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文档简介
1、一、Functool 简介Functool是AW工作站及Console操作台上的一个选配软件包。它用于对符合条件的数据 组图像加以分析后处理。符合条件的数据组指:数据组中每个层面含有多幅图像,这些多幅的图像或是含有时间变 化,或是B值的变化,或是含有频率的变化。含有时间变化的图像有:Dynamic contrast, Perfusion, fMRI (BOLD)。含有B值变化的图像:Diffusion。含有频率变化的图像: MRS (acquired with the Probe/SI)所有图像要求是同样的扫描层面、同样的扫描中心、同样的扫描像素。最多可载入1024幅图像。分析处理的结果以曲线
2、图或参数伪彩图来表示,这些结果可供保存照像或彩色打印。注:在启动 Functool之前,结束其他所有的应用软件(如 Main Viewer, 3D Analysis, IVI, Reformat, etc )、Functool界面介绍:、载入图像并启动 Functool:1,在Browser中选择符合条件的图像,点击上丝丝_|。显示如下界面:弥散图像的后处理按键脑功能成像的后处理按键灌注及动态扫描的后处理按键灌注及动态扫描的后处理按键弥散张量成像的后处理按键2,左侧界面属于功能版面,各个按键的注释及功能见下图切换至图像管理界面Functool分析界面关闭Functool分析界面NewProto
3、col选择新的处理方式科研软件对所选处理方式的功能设定PreL, b iFilm/Save界面设定图像的保存与照相T 剪切、复制、粘贴功能版面按键注释用曲线的形 式表示不同 时相(X轴)感 兴趣区信号 强度的变化 (Y轴)用柱状图的 形式表示在 某一个信号 强度下(X轴) 像素的数量 (Y轴)以列表的形 式表示不同 相位上(rank) 感兴趣区内 的平均信号 强度强度3, Functool工具栏各项按键说明选择移动/恢复正常调节窗宽窗位放大/缩小图像滚动圜覆旋转/翻转显示/隐藏网格自由划感兴趣区平滑/非平滑显示/隐藏注释对称ROI武也方形/圆形ROI融合/分裂组合/分解添加注释方形/多角形RO
4、I4,当选择某一个重建功能后即进入到图像显示窗口。在显示的图像上,凡是红色注释的地 方都可直接进行改动:点击左键;用鼠标/键盘的左键/右键改动数字或字母;或用中键直接向两边拖拉。左上角的序列窗:.点击该处可隐去或显示被检查者的姓名。.点击该处选择不同的层面:.点击DFOV旁的数字可对图像进行放大,或将已放大的图像缩小(不能缩小原始图像).点击rank旁的红色数字,对同一层面不同时相或不同B值的图像加以选择。.点击红色数字手动调节窗宽窗位。.点击四周显示方位的字母,可在显示平面内的移动图像。在序列窗内,点击鼠标右键,弹出功能菜单Sat Reference hiagc Display Normal
5、 Reset RQIsSave ViewCreate AnnotationH6 PRESS ROI设置背景图像恢复正常重新设置ROI形态保存功能窗全部显示创建注释隐藏波谱扫描的ROI显示序列数据Show Seres Daita?右上角的图表区:可以曲线图、柱状图或表格三种不同形式表示ROI内的信号强度随时间(B值或频率)变化情况(见第四页)。MR中以曲线图最为常用 。.调节纵轴上下两端的数字,可改变纵轴标尺的范围:可分别以绝对值、相对值或百分比代表信号强度变化。.调节横轴左右两端的数字,可改变横轴标尺的范围:可分别代表图像的序号、时间、B值或频率 ppm。.调节光标的大小,有平滑后处理的功能图
6、像作用。.点击该处,可改变显示信号强度的方式(平均值AVG最大值 MAX最小值 MIN、标准偏差DEV。.如果有多个 ROI被定义,点击该处可选择多条曲线的显示方式。这些曲线可重叠在一起,也可分为多个单独的小图表。.如果有ROI被定义,在图表区随着鼠标会出现一十字形可移动的标尺。在图表区,点击鼠标右键,弹出功能菜单Set X UnitSet Y UnitShow ROI UstSave ViewOeate AnnotationShow DeviationSingle Graph用于定义横轴标尺的意义,rank代表图彳t号;time代表时间变化用于定义纵轴标尺的意义,absolute绝对值;re
7、lative相对值;百分数以表格形式显示图像 MR单位以直方图的形势表示在某一个横坐标单位上,MR单位含量以屏幕保存的形式保存图像创建注释或隐去注释显示或隐去偏差值显示单一表格Set Retere nce knage Color Ramps /Display NomniReset ROIsSave ViewCreate Annotat mHide PRESS ROISplit View下方的功能图:通过调节不同的功能计算,可得到伪彩函数图。两个功能窗可以显示 不同的伪彩函数图.计算函数,点击它可以切换到不同的计算函 数,利用像素的信号强度大小计算出不同的 函数值。.色标范围,用于规定伪彩显示范
8、围。功能图 是以不同的色彩代表函数的大小。调节色标 范围决定显示信号强度的范围。与窗宽窗位 的意义相同。.选中的ROI的相应的后处理参数的结果。在图表窗内,点击鼠标右键,弹出功能菜单。设置背景图像为参数图选择不同的色板 恢复正常重新设置ROI形态保存功能窗全部显示创建注释隐藏波谱ROI形态多个显示表示 78% 的透明 度,可同 时显示背 景图像和 功能图像在功能窗的左下角0%Transparaent 表示背景图像 与功能图像的 透过关系,0 表示功能图像 是完全透明的三、利用Functool进行图像后处理的主要步骤:?从Browser中选择欲处理的图像,点击 Functool启动该软件。?选择
9、适当的后处理图标?点击左上角图像的rank值,查看患者在采集过程中是否有移动,以避免产生 错误的分析结果。?定义ROI ,查看时间信号强度曲线。?点击工具栏上方的功能键,进行必要的参数调节。然后点击Compute o?保存所得图像,退出Functool界面。下面将对下列分析方法举例说明1,弥散成像扫描及后处理(Diffusion Weight Imaging )2,动态增强扫描及后处理(Dynamic Contrast Imaging )3,脑功能成像及后处理(Functional MRI-BOLD )4,灌注成像及后处理(Perfusion Dynamic Susceptibility Im
10、aging)5,波谱成像后处理( Magnetic Resonance Spectroscopy)弥散成像扫描及后处理(Diffusion Weight Imaging )一、 扫描方法:1,脉冲序列:single shot SE DWI EPI.主要参数:8值=1000,三个弥散方向,SPF减少周围神经刺激症(PNS)。.图像特点:含两组图像,B值为零T2加权图及B值为1000弥散加权图。二、利用Functool进行图像后处理:GE公司提供的用于分析弥散加权图像DWI的数学模式有两种,ADC (表观弥散系数)及 GE独有的eADC (指数化的表观弥散系数)。.在图像浏览器中选择弥散扫描的序列
11、,点击上neWl?。.点击ADC键,进入到弥散图像后处理界面.调节原始图像在左上角的原始图像区,用鼠标中间键调节窗宽窗位到合适。鼠标左键点击rank键,查看检查部位是否有移动。鼠标左键调节左上角显示层面位置的数值到感兴趣层面。4,调节阈值在左下角的后处理界面 Processing Threshold 中,调节下方蓝线上的左侧最小阈值棒, 使左上角弥散序列图像中的全部脑组织均被绿线覆盖,背景图像无绿线覆盖,然后点击Next。调节阈值的意义在于凡是没有被绿线覆盖的区域在后处理计算中,均按0计算,被绿线覆盖的区域按实际的 MR单位计算前页所示的调节步骤rocnslniQi ThrBSholils!b
12、l vl dti-fe Id tLm mhgo o4 MR bPneti vln*e wbcted rW *f *Ivm 看%甲图5 5,定义ROI,将其放置在预分析观察的部位调节B值(图一),在方格内输入在扫描中真实应用的B值,否则在最后的计算结果中,ADC值是不准确的。点击 Next进入下一个调节界面 Advanced Setting 。6, Advanced Setting (图二):在此界面中,上面的 Confidence level是用于调节统计分析的概率值,常规选择默认状态即可。下面的 Unit ADC map是选择后处理结果 的ADC值的单位,常规选择 mm/s。然后点击Next
13、进入Final Setting 界面。7,在Final Setting 界面中(图三),点击 Compute ,就在功能窗内显示出后处理的 功能图(图四)及相应的计算结果。图四8,左侧的功能窗显示的是 eADC图,右侧功能窗显示的 ADC图。注意eADC值是没有 单位的,ADC值是有单位的,在画出感兴趣区后,所得的值就是该区域的弥散系数 值,单位是 mm/s o功能窗的左上角的放大见下图1 0 .7UFOV cmApparent DifFusioni CoefFicient 。刖m*/春? _Exponentia1 ftpparent Diffusion CoeFFici&nt注:ADC (表
14、观弥散系数)是专用于 DWI的数学模式。在各向同性DWI图像中信号强度有两种成份:组织的 T2成份,即常说的 T2 shine through效应;自由水的弥散效应。DWI不能真正反映组织的弥散情况。弥散受限的组织表现为高信号,而长TE组织即使无弥散受限由于T2 shine through效应也会表现为高信号。而在ADC参数图中可消除 T2 shine through效应的影响。在 ADC图中,亮的部分表示局部组织的弥散程度高,低信号的部分表示局部弥散受卜Mo eADC图不仅消除了 T2 shine through 效应的影响,还保留 DWI图像信号的特 点:即弥散受限的组织表现为高信号,自由
15、弥散的组织为低信号。Color Ramps提供多种伪彩显示方式。系统默认的是 以配合DWI的灰白对比信号特点。ln (I(b) / I(0) =KDC*beADC = I(b) / I(0)9,在参数图区点击右键,其中Rainbow ,可选择 Gray level10,点击Film/Save保存功能图像动态增强扫描及后处理(Dynamic Contrast Imaging )一、 扫描方法:.脉冲序列:2D/3D Fast GRE/SPGR 或 3D Fast TOF GRE/SPGR.主要参数:在 Image Option 中选 Multi Phase, 5 6 个时相;# of Acqs
16、before pause 为 1。.扫描方法:开放静脉通道,准备好造影剂;预扫描;开始扫描,第一个时相扫描结束后,打 药后根据不同部位选择不同的延迟时间进行其他时相的扫描;根据情况需要指导患者呼吸。二、利用Functool进行图像后处理:GE公司提供的用于分析动态增强的数学模式有多种, Maximum Slope of Increase(MSI) , Positive Enhancement Integral(PEI), Mean Time to Enhance(MTE)。1 .选择欲分析的图像,点击吧12_。2,选择 MR Standard或SER功能按键3,重复第13页的步骤3、4。4,定
17、义ROI,调节其大小,将它放置在病变区;复制 同样的ROI放置在正常区,以供对照。伴随 ROI 的设定,在曲线窗内就会出现相应的信号曲线。, 在 Pre and Post Enhancement Images调节界面中,上面的调节棒用来调节增强前的图像,指注入造影剂 前的最后一个时相,下面的调节棒用来调节增强后的 图像。. Base and Sign 调节界面中,选择 Interpolated和Pos用ve ,点击Next进入下面的界面。点 击Compute ,得出最后的功能图像。.点击左上角红色的计算函数名称,切换显示不同的函数的伪彩图。.点击Film/Save保存函数图。如果同时还要保存函
18、数图上的感兴趣区位置及相应的数值, 鼠标右键点击后选择 Save View 。.退出Functool处理界面Functool 7脑功能成像及后处理(Functional MRI-BOLD )一、 扫描方法:1 .脉冲序列:single shot multi phase GRE EPI2,参数举例:TR = 2000, NEX = 1, 128 个 Phase.刺激模式:TR/1000 *10的值为刺激时间,再用相同的时间为静息时间。10表示相位数。TR/1000表示将TR时间由毫秒换算成秒。.在非EXCITE系统上,每个序列最大的扫描图像数为512帧,因此,128个相位意味着最大扫描层面为4层
19、;在EXCITE II系统上,每个序列的最大扫描图像数为1024帧,128个相位意味着最大扫描层面为 8层。GE公司提供的用于分析脑功能成像BOLD的数学函数为相二、利用Functool进行图像后处理:关系数(Correlation Coefficient ).选择欲分析的图像及背景图像,点击.点击fMRI功能按键。.复第13页的步骤3、4。.在 Functional MRI : Reference Pattern 调节 界面中,NS表示扫描开始时的平静状态的相 位数;NA表示平静状态后的 BOLD的刺激状 态的相位数;NB表示刺激状态后的静息状态 的相位数。各个相位数的设定依据扫描前的刺激模
20、式设定 的相位值输入。点击 Next进入下面的界面。.在Final Setting 界面(图一),点击 Advanced Setting ,进入高级设定界面(图二), 调节统计分析的概率值,常规选择默认值即可。点击Done回到Final Setting 界面,点击Compute得出最后的相关函数图。注:Correlation Coefficient显示事件的相关性。他在fMRI的后处理中的意义在于表示图像信号强度的变化与刺激模式设定的相关性,相关性越大,表示该区域越有可能是该种刺激的兴奋中枢灌注成像及后处理 Perfusion (Dynamic Susceptibility Imaging)一
21、、扫描方法:.脉冲序列:multi phase GRE EPI 或 SE EPI.主要参数:调节扫描参数使扫描时间在1:00左右,同时保证足够的时间分辨率及扫描范围。最少使用30-35个相位数。操作者应注意相位数乘以层数不能超过每个序列所限制的最大 扫描层数。3,扫描方法:开放静脉通道,准备好造影剂;预扫描;开始扫描,第一幅图像开始出现后, (15ml)以3-4ml/sec的速度快速注射造影剂及相同剂量的盐水,扫描结束。二、利用Functool进行图像后处理:GE公司提供的用于分析灌注成像Perfusion的数学模式主要有两种,Negative Enhancement Integral (NEI) Mean Time to E
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