国内外医学数据库课件

生物医学数据库检索RetrievalofMedicalInformationDatabase主讲人：胡笳

昆明医科大学医学信息检索教研室生物医学数据库检索RetrievalofMedica前言医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室医学信息检索系统是发展、利用较早、较快的一个领域，各种医学数据库的不断出现和广泛应用，为促进人类医学科学研究水平的发展，发挥了重要的作用。近年来，随着人类科学技术的不断发展，新技术、新方法不断出现，医学数据库开发和利用也出现了一些新特点。前言医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室中文数据库中文数据库医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室共八十九种数据库医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室共八十九种数据库医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室医学数据库的类型-----What1数据库的信息来源------Who2常用数据库的特点------Why3怎样使用------How4医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室医学数据库的类型-医学外文数据库的类型医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室

文摘型数据库

MedlineEMBASE.com（荷兰《医学文摘》）BIOSISPreview（美国《生物学文摘》）CA(美国《化学文摘》)Dialog联机检索系统医学外文数据库的类型医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研医学外文数据库的类型医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室

全文型数据库

ElsevierScienceDirect全文期刊数据库ProQuest全文期刊数据库Springer全文期刊数据库OVID全文期刊库EBSCOhost全文期刊数据库医学外文数据库的类型医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研医学外文数据库的类型医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室

引文检索数据库

美国科学引文索引----SCI医学外文数据库的类型医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研医学外文数据库的类型医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室

循证医学数据库

WILEYCochrane数据库OVID数据库----BestEvidencePubMed----ClinicalQueriesSumSearch循证医学资源网站医学外文数据库的类型医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研Who----信息来源医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室Medline

是美国国立医学图书馆（theNationalLibraryofMedicine,NLM）研制开发的国际上最具权威性的综合性生物医学文献书目数据库。收录范围：全世界70多个国家和地区1966年以来的4600余种生物医学期刊，目前文摘条目1300余万篇，年报道量40万条，英文刊物占90%、3/4有英文摘要，每周更新。内容涉及：医学、药学、牙医学、护理学、预防医学、卫生管理、兽医学等专业。PubMed是其提供Internet免费检索的WEB数据库。Who----信息来源医学信息检索与利用昆明医学院信息Who----信息来源医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室2.EMBASEEMBASE(theExderptaMedicalDatabase,荷兰医学文摘),是荷兰Elsevier科学出版公司建立的生物医学与药学书目数据库。收录了自1974年以来的70多个国家和地区的3800种期刊，尤其涵盖了大量欧洲和亚洲医学刊物。Who----信息来源医学信息检索与利用昆明医学院信息检Who----信息来源医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室3.BiosisPreviewBIOSISPreview是美国《生物学文摘》（BiologicalAbstract）的在线数据库。是美国生物科学信息服务社(BIOSIS)生产的世界上最大的有关生命科学的文摘和索引数据库。收录世界上100多个国家和地区的5500多种期刊的文献和1650多个会议的会议录和报告，每年大约增加28万条记录。Who----信息来源医学信息检索与利用昆明医学院信息检Who----信息来源医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室4.CA(美国《化学文摘》)《化学文摘》，ChemicalAbstracts，简称CA，是世界最大的化学文摘库。也是目前世界上应用最广泛，最为重要的化学、化工及相关学科的检索工具。创刊于1907年，由美国化学协会化学文摘社（CASofACS，ChemicalAbstractsServiceofAmericanChemicalSociety）编辑出版。Who----信息来源医学信息检索与利用昆明医学院信息检Who----信息来源医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室6.全文型数据库数据库名称

出版商及期刊数量ElsevierElsevier全文数据库是荷兰著名商业出版公司爱思唯尔科学(ElsevierScience)的核心产品，共收录了2500余种期刊，涵盖24个学科，其中1400多种被《科学引文索引》(SCI)收录。ProQuest是美国ProQuestInformationandLearning旗下的网络医学期刊数据库。该库收录了1997年以来重要的生物医学期刊1200多种。Springer施普林格出版社于1842年在德国柏林创立，是全球第一大科技图书出版公司和第二大科技期刊出版公司，每年出版5,500余种科技图书和约1,700余种科技期刊，其中超过1,500种经同行评阅的期刊。OVID美国OvidTechnologies公司开发的医学数据库系统，收录了超过1200种科学、科技及医学期刊。收录了从1993年至今的文献，其中超过350种属于核心期刊，被SCI收录的期刊超过300种EBSCOhostEBSCOhost是美国EBSCOPublishing公司提供的数据库。学科综合性较强，收录了包括自然科学、社会科学、人文艺术、生物医学等多学科领域的3000多种期刊。Who----信息来源医学信息检索与利用昆明医学院信息Why----数据库的特点

医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室书目型数据库（文摘型数据库）

MedlineEMBASE.com（荷兰《医学文摘》）BIOSISPreview（美国《生物学文摘》）CA(美国《化学文摘》)Why----数据库的特点医学信息检索与利用昆明医Why----数据库的特点

医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室书目型数据库（文摘型数据库）

建立时间较早，认知度高

收录期刊数比较多，专业性强

检索系统成熟、规范

标引质量高、检索途径全面

无全文提供Why----数据库的特点医学信息检索与利用昆明医Why----数据库的特点

医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室书目型数据库（文摘型数据库）如：Medline

收录4600多种生物医学专业期刊；

提供包括作者、题名、关键词、主题词、代码等30多个经详细标引的可检字段MESH主题词规范标引

Why----数据库的特点医学信息检索与利用昆明医PubMed部分功能医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室超过三十多个可检字段经规范化的MESH词表检索PubMed部分功能医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研EMBASE的特点

医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室EMBASE

收录3800多种医学、药学专业期刊；

涵盖了大量的欧洲和亚洲医学期刊；

专有药物检索（DrugSearch）:支持药物名称检索，并提供药物联接，其中包括17个核心的药物联接和47个药物管理联接。EMTREE词表检索EMBASE的特点医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研Why----数据库的特点

医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室全文型数据库

国外全文数据库大多由期刊出版商或出版集团生产

收录期刊一般为本出版社自主产权的杂志，收录范围少

检索系统简单、易于操作，但功能不够齐全

大多为电脑机器标引，标引质量一般

检索结果为全文Why----数据库的特点医学信息检索与利用昆明医Why----数据库的特点

医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室Why----数据库的特点医学信息检索与利用昆明医PubMed与CBMPubMed中国生物医学文献数据库CBMVSPubMed与CBMPubMed中国生物医学文献数据库VS检索举例医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室某医院消化科医生欲申报立项课题“幽门螺杆菌（HP）感染胃癌易感基因多态性检测的研究”。课题研究内容是IL-1β,IL-10,TNF-α多态性检测,用于HP感染胃癌高危人群的筛查。检索词:胃癌（gastriccancer）；幽门螺杆菌（Helicobacterpylori）；白细胞介素1β（IL-1β）；白细胞介素10（IL-10）；肿瘤坏死因子α（TNF-α）；基因多态性（Polymorphisms）。检索举例医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室某医院消化中国生物医学文献数据库（CBM）医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室中国生物医学文献数据库（CBM）是我国最早的生物医学文献数据库之一。收录了1978年以来中国生物医学期刊1800多种，年增长量40余万篇。学科范围涉及基础医学、临床医学、预防医学、药学、中医学及中药学等医学各个领域。其医学主题词（MeSH）检索是几个中文数据库中独有的，标引依据美国国立医学图书馆的MeSH和中国中医研究院出版的《中医药学主题词表》。中国生物医学文献数据库（CBM）医学信息检索与利用昆明医学院中国生物医学文献数据库（CBM）医学信息检索与利用CBM主题词表查词中国生物医学文献数据库（CBM）医学信息检索与利用CBM主题中国生物医学文献数据库（CBM）医学信息检索与利用CBM主题词表参见系统中国生物医学文献数据库（CBM）医学信息检索与利用CBM主题CBM主题检索医学信息检索与利用CBM检索主要主题词扩展树形结构检索扩展副主题词CBM主题检索医学信息检索与利用CBM检索主要扩展树形结构检CBM主题检索医学信息检索与利用CBM中英文主题词入口词参见树状结构号表明其类别CBM主题检索医学信息检索与利用CBM中英文主题词入口词参见CBM主题检索医学信息检索与利用CBM主题词在学科分类中的位置族首词树状结构表明该主题词分属四个不同的上位学科CBM主题检索医学信息检索与利用CBM主题词在学科分类中的位CBM检索CompanyLogo主题词检索5篇缺省检索17篇CBM检索CompaCBM检索医学信息检索与利用CBM

缺省字段：在中国生物医学文献数据库（CBM）中，是中文标题、摘要、作者、关键词、主题词和刊名内容的组合。CBM检索医学信息检索与利用CBM

缺省字段：在中国生物医学CBM检索医学信息检索与利用CBMCBM检索医学信息检索与利用CBM医学信息检索与利用CBM检索词在题名字段出现检索词在文摘字段出现检索词在刊名字段出现医学信息检索与利用CBM检索词在题名字段出现检索词在文摘字段PubMed由美国国立医学图书馆（nationallibraryofmedicine,NLM)下属的国家生物技术信息中心（NationalCenterforBiotechnologyInformation，NCBI)开发，用于检索生物医学文献的WEB数据库。1997年6月起提供INTERNET免费服务

医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室PubMed由美国国立医学图书馆（nationallibr医学信息检索与利用PubMedPubMed医学信息检索与利用PubMedPubMed医学信息检索与利用PubMed医学信息检索与利用PubMedAug-23PubMed数据库不同的标注不同的来源Aug-23PubMed数据库不同的标注不同的来源

通过PubMed可检索的信息

Medline收录范围：全世界70多个国家和地区1966年以来的4600余种生物医学期刊，目前文摘条目1300余万篇，年报道量40万条，英文刊物占90%、3/4有英文摘要，每周更新。内容涉及：医学、药学、牙医学、护理学、预防医学、卫生管理、兽医学等专业。记录标注：[PubMed-indexedforMEDLINE]PubMed数据库通过PubMed可检索的信息MedlinePubMed

Premedline

收集未经标引的最新文献,经MeSH词表标引后，每周向medline移加一次,同时从Premedline中删除。记录标注：[PubMed-inprocess]Aug-23PubMed数据库Aug-23PubMed数据库PublisherSuppliedCitation

出版商直接向PubMed递送的电子文献。其中有一部分在Medline中未收录。

若出版商提供全文，PubMed则建立与全文的链接，可免费或交一定费用直接联机获取原文。记录标注:[PubMed-assuppliedbypublisher]Aug-23PubMed数据库Aug-23PubMed数据库二、检索规则（一）AutomaticTermMapping词汇自动转换

1、MeSHTranslationtableVitaminc转换为

“ascorbicacid”[MeshTerms]ORvitaminc[TextWord]

想要查验检索词的转换情况，并调整和保存检索策略，可点击“details”按钮PubMed数据库二、检索规则（一）AutomaticTermMappin

2、JournalsTranslationtableNewEnglandjournalofmedicine转换为“NEnglJMed”[Journal]

包括期刊的三种不同表达方式刊名全称、MEDLINE刊名缩写格式、ISSN例JournalofleukocytebiologyJleukocbiol0741-5400Aug-23PubMed数据库Aug-23PubMed数据库

3、PhraseList

Coldcompresses

在前两个表中均未找到，在短语列表中可找到这个词组。Aug-23PubMed数据库Aug-23PubMed数据库

4、AuthorIndex

当一个短语在前三个表中都找不到匹配词，PubMed就会到作者索引中查找。

例：smithjc姓前（全称）、名后（首字母缩写）Aug-23PubMed数据库Aug-23PubMed数据库

如果在上述4个表或索引中仍找不到相匹配的词时，PubMed就将短语劈开，用AND将短语中的单个词连接起来在全部字段中查找，直到找到相应的词为止。例：pressurepoint转换为((“pressure”[MeSHTerms]ORpressure[TextWord])ANDpoint[AllFields])Aug-23PubMed数据库如果在上述4个表或索引中仍找不到相匹配的词时，PubM二、检索规则（一）AutomaticTermMapping词汇自动转换

1、MeSHTranslationtableVitaminc转换为

“ascorbicacid”[MeshTerms]ORvitaminc[TextWord]

想要查验检索词的转换情况，并进行调整和保存检索策略，可点击“details”按钮Aug-23PubMed数据库MeSHTranslationTable主题词注释表JournalsTranslationTable期刊注释表CommonPhraseList常用词组表AuthorIndex作者索引表NoMapping检索词拆分AND二、检索规则（一）AutomaticTermMappin（二）短语检索如果在短语上加双引号，系统将只在PhraseList中查找，不再进行转换。例如：“singlecell”

“oxygenfreeradicals”Aug-23PubMed数据库（二）短语检索Aug-23PubMed数据库Aug-23PubMed数据库短语检索自动转换后的结果Aug-23PubMed数据库短语检索自动转换后的结果三、检索途径与方法基本检索-BasicSearch高级检索-AdvancedSearch(preview/index)限定检索-LimitsSearch期刊检索–JournalDatabases主题词检索-MeSHDatabases引文匹配-CitationMatcher临床查询–ClinicalQuerieAug-23PubMed数据库三、检索途径与方法基本检索-BasicSearchACompanyLogoCompanyLo医学信息检索与利用PubMed

检索选项医学信息检索与利用PubMed检索选医学信息检索与利用PubMed三、基本检索普通感冒与Vc的关系检索词：1、CommonCold2、Vitaminc医学信息检索与利用PubMed三、基本检索普通感冒与Vc的关CompanyLogoCompanyLoCompanyLogoCompanyLoCompanyLogoCompanyLoCompanyLogo四、高级检索CompanyLoCompanyLogoCompanyLoCompanyLogoCompanyLo医学信息检索与利用PubMed医学信息检索与利用PubMed医学信息检索与利用PubMed六、主题词检索举例：阿司匹林引起心肌梗死检索词：1、阿司匹林(Aspirin)2、心肌梗死(MyocardialInfarction)医学信息检索与利用PubMed六、主题词检索举例：阿司匹林引CompanyLogoCompanyLoCompanyLogo选择主题词CompanyLoCompanyLogo可组配的副主题词限定在主要主题词检索不扩展下位词检索CompanyLoCompanyLogoCompanyLoCompanyLogoCompanyLoCompanyLogo入口词与款目词相关参见与树状结构表表示分属两个学科类属CompanyLoCompanyLogo临床循证医学文献属于PubMed的免费全文CompanyLoCompanyLogo七、限定检索出版日期限定文献类型限定原文语种限定研究对象限定性别限定子集限定年龄组限定CompanyLoCompanyLogoCompanyLo案例CompanyLogo“幽门螺杆菌（HP）感染胃癌易感基因多态性检测的研究”。课题研究内容是IL-1β,IL-10,TNF-α多态性检测,用于HP感染胃癌高危人群的筛查。检索词:胃癌（gastriccancer）；幽门螺杆菌（Helicobacterpylori）；白细胞介素1β（IL-1β）；白细胞介素10（IL-10）；肿瘤坏死因子α（TNF-α）；基因多态性（Polymorphisms）。案例CompanyPubMed词语自动转换检索CompanyLogoPubMed词语自动转换检索www.themegalleryPubMed主题词检索CompanyLogoPubMed主题词检索www.themegallery.coCompanyLogoCompanyLoCompanyLogoCompanyLo外文数据库对比医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室

举例：

检索“发表在核心临床医学杂志上并能查询到全文的“有关老年人心肌梗塞的溶栓治疗”(MyocardialInfarction；ThrombolyticTherapy)的文献。对比数据库：PubMedSpringer全文期刊数据库OVID全文期刊库外文数据库对比医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室数据库对比医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室

PubMed("MyocardialInfarction/therapy"[Mesh])AND"ThrombolyticTherapy"[Mesh]检出文献数：2788年龄组：65岁以上540篇免费全文数据库对比医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室Pu医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室Springer检索表达式医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室Springer检医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室Springer检出文献数：1862医学专业文献数：1318点击篇名可阅读全文下载PDF格式全文医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室Springer检医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室Springer医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室SpringerCompanyLogoOVIDCompanyLoCompanyLogoOVID较完善的检索系统全文资源可供检索的多个字段CompanyLo医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室OVID检索词选择不同的字段，检出结果不同医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室OVID检索词选择医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教