3p87药代动力学软件的使用说明.doc

主题: 3p87药代动力学软件的使用说明 作者: liuying 楼主尽管现在3p87/3p97不是最好的药代动力学处理软件，但好多人还在用。下面贴一个使用说明供新手参考。3p87(新版)使用说明一.基本要求1.在合理的取样设计基础上,对于非静脉注射给药,一室模型不少于五个,二室模型不少于八个,三室模型不少十一个不同时刻的血药浓度数据.对于静脉推注给药和静脉滴注给药滴完药以后,一室模型不少于四个,二室模型不少于五个,三室模型不少于九个不同时刻的血药浓度数据.2.IBM-PC及于其兼容的各种型号微机,英文DOS操作系统,打印机.二.调用3P87程序前的准备工作1.确定主数据.如果一个剂量组有几个个体,主数据是指浓度数据的均数或中位数,或用户认为最具代表性的浓度数据.一般来说,对静脉注射给药的数据用均数或中位数比较合适,对于非静脉注射给药可考虑用实测点多的数据为主数据.目的是在计算个体数据时,可参考主数据的计算结果,选定房室数和权重进行计算.2.打印曲线图形的准备工作.见文件DQX.TXT可用打印机打印出来,即执行命令PRINTAQX.TXT三.调用3P87将3P87程序盘放入A驱动器,键入A:3P87并回车,即显示程序首页,再按任意键,显示出程序主菜单:主菜单1.输入或修改数据2.用主数据计算药代动力学参数3.对多组数据进行批处理计算4.由用户指定算法和条件计算药代动力学参数5.输出计算结果6.用简化系统计算药代动力学参数7.药代动力学房室模型的图示和说明8.退出3P87程序四.输入或修改数据在屏幕出现程序主菜单后,键入数字1屏幕左上角显示出PleaseExecutea:inp键入a:inp并回车,屏幕显示出输入菜单:输入菜单1.输入数据2.修改标题文件3.修改浓度-时间数据4.增添浓度-时间数据5.删除浓度-时间数据6.显示输入的数据7.打印输入的数据8.返回主菜单1.输入数据1.1建立标题文件在屏幕显示输入菜单后,键入数字1即显示出标题文件中需要输入的内容:1.药名或文件名2.实验对象3.研制单位4.日期5.实验者6.计算者7.测定灵敏度8.浓度单位9.测定精密度(cv%)10.时间单位11.给药剂量单位用户按光标提示项目逐项输入之,其中1.8.10.11.项与实验记录和计算有密切关系,必须输入.每输完一项(数字或文字)都要按回车键(ENTER键).当全部项目输入完后,屏幕重现标题文件全部内容,同时询问用户是否需要修改,如不修改,按回车键后向用户提问是否确认Areyousure(Y/N)?如确认按Y键,程序进入下一步;如需修改,按N键,再用四个箭头编辑键,把光标移到要修改处进行修改,每修改完一项必须按回车键.当全部项目正确无误后,再按上述方法进入程序下一步给药途径的输入.1.2输入给药途径屏幕显示出三种给药途径1.静脉推注2.静脉滴注3.非静脉给药用户按相应数字键选定给药途经后,程序进入下一步剂量组数的输入.1.3输入剂量组数用户按相应数字键后,程序进入下一步输入各剂量组的个体数目,剂量和静脉滴注时的滴注时间.1.4输入各剂量组的个体数目,剂量和静脉滴注时的滴注时间.用户按光标提示项目逐项输入相应数据.每输完一个数据都要按回车键.当全部数据输完后,亦可用四个箭头编辑键,把光标移到要修改处进行修改,每修改完一项必须按回车键.当正确无误后,按回车键进入程序下一步输入浓度-时间数据.*当上述数据输入完成后,程序自动以用户输入的药名或文件名中前八个英文字母加后缀.TIT形成标题文件,存入当前盘,以后可随时使用.1.5输入浓度-时间数据先输入各剂量组的主数据,供选择模型,算法,权重用,然后输入各剂量组内各个体的浓度-时间数据.如用户想对每个个体都逐一计算各种模型,可将个体数据按主数据输入.在输入浓度-时间数据时,屏幕上显示出当前要输入的数据的序号(DataNo.),主数据号(Main*)或个体序号(Subject*),给药途经(RouteofAdministration),剂量(Dose);并询问该组数据的点数(NumberofPairs),按相应数字键和回车键回答之.用户根据屏幕提示的剂量组号,个体号,光标指示的时间或浓度位置,依次输入相应数据.每个数据输入后都要按回车键.全部数据输完后,屏幕重现全部输入内容,按回车键,经确认后记入当前盘,或用四个箭头编辑键,把光标移到要修改处进行修改,每修改完一项必须按回车键.*输入完所有浓度-时间数据后,程序自动以用户输入的药名或文件名中前八个英文字母加后缀.INP形成浓度-时间数据文件,存入当前盘,以后可随时使用.2.修改标题文件在屏幕显示输入菜单,按数字键2后,屏幕显示询问要修改的文件名(药名),键入文件名后,屏幕重显原标题文件的全部内容,用四个箭头编辑键,把光标移到要修改处进行修改,其方法和输入标题文件时一样.3.修改浓度-时间数据在屏幕显示输入菜单,按数字键3后,屏幕显示询问要修改的数据序号(DataNo.),键入序号后,屏幕重显该记录号的全部内容,用四个箭头编辑键,把光标移到要修改处进行修改.修改的内容可以是浓度-时间点的个数,时间值,浓度值.每修改完一项必须按回车键.其方法和输入浓度-时间数据时一样.4.增添浓度-时间数据在屏幕显示输入菜单,按数字键4后,出现增添数据菜单:1.增添新剂量组2.在某剂量组内增添个体数据3.返回输入菜单按数字键或1或2或3,完成相应的工作.4.1增添剂量组屏幕显示输入文件结构,询问是否要增添Append(Y/N)?要增添则键Y,然后询问要增添的组数(NumberofGrouptobeAppended),用户输入组数并得到确认后,屏幕重现剂量组别,个体数,剂量,静脉滴注时间的结构,光标停在准备增添的地方,用户根据提示,顺序输入剂量组的个体数,剂量,滴注时间.其方法与开始输入时一样.4.2在剂量组内增添个体数据根据询问回答要增添的剂量组号(DatawillbeAppendedtoGroupNo.)和新增添的个体数(NumberofSubjectstobeAppended),随后按提示顺序输入时间-浓度点数,时间和浓度数据,方法与前述相同.5.删除浓度-时间数据在屏幕显示输入菜单,按数字键5后,出现删除数据菜单:1.删除一个剂量组的全部数据2.删除一个剂量组中的一个个体数据3.返回输入菜单按数字键或1或2或3,完成相应的工作.5.1删除一个剂量组的全部数据屏幕首先要确认是否要删除Delete(Y/N),在确认后,询问将要删除的剂量组号(TheGroupNo.tobeDelete),用户键入剂量组号,还要再次认可(Group*willbeDeletedAreYouSure(y/n)?)后,程序删除该剂量组全部数据,包括主数据,个体数据,并按新的结构重排一次数据.5.2删除一个剂量组中的一个个体数据根据屏幕显示的数据序号(DataNO.),剂量组号(Group)等,回答准备删除的数据序号(PleaseInputtheDataNO.tobeDeleted?)后,该序号的数据即被删除.*增添或删除记录将要改变整个文件的结构,使标题文件中的剂量组数,组内个体数,剂量和滴注时间,以及输入和输出文件记录顺序都必然发生相应的变动.为此建议用户在此前,应首先复制一份原文件作备用.6.显示或打印输入文件在屏幕显示输入菜单,按数字键6或7即可显示或打印输入文件内容,用户从该内容可以了解数据排列顺序,便于修改核对,这对于指定数据号进行计算也非常有用.其顺序是按剂量组顺序排列的,先按主数据序号排列,再按个体顺序排列.用户可自如调用有关记录.五.计算药代动力学参数在屏幕出现程序主菜单后,键入数字或2或3或4即可进行药代动力学参数计算.此时屏幕左下侧有一对话区,用户应回答其中的提问.为防止误答,在键入回答后要求再确认Areyousure(Y/N)?键Y表示确认无误,就进行下一步.计算时屏幕分成左右两栏,左栏显示出数据号,模型号,房室数,给药途经,计算方法,权重,收敛精度,迭代次数(No.ofiterations),残差平方和(SunofSquares)等.右栏显示出正在计算的血药浓度-时间数据.屏幕左下侧的对话区显示出CALCULATIONPleaseWaiting(正在计算,请等待).计算完毕后,不显示或打印结果,而是将全部结果存入当前盘,用户可随时调用,调用方法见后面六.1.用主数据进行计算在屏幕显示主菜单后,键入数字2屏幕显示出:AUTOCOMPUTATION(自动计算).对自动计算,对话区只提问文件名.计算时,程序首先判别正在计算的数据是符合线性还是符合非线性动力学模型.如符合线性动力学模型,则分别计算出九种情况的结果:一,二,三房室各用1,1/C,1/C/C三种权重;如符合非线性动力学模型,则计算出三种情况的结果:一房室三种权重.2.批处理的计算在屏幕显示主菜单后,键入数字3屏幕显示出:BATCHCOMPUTATION(批处理计算).对批处理计算,要依次回答出现在对话区中的提问:(1)文件名(2)选择模型用户可根据屏幕右栏中显示的十五种模型,键入所选模型前面的数字即可.有关选择模型的方法可参考下面六.1.1.1的说明1.(3)选择权重用户可根据屏幕右栏中显示的三种权重,键入所选权重前面的数字即可.有关选择权重的方法可参考下面六.1.1.1的说明2.3.指定算法和条件的计算在屏幕显示主菜单后,键入数字4屏幕显示出:SPECIFIEDCOMPUTATION(指定计算).对指定计算,要依次回答出现在对话区中的提问:(1)文件名(2)要计算的数据号用户要了解数据号,可以用输入菜单的第七项打印出清单(3)存入计算结果的记录号屏幕提示该号应大于已存有结果的记录号,因此用户键入的数字一般应大于已存有结果的记录号的数字,除非用户想用新算出的结果替换原有的结果.(4)选择算法根据屏幕右栏中显示的四种方法,键入所选方法前面的数字.(5)选择模型根据屏幕右栏中显示的十五种模型,键入所选模型前面的数字.给定收敛精度例如取0.001或0.01.(7)确定初值选择方法按屏幕右栏显示的三种方式由用户指定:(7-1)自定初值根据提示由键盘键入(7-2)半自动确定用户根据屏幕显示的曲线转折点的位置,由后向前计数,键入转折点的序号,由程序用残数法计算初值.(7-3)自动确定由程序自动计算初值.当对话区显示出InitialValuesGained,Pressanykeytocontinue表示初值已算好,按任一键开始自动计算.六.计算结果的输出在屏幕出现程序主菜单后,键入数字5调出输出程序,屏幕显示出FileName键入文件名并予以确认后,显示出输出菜单(OUTPUTMENU):1.常规打印输出2.显示个体数据计算结果3.绘制相关图及散点图4.打印输出文件清单5.返回主菜单1.常规打印输出在屏幕显示输出菜单后,键入数字1显示出常规打印输出菜单(PROUTINEPRINTOUT):1.打印标题文件2.打印供选择模型用的计算结果3.打印批处理的结果4.打印用户指定计算的结果5.打印个体数据的计算结果6.打印统计矩的结果7.返回输出菜单在屏幕显示出常规打印输出菜单后,键入相应数字即可完成对应的工作.1.1供选择模型用的计算打印出的主要内容及几点说明在屏幕显示出常规打印输出菜单后,键入数字2即可打印出如下主要内容.(1)拟合优度比较表表中列出记录号,组号,权重,房室数及以下内容:加权残差平方和(WSS)相关系数(R)确定系数(R*R)=1-WSS/LYY拟合优度值=SQR(WSS/(N-P)SQR(A)表示开A的平方,N是浓度-时间数据点数,P是参数个数最大绝对误差(MAE)最大相对误差(MRE)AIC=N*LN(WSS)+2PLN(A)表示取A的自然对数,P是参数个数游移检验(RunTest)是各点实测浓度与计算浓度差值正负号变化的次数(2)拟合曲线图将九种情况(一,二,三房室各加1,1/C,1/C/C权)的计算结果用C-T曲线及LN(C)-T曲线表示(3)F检验各种权重下两种房室模型之间的F值和P值(4)统计矩计算结果AUC,AUMC,MRT,VRT说明1.关于房室数的选择可根据F检验和AIC值选择房室数.对于相同的权,当F检验有显著意义(P0.05或P0.05)时,则取房室数少者为宜.说明2.关于权重的选择如何选择权重,至今意见不一,以下几点意见可供参考:首先比较拟合优度值(Goodnessoffit),数值越小越好,如数值相等或相近,再同时结合最低检测浓度,参考最大绝对误差和相对误差.一般说来,权重为1时,最大绝对误差较小,对高浓度数据部份拟合较好,有利于计算表观分布容积及生物利用度,权重为1/C/C时,最大相对误差较小,对低浓度数据部份拟合较好,有利于计算消除相半衰期,权重为1/C时,通常能兼顾高低浓度两部份数据,但最大绝对误差及相对误差往往并非最小.1.2批处理计算打印出的主要内容在屏幕显示出常规打印输出菜单后,键入数字3即可打印出如下主要内容.(1)批处理拟合优度表内容同六.1.1.1(1)(2)一级参数表(3)二级参数表一级和二级参数表中均给出各剂量内各个体的参数值,平均值,标准差和标准误.(4)统计矩计算结果AUC,AUMC,MRT,VRT1.3用户指定计算打印出的主要内容在屏幕显示出常规打印输出菜单后,键入数字4可打印出如下主要内容:拟合优度简表,各记录号的详细内容.这些内容可用本菜单第5项功能打印出来,或用输出菜单第2项功能显示在屏幕上.1.4个体数据计算的详细输出在屏幕显示出常规打印输出菜单后,键入数字5进入个体数据计算结果的输出.再键入起始和终止记录号,即可依次按下列顺序打印出各记录的详细结果:标题及计算条件;拟合优度数据及药代动力学参数;浓度实测值与计算值比较表;C-T曲线图;LN(C)-T曲线图.如果记录号的内容是用统计矩法计算的,则只打印出统计矩参数.1.5统计矩计算结果的输出在屏幕显示出常规打印输出菜单后,键入数字6进入统计矩计算结果的输出,将主数据及批处理统计矩参数依次打印出来.2.个体数据计算结果显示在屏幕显示输出菜单后,键入数字2进入个体数据计算结果显示.再键入起始和终止记录号,则依次打印出以下内容:标题及实验设计;记录号;计算条件及拟合优度数据;一级药代动力学参数;浓度实测值与计算值比较表;药代动力学参数表;统计矩参数表(只含有统计矩计算的记录号,才显示此结果);C-T曲线图;LN(C)-T曲线图.3.绘制相关图及误差散点图在屏幕显示输出菜