及其邻近SNPs，所产生mRNA碱基变化和蛋白质残基变化提供从该SNP记录到NCBI其它数据库的链接PDB（Protein Data Bank）概述100存储生物大分子三维结构的数据库1971年创建，由美国Brookhaven国家实验室（Brookhaven National Laboratory）负责运维 1998年，美国结构生物信息合作研究组织RCSB （Research Collaboratory for Stru

57、ctural Bioinformatics）成立，负责PDB的开发和管理 1998年，美国结构生物信息合作研究组织RCSB （Research Collaboratory for Structural Bioinformatics）成立，负责PDB的开发和管理成员组织：美国的RCSB PDB、欧洲的PDBe、日本的PDBj、美国的BMRB成员之间同步更新、共享数据 数据免费对外开放，PDB数据每周更新一次101PDB（Protein Data Bank）数据记录 PDB数据记录:生物大分子所属物种名称测量结构的实验手段原子坐标分辨率结构因子温度系数蛋白质主链数目配体分子式金属离子二级结构等信息

58、OMIM概述102 关于人类基因和表现型的在线知识库 内容源于Victor A. McKusick博士于1966年编写发行发表的Mendelian Inheritance in Man一书。 内容源于Victor A. McKusick博士于1966年编写发行发表的Mendelian Inheritance in Man一书检索方式：基因的系统综述在数据库的编号以“*”开始表现型系统综述的编号以“#”开始基因和表现型综合描述的编号以“+”开始未知分子机制的表现型或者位点描述的编号以“%”开始103OMIM查询阿尔兹海默症相关的基因输入疾病名称：Alzheimers DiseaseOMIM关于阿

59、尔兹海默症的记录104涵盖内容临床特点、生化特点、病理、遗传、诊断、分子遗传学、人口遗传学、动物模型等角度提供了疾病的标准分类编码ICD（International Classification of Diseases）和SNOMED CT（Systematized Nomenclature of Medicine Clinical Terms）内容导航疾病名称的临床编码疾病相关基因列表OMIM关于阿尔兹海默症基因APP的记录105关联至外部基因数据库涵盖克隆、基因结构、基因功能、发病机理、分子遗传学、动物模型等角度与核酸、基因变异、蛋白质、生物分子网络、生物医学文献、临床等50多个数据库建立

60、了关联链接基因相关表现型内容导航106生物信息学资源应用基因、RNA和蛋白质序列信息搜集方法1：关键词检索核酸序列数据库 访问NCBI的基因数据库输入基因名字并限定物种 “APP AND Homo sapiensporgn”查询得到人类APP基因/gene/351方法 2：借助数据库之间的互相链接，获取基因序列信息在OMIM基因的页面右侧，点击Gene Info导航条，展开一组基因数据库选择其中的NCBI Gene直接链接到人类APP基因页面/gene/351阿尔兹海默症相关人类APP基因信息页面107基因基本信息（NCBI， Gene ID：351） 包括名字、所属物种、基因功能描述等内容基