DB32T 4964-2024粳稻品种真实性和纯度SSR分子标记检测法

ICS65.020.20江苏省地方标准DB32/T4964—2024粳稻品种真实性和纯度SSR分子标记检测法VarietygenuinenessandpuritytestingofjaponicaricewithSSRmarkers2024-12-27发布2025-01-27实施Ⅰ前言 Ⅲ 2规范性引用文件 3术语和定义 5检测方法 5.1基本要求 5.2真实性检测 5.3纯度检测 5.4引物合成 6结果报告 附录A（资料性）等位基因扩增片段信息 Ⅲ起草。请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别专利的责任。本文件江苏省农作物标准化技术委员会提出、归口并组织实施。本文件起草单位：扬州大学、江苏省种子管理站。杜海波。1DB32/T4964—2024粳稻品种真实性和纯度SSR分子标记检测法本文件给出了粳稻（OryzasativaL.japonica）品种真实性，描述了检测方法和结果报告。本文件适用于江苏地区推广的粳稻品种的真实性验证和真实性身份鉴定，也适用于粳稻常规种、杂交种及其亲本的纯度检测。江苏籼稻品种（包括常规种、杂交种及其亲本）的真实性和纯度测定可参照执行。本文件不适用于粳稻实质性派生品种和转基因品种的鉴定。2规范性引用文件下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款。其中，标注日期的引用文件，仅该日期对应的版本适用于本文件；不标注日期的引用文件，其最新版本（包括所有的修改单）适用于本文件。GB/T39917—2021主要农作物品种真实性和纯度SSR分子标记检测稻3术语和定义GB/T39917—2021界定的术语和定义适用于本文件。简单序列重复（SSR）是一类由2个~6个碱基组成的串联重复DNA序列。水稻不同品种在SSR重复次数上会存在差异，这种差异可在世代间稳定遗传。筛选在品种间重复次数变异丰富的SSR位点是利用SSR分子标记鉴定品种真实性和纯度的关键。采用固定数量的SSR引物对抽取品种的代表性样品DNA进行扩增和电泳检测，并通过与标准样品比较或与已知品种SSR指纹数据库比对，可对抽样品种的真实性或身份进行鉴定。筛选能够鉴别品种群体中异常个体的SSR引物，进而利用其检测该品种的一定数量个体，根据检测到的异常个体数占比，可对该品种的整体一致性或纯度作出评价。中国栽培稻分为籼稻和粳稻两个亚种，江苏水稻以粳稻为主。籼稻和粳稻在基因组组成和生态适应性上存在明显差异，造成一些SSR位点的重复次数差异在籼稻品种间广泛存在，但却不存在于粳稻品种间。依据江苏粳稻品种间的序列变异特征，筛选在品种间变异丰富的SSR位点，结合GB/T39917—2021中的SSR位点和检测流程，可提高SSR标记在江苏粳稻品种真实性和纯度检测中的鉴定效率。2DB32/T4964—20245检测方法5.1基本要求检测平台、样品要求、仪器设备、试剂溶液配制、检测程序、DNA提取、PCR扩增、扩增产物分离和数据分析应符合GB/T39917—2021的规定。5.2真实性检测5.2.1根据分辨率高、多态性信息含量值高、染色体分布均匀、与GB/T39917—2021间的衔接等筛选原则，本文件确定76对SSR引物作为江苏粳稻品种真实性鉴定引物，其中48对为GB/T39917—2021中的引物（编号为PR01~PR48另外28对为新增引物（编号为R49~R76）见表1。5.2.2利用76对引物构建江苏已知粳稻品种及部分杂交籼稻品种的SSR指纹数据库。各对引物扩增的部分代表性带纹和品种见附录A。5.2.3进行品种真实性验证检测时，将76对SSR引物分为Ⅰ组和Ⅱ组两组依次进行，其中Ⅰ组为GB/T39917—2021中的48对引物；Ⅱ组为新增的28对引物。在Ⅰ组引物检测中，若检测到可以判定“否定”结果的差异位点数的，终止检测；未检测到或检测到但未达到可以判定“否定”结果的差异位点数的，应继续完成Ⅱ组引物的检测。5.2.4进行品种真实性身份鉴定检测时，应完成全部76对引物检测，可采用Ⅰ组和Ⅱ组序贯方式进行，也可采用其他次序进行。利用江苏已推广粳稻品种的SSR指纹数据库，通过指纹数据比对筛查确定具体品种。经比较后与已知品种存在没有位点差异或差异位点数不足而无法得出结论或有争议的，允许采用田间种植鉴定方法等其他方法进行进一步检测鉴定。5.3纯度检测5.3.1品种纯度检测所选的引物，应通过检测样品预试验，从76对SSR引物中筛选出能够准确识别该样品品种中异常个体的引物。5.3.2异常个体的类型不同，所选引物和数目也应不同。筛选时应结合引物的杂合度、DNA快速提取和多重引物组合电泳的潜力，选择合适引物。注：杂交种异常个体主要类型为自交、异交、混杂；常规种和杂交亲本种子异常个体为异交、混杂。5.3.3筛选结果表明样品在个别位点存在遗传不稳定状况的可将其剔除；检测样品存在严重遗传不稳定状况的可终止纯度测定。5.4引物合成5.4.1真实性检测或身份鉴定引物表1给出了28对新增的真实性验证或身份鉴定引物，其中各引物染色体位置参考的基因组版本号为Os⁃Nipponbare⁃Reference⁃IRGSP⁃1.0。选用PAGE电泳，只需合成普通引物，采用单引物电泳；选用荧光毛细管电泳，应在正向引物的5′端标记荧光染料合成引物，采用单引物或组合引物电泳。3DB32/T4964—2024表1新增的28对真实性验证或身份鉴定引物编号引物名称染色体（位置bp）退火温度/℃引物序列（5'→3'）标记荧光R49RM13311（1670278）55正向：CACCAGCTTCATGCATGCFAM反向：AGCACTCAACTGATGCAGTGR50RM91（23326225）55正向：GGTGCCATTGTCGTCCTCVIC反向：ACGGCCCTCATCACCTTCR51RM38251（36471203）55正向：AAAGCCCCCAAAAGCAGTACVIC反向：GTGAAACTCTGGGGTGTTCGR52ZY24.5⁃2⁃62（5126573）55正向：CACTCCTACTTCCTCCGTTFAM反向：AGGCGTGATGTTCTACTGTTAR53RM13582（10185685）55正向：GATCGATGCAGCAGCATATGNED反向：ACGTGTGGCTGCTTTTGCR54RM54722（30643072）55正向：CACTCAAGACCAGACCTGTACGPET反向：CGGCACGTCATTGTAGTGACR55RM2183（8406429）55正向：TGGTCAAACCAAGGTCCTTCFAM反向：GACATACATTCTACCCCCGGR56RM32973（13289444）55正向：CTCGTACTCCTCTTCCACCGVIC反向：GTAACCTAGCTGCCCCTTCCR57LG25.4⁃3⁃13（25378971）55正向：AACTGAATAATAAGCCAACCPET反向：AGAATGCTCTGAGGGATGTR58XG16.6⁃4⁃14（15247546）55正向：AAAGTGTCCCAGTCCATTFAM反向：CCTTTACTCGCCAGATGCR59RM13594（20032557）55正向：CTCGCGAGGAAGAAGACAACPET反向：CGCCGGCTGGTTAATTAATCR60RM37965（488187）55正向：ATTAGCCTTTAATTCCACTGFAM反向：ATACAAACAAACAGCTTGTGR61RM11155（14816294）55正向：GCTGCAATTTATACCGGAGGPET反向：AGCCACCACCATCTATCTGCR62RM31836（12448177）55正向：GCTCCACAGAAAAGCAAAGCVIC反向：TGCAACAGTAGCTGTAGCCGR63RM71936（20258707）55正向：ATGTGGGAATTTCTAGCCCCNED反向：CCCTAGTTTTCCAAATGGCCR64RM4126（30328850）55正向：CACTTGAGAAAGTTAGTGCAGCFAM反向：CCCAAACACACCCAAATAC4DB32/T4964—2024表1新增的28对真实性验证或身份鉴定引物（续）编号引物名称染色体（位置bp）退火温度/℃引物序列（5'→3'）标记荧光R65RM57117（3142306）55正向：GTCCATGCATCCATCTCTAGFAM反向：ACGGAAGGAATACGTCTGTAR66RM68727（4660489）55正向：GGATGAACACTGATGATGGCFAM反向：ACCTCCACCACGATATCCACR67RM547N8（5592401）55正向：GTCAAGATCATCCTCGTAGCNED反向：TGTCGATTGTATCAGTTTGGR68RM228258（11759304）55正向：AGCACATCACAAACCTACCCTACCVIC反向：CCTAATTAATCCCGCGGAACCR69RM54858（24072903）55正向：CTTCCACAAGCTTGGCTAGGPET反向：AATGCCATCCCCTACTCATGR70WY13.3⁃99（13265227）55正向：CTGACTCCGACATCCGAAACFAM反向：AACCCTGGCAAGTAGTAAAGR71RM568910（13554862）55正向：GCACATGGTGAGACGTCCTCFAM反向AAGTCCTGTAGTAGGTCACACCGR72RM5918N11（3025975）55正向：AAAGGAAAGCCACAGAAGTGNED反向：TTGCAACCAGGTTGGTAAGAR73RM536N11（8990595）55正向：ACATGCACCAGAGTTCATAATFAM反向：TTTCTTTGCTCAGACCTTACAR74RM2780812（7358562）55正向：GGAAGTGCCCGATTAGTATAGGFAM反向：ATCACCTACTACCTCCATTTCAGGR75ZY15.1⁃12⁃412（24434567）55正向：TAACGGTTGGATGTTTTGCTFAM反向：AGAGTTTTCGATGCTTTGATR76RM697312（694000）55正向：CAACTCCAGCTTCGCCAACVIC反向：CGGCCACACCTAAATAAACG注：标记荧光栏中所列的荧光标记如FAM等仅作为示例，只适用于本文件中的检测平台使用。5.4.2品种纯度检测引物表2给出了13对品种纯度检测推荐引物，作为优先筛选的候选引物。筛选时，可用至少含20粒的小样品进行试验，依据5.3的要求，确定适宜的引物或引物组合。推荐的13对引物未达到效果的，可选择另外63对引物或其他引物进行筛选。5DB32/T4964—2024表2品种纯度检测推荐引物编号引物名称染色体（位置bp）退火温度/℃引物序列（5'→3'）标记荧光PR01RM5831（8329859）55正向：AGATCCATCCCTGTGGAGAGFAM反向：GCGAACTCGCGTTGTAATCPR07RM3367（21872197）55正向：CTTACAGAGAAACGGCATCGVIC反向：GCTGGTTTGTTTCAGGTTCGPR14RM2082（35141667）55正向：TCTGCAAGCCTTGTCTGATGPET反向：TAAGTCGATCATTGTGTGGACCPR18RM2536（5426496）55正向：TCCTTCAAGAGTGCAAAACCPET反向：GCATTGTCATGTCGAAGCCPR19RM4817（2876164）55正向：TAGCTAGCCGATTGAATGGCFAM反向：CTCCACCTCCTATGTTGTTGPR23RM22411（27673250）55正向：ATCGATCGATCTTCACGAGGNED反向：TGCTATAAAAGGCATTCGGGPR43RM5674（34718825）55正向：ATCAGGGAAATCCTGAAGGGFAM反向：GGAAGGAGCAATCACCACTGPR46RM2789（19320429）55正向：GTAGTGAGCCTAACAATAATCNED反向：TCAACTCAGCATCTCTGTCCR57LG25.4⁃3⁃13（25378971）55正向：AACTGAATAATAAGCCAACCPET反向：AGAATGCTCTGAGGGATGTR65RM57117（3142306）55正向：GTCCATGCATCCATCTCTAGFAM反向：ACGGAAGGAATACGTCTGTAR67RM547N8（5592401）55正向：GTCAAGATCATCCTCGTAGCNED反向：TGTCGATTGTATCAGTTTGGR71RM568910（13554862）55正向：GCACATGGTGAGACGTCCTCFAM反向：AAGTCCTGTAGTAGGTCACACCGR74RM2780812（7358562）55正向：GGAAGTGCCCGATTAGTATAGGFAM反向：ATCACCTACTACCTCCATTTCAGG注：标记荧光栏中所列的荧光标记如FAM等仅作为示例，只适用于本文件中的检测平台使用。6结果报告真实性鉴定和纯度检测的结果报告应符合GB/T39917—2021的要求。6DB32/T4964—2024（资料性）等位基因扩增片段信息表A.1列出了76对引物在江苏推广粳稻品种及部分籼稻品种中扩增的片段长度范围、主要等位基因扩增片段大小，以及参照样品对应的扩增片段信息。其中参照样品只是列举，考虑到在某一SSR位点多个品种存在相同的扩增片段大小，确认某一品种在该位点扩增片段大小与参照样品是相同的，该品种39917—2021给出的范围间进行了整合，保留了最大扩增范围值。表A.1已知品种主要等位基因扩增片段信息引物等位基因扩增片段参照样品编号名称范围/bp片段定义/bp名称扩增片段/bpPR01RM583157~198保稻701157/157镇糯19号178/178浙粳优1758180/189武育粳18号183/183苏秀326号186/186太湖糯2号189/189淮糯12号192/192苏香粳3号195/195武运粳23号198/198PR02RM424239~287苏香粳3号239/239连黑糯1号278/278PR03RM8575~140苏香粳3号80/80武香粳10085/8585/95PR04RM47198~120盐稻18号98/100丰粳1606100/104苏香粳2号102/102苏香粳3号104/1047DB32/T4964—2024表A.1已知品种主要等位基因扩增片段信息（续）引物等位基因扩增片段参照样品编号名称范围/bp片段定义/bp名称扩增片段/bpPR05RM598144~168144/147144/147武运粳29号150/150淮稻56156/156武育粳18号159/159苏香粳3号162/162168/168PR06RM190103~126镇稻16号103/103苏香粳3号120/120镇稻15号122/122扬粳3012124/124太湖糯2号126/126PR07RM336119~196太湖糯2号136/136苏香粳2号148/148扬育粳2号154/154皖垦粳516157/157太湖糯160/160盐稻10号163/163苏香粳3号166/166金地糯288169/169PR08RM72147~214甬优4543147/151常优粳11号151/151镇稻32号154/154156/156南粳9108172/172苏香粳3号175/1758DB32/T4964—2024表A.1已知品种主要等位基因扩增片段信息（续）引物等位基因扩增片段参照样品编号名称范围/bp片段定义/bp名称扩增片段/bpPR08RM72147~214镇稻11号187/187武运粳24号190/190PR09RM219182~248苏秀10号186/186淮稻13号192/192镇稻13198/198华丰稻1号200/200南粳55202/202金香糯1号220/220连粳18号230/230淮稻33244/244PR10RM590117~150134/136134/136苏香粳3号139/139139/145常优粳13号139/148PR11RM209102~162镇稻18号102/102常农粳6号104/104连粳10号111/1119DB32/T4964—2024表A.1已知品种主要等位基因扩增片段信息（续）引物等位基因扩增片段参照样品编号名称范围/bp片段定义/bp名称扩增片段/bpPR11RM209102~162盐糯17118/118盐田育3号121/121苏香粳2号126/126津稻263128/128常农粳10号134/134连粳17号139/139141/141苏秀326号152/152PR12RM19209~252盐稻12号209/209南粳5718213/213苏香粳2号216/216浙粳优1758233/235浙粳优1758233/235宁粳8号242/242苏香粳3号246/246PR13RM1195138~152常优粳158142/146中江粳228144/144南粳55146/146常农粳13号152/152PR14RM208159~181苏香粳2号167/167泗稻785169/169太湖糯2号171/171苏香粳3号179/179扬育粳2号181/181PR15RM232121~179DB32/T4964—2024表A.1已知品种主要等位基因扩增片段信息（续）引物等位基因扩增片段参照样品编号名称范围/bp片段定义/bp名称扩增片段/bpPR15RM232121~179苏盐粳302129/129苏香粳2号152/152苏香粳3号158/158通粳981160/160金粳18162/162PR16RM119153~190武运粳29号153/153苏香粳3号166/166PR17RM267136~168苏香粳3号136/136太湖糯2号138/138PR18RM253117~163117/117武香糯7368125/125苏稻5号129/129武育粳18号131/131苏香粳3号135/135通优粳1号137/137丰粳3227149/149镇稻16号151/151武育粳39号154/154PR19RM481138~189太湖糯141/141盐稻10号144/144144/147DB32/T4964—2024表A.1已知品种主要等位基因扩增片段信息（续）引物等位基因扩增片段参照样品编号名称范围/bp片段定义/bp名称扩增片段/bpPR19RM481138~189南粳优293159/162南粳优293159/162苏香粳3号165/165连粳13号171/171147/180PR20RM339130~187130/137镇稻15号137/137华粳15号140/140苏香粳3号143/143广陵优粳187/187PR21RM316190~214192/192苏香粳2号194/194南粳9108196/196南粳优293214/214PR22RM258126~167扬农粳1030148/148PR23RM224117~159苏香粳3号123/123太湖糯125/125通粳981139/139广陵优粳141/141常农粳6号157/157武运粳24号159/159DB32/T4964—2024表A.1已知品种主要等位基因扩增片段信息（续）引物等位基因扩增片段参照样品编号名称范围/bp片段定义/bp名称扩增片段/bpPR24RM17143~189太湖糯2号143/143苏香粳3号156/156泗稻785159/159泗稻20号161/161镇糯19号166/166PR25RM493208~266苏香粳3号212/212212/236扬育粳2号245/245武运粳23号248/248PR26RM561181~198常优粳10号181/185连粳11号185/185苏香粳3号187/187苏香粳2号191/191太湖糯195/195PR27RM8277163~217163/179迁粳26号167/167179/203常优粳7号182/209华粳7号185/185盐田育3号188/188镇稻448191/191连粳11号197/197苏香粳3号203/203连粳10号206/206武运粳29号209/209丰粳1606212/212DB32/T4964—2024表A.1已知品种主要等位基因扩增片段信息（续）引物等位基因扩增片段参照样品编号名称范围/bp片段定义/bp名称扩增片段/bpPR28RM551166~210苏香粳3号188/188华粳7号190/190连粳11号194/194PR29RM274146~162苏香粳3号149/149武运粳27号152/152扬育粳2号162/162PR30RM176113~136常农粳6号117/117泗稻20号123/123苏香粳2号127/127太湖糯2号133/133苏香粳3号136/136PR31RM432168~188常优粳7号168/188镇稻13172/172苏垦118184/184苏香粳3号188/188PR32RM331146~176太湖糯2号152/152苏香粳2号155/155广陵优粳158/158PR33OSR28133~187南粳5055169/169苏香粳3号172/172金粳18175/175DB32/T4964—2024表A.1已知品种主要等位基因扩增片段信息（续）引物等位基因扩增片段参照样品编号名称范围/bp片段定义/bp名称扩增片段/bpPR33OSR28133~187172/181常优粳6号172/187PR34RM311156~190扬农香28156/156扬育粳2号158/158苏香粳3号162/162常农粳11号176/176宁香粳9号182/182扬农糯418188/188甬优4543190/190PR35RM21122~168苏香粳2号122/122扬育粳2号124/124泗稻20号130/130华粳7号132/132太湖糯134/134苏香粳3号136/136南粳9212140/140太湖糯2号142/142武运粳27号146/146南粳晴谷152/152常优粳10号154/154镇稻14156/156新稻25158/158常农粳6号162/162甬优4543139/164丰粳200168/168PR36RM3331106~166常优粳11号110/128DB32/T4964—2024表A.1已知品种主要等位基因扩增片段信息（续）引物等位基因扩增片段参照样品编号名称范围/bp片段定义/bp名称扩增片段/bpPR36RM3331106~166连粳15号122/122苏香粳3号126/126苏香粳2号128/128南粳优293126/130PR37RM443109~139苏香粳3号121/121常农粳7号123/123PR38RM49087~108通优粳1号91/91常优粳15893/99苏香粳3号97/97太湖糯2号99/99南粳9108108/108PR39RM71113~214镇稻15号121/121苏香粳3号123/123扬育粳3号148/148PR40RM423244~304上农粳219268/268苏香粳3号271/271苏秀867号289/289PR41RM571163~204180/186皖垦粳516184/184苏香粳3号186/186DB32/T4964—2024表A.1已知品种主要等位基因扩增片段信息（续）引物等位基因扩增片段参照样品编号名称范围/bp片段定义/bp名称扩增片段/bpPR41RM571163~204太湖糯188/188PR42RM231168~196172/172188/194太湖糯2号192/192苏香粳3号194/194镇稻36号196/196PR43RM567239~280镇稻17239/239连粳11号244/244连糯1号248/248金粳18250/250武运粳29号256/256通粳981266/266270/270连粳7号280/280PR44RM28971~127通粳981108/108PR45RM54271~116镇稻11号88/88DB32/T4964—2024表A.1已知品种主要等位基因扩增片段信息（续）引物等位基因扩增片段参照样品编号名称范围/bp片段定义/bp名称扩增片段/bpPR45RM54271~116PR46RM278126~158126/126苏香粳3号128/128武育粳528150/150PR47RM332155~179连粳11号161/161苏香粳3号164/164镇糯20号167/167PR48RM7102168~199苏香粳2号168/168淮粳801170/170苏香粳3号188/188淮稻36190/190168/199R49RM1331123~145盐稻10号123/123苏香粳3号131/131南粳9108137/137通优粳1号139/139常优粳7号131/145R50RM9111~199DB32/T4964—2024表A.1已知品种主要等位基因扩增片段信息（续）引物等位基因扩增片段参照样品编号名称范围/bp片段定义/bp名称扩增片段/bpR50RM9111~199121大粮202121/143126苏香粳3号126/126128扬育粳2号128/128131135甬优4543135/182137连黑糯1号137/137139扬育粳3号139/139143连粳7号143/143148武运6296148/148152156159180泗稻20号180/180182通粳981182/182184甬优1526184/184186太湖糯2号186/186189扬农稻1号189/189199R51RM3825130~163130139145常优粳11号145/158148连糯1号148/148150淮稻13号150/150154苏香粳2号154/154156连粳11号156/156158苏香粳3号158/158160宁香粳11160/160163常农粳8号163/163R52ZY24.5⁃2⁃6206~258206苏秀326号206/206208皖垦粳1514208/208211徐稻15号211/211224甬优1526224/228DB32/T4964—2024表A.1已知品种主要等位基因扩增片段信息（续）引物等位基因扩增片段参照样品编号名称范围/bp片段定义/bp名称扩增片段/bpR52ZY24.5⁃2⁃6206~258228常优粳7号224/228231扬农粳1030231/231233苏香粳3号233/233236苏稻5号236/236244华粳7号244/244250泗稻15号250/250252太湖糯2号252255苏香粳2号255/255258R53RM1358150~190150153常农粳16号153/153155157太湖糯157/157164南粳9108164/164166南粳5818166/166168174连黑糯1号174/174176盐粳21号176/176178淮稻13号178/178180苏香粳3号180/180182常农粳12号182/182190常优粳7号164/190R54RM5472134~179134甬优6711134/145145太湖糯145/145150苏秀10号150/150152苏香粳3号152/152154华粳7号154/154163连粳11号163/163165167甬优2640134/167169177134/17720DB32/T4964—2024表A.1已知品种主要等位基因扩增片段信息（续）引物等位基因扩增片段参照样品编号名称范围/bp片段定义/bp名称扩增片段/bpR54RM5472134~179179常优粳10号154/179R55RM218114~154114太湖糯114/114119苏粳1180119/119123126南粳518126/126128徐稻3号128/128131134苏香粳2号134/134136金武粳1号136/136145南粳9108145/145154武运粳80154/154R56RM3297151~180151苏香粳3号151/151162苏香粳2号162/162168172175178180R57LG25.4⁃3⁃1144~171144苏秀326号144/144151153新稻20153/153155太湖糯155/155169中科盐3号169/169171苏香粳3号171/171R58XG16.6⁃4⁃1192~219192宁粳5号192/192198武育粳377198/198213苏香粳3号213/213215南粳0212215/215219镇稻448219/219R59RM1359115~150115甬优4543115/121121苏香粳2号121/121123泗稻301123/123DB32/T4964—2024表A.1已知品种主要等位基因扩增片段信息（续）引物等位基因扩增片段参照样品编号名称范围/bp片段定义/bp名称扩增片段/bpR59RM1359115~150太湖糯2号129/129南粳9108133/133镇稻14135/135苏香粳3号137/137新科稻21140/140常农粳7号143/143R60RM379684~106镇稻11号84/84苏香粳3号89/89太湖糯92/92连粳17号97/97宁粳5号102/102淮稻14号104/104徐稻11号106/106R61RM1115139~163扬粳糯2号139/139武运6296148/148广陵优粳152/152苏香粳3号157/157161/161常农粳16号163/163R62RM3183121~140宁粳5号121/121新稻20124/140苏秀326号138/138苏香粳3号140/140R63RM7193127~200苏香粳3号137/137苏秀10号139/139淮稻26号146/146DB32/T4964—2024表A.1已知品种主要等位基因扩增片段信息（续）引物等位基因扩增片段参照样品编号名称范围/bp片段定义/bp名称扩增片段/bpR63RM7193127~200南粳8911155/155连糯1号159/159金香玉1号163/163镇稻16号176/176R64RM412171~198苏香粳2号171/171扬粳5118173/173常农粳16号179/179武育粳18号190/190大粮202196/196苏香粳3号198/198R65RM5711110~164苏香粳3号113/113镇稻18号115/115华瑞稻1号117/117扬农糯418119/119常优粳7号126/129常优粳11号126/129132/152苏研9981135/135泰香粳999138/138武香粳9127142/142宁粳5号145/145苏秀326号148/148132/152常优粳6号148/154徐稻19号161/161R66RM687274~92华瑞稻1号74/74DB32/T4964—2024表A.1已知品种主要等位基因扩增片段信息（续）引物等位基因扩增片段参照样品编号名称范围/bp片段定义/bp名称扩增片段/bpR66RM687274~92苏香粳3号78/78通粳98186/86南粳505590/90宁粳5号92/92R67RM547N110~195144/147太湖糯2号147/1