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文档简介

1、第五章 兽医流行病学资料Data for Vet. Epidemiological Investigation5.1 资料性质(nature of data)5.2 资料来源(sources of data)5.3 资料收集(data collection)5.4 资料的贮存与调出(data storage and retrieval)5.1 资料性质5.1.1 概述5.1.2 资料要素5.1.3 资料的编码5.1.4 资料的度量资料(data): 是指收集在一起的与某疾病有关的信息或事实,尤其是数字事实,它可能与临床症状、病理剖检、实验室诊断和治疗等有关,可用于流行病学研究时的参考。包括:

2、观察现象(True/False) 观察现象的解释(True/False)5.1.1 概述5.1.2 资料要素资料分类疾病诊断标准诊断评价资料分类 观察性资料(observational data)临床症状、病变和实验室检查结果等。流行病学工作者更希望具体的观察性资料帮助作出病因推断。 解释性资料(interpretative data)对疾病的诊断常是对临床症状、病变和实验室检查结果等一系列观察现象的解释,是解释性资料,往往主观性更强。如诊断为犬瘟热是对多个症状(流鼻漏、腹泻、及咳嗽等)的解释。管理者常依赖解释性资料作出决定。疾病诊断标准(1)临床症状与表现(2)特异性病原因子(3)对诊断性检

3、测的反应猪伪狂犬病:流产、死胎、木乃尹PRVPCR、LAT、ELISA、NT诊断评价诊断指标与标准(diagnostic index and criteria)敏感性与特异性(sensitivity and specificity)可靠性与真实性(reliability and validity)诊断指标客观指标:作仪器测定、很少依赖诊断者的主观意识。半主观指标:根据诊断者的主观感知判断(如肿块的硬度),来自畜主的陈述也是一种半主观指标;主观指标:被诊断者主诉的指标。诊断标准诊断标准:又称诊断界限,是用来区分患某病动物和健康动物的诊断指标值。病、健值间有重叠,流行病学调查应严格按规定的标准进行

4、诊断,不能随意更改。 “亚健康状态”病、健值间有重叠敏感性与特异性敏感性(%)= a/(a+c)x100 即:实际有病而按诊断标准被正确地判为有病的百分率。特异性(%)= d/(b+d)x100 即:实际无病而按诊断标准被正确地判为无病的百分率。按所定诊断标准按“金标准”诊断有病无病阳 性a(真阳性)b(假阳性)阴 性c(假阴性)d(真阴性)金 标 准金标准(gold standard): 指目前临床应用的敏感性和特异性都最高的标准方法,按金标准诊断最接近真实情况。假阴性率(漏诊率)(%) = c/(a+c)x100 即:实际有病但被判断为无病者的百分率;假阳性率(误诊率)(%) = b/(b

5、+d)x100 即:实际无病但被判断为有病者的百分率。符合率符合率:一个试验判断的结果与规范的标准诊断 相比,两者相同的百分率称为符合率。符合率(%) = (a+d)/(a+b+c+d)x100阳性符合率(%) = a/(a+b+c)x100阴性符合率(%)= d/(b+c+d)x100真实性真实性:是指诊断技术获得的结果与预期的结果相似。可用正确诊断指数(r)表示。 r = 1-(假阳性率+假阴性率) =(敏感性+特异性)-1 = (ad-bc)/(a+c)(b+d)真实性与可靠性可靠性:是指诊断技术在重复时可产生相似的结果。影响因素有两方面: 方法本身,如试剂的稳定性等观察差异。Initi

6、al evaluation of the search resultsThe quality of the article must be determined.If the study is of reasonably good quality or no other information is available, the important and useful results must be determined.It must be determined that how or if the results can be used in the specific clinical

7、setting.Quality of dataAssessing the quality of the article is addressed for each of the four common clinical questions: Treatment and prevention Diagnostic testing Prognosis(预后) Causation5.1.3 资料的编码资料通常用文字与数字表示,也可用编码表示。编码:将内容和数字用标准化缩写形式的密码来表示,是一种速记形式。用电脑处理时,密码比文字更容易、更经济,故常用于电脑化记录系统中。密码可分为字母密码、数字密码、

8、字母数字密码和符号密码。欧盟设置统一代码通报动物疫情5.2 资料的来源国际组织:OIE、WHO、FAO政府兽医机构:兽医局、畜牧司、动检局基层兽医部门产业部门:畜禽养殖单位血清库:血清样本的贮存与收藏其它来源:计划、经济、统计部门等(年鉴)互联网:中国畜牧兽医信息网、OIE、WHO报刊杂志:中国动物检疫国外动物疫情数据库农业部(2003年):“国外动物卫生信息系统”这一系统能够动态监视国外动物疫情, 掌握各国动物疫情现状和流行趋势, 科学评估进口动物和动物产品传入疫病的风险。国家动物流行病学研究中心网站 http:/Actinobacillus pleuropneumoniaeZhou RZh

9、ou R 2004Langford P5.3 资料收集死亡和发病统计资料其他背景资料资料的整理常规资料收集包括死亡和发病统计资料及其他背景资料,能为动物群体中的疾病问题持续提供背景材料,可依据这些材料计划并实行一项特殊研究。死亡和发病统计资料法定应报告传染病造成的死亡与发病数字都有可以从各级政府兽医机构的疫情统计报表中得知,如农业部的兽医通报。其它机构,也可能收集发病死亡资料,但应注意资料的可信性。其他背景资料自然地理资料:环境地形、地貌、水文、地质、气候、野生动物、自然灾害等。经济地理资料:行政区划、人口分布、工农业发展状况、畜群结构、饲养管理等。 兽医机构及运作资料:兽医行业的组织结构、行

10、政管理、技术力量、教育和研究、兽医药品的生产与管理、畜禽卫生保健制度等。资料的整理检查收集的资料资料的完整性资料的准确性资料的修正、剔除和补充设计分组:指根据各项目的特征,将同质的资料归并在一起,使资料系统化,以显示内部的规律性。质量分组:疾病种类、种或品种、性别或年龄等数量分组:在质量分组的基础上,再按数量分组,便于作资料内比较。如发病率、死亡率、体温等资料的整理(cont.)拟整理表:原始资料整理归组后,通常用表或图表示(直观)归组划记法:把原始资料中标志相同的用“正”字划记法计数后列于整理表。分卡法:把原始记录卡按项目分组,清点后把有价值的内容或项目过录到“过录卡”上,再分卡归组输入电脑

11、:把归组资料输入电脑,再作统计分析5.4 资料的贮存与调出 非电脑记录法电脑记录法兽医资料库非电脑记录法日记簿:每天对所检查病例的日记性记录,通常是一种叙事性描述。这种记录因内容庞杂,流行病学研究中很难应用。 记录卡:是保存临床记录的常用方法,每张卡片一个动物,通常按畜主的名字依字母顺序存放,一个动物的不同卡片按时间顺序排列,可提供病畜完整的病史。记录卡一般打印有固定栏目,如品种、性别、出生日期等,并留有空白区供记录用。打孔卡片记录技术:分为项目卡片(边缘缺刻)和特征卡片(中央打孔)两种。电脑记录法流行病学数据贮存和分析软件包EPI INFO (USD Incoprorated),EPI PA

12、K (Epidemiology Monitor),EPIDEMO (M. Beiboer)动物生产和兽医服务专用软件DHMD (Dairy Herd Management System)SUIS (Swine User Information Service)兽医资料库资料可能是描述属性特征的(如品种、性别、出生年月等),这部分资料具有病例特异性;有些属性各次记录有变异(如诊断与症状),属记录特异性资料;一个记录中各组之间的联系可用多种方法表示,产生四种资料库。资料库的类型记录型资料库:是构建资料库的传统方法 ,中心组分是包含病例特异与记录特异资料的个案记录。难于区分记录之间各属性的相关性,在

13、流行病学研究中应用有限。层次性资料库:资料组分按属性间的相关性被贮存在呈树状结构的叉点上(树状结构)。网络型资料库:资料库中很多组分可以相关(网状结构)。关系型资料库:所有的资料都用二维表来表示的一种资料库。表项是单值,但记录关系(次序不确定)。3.2 资料库的规模小规模资料库:农场或研究机构收集的动物群体内部疾病问题的资料库,很多畜群保健与生产计划是典型的小规模资料库。中规模资料库:涉及较广范围的疾病问题,如畜禽屠宰场、诊断实验室和兽医诊疗所收集整理的资料。大规模的资料库:涉及全国范围或国际性的疾病问题,如OIE 的database (http:/)。General 8 steps for

14、investigating outbreak1. Describe the time, location and signalment of the affected animals.2. Establish a case definition that clearly diagnoses affected animals.3. Determine the normal level of the disease and compare with the present level of disease to confirm that an outbreak has occurred or is

15、 occurring.4. Identify affected animals and treat, isolate or cull as appropriate.5. Use epidemiologic studies to test hypotheses about the identity of the disease, its source, and its predisposing factors. This includes comparing animals with and without disease (case-control studies) or animals with or without the hypothesize

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