医学文献光盘检索系统介绍课件

医学文献光盘检索系统介绍2

第一章光盘检索概述第一节数据库第二节机检的途径第三节机检技术第四节机检检索策略制订第二章MEDLNE光盘数据一、WINSPIRS主要检索界面二、MEDLINECD-ROM检索途径与方法三、检索举例四、检索效率第三章CBMdisc光盘数据库一、CBMdisc数据库概述二、CBMdisc检索途径与方法三、检索举例

3第一章

光盘检索概述下一页返回目录上一页4一、光盘和光盘检索1.光盘的定义：

光盘是当今用于存贮声音、图像、图表、照片、数据、文字等各种信息的最为理想的介质。

光盘实际上是高密度光盘（CompactDisc)的简称，是用聚焦的氢离子激光束处理记录介质的方法存储和再生信息的介质，又称激光光盘。下一页返回目录上一页52.光盘的种类光盘按功能的不同可分为三类：

即Compact-DiscReadOnlyMemory,简称CD-ROM,又称为高密度光盘只读存贮器，是第一代光盘。(1)只读光盘：下一页返回目录上一页6(2)写读光盘：

即WriteOnceReadMany的简称，是第二代光盘。

同磁盘一样，可以删除，改写，也可增加新记录，是第三代光盘。下一页返回目录上一页(3)可擦写光盘（Erasable):73.光盘检索的原理1.6微米存贮信息时，激光束聚焦在记录层的轨迹上，使局部温度上升，该处金属因表面张力关系而形成凹坑。盘的直径为4.75英寸，盘面上有三英里长的螺旋形轨迹。1微米下一页返回目录上一页84.光盘的特点：(1)存贮容量大(2)读取速度快(3)稳定性好，坚固耐用(4)使用寿命长局限性:用户只能读取盘上的数据,而不能写自己的数据(5)使用方便下一页返回目录上一页91994年6月，《中国生物医学文献光盘数据库》诞生，标志着中文医学文献的检索进入了计算机时代。下一页返回目录上一页5.光盘数据库

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第一节数据库

数据库(Database)是指若干个文档(File)构成，存储于磁盘、磁带或光盘等载体上，并能满足特定目的或特定数据处理系统需要的数据集合。一个数据库相当于一种书本式手工检索工具。一、数据库的结构数据库按其编排结构与功能分为顺排与倒排文档。11顺排文档

1、顺排文档（SequentialFile）是大量记录（Records）的集合，按文献纪录入编的存取号从小到大依次排列的目录式文档。它相当于印刷型手工检索工具的正文题录或文摘部分。（1）纪录（Records）是数据库中一个完整的信息单元，由一系列字段(Fields）构成。相当于手检工具的题录或文摘。12（2）字段（Fields）是著录文献各项的名称及其内容，是描述文献内容外特征的各項标识内容。字段相当于题录或文摘中的各項目名称，如:题名(TI）、著者(AU)、地址(AD)、出处(SO)、主题词(MESH)、主要主题词(MMH,MJMH)、关键词(KW)、特征词(TG)、出版年(PY)、语种(LA)、摘要（AB）等等。13倒排文档2.倒排文档（InvertedFile）是从顺排文档记录中抽出的每一个文献特征的标识作为存贮单元，并按某种顺序排列（字顺、分类号、序号）排列，同时在每一个标识后面注明相应的文献纪录存取号。不同类型的标识可形成不同的倒排文档，如著者倒排文档（即著者索引）、主题倒排文档（即主题索引）等等。14二、数据库的种类数据库按所含信息的内容主要有以下几种:1、参考型数据库（ReferenceDatabase）又分书目数据库和事实数据库。此种数据库，用户从中获得文献线索后，还需进一步查找原文。（1）书目数据库（BibliographicDatabase）:又称参考型数据库，主要指二次文献数据库，包括各种机读版的题录、文摘、目录等形式的数据库，提供原始文献的线索或简要的内容，指引用户去查原始文献。如MEDLINECD-ROM,CBMdisc等。15（2）事实数据库（FactDatabase）:或称指南数据库（DirectoryDatabase）,它存贮的数据库一般是用来描述人物、机构、事物等的情况、现象、特征、过程等事实信息。如人名录、机构指南、产品目录、科研成果目录等。2、源数据库（SourceDatabase）:又分数值数据库、图像数据库、术语数据库、16全文数据库等。此类数据库，用户一般不必再查其他信息源即可满足。（1）数值数据库（NumericDatabase）主要为用户提供数值性的信息，包括各种统计数据，科学实验数据等。（2）全文数据库（Full-TextDatabase）是一种存贮全文或节选其中主要部分而形成的文献数据库。173、混合型数据库（MixedDatabase）:具有上述多种数据库，如多媒体数据库（MultimediaDatabase）。18第二节机检的途径

机检的检索途径有主题词检索、文本词（自由词）检索，索引词检索，著者检索，横向检索等途径。一、主题词检索或称轮排主题词检索（ThesaurusSearching）。主题词检索是通过轮排主题词表选择检索词为入口进行检索的一种途径。它包含1、轮排主题词表，2、所选词祥解，3、树状结构：扩展全部树，4、副主题词等内容。19主题词检索的优点是

（1）输入非主题词（款目词）能引见到规范化主题词；（2）输入不甚确切的相近词，或仅输入词的前半部，就会显示相近的规范主题词。（3）输入正确的主题词，就出现该主题词为首的其他相近词；（4）对所选词的含义是否确切可通过“所选词祥解”以确定是否选用；（5）对所选词的内容范围，可采用单主题词检索，也可通过扩展树，进行扩大范围检索；（6）通过副主题词表，选择副主题词，以确定检索范围大小。202、文本词检索（Free-TextSearching）文本词检索是指输入任意字母、词、词组或符号查找文献的一种检索途经。只要在任一字段中有与输入内容相同的字、词、符号的文献都为命中文献，所以又称自由词检索或直接检索文本词检索的特点是(1)在文献各字段中必须有与输入的相同的字、词，才能命中，只要有一个字母不同，检出的结果就完全不同，或者为0，如disease与diseases就有不同的结果。如输入disease即为0，因为数据库中没有这样的词。21（2）各种途径的检索结果都显示在文本词检索“查找”或find状态下。3、索引词检索（IndexSearching）索引词检索通过索引词表选择检索词为入口进行检索的一种检索途径。索引词表中的词包括数据库中所有可检字段中所有单个词，部分词组，主题词，关键词，特征词，期刊名，编辑出版单位，作者姓名，作者单位地址，等等。所以又称索引词表检索。22索引词表检索的特点（1）凡索引词表中有的字、词、词组都能检出文献，并能显示该词的命中文献数和出现数。（2）输入不确切的词或英文单词拼写不甚确切，都能显示出拼写相近的正确的索引词，如输入“心律”就会显示以“心律”为首的按字顺排列的一段索引词表，其下就可能出现“心律不齐、心律失常、心律混乱”等一系列词，供你选择。234、横向检索（Lateralsearching）横向检索就是在检索过程中从显示纪录的各个字段中选择你所需的词作为检索词入口，进行检索的一种检索途径。横向检索的特点是在已获得初步结果的纪录中任何字段有你所需要检索的词或词组，都可作为检索词进行检索。其中以文摘和Mesh字段最有用。横向检索可以不必再打入检索词。245、著者姓名检索就是以作者姓名为检索词的一种检索途径。25第三节机检技术机捡技术包括布尔逻辑组配检索、截词检索、同字段检索等。一、布尔逻辑组配检索是通过逻辑运算符号and（乘）、or（和）、not（非）将几个检索词联接起来进行逻辑运算，达到检索目标的检索技术。1、and（逻辑乘）：AandB就是要求在命中的文献种既含有A又含有B的一种检索技术。如下图

ABAandB这是一种缩小范围的检索技术。262、OR（逻辑和）如CorD,只要含有C或含有D，或含有C和D的文献都是命中的文献，

CD如右图CorD。这是一种扩大检索范围的技术。EF3、not(逻辑非):如EnotF，是指检出E的文献中不含有F的内容，即凡E的文献中，含有F者都被排除，不再检出。这是一种缩小检索范围的检索。27二、截词检索截词检索：是在词干的后面运用截词符号*进行扩大检索范围的一种检索技术。即英文中有许多词有一些同根词，词尾形态不同，词义相近，如digest(消化，动词),digestant(助消化的)，digestibility(可消化性)，digestion(消化,名词），digestive(消化的、助消化的，消化药）都与消化有关。28不同机检系统，截词方式也不完全相同。按截词位置和符号不同，有前截词,中间截词和后截词。截词符号也有用“？”若将截词符号加在digest之后，即digest*，则凡文献中有前方词干digest相同，而词尾不同的文献，全部都是命中文献。29三、同句检索同句检索：即在两个词之间用with的一种检索技术。凡文献中，只要所要求的两个词在同一句子中即为命中文献，如GwithH。只要G和H在同一句中即可检出。如coughwithasthams。30四、同字段相邻检索同字段相邻检索：用near加数字，把两个词连起来，如Diagnosisnear3virus,就是凡在同一字段中有Diagnosis与virus之间相隔3个词以内的文献即为命中文献。如diagnosisofHBVirusinfection31五、检域限定检索或称限定字段检索是指检索词限定出现在某一特定字段者，为命中文献。就是在检索词之后用限定符号in，再加字段简称。如arrhythmiainTI，就是在题名中arrhythmia(心律不齐)的文献即为命中文献。可限定检索的字段有TI、AU、

CP、LA、SO、AD、MeSH、MMH，等。限定字段检索是一种缩小检索范围的检索技术，而且使检出的文献非常准确、切题。32

六、限定年份检索限定年份检索：指检索的文献限定在某一或某些年内。限定的年份符号可用in或py<、=、>

等。如1998inpy或py=1998（即1998年的文献为命中文献）。也可py<1998,py>1998,33七、优先检索优先检索：在使用逻辑运算符号和其它符号时要注意其先后检索顺序。（1）加括号为优先检索，Py=1979---1998。这也是一种缩小检索范围的技术。

34（2）不加括号者依次为not、and

near、with,以or为最低（后）。如freeradicalsandvitaminCorascorbicacid,系统会自动在freeradicalsandvitaminC之间加括号，成为（freeradicalsandvitamin）orascorbicacid。这与freeradicalsand（vitaminCorascorbicacid）的检索结果是不同的。35第四节机检的检索策略的制订

机检的检索策略就是进行机检时对采用的数据库，选用的检索途径和检索词、运用的检索技术、列出的检索式和安排的检索步骤等所制订的计划。在机检中检索策略具有决定检索结果的作用。制订检索策略应考虑下列几点：1、仅可能采用主题词检索，因为主题词包含同义词、近义词、还有可扩展的下位词，范围较广，容易检出结果。2、为保证检出切题文献，可采用自由词检索。363、注意用好逻辑组配关系。4、如果检出同类文献太多，可采用

in限定字段（TI、AB、MeSH、MMH、PY、LA）或用not,and

组配，和单主题词检索。5、如果检出文献太少，可通过主题词扩展树检索，并采用全部副主题词检索，截词检索或在题名、摘要和Mesh中选词进行横向扩大检索，及索引词中选用同义词，近义词检索。37检索举例：查PCR检测乙肝病人肝组织和血中HBVDNA的文献。检索式可以:#1聚合酶链反应#2肝炎病毒，乙型inTInear2DNA#3#1and#2(即PCR测定乙型肝炎病毒DNA)#4肝or肝组织#5#3and#438第二章MEDLINE光盘数据库

数据库介绍

MEDLINE是美国国立医学图书馆（NationalLibraryofMedicineL）建立的MEDLARD（MedicalLiteratureAnalysisandRetrievalSystems）系统的生物医学数据库（MEDLARS的全称MEDLARSONLINE）。收录1966年以来世界上70多个国家和地区出版的生物医学及其相关学科期刊3800余种。该数据库包括3种重要索引的内容:IndexMedicus,IndextoDentalLiterature和InternationalNursingIndex。39

银盘公司（Silver-Platter）的MEDLINE

数据库的CD-ROM称为Spirs(Silver

PlatterInformationRetrievalSystem)，包括有

PC-Spirs,WinSpirs,Webspirs等三种检索界面，如后:

40MEDLINE光盘数据库结构MEDLINE光盘数据库的记录由26个字段组成。其中AI、AN、CP、ISSN、LAPT、PY、SB、TG、UD字段为限制字段。如查原文为英文文献时，输入的检索词必须加以限定，检索式应为：englishinla或la=english下一页返回目录上一页

41MEDLINECD-ROM数据库字段一览表字段简称字段全称字段中译名称ABAbstract文摘ADAddressofAuthor著者地址AIAbstractIndicator文摘标识ANMEDILINEAccessionNumberMEDILINE存取号AUAuthor(s)著者姓名CMComments评论CNContractorGrantNumbers合同号或资助项目号CPCountryofPublication出版国家42

字段简称字段全称字段中译名称GSGeneSymbolISSNInternationalStandard国际标准连续出版物号

SerialNumberLALLanguageofArticle文献语种MeSHMedicalSubjectHeadings医学主题词MIMEMinorMeSHHeadings次要医学主题词MJMEMajorMeSHHeadings主要医学主题词NMNameofSubstance物质名称PSPersonalNameasSubject文中主要论及人名PTPublicationTYPE出版类型PYPublicationYear出版年43

字段简称字段全称字段中译名称

RNCASRegistryNumber化学文摘社化学物质

orECNumber登记号或酶命名号SBSubsetMEDLINE子集SISecondarySource第二文献来源

IdentifierSOSource文献来源

(BibliographicCitation)TGChecktags特征词TITitle题名TOOriginalTitle非英语语种的原文篇名UNUpdateCode更新代码44

数据库检索系统

一、WinSpirs主要检索界面启动WinSpirs软件后，点击start，然后在数据库中选择年份，继续点击OK，系统显示WinSpirs主要检索屏幕（如图4）.主要检索屏幕分检索区、检索史区、检出记录区和工具拦。工具拦上的按钮是NEDLINE最常用的检索指令。451、检索区（SearchArea）在当Search框内输入检索词或检索式，点击“Search”按扭，系统立刻执行检索指令进行检索，在检出记录区显示检索结果。2、检索史区（Searchhistory）当系统接受检索词或检索式经过检索后，检索史便显示出已经检索的检索策略，包括检索序号，相应的检索提问式和命中文献数。通过点击File菜单中的SaveSearchHistory可将检索史内的检索策略存盘；点击File菜单中的LoadandRunSearches可调用保存过的检索策略重新用于检索。463、检出记录区（RetrievedRecords）显示检索结果供浏览阅读，利用滚动条可逐条显示，如对某篇文献感兴趣，可点击左边的“□”，对文献进行标记，以便打印或套录。4、工具栏工具栏上有7个按钮，其中contents按钮不用于MEDLINE数据库，其它都是常用的检索指令。47二、MEDLINECD-ROM数据库检索途径

与方法

PC-SPIRS提供的检索方式

A.菜单式（多级菜单）SPIRS主菜单Find

HistoryIndexThesaurusShow

ClearPrintGuideXchange

RestartOptionsDownloadQuit48B.指令式：SPIRS功能键F1Help要求帮助F6Print打印F2Find寻找F7Restart重新开始F3Guide指南F8Xchange换盘F4Show显示F9Thesaurus词表F5Index索引F10MainMenu主菜单F11Download套录F12Clear删除检索式下一页返回目录上一页49（一）Database选库检索前，需要先确定数据库检索年限，点击Database按钮，系统弹出数据库年份窗口，提供选择数据库年限。如果在检索结果中发现文献量太多需要对发表年份作调整时，可通过Limit辅助按扭，点击PublicationYear执行检索限定；也可通过字段限制符直接在检索框内输入检索式进行检索。50（二）自由词检索适用自由词检索的情况有以下几种：A.无相应的主题词最新出现的科技词汇

某些特定的概念中国医学和中草药方面B.对主题词不太熟悉时C.对主题词检索结果不满意时下一页返回目录上一页51

用鼠标左键点击“Search”按钮或按“F2”功能键，即可进入检索状态。1.Search指令（Find指令）下一页返回目录上一页52在Search状态下,检索式可以是以下几种形式:(1).任意的字母或数字，如:ac,28,etc.(2).任意单词或词组;如:cancer,vitaminA(3).连缀词组;如:liver-neoplasms，lung-disease(4).词根(截词):下一页返回目录上一页53ComputerComputers(5).以前的检索式，如:#3用“*”表示截词符号.如:computer*,不但可以查出含有computer的文献,所有含有computers,computerized,computerizing,computerization等词的文献也可检索出.(6).逻辑检索式如:childandnutrition下一页返回目录上一页54a.逻辑“与”(用“AND”表示)

检索式AandB,表示文献中同时包含检索词A和检索词B的文献才是命中文献。例：insulin(胰岛素)anddiabetes（糖尿病）下一页返回目录上一页55b.逻辑“或”(用“OR”表示)

检索式AorB

，表示包含检索词A的文献或包含检索词B的文献或者同时包含检索词A和检索词B的文献均为命中文献。

例：cancer（癌）

ortumor（瘤）下一页返回目录上一页56c.逻辑“非”(用“NOT”表示)检索式AnotB，表示包含检索词A同时不包含检索词B的文献为命中文献。三个逻辑运算符中，NOT运算优先级最高，AND次之，OR最低例：hepatitisBvirusnothuman

（乙肝病毒）（人类）下一页返回目录上一页57

(7).带通配符的单词,如:colo?r代表color或colour2.Show指令

在浏览已检出的记录时，如发现有更好更确切的词，那么这些自由词也可供检索。如：用“RiverBlindness”检索出的文献，浏览时发现该病的拉丁名称是“Onchocerciasis”，即可用该词再检索。

“?”表示0或1个字母下一页返回目录上一页583.Index指令

索引中给出了每个词及含有该词的记录在数据库中的数量,除主题词,主题词/副主题词,著者姓名,化学物质登记号,酶命名号,化学物质和酶的名称,刊名缩写外,还有来自记录中TI,AB字段的自由词.用鼠标左键点击“Index”或按“F5”功能键，即可进行索引检索。下一页返回目录上一页59

（三）主题词检索MeSH词表是一种受控词表(即规范化语言词表)。它指引用户使用规范化的生物医学术语查找文献。1.MeSH词表用鼠标左键点击“Thesaurus”按钮或“F9”功能键，即进入主题词检索状态。下一页返回目录上一页60SilverPlatter公司的MEDLINECD-ROM的MesH词表(Thesaurus)由三部分组成:A.ThepermutedList（轮排词表）轮排词表是把词表中的主题词和款目词按单元词字顺排列所构成的字顺表。下一页返回目录上一页61屏幕标题和所选词DefinitionofTerms(所选词的定义)PreviousIndexing(历史标引注释)RelatedTerms(相关词)．所选词的族首词．所选词的直接上位词．所选词本身．所选词的直接下位词Tree(树形结构)C、

TheSelectedTermDetail(所选词详解)下一页返回目录上一页62C.TheMeSHTreeDisplay(HierarchicalStructure)(MeSH树状结构表或等级结构显示）这部分显示所选MeSH在树状等级表中的详细结构，即上位词、下位词及其等级。副主题词表：副主题词是对主题词的进一步限制，用来检索更为专指的文献。副主题词表中列出的副主题词都是适配该（类）主题词的副主题词。下一页返回目录上一页632.Search指令：在Search状态下可用以下三种方法来进行主题词的检索：1)用连字符“-”连接或结尾的检索词；如：gastric-mucosa,neoplasms-2)用符号“/”连接主题词与副主题词；如：hepatitisB/diagnosis3)用字段标识符限定检索，表达式为“主题词

inMeSH”。如：hepatitisBinMeSH下一页返回目录上一页64（四）限定字段检索检索式为：检索词in

字段名如：bloodinso（五）检索结果的输出检索结果的输出有三种方式：显示、打印、套录。下一页返回目录上一页

比较特殊的有文摘标识限制，检索式为：

ai=ab或abinai651.显示（Show)

用鼠标左键点击“Show”按钮或按“F4”功能键可对检索结果进行显示。

在浏览检索结果的过程中，可用鼠标左键点击所显示记录左上方的“”符号标记出有兴趣的文献，以便打印、重新显示或套录用。下一页返回目录上一页662.打印(Print)3.套录(Download)

用鼠标左键点击“Print”按钮或按“F6”功能键可对检索结果进行打印。此命令可将检索到的文献转存到软盘或硬盘的文件中。用鼠标左键点击“Download”按钮可将检索结果拷贝。下一页返回目录上一页67三、检索举例

（一）光盘检索的步骤

1.分析课题，确定概念词；2.用《医学主题词表》或Thesaurus将概念词规范化为主题词；

3.不能转化为主题词的概念词作为自由词检索；

4.将主题词、自由词运用逻辑运算符组合进行检索，发挥主题词的查准性和自由词的查全特性。下一页返回目录上一页68（二）检索实例1、自由词检索：例1.气管异物的英文文献气管异物包括支气管异物，其英文表达方式有trachealforeignbodies、bronchialforeignbodies、acheobronchialforeignbodies、bronchotrachealforeignbodies等。以采用截词符“*”及逻辑符“or”制订检索策略。在Search状态下输入（trach*foreignbodiesorbronch*foreignbodies）andla=english。以MEDLINE数据库1996-2000为例。69其检索步骤如下：#117trache*foreignbodies#218bronch*foreignbodies#332#1or#2#41758773la=english#520#3and#4#117trache*foreignbodies具体检索界面展示如后：702、主题词检索：主题词是经过规范化的术语，能确切地表达文献的主题概念。用主题词检索可检出含有同一概念各种表达形式（学名、俗名、同义词、近义词）的文献，以避免漏检。主题词与副题词组配，提高检索的专指性。因此主题词往往作为首选的检索途径。71例2、查有关微量元素分析的文献微