基于数据挖掘的常用药用植物数据库构建

基于数据挖掘的常用药用植物数据库构建

有许多与中医研究相关的主题，如药理学、中医学、中医、药理学、剂学、药理学、药理学等。得益于现代科学技术的快速发展,中药研究积累的数据和信息越来越庞杂,这使得对中药的认识也越来越深刻,但怎样从庞杂的信息中快速获取研究所需的资料就成了当务之急,随着关系型数据库的成熟运用为我们提供解决途径,可以通过构建并检索专业的中药研究相关的数据库来解决。现就国内开发的中药、药用植物相关数据库的现状以及中泰常用药用植物数据库的构建进行分析及评价。1主要药用植物数据库建设情况国内药用植物数据库的开发起步较晚,随着对药用植物研究信息需求的不断增长,越来越多的药用植物数据库被开发出来,现就互联网上可以公开访问的典型药用植物数据库情况进行分析,内容如下。1.1specity数据库设计药用植物数据库是中国植物主题数据库下的子数据库。中国植物主题数据库是基础科学数据共享网资助项目,由植物学学科积累深厚和专业数据库资源丰富的中科院植物所和中科院昆明植物所联合建设。以Species2000中国节点和中国植物志名录为基础,整合植物彩色照片、植物志文献记录、化石植物名录与标本以及药用植物数据库,强调数据标准化和规范化。其中的药用植物数据库由中国科学院昆明植物研究所主持,依托植物物种信息数据库对植物药用信息进行了整理汇总,收集了8000余种药用植物,以及40余个民族药物使用体系的信息。着重于传统药用知识的整理与汇总,提供一个传统药用知识的信息发布平台。数据库构建包含的字段为:拉丁名、基本信息(名称状态、中文名、分布、形态描述)、照片信息、文献信息、药用植物信息(苗药、资源志)、标本分布信息。1.2数据库植物和药物资源开发药用植物品种数据库是由北京市农林科学院农业科技信息研究所构建的。数据库采集了1853条记录。数据库包含的字段为:植物名称、植物学名、药物名称、药物学名、英文名、异名、种类、主要产地、来源、关键词、描述(原植物形态、生活习性、采制、药材性状、主要成分、性味、功能主治、栽培技术要点、药理作用、附方、附注)、图片等。可以通过北京农业数字图书馆的网站进行浏览查询。1.3推进药用植物类研究,促进信息共享药用植物图像数据库由香港浸会大学中医药学院和图书馆共同合作构建,该数据库建立在对药用植物的长期调查研究和经验、信息积累的基础上,以植物图谱外加文字说明的形式,对上千种药用植物进行系统的整理、归类、总结,目的是推进药用植物研究的普及化、国际化和信息共享以及辅助教学。数据库包含的字段为:中文名称、汉语拼音、英文名称、拉丁学名、科属归类、植物形态、生境分布、药用部位、采收加工、性味功能、主治用法、应用举例等。1.4海南肺癌药用植物数据库海南抗癌药用植物数据库信息系统是海南省自然科学基金资助的项目。该系统对海南岛丰富的植物资源进行了调查研究统计,对其中的抗癌药用植物进行研究分析整理,低等植物按照藻、菌、类排队,高等植物按照哈钦逊(J.Hutchinson)分类排队,设计并编制成了海南抗癌药用植物资源网。该数据库收录海南约100多种抗癌药用植物。内容包括药材名、原植物中文科名、原植物拉丁科名、原植物中文属名、原植物拉丁属名、原植物中文种名(及亚种或变种名)、原植物拉丁种名(及亚种或变种名)、药用部位、形态特征、分布、生境、习性、繁殖方式、功能和主治,特别是有效成分。数据库包含的字段为:植物名、拉丁学名、别名、科名、药材来源、植物形态、生境分布、栽培要点、采制、化学成分、抗癌药理、性味功能、抗癌效验、宜忌与注意、参考资料。2中泰常用植物数据库信息系统的需求分析和构建2.1我国南方与针对东南亚泰国药用植物资源丰富,对药用植物的研究也十分重视,从传统应用、有效成份以及临床实验等方面进行了研究。由于地理位置的关系,我国南方与泰国在药用植物应用方面存在共同之处。随着国家与东盟区域合作的发展,相关的科技、经济、教育等领域的交流越来越频繁。广西中医药大学与泰国孔敬大学在药用植物研究方面有着良好的交流与合作,因此构建中国西南地区及泰国常用的药用植物数据库进行研究信息共享,对开展进一步的研究,对发展我国及泰国等东盟国家的药学事业具有重要意义。2.2数据库的开发环境中泰常用药用植物数据库信息系统总计包括了500种中泰常用药用植物,收录信息字段包括:药物名称、拼音名称、英文名称、拉丁名、科属分类、功效分类、药物图片、别名、植物形态、分布、采集加工、药材性状、生态学、化学成分、药理作用、临床实验、药性、功效与主治、用法用量、使用注意、传统用法、毒理学、制剂、参考文献。数据库的开发环境为vs2008;开发技术为2.0以上;运行环境配置为硬件为CPU主频3G以上,内存2G以上;运行的软件环境为Windows2003、Windows2008,iis6以上,dotnet运行时2.0以上。3数据库内容方面根据不同的实际需求,数据库的开发往往有所侧重。本文从药物名称、药用植物学、中医药学、化学成份、药理毒理、图片、查询以及是否有英文版等角度对上述药用植物数据库的信息内容进行了对比分析,其中信息含量的大小级别分为简单、适量和详细三个等级。结果如表1。依据表1分析结果可见,在药物名称信息及植物学信息方面各数据库所含内容均较详细,药物名称内容包含了拉丁名称、拼音名称、异名以及较为详细的植物学形态描述;由于中泰常用药用植物数据库的开发过程中查阅了大量的研究文献,因此在中医药学、化学成份、药理毒理学相关信息方面,相比之下,中泰常用药用植物数据库所含信息十分丰富,例如桂枝的制剂字段包含了37条内容,并且增加一些比较有特色的字段,如临床实验等;在图片及有无英文版方