转录组学揭示大肠杆菌感染病理过程

数智创新变革未来转录组学揭示大肠杆菌感染病理过程转录组学基础理论阐述大肠杆菌感染概述转录组学在感染研究中的应用大肠杆菌感染转录谱特征感染早期转录应答分析感染中后期基因表达变化关键致病基因及通路鉴定转录组学揭示的病理机制探讨ContentsPage目录页转录组学基础理论阐述转录组学揭示大肠杆菌感染病理过程转录组学基础理论阐述转录组学基本概念1.定义与组成：转录组学是研究一个生物体内所有基因在特定条件下的转录产物的整体集合，包括mRNA、非编码RNA等。它揭示了基因表达水平的动态变化。2.转录过程：DNA通过RNA聚合酶的作用转录为mRNA，这个过程涉及到启动子识别、转录起始、延伸及终止等多个步骤。3.高通量测序技术：现代转录组学依赖于RNA-seq等高通量测序技术，用于全面、定量地分析细胞或组织中的转录本丰度，以解析基因表达模式。转录调控机制1.转录因子作用：转录因子是一类能够结合到DNA特定区域，从而影响转录活性的蛋白质，它们参与正向或负向调节基因表达。2.组合调控网络：多个转录因子协同作用形成复杂的调控网络，控制基因在不同生理状态或应答环境刺激时的表达差异。3.沉默与激活机制：转录抑制和增强作用分别由阻遏蛋白和激活蛋白实现，这些机制对于理解病原体如大肠杆菌如何调控宿主细胞的转录至关重要。转录组学基础理论阐述RNA剪接与转录后修饰1.RNA剪接：真核生物的预mRNA通常经过剪接去除内含子，拼接外显子产生成熟mRNA的过程。这一过程可能涉及多种剪接变异，影响转录组多样性。2.转录后修饰：包括甲基化、磷酸化、编辑等多种类型，它们可影响mRNA稳定性、翻译效率以及亚细胞定位，从而改变其生物学功能。3.研究进展：通过对转录后修饰进行深入探究，有助于揭示大肠杆菌感染期间宿主细胞内部转录后调控层面的变化及其相关病理机制。转录组数据分析方法1.数据质量控制：包括低质量reads过滤、去污染、比对率评估等步骤，确保后续分析的有效性和准确性。2.基因表达定量与差异分析：基于reads计数或FPKM值等指标进行基因表达量化，并运用统计学方法比较不同样本间的差异表达基因。3.功能注释与富集分析：通过GO、KEGG等途径对差异基因进行功能分类和富集分析，从而推断大肠杆菌感染导致的细胞功能变化路径。转录组学基础理论阐述大肠杆菌转录组特征1.大肠杆菌感染响应：感染过程中，大肠杆菌自身会调整转录程序以适应宿主环境，包括毒素生产、免疫逃逸、代谢重编程等相关基因的上调或下调。2.侵袭与定植策略：通过转录组学分析可以揭示大肠杆菌在宿主体内的侵袭、定居及扩散过程中的关键转录调控事件。3.抗生素耐药性表型：转录组学可用于研究大肠杆菌对抗生素的耐药机制，如抗性基因的转录激活、耐药相关通路的调控等。基于转录组学的大肠杆菌感染诊断与治疗1.病理标志物发现：通过对比健康和感染状态下宿主细胞的转录组数据，挖掘具有疾病特异性的转录异常标记物，为早期诊断和预后判断提供依据。2.疾病分型与预测：利用转录组学数据构建疾病分型模型，对大肠杆菌感染的严重程度、临床结局等进行精准预测。3.个性化治疗策略：基于转录组学的药物靶标筛选和药物敏感性预测，有望推动针对患者个体特征的精准治疗方案制定。大肠杆菌感染概述转录组学揭示大肠杆菌感染病理过程大肠杆菌感染概述大肠杆菌分类与致病机制1.分类与种类：大肠杆菌广泛存在于环境中，包括许多非致病性和多种致病性类型，如肠产毒性大肠杆菌（ETEC）、肠侵袭性大肠杆菌（EIEC）、肠出血性大肠杆菌（EHEC）等。2.致病途径：不同类型的致病性大肠杆菌通过不同的机制导致感染，例如EHEC产生毒素引起肠道出血性病变，而EPEC则通过紧密粘附于肠道上皮细胞造成微绒毛破坏。3.病原体适应性：大肠杆菌能通过基因变异、水平基因转移等方式快速适应宿主环境，使其能在人体内定殖并引发疾病。大肠杆菌感染途径与流行病学特征1.感染途径：人与动物粪便污染食物或水源是最常见的感染途径；此外，密切接触病畜或患者，以及医源性传播也可能发生。2.易感人群与分布：各年龄段均可受感染，但婴幼儿、老人及免疫功能低下者易感；全球范围内，发展中国家因卫生条件差，大肠杆菌感染更为普遍。3.流行趋势：随着全球化进程加速，跨国旅行和食品贸易可能促使新的致病性大肠杆菌株在全球范围内扩散。大肠杆菌感染概述大肠杆菌感染临床表现与诊断1.临床症状多样性：大肠杆菌感染可表现为从无症状带菌状态到急性胃肠炎、尿路感染、败血症乃至致命的出血性结肠炎等多种临床症状。2.实验室诊断：包括细菌培养、生化反应以确认大肠杆菌的存在；分子生物学技术如PCR用于鉴定特定致病性基因型别。3.影像学与内镜检查：在某些病例中，内窥镜和影像学检查有助于发现肠道炎症、溃疡、出血等病变。大肠杆菌感染的转录组学研究方法1.转录组测序技术：RNA-seq等高通量测序技术成为研究大肠杆菌感染期间宿主与病原体相互作用的重要工具，可以揭示病程中的基因表达变化。2.宿主-病原体相互作用分析：通过比较感染前后宿主组织的转录组谱，揭示大肠杆菌如何操纵宿主细胞信号传导、免疫反应等相关基因表达。3.病原体转录组分析：同时对感染后的大肠杆菌进行转录组分析，了解其在体内适应与生存策略中的基因调控网络。大肠杆菌感染概述大肠杆菌感染的治疗策略1.抗生素治疗：针对不同类型的大肠杆菌感染选择合适的抗生素，然而，耐药性问题日益严峻，强调合理使用抗生素及开发新型抗菌药物的重要性。2.支持疗法：对于重症病例，需要进行液体复苏、电解质平衡调节等支持性治疗，并监测并发症的发生。3.预防措施：加强个人卫生、食品安全监管、疫苗研发等多方面综合防控策略，降低大肠杆菌感染发生率。大肠杆菌感染后的预后与预防1.预后因素：感染类型、年龄、基础疾病、及时合理的治疗等因素影响预后，部分严重病例可能导致永久性肠道损伤甚至死亡。2.免疫反应与保护力：成功清除感染的大肠杆菌后，机体可能会产生一定的免疫力，但不同型别的大肠杆菌间的交叉保护作用有限。3.长期健康影响：长期大肠杆菌感染或反复感染可能与慢性肠道炎症、肠道微生态失衡等问题相关，需关注患者的远期健康状况。转录组学在感染研究中的应用转录组学揭示大肠杆菌感染病理过程转录组学在感染研究中的应用1.基因表达谱分析：通过对大肠杆菌感染宿主细胞后的转录组数据进行分析，可以识别出特定的大肠杆菌基因表达模式，有助于精确鉴定感染菌株类型和毒力因子。2.感染标志物发现：通过对比未感染与感染状态下的宿主细胞转录组差异，可挖掘出特异性的转录水平变化，为病原体早期诊断提供新标志物。3.病原体进化及变异监测：转录组学技术能揭示不同环境或感染阶段大肠杆菌基因表达的动态变化，从而帮助理解其进化路径及抗药性等相关变异。宿主免疫反应的转录组学解析1.免疫应答特征刻画：转录组学揭示了宿主在大肠杆菌感染过程中免疫相关基因表达的时空规律，如炎症因子、趋化因子、细胞因子等，为理解免疫防御机制提供依据。2.免疫耐受与逃逸机制探究：通过对感染后宿主细胞转录组的变化分析，可以深入了解病原体如何调控宿主免疫系统，实现对其自身保护并逃避免疫清除的过程。3.免疫治疗靶点筛选：基于转录组数据的深入挖掘可指导针对宿主免疫反应的新型治疗策略设计，例如靶向抑制过度炎症反应或增强适应性免疫应答的药物研发。转录组学在病原体识别与鉴定中的应用转录组学在感染研究中的应用大肠杆菌感染进程的分子时序研究1.感染过程的时间轨迹构建：转录组学可以通过收集感染不同时间点的数据，描绘出从入侵到定殖再到致病的整体分子变化过程。2.关键节点事件识别：通过比较不同时期的转录组差异，可确定影响感染进程的关键事件及其相关基因，如黏附、侵袭、毒素产生等。3.感染进程的预测建模：结合生物信息学方法，建立基于转录组数据的感染进程模型，为疾病预防与控制提供理论支持。抗生素耐药性机制的转录组学研究1.抗生素作用下大肠杆菌基因表达响应：转录组学技术能够揭示抗生素处理后大肠杆菌基因表达的全局变化，包括抗生素作用靶点的改变以及细菌的自救策略（如泵排效应）。2.抗药性相关基因鉴定：通过对比敏感和耐药菌株的转录组差异，可发现参与抗生素耐药性产生的候选基因，为抗药性防控提供科学依据。3.新型抗菌策略探索：深入挖掘转录组数据中的潜在信号通路和关键调控因子，为开发新型抗菌药物或疗法提供方向。转录组学在感染研究中的应用大肠杆菌与宿主相互作用的网络生物学分析1.相互作用网络构建：运用转录组数据联合蛋白质组、代谢组等多组学数据，构建大肠杆菌与宿主间的分子相互作用网络。2.网络模块功能解析：通过网络拓扑分析，识别出涉及感染过程的核心模块和关键分子，深入揭示病原体与宿主之间的相互调节机制。3.疾病干预策略优化：基于相互作用网络模型，探索针对性的干预策略，以期在降低对宿主正常生理功能干扰的同时有效清除病原体。转录组学驱动的个体化诊疗方案制定1.宿主遗传背景对感染的影响评估：利用转录组学揭示宿主基因型与表型（即感染程度和预后）之间的关联，为个体化诊疗方案提供遗传学依据。2.患者亚群分类：根据宿主对大肠杆菌感染的转录反应差异，划分不同的患者亚群，并针对各亚群特点定制相应的治疗策略。3.治疗疗效预测与监控：通过实时监测患者的转录组动态变化，可提前预测治疗效果和可能发生的并发症，及时调整临床治疗方案，提高治愈率和患者生活质量。大肠杆菌感染转录谱特征转录组学揭示大肠杆菌感染病理过程大肠杆菌感染转录谱特征感染诱导的基因表达变化1.大肠杆菌感染启动宿主应答：在大肠杆菌感染过程中，宿主细胞会表现出特定的转录谱变化，大量与免疫反应、炎症信号通路及抗菌肽合成相关的基因表达上调。2.负调控基因的变化：同时，一些通常抑制炎症反应或促进细菌定植的基因表达可能下调，揭示了宿主对病原菌入侵的防御策略。3.细胞周期与修复机制的调整：转录组分析还显示，在感染期间，宿主细胞可能会暂停正常细胞周期进程，优先投入损伤修复和抗感染反应。致病因子相关基因表达1.大肠杆菌效应蛋白基因表达：研究发现，大肠杆菌在感染期间会表达一系列毒力因子，如粘附素、毒素和其他入侵分子，这些基因的转录水平增加，反映了其侵袭性和毒性。2.毒力调节网络：转录组学数据揭示了大肠杆菌毒力基因的精细调控网络，包括毒力操纵子、信号传导系统及其在感染过程中的动态变化。3.抗生素抵抗基因表达模式：在某些情况下，大肠杆菌感染还可能导致抗生素抵抗基因的上调表达，增加了治疗难度。大肠杆菌感染转录谱特征免疫细胞功能重塑1.免疫细胞特异性转录响应：不同类型的免疫细胞（如巨噬细胞、T细胞和B细胞）在遭遇大肠杆菌时会有特异性的转录谱变化，涉及细胞活化、趋化性及免疫调节功能等方面。2.细胞因子风暴与炎症反应：转录组学数据揭示了感染早期免疫细胞分泌大量细胞因子和趋化因子，形成细胞因子风暴，导致急性炎症反应。3.免疫耐受与适应性免疫反应：长期大肠杆菌感染可能导致免疫耐受现象的出现，表现为某些免疫细胞亚群转录水平的改变，以及适应性免疫应答的调整。组织损伤与修复相关转录谱特征1.组织损伤标志物基因表达：感染期间，宿主受损组织区域内的基因表达发生显著变化，包括细胞凋亡、坏死和修复相关基因的上调。2.炎症介导的组织损伤：炎症因子和活性氧类物质导致的氧化应激反应在转录层面得到体现，关联到细胞外基质重塑、血管新生及组织纤维化的进程。3.组织修复与再生：随着感染进展，机体开始启动自我修复机制，涉及到生长因子、细胞迁移及分化等方向的基因转录活动增强。大肠杆菌感染转录谱特征微生物群落扰动与肠道稳态失衡1.菌群失调转录标记：大肠杆菌感染可导致宿主肠道微生物群落结构显著改变，进而影响宿主肠道上皮细胞、免疫细胞以及其他共生菌的转录表达谱。2.微生物代谢产物影响：病原菌产生的代谢产物可能干扰肠道内环境平衡，影响正常菌群的功能，并通过转录组学手段观察到这一系列变化。3.相互作用与共进化：转录组学研究还提示了宿主与大肠杆菌之间的相互作用，以及肠道微生态与宿主之间的协同进化现象。潜在干预靶点识别1.关键转录因子与信号通路鉴定：通过对大肠杆菌感染转录谱的深入挖掘，可以鉴别出参与感染病理过程的关键转录因子和信号通路，为后续药物研发提供靶标候选。2.基因表达差异的生物学意义解析：通过对差异表达基因进行GO注释和KEGG通路富集分析，可以揭示其在感染病理过程中的生物学功能和作用机理。3.预后与诊断标志物筛选：转录组学研究有助于筛选出具有临床应用价值的大肠杆菌感染预后和早期诊断标志物，为临床实践提供新的理论依据和技术支持。感染早期转录应答分析转录组学揭示大肠杆菌感染病理过程感染早期转录应答分析早期识别信号传导通路1.细胞感应机制：在大肠杆菌感染初期，宿主细胞通过转录应答激活一系列信号传导通路，如Toll样受体（TLR）和NOD-like受体（NLR），识别并响应细菌的病原相关分子模式（PAMPs）。2.通路激活与调节：这些信号通路诱导NF-κB、MAPK和IRF等转录因子活化，调控下游基因表达，启动免疫防御反应。3.时空动态变化：早期转录应答中的信号传导通路表现出明显的时空特征和动态变化规律，为后续研究提供了时间窗口和干预靶点。炎症反应基因表达谱1.炎症介质产生：在大肠杆菌感染早期阶段，宿主细胞通过上调炎性细胞因子（如TNF-α、IL-6和IL-8）和其他炎症介质的转录水平，触发局部和全身的炎症反应。2.基因协同作用：多个炎症相关基因间的协同作用形成了复杂的网络，共同参与了早期炎症微环境的构建和维持。3.炎症调控的双重刃剑效应：适度的炎症反应有助于清除病原体，但过度或持续的炎症可能导致组织损伤和疾病恶化，需进一步探究其精细调控机制。感染早期转录应答分析抗菌肽及免疫防御分子的转录调控1.抗菌肽表达增强：在感染早期，宿主细胞通过上调抗菌肽（如β-防御素、CAMP等）及相关免疫防御分子的转录水平，发挥直接杀菌或辅助吞噬作用。2.免疫分子协同防御：同时，其他免疫防御分子如补体系统、天然杀伤细胞相关基因也发生转录上调，协同抗菌肽形成多层次的防御屏障。3.转录因子的作用：抗菌肽及免疫防御分子转录上调的精确调控往往涉及多种转录因子，如AP-1、STAT和CREB等。细胞凋亡与生存机制的转录调控1.细胞命运决定：大肠杆菌感染早期，宿主细胞内会启动一些凋亡相关基因的转录，同时也会有抗凋亡基因的上调以平衡细胞生死，影响感染进程。2.凋亡与自噬：在转录层面观察到凋亡与自噬之间的相互作用和调节，如Bcl-2家族成员、caspase以及Atg蛋白等关键基因的动态变化。3.细胞死亡与病程关系：理解这一时期的细胞命运决定机制对于揭示大肠杆菌如何逃避宿主免疫清除，以及探讨治疗策略具有重要意义。感染早期转录应答分析免疫细胞募集与分化转录表型1.细胞因子招募信号：感染早期转录应答中，宿主细胞分泌趋化因子吸引免疫细胞（如中性粒细胞、巨噬细胞和T细胞等）至感染部位，涉及CXC、CC类趋化因子及其受体的转录上调。2.免疫细胞功能重塑：到达感染部位的免疫细胞根据接收到的转录信号进行分化、极化，如M1/M2巨噬细胞或多效Th细胞表型的转换。3.动态演变与协调：随着感染进展，免疫细胞招募与分化的转录表型呈现出动态演变特征，并与其他免疫应答环节相互协调。转录组学数据分析方法与生物信息学工具1.高通量测序技术应用：RNA-seq技术用于捕获大肠杆菌感染早期的全局转录应答，高灵敏度地揭示大量差异表达基因和信号通路。2.生信分析策略：运用生物信息学方法如DESeq2、edgeR等对数据进行统计分析，确定显著差异基因并进行GO富集、KEGG通路注释等生物学功能分析。3.多维度整合分析：结合基因共表达网络分析、转录因子预测等手段，深入解析感染早期转录应答背后的复杂网络结构与调控机制。感染中后期基因表达变化转录组学揭示大肠杆菌感染病理过程感染中后期基因表达变化感染诱导的免疫反应基因表达谱分析1.大肠杆菌感染中后期，宿主细胞内的免疫相关基因显著上调，包括参与先天免疫如TLR（Toll-likereceptors）信号传导和适应性免疫如MHCII类分子表达的关键基因。2.转录组数据显示IFN-γ（干扰素γ）、IL-6（白介素6）等促炎因子及抗微生物肽基因表达增加，反映了强烈的炎症反应与抗菌防御机制。3.随着感染进程发展，部分负调控免疫反应的基因也有所改变，可能涉及对过度炎症反应的调节以避免组织损伤。细菌毒性效应子基因的表达动态1.在感染中后期，大肠杆菌释放的毒性效应子基因如tisB、stcE等呈现上调，这些基因编码的蛋白质可破坏宿主细胞膜完整性或抑制其免疫防御功能。2.研究发现某些毒力岛上的基因表达量显著增强，提示细菌在应对宿主环境压力时调整了其毒力策略。3.对这些毒性效应子基因表达模式的研究有助于理解大肠杆菌致病机理并为治疗干预提供新靶点。感染中后期基因表达变化1.感染中后期，大肠杆菌为了适应恶劣的宿主体内环境，启动了一系列代谢通路相关基因的表达调整，例如糖酵解、TCA循环、氨基酸代谢等。2.这些基因表达的变化有助于细菌获取能量、合成生物膜和抗逆物质，支持其生存与繁殖。3.监测此类基因的表达水平变化对于评估宿主机体防御效果及探索新型抗菌策略具有重要意义。宿主细胞凋亡与存活相关基因的表达特征1.在感染中后期，宿主细胞内涉及凋亡与存活的基因表达发生显著变化，如Bcl-2家族成员以及Caspase酶等基因表达的动态调控。2.细菌感染可能导致宿主细胞的程序性死亡或异常增殖，这可能影响炎症反应的持久性和感染灶清除效率。3.进一步研究这些基因的表达调控网络及其功能意义，有望为开发防治大肠杆菌感染的新策略提供理论依据。代谢重塑相关的基因表达变化感染中后期基因表达变化细菌逃避宿主免疫监视的转录策略1.在感染后期，大肠杆菌可能通过上调一些与逃逸宿主免疫监视相关的基因，如表面抗原变异、隐蔽性代谢途径、抗吞噬能力等。2.宿主细胞的转录组数据揭示了细菌对抗宿主免疫应答的复杂策略，如通过分泌外泌小RNA来干扰宿主免疫信号传导。3.这些研究揭示了大肠杆菌在感染进程中与宿主免疫系统相互作用的新机制，并为研发新型疫苗或免疫疗法提供了思路。修复与恢复相关基因表达的动态演变1.在感染中后期，宿主细胞开始启动一系列修复与恢复相关的基因表达，如参与DNA修复、细胞周期调控、组织再生等生物学过程。2.这些基因表达的激活旨在维护机体稳态、减轻炎症损伤，并促进受损组织的修复重建。3.深入探究这类基因的表达模式及其调控机制，有助于我们更好地理解机体如何应对大肠杆菌感染并最终实现康复。关键致病基因及通路鉴定转录组学揭示大肠杆菌感染病理过程关键致病基因及通路鉴定大肠杆菌感染相关基因鉴定1.差异表达基因分析：通过比对感染与非感染样本的转录组数据，识别出在大肠杆菌感染过程中显著上调或下调的关键致病基因。2.功能富集分析：运用GO（GeneOntology）和KEGG（KyotoEncyclopediaofGenesandGenomes）等工具，确定这些差异表达基因在生物学过程、分子功能以及细胞组件中的富集情况，揭示其潜在的致病机制。3.疾病关联基因验证：利用现有文献资料和数据库资源，对鉴定出的大肠杆菌感染关键基因进行疾病关联性验证，确保它们在感染病理过程中的核心作用。信号传导通路解析1.感染相关信号途径：基于转录组数据分析，鉴定出在大肠杆菌感染期间激活或抑制的信号传导通路，如Toll样受体信号通路、NF-κB信号通路等。2.通路网络构建与调控：通过构建感染相关的信号通路网络图，并结合基因共表达分析，揭示关键基因在通路网络中的地位及其相互调控关系。3.通路干预策略探讨：针对关键信号通路的发现，探讨可能的药物靶点与治疗干预策略，为抗大肠杆菌感染治疗提供新思路。关键致病基因及通路鉴定毒力因子鉴定1.大肠杆菌毒力基因筛查：通过对大肠杆菌转录组数据的深入挖掘，筛选出编码细菌毒力因子的基因，如铁摄取系统、毒素分泌系统、粘附素等。2.毒力因子作用机制研究：探讨这些毒力基因在宿主细胞上的作用机制，包括细胞侵袭、免疫逃逸和组织损伤等方面。3.毒力表型验证：采用实验方法对筛选出的毒力因子进行功能验证，以确认其在大肠杆菌感染过程中的关键作用。宿主响应基因识别1.宿主应答基因检测：对比正常和感染状态下的宿主细胞转录组，鉴别出与大肠杆菌感染密切相关的宿主应答基因，如炎症因子、免疫调节基因等。2.宿主防御与免疫反应探究：分析这些宿主响应基因的功能特性，揭示宿主如何通过调节自身基因表达来应对大肠杆菌的入侵与感染。3.宿主-病原体互作机制阐明：通过基因敲除、过表达等手段探究宿主响应基因与大肠杆菌感染之间的动态互作机制。关键致病基因及通路鉴定转录因子与调控网络研究1.转录因子活性变化分析：基于转录组数据，识别在大肠杆菌感染背景下，宿主细胞内活性显著改变的转录因子。2.转录调控模块构建：构建转录因子与其下游目标基因形成的调控模块，探索在感染过程中这些模块如何协同工作以调控致病基因表达。3.转录调控机制解析：通过ChIP-seq、RNA-seq等技术进一步验证转录因子与调控网络在大肠杆菌感染病理过程中的具体作用方式与调控规律。疾病进程分子标记物筛选1.分子标记物候选基因挖掘：通过比较不同感染阶段的转录组数据，找出在大肠杆菌感染进程中具有代表性的、随疾病进程而变化的分子标记物候选基因。2.标记物诊断效能评估：利用临床样本验证所选分子标记物在感染诊断、病情监测以及预后判断等方面的性能表现。3.疾病进展预测模型建立：根据所选分子标记物构建疾病进程预测模型，为大肠杆菌感染的早期诊断、精准医疗提供科学依据。转录组学揭示的病理机制探讨转录组学揭示大肠杆菌感染病理过程转录组学揭示的病理机制探讨大肠杆菌感染相关基因表达谱分析1.感染响应基因鉴定：通过转录组数据分析，可以识别出在大肠杆菌感染过程中宿主细胞及细菌自身显著上调或下调的关键基因，这些基因可能参与免疫反应、炎症介导、病原体附着与侵袭等过程。2.基因调控网络构建：研究感染期间基因间的相互作用和调控关系，包括转录因子、非编码RNA的作用，揭示其在感染发生和发展中的调控机制。3.差异表达基因的功能富集分析：运用生物信息学工具进行GO注释和KEGG通路富集分析，以探究感染导致的生物学功能变化及其相关信号通路。宿主免疫应答的转录水平变化1.免疫相关基因表达