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第八章代谢总论与生物氧化第一节新陈代谢的有关概念第二节代谢的发生过程第三节中间代谢的实验研究方法第四节生物氧化概述第五节ATP与其它高能化合物第六节三羧酸循环第七节呼吸链与氧化磷酸化第一页,共八十五页。第一节新陈代谢的有关概念一、新陈代谢的概念:
新陈代谢是生物体最基本的特征,是生命存在的前提。1.狭义概念:是指细胞内所发生的酶促反应过程,称为中间代谢。这是代谢活动的主体,也是代谢研究的主要内容。2.广义概念:是生物与外界环境进行物质与能量交换的全过程。即:生物体内所经历的一切化学变化。包括消化、吸收、中间代谢及排泄等阶段。新陈代谢包括生物体内所发生的一切合成和分解作用。一方面,生物体不断从周围环境中摄取物质,通过一系列生化反应,转变为自己的组成部分;另一方面,将原有的组成成分经过一系列生化反应,分解成不能在利用的物质排出体外,不断地进行自我更新。生物体通过新陈代谢所产生的生命现象是建立在合成代谢与分解代谢矛盾对立和统一的基础上的,它们之间既相互联系、相互依存,又相互制约。第二页,共八十五页。
合成代谢
分解代谢
物质代谢能量代谢新陈代谢新陈代谢图解(同化作用)(异化作用)小分子大分子需要能量释放能量大分子小分子第三页,共八十五页。二、新陈代谢的内容1.物质代谢和能量代谢(1)物质代谢:重点讨论各种生理活性物质(如糖、蛋白质、脂类、核酸等)在细胞内发生酶促反应的途径及调控机理,包含旧分子的分解和新分子的合成;(2)能量代谢:重点讨论光能或化学能在细胞内向生物能(ATP)转化的原理和过程,以及生命活动对能量的利用。能量代谢和物质代谢是同一过程的两个方面,能量转化寓于物质转化过程之中,物质转化必然伴有能量转化。第四页,共八十五页。(1)合成代谢活细胞从外环境中取得原料合成自身的结构物质、贮存物质、生理活性物质及各种次生物质的过程是合成代谢,也叫生物合成。是需要供应能量的过程。(2)分解代谢有机物质在细胞内发生分解的作用过程。分解过程中的许多中间产物可供作生物合成的原料。伴随分解代谢释放出化学能并转化为细胞能够利用的生物能(ATP)。合成代谢和分解代谢相辅相成,有机地联系在一起,构成中间代谢的统一整体。
2.合成代谢与分解代谢第五页,共八十五页。3.代谢途径
无论物质代谢还是能量代谢,分解代谢还是合成代谢,一般都是由多种酶催化的连续反应过程。所谓代谢途径就是细胞中由相关酶类组成的完成特定代谢功能的连续反应体系。细胞中具有某种代谢途径也就是指具有其酶系。代谢途径的组成可简单示意如下:第六页,共八十五页。PSABCD式中S代表代谢底物,P代表产物,E代表酶。从S到P之间的一系列过渡产物称为中间产物。底物、中间产物、终产物统称为代谢物。不同代谢途径所具有的相同的中间产物称为公共中间产物。通过公共中间产物可实现途径间的互相联系,调节代谢物质的流向,维持细胞中各种物质的代谢平衡。第七页,共八十五页。4.生物的营养类型
自然界中的生物根据其所利用的碳源和能源,可分为不同的营养类型。(1)自养与异养:碳源是为细胞生物合成提供碳素营养的物质。有些生物利用无机物二氧化碳作为碳源,这类生物称为自养生物。有些生物需要现成的有机物作为碳源,称之为异养生物。第八页,共八十五页。(2)光能与化能:生物体能够利用的能源主要有光能和化学能。根据不同生物对能源的要求,可分为光能营养型和化能营养型。
光能营养型是直接利用光能,通过光合磷酸化作用合成ATP;化能营养型是利用现成有机物或无机物,通过氧化磷酸化反应合成ATP。第九页,共八十五页。生物营养类型营养类型碳源能源电子供体生物举例自养型光能自养CO2光H2O等植物化能自养CO2无机物氧化H2、S氢细菌异养型光能异养有机物光有机物藻类化能异养有机物有机物氧化有机物动物
四种营养类型中,光能自养型和化能异养型占绝大多数。另两种营养类型相对较少。还应指出,有些高等生物的所有细胞并非都属于同一营养类型。例如,高等植物叶子是光能自养,而根部则为化能异养型。叶绿细胞在日光中为光能自养型,在黑暗中又为化能异养型。第十页,共八十五页。(3)需氧与厌氧:不同生物对分子氧的依赖关系也有很大区别,据此可分为需氧生物、厌氧生物和兼性生物。
需氧生物是在有氧条件下才能维持代谢的生物。其代谢活动需要以分子氧(O2)作为有机物氧化反应的电子受体。
厌氧生物是在无分子氧的环境中生活的,以无机物或有机物为电子受体,不能用O2作为电子受体,而且分子氧(O2)对绝对厌氧生物会有毒害作用。
兼性生物在有氧、无氧条件下都能生存,有氧时利用氧,无氧时能利用某些氧化型有机物作为电子受体。第十一页,共八十五页。第二节代谢的发生过程一、分解代谢的一般过程几乎所有生物都具有分解利用有机物的能力。总览有机营养物质(糖、脂、蛋白质)分解代谢的发生过程,可以分为四个阶段。生物大分子的降解阶段单体分子初步分解阶段乙酰基完全分解阶段氢的燃烧阶段第十二页,共八十五页。1.生物大分子的降解阶段。外源生物大分子通过消化作用降解,内源生物大分子通过胞内酶催化降解,分解为其单体分子,即多糖分解为己糖或戊糖,蛋白质分解为氨基酸,脂肪分解为甘油和脂肪酸等。这些降解反应途径都很短,仅有几种酶催化,不产生可利用的能量。第十三页,共八十五页。2.单体分子初步分解阶段。细胞都具有特定的分解代谢途径,分别将单糖、氨基酸、脂肪酸等单体分子进行不完全分解。如糖的EMP途径、脂肪酸的β-氧化,等等。各种单体分子不管其结构和性质差别多大,经过第二阶段的有关代谢途径都能巧妙地被降解成少数几种中间产物,主要是乙酰CoA。因此,第二阶段起到了殊路同归、把多形性的底物分子向一体化结构集中的作用,为最后纳入同一代谢途径进行完全分解创造了条件。第十四页,共八十五页。3.乙酰基完全分解阶段。三羧酸循环途径是各种营养物质分解所生成的乙酰基集中燃烧的公共途径。经过三羧酸循环,乙酰基完全分解,碳原子氧化成二氧化碳,并有少量能量释放,生成ATP。大量的化学能以氢原子对2H(2H+
+2e)的形式转入还原型辅酶分子。还原型辅酶再将氢原子对送入呼吸链进行氧化放能。第十五页,共八十五页。4.氢的燃烧阶段。这是有机物氧化分解的最后一个环节。主要包括电子传递过程和氧化磷酸化作用。在线粒体内膜上由多种色素蛋白组成的呼吸链是使第二、三阶段生成的氢原子对(2H++2e)完全氧化的组织体系,也是细胞中有机物氧化分解释放能量的主要部位。第十六页,共八十五页。二、合成代谢的一般过程生物合成包括组建生物大分子所需单体分子的合成、生物大分子的合成、细胞结构的组建、生理活性物质及次生物质的合成等。所有生物合成都是需能酶促反应过程。需要由核苷三磷酸,主要是用ATP供能,所有生物合成过程都需还原型辅酶(NADPH)供应还原力。除了营养贮存物质的合成之外,一般正常生理状态下的生物合成都遵守细胞经济学的原理,用多少,合成多少。合成途径的启、闭、快、慢都受细胞调节系统调节。不同生物类群的生物合成能力有所不同,所用的原材料和能量来源也不尽相同。但是,一切活细胞都需要自行合成本身所需要的种种生物大分子。合成代谢一般可以分成三个阶段:原料准备、单体分子合成、生物大分子合成。生物合成所需的碳源、氮源、能量和还原力(NADPH)主要通过分解代谢供应。从这种意义上来讲,分解代谢可以视为合成代谢的原料准备阶段。自养生物所需要的单糖、脂肪酸、氨基酸、核苷酸等各种单体分子及其他生理活性物质,生物自身都能合成。高等动物和人体有几种氨基酸和脂肪酸及维生素等生理活性物质,自身不能合成,需要靠植物和微生物供给。微生物的生物合成能力差别很大。凡自身不能合成的单体分子则为其生长限制因子,必须由外界供给。对于异养生物而言,分解代谢是生物合成的先决条件。只有充足的营养源被分解,才能为生物合成供应必需的原料和能量。第十七页,共八十五页。第三节中间代谢的实验研究方法
中间代谢的研究内容很多,研究目的不同,所用的生物材料和实验方法也不相同。为探讨代谢途径及其调节机理,动物、植物、微生物材料都可以作为实验对象。根据实验材料的水平,常将实验分为活体内实验和活体外实验。第十八页,共八十五页。1.活体内实验(整体实验)用整体生物材料或高等动物离体器官或微生物细胞群体进行中间代谢实验研究称为活体内实验。(一)活体内实验和活体外实验实验结果代表生物体在正常生理条件下整体代谢情况,比较接近生物体的实际。典型例子:1904年,德国化学家Knoop提出的脂肪酸β-氧化学说。第十九页,共八十五页。2.活体外实验用从生物体分离出来的组织切片,组织匀浆或体外培养的细胞、细胞器及细胞抽提物进行中间代谢实验研究称为活体外实验表示。典型例子:糖酵解、三羧酸循环、氧化磷酸化等。第二十页,共八十五页。探讨物质代谢途径的常用方法有:代谢平衡实验、代谢障碍实验、代谢物质标记追踪实验、特征性酶鉴定实验、核磁共振波实验等。其中最有效的是代谢物质标记追踪实验和核磁共振实验。(二)代谢途径的探讨方法第二十一页,共八十五页。1.代谢平衡实验通过活体内实验研究代谢物摄入和产出排出的平衡关系,可以了解对代谢物的利用能力及产物生成情况。例如测定“呼吸商”(R.Q.)可以判断体内能量利用情况。R.Q.=产CO2量(升)/耗O2量(升)糖类物质R.Q为1,脂肪R.Q为0.7,蛋白质R.Q为0.8。人体正常代谢时,R.Q介于0.85-0.95之间,说明三大营养物质同时发生了氧化分解。饥饿状态下:R.Q?糖尿病人:R.Q?问题:若测得生物材料的R.Q接近1,则表明能量主要来自于何类物质分解?第二十二页,共八十五页。2.代谢障碍实验(代谢途径阻断实验)正常生物体的中间代谢过程中,中间产物不会过多积累,不容易进行分析研究;若用适当方法造成代谢障碍,阻断代谢途径,则使中间产物积累,便于进行分析研究。阻断代谢途径的方法有:造成微生物营养缺陷性、使用抗代谢物、专一性抑制剂等。第二十三页,共八十五页。(1)微生物营养缺陷性(微生物基因突变型)采取诱变剂使微生物的基因发生突变,从而造成某种酶缺损,代谢途径中断,缺损酶前面的中间产物会大量积累,致使细胞中该种物质含量增高,便于进行分析研究。应用实例:乳糖的代谢机理。优点:容易突变;经济;简便等第二十四页,共八十五页。(2)使用抗代谢物抗代谢物,又叫代谢拮抗物,或代谢物结构类似物。其分子结构与代谢物的分子结构类似。实质:竞争性抑制剂。例子:丙二酸是琥珀酸的抗代谢物,能对琥珀酸脱氢酶发生很强的竞争性抑制作用,造成代谢中间产物“琥珀酸”积累,从而证明了TCA循环中有生成琥珀酸这一反应步骤。第二十五页,共八十五页。(3)酶的专一性抑制剂例子:碘乙酸是巯基酶的专一性抑制剂,可抑制酵母的酒精发酵,造成3-磷酸甘油醛和磷酸二羟丙酮积累。由此证明了酵解途径中1,6-二磷酸果糖是三三裂解生成了三碳糖。(4)利用药物造成异常动物实验(病变动物法)用人工方法使动物发生某一过程的代谢障碍,然后给以一定量受试物质,研究其中间代谢过程。例子1:研究维生素缺乏症,可给以缺乏某种维生素的饲料,若干天后观察其病变情况,在加入该种维生素,观察其症状有否好转,从而确定该种维生素的功能。例子2:“人工糖尿病”。例子3:生糖氨基酸;生酮氨基酸第二十六页,共八十五页。3.代谢物标记追踪实验将代谢底物分子适当“标记”,然后追踪“标记”在细胞中的去向,就可以了解底物分子在中间代谢中经过什么中间产物,生成了什么终产物。这是探索代谢途径最有效的方法。标记方法有:化学标记法、同位素标记法。第二十七页,共八十五页。(1)化学标记法1904年,德国F.Knoop首次用苯环标记脂肪酸探讨中间代谢途径,提出著名的脂肪酸β-氧化学说。缺点:化学标记法使天然代谢物分子结构和理化性质发生了改变,这可能给正常代谢途径造成某些影响。第二十八页,共八十五页。(2)同位素标记法1941年,RudolfSchoenheimer首次采用同位素标记法进行实验。同位素种类:稳定同位素和放射性同位素。二者区别:是否衰变、是否有射线。常用的稳定同位素有:重氢(2H或D)、15N、13C、18O等。
用“稳定性同位素”标记的化合物可用质谱仪定量测定,也可用超离心法分离鉴定。根据放射线同位素衰变时放出的射线性质,可以用专门仪器或专用方法测定。常用的放射性同位素有氘(T或3H)、14C、32P、34S、131I。优点:1)同位素标记法特异性强,灵敏度高,测定方法简便。2)放射性同位素分析方法比稳定同位素更方便、灵敏,应用更普遍。缺点:放射性同位素对人体有毒害,某些同位素的半衰期长,容易造成环境污染,所以需要在专门的同位素实验时进行。第二十九页,共八十五页。4.测定特征性酶每条代谢途径都有其特征性酶,它的存在就表明该代谢途径存在。例如:糖代谢途径中的特征酶:EMP途径:醛缩酶HMP途径:6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶TCA途径:柠檬酸合成酶第三十页,共八十五页。5.核磁共振波谱法(nuclearmagneticresonancespectroscopy,简称NMR)核磁共振谱可反映分子中各个原子所处的状态。由布洛赫和巴塞尔于1948年建立,因此获得1952年诺贝尔奖。应用最多的有13C谱、19F谱、31P谱和15N谱。特点:样品不受破坏,且能最真实地反映机体内的化学反应情况。第三十一页,共八十五页。第四节生物氧化概述一、生物氧化1.定义:有机物在生物细胞内进行氧化分解而生成CO2和H2O并释放能量的过程。又称细胞氧化或细胞呼吸。2.本质:生物氧化是发生在生物体内的氧化还原反应,因而具有氧化还原反应的共同特征。并且物质被氧化时总伴随能量的释放。第三十二页,共八十五页。3.特点:生物氧化是在活细胞内进行的,它与体外的直接氧化相比又有许多不同的特点:有机物在生物体内完全氧化与在体外燃烧而被彻底氧化,在本质上是相同的,最终的产物都是CO2和H2O,同时所释放能量的总值也相等;生物氧化在常温、常压、接近中性的pH和多水环境中进行;是在一系列酶、辅酶和中间传递体的作用下逐步进行的;氧化反应分阶段进行,能量逐步释放,既避免了能量骤然释放对机体的损害,又使得生物体能充分、有效地利用释放的能量;生物氧化过程中释放的化学能通常被偶联的磷酸化反应所利用,贮存于高能磷酸化合物(如ATP)中,当生命活动需要时再释放出来。4.类型:生物氧化是在一系列氧化-还原酶催化下分步进行的。每一步反应,都由特定的酶催化。在生物氧化过程中,主要包括如下几种氧化类型:第三十三页,共八十五页。5.酶类:催化生物氧化的酶习惯上分为不需氧脱氢酶、需氧脱氢酶、氧化酶、过氧化氢酶和电子递体。(1)不需氧脱氢酶类:直接作用于底物,使之脱氢氧化,但不以氧作为直接受氢体的酶。是生物氧化反应中的主要酶类。还原型底物
SH2氧化型底物
S氧化型辅酶还原型辅酶还原型受体氧化型受体不需氧脱氢酶第三十四页,共八十五页。(2)需氧脱氢酶类:直接作用于底物,使之脱氢氧化,并且需要以氧作为直接受氢体的酶。反应生成过氧化氢。还原型底物
SH2氧化型底物
S氧化型辅酶还原型辅酶O22-
O2需氧脱氢酶H2O22e2H+
第三十五页,共八十五页。(3)氧化酶类:不能从底物上脱氢,只能夺取底物上的电子对,并激活氧分子生成水。还原型底物
SH2氧化型底物
S2Cu2+
2Cu+
1/2O22-
1/2O2氧化酶H2O2e2H+
第三十六页,共八十五页。(4)电子递体:专门负责传递不需氧脱氢酶脱下来的电子(有的也传递质子)的酶类(祥见呼吸链)。H2O12O2O2-MH2还原型代谢底物FMNFMNH2CoQH2CoQNAD+NADH+H+2Fe2+2Fe3+
细胞色素b-c-c1-aa3
FeS2H+M氧化型代谢底物2e第三十七页,共八十五页。6.CO2的生成:糖、脂、蛋白质等有机物转变成含羧基的中间化合物,然后在酶催化下脱羧而生成CO2。
类型:α-脱羧和β-脱羧氧化脱羧和单纯脱羧CH3COSCoA+CO2CH3-C-COOH
O丙酮酸脱氢酶系NAD+
NADH+H+CoASH例:+CO2H2N-CH-COOHR氨基酸脱羧酶CH2-NH2R第三十八页,共八十五页。7.H2O的生成:代谢物在脱氢酶催化下脱下的氢由相应的氢载体(NAD+、NADP+、FAD、FMN等)所接受,再通过一系列递氢体或递电子体传递给氧而生成H2O。CH3CH2OHCH3CHONAD+
ADH+H+
乙醇脱氢酶例:NAD+电子传递链
H2O2eO=2H+1\2
O2第三十九页,共八十五页。二、自由能和氧化还原电位1.自由能自由能(G):指一个反应体系中能够做功的那部分能量。自由能的变化(ΔG):产物的自由能与反应物的自由能之差,与反应转变过程无关。标准自由能的变化(ΔG0):298K,101.3KPa,反应物浓度为1mol/L,pH=0。生化反应中标准自由能的变化(ΔG0’):298K,101.3KPa,反应物浓度为1mol/L,pH=7。ΔG<0ΔG=0ΔG>0反应达到平衡放能,反应自发进行吸能,反应不能自发进行在AB中,ΔG=Δ B-ΔA自由能的概念对于研究生物化学过程具有很重要的意义,生物体用于作功的能量正是体内化学反应释放的自由能,生物氧化释放的能量也正是为有机体利用的自由能。它不仅可以用来判断机体内某一过程能否自发进行,而且还可以利用自由能这个函数来计算反应的其它有用参数。第四十页,共八十五页。在反应A+BC+D中自由能变化是标准自由能变化与平衡常数的函数:2.自由能与平衡常数当反应达到平衡时,ΔG=0,那么,第四十一页,共八十五页。3.自由能与氧化还原电位的关系pH=7,101.3KPa,25℃,反应物浓度为1mol/L,氧化态与还原态物质与标准氢电极组成原电池测定得到的氧化还原电位。∆E0’=E0’电子受体-E0’电子供体电子从E0’较小的物质转移到E0’较大的物质是自由能降低的结果。其关系为:
∆G0’=-nF∆E0’n为转移电子数;F为法拉第常数,等于96.5kj/V.mol第四十二页,共八十五页。第五节ATP与其它高能化合物(一)高能化合物的类型1.高能键(high-energybond)高能键是1941年提出的一个概念,用“~”表示,是指其结构不稳定,性质活泼,自发水解或基团转移的趋势很强,当其发生水解或基团转移反应时,释放的自由能很多。高能键中的“高能”是指其自由能高,并非键能高。“高能键”与“键能”(energybond)区别:化学中的“键能”是指断裂一个化学键所需要的能量;“高能键”是指水解或转移该键所释放的能量。细胞中重要的高能键:高能磷酸键和高能硫脂键。第四十三页,共八十五页。2.高能化合物:分子结构中含有高能键的化合物称为高能化合物。第四十四页,共八十五页。(二)ATP的结构特点及其重要意义ATP(三磷酸腺苷,腺苷三磷酸,adenosinetriphosphate)是一种很重要的高能磷酸化合物。生物体每天要消耗大量ATP,安静状态的成年人:每天消耗40kgATP;激烈运动时:每分钟就消耗0.5kg。ATP是一分子腺嘌呤、一分子核糖和三个相连的磷酸基团构成的核苷酸,其结构:腺嘌呤核苷酸(AMP)二磷酸腺苷ADP三磷酸腺苷ATP22第四十五页,共八十五页。意义:(1)ATP是产能反应和需能反应之间最主要的能量介质放能反应通过氧化磷酸化反应合成ATP,贮存能量;需能反应,则通过ATP水解供应之。a.当ATP提供能量时,在ATP远端的γ-磷酸基团水解为无机磷酸分子,ATP失掉一个磷酰基而变成腺苷二磷酸。ATP+H2O→ADP+Pi(标准自由能变化ΔG0’=-30.514kJ/mol)b.在某些情况下,ATP的α和β磷酸基团之间的高能键被水解(即同时水解γ和β-磷酸基团),形成AMP和焦磷酸。ATP+H2O→AMP+PPi(ΔG0’=-32.19kJ/mol)第四十六页,共八十五页。(2)作为磷酸基团供体参与磷酸化反应生化反应中,无论是分解代谢还是合成代谢,常常需要先将反应底物分子活化,其中,磷酸化是一种普遍活化方式。ATP具有很活泼的磷酸基团,可作为磷酸基的供体参与细胞中的磷酸化反应,此类反应由激酶催化。反应生成的磷酸化葡萄糖分子具有较高的自由能,易进一步参加反应。第四十七页,共八十五页。(3)ATP参加高能磷酸基团转移反应ATP在磷酸基团转移中起“中间传递体”的作用,故称“磷酸基团传递者”。磷酸烯醇式丙酮酸和1,3-二磷酸甘油酸是葡萄糖的分解的中间产物,葡萄糖分解为乳酸时所释放的大部分自由能,几乎都保留在这两个化合物中。在细胞中这两个化合物并不直接水解,而是通过特殊激酶作用,以转移磷酸基团的形式,将捕捉的自由能传递给ADP从而形成ATP。而ATP分子又倾向于将它的磷酸基团转移给具有较低磷酸基团转移势能的化合物,例如葡萄糖和甘油,从而生成6-磷酸葡萄糖和3-磷酸甘油。其中,磷酸烯醇式丙酮酸和1,3-二磷酸甘油酸叫做“超高能化合物”(superhigh-energycompound),它们水解所释放的自由能比ATP高;同理,6-磷酸葡萄糖和3-磷酸甘油叫做“低能磷酸化合物”。第四十八页,共八十五页。
GTP、UTP、CTP。其中,GTP对G蛋白的活化、蛋白质生物合成、蛋白质的寻靶、蛋白质的转运等作为推动力提供自由能;
UTP在糖原合成中起活化葡萄糖分子的作用;
CTP在合成磷脂酰胆碱、磷脂酰乙醇胺以及合成纤维素中起推动作用等。(三)其他供能核苷酸第四十九页,共八十五页。ATP作为自由能的贮存分子,其产生和利用处于动态平衡中。一般情况下,ATP在形成后一分钟内就会被利用,故严格说来ATP不是能量的贮存形式,而是传递能量的物质。细胞能量状态的表示方法:能荷(energycharge)。(四)ATP系统的动态平衡第五十页,共八十五页。第六节三羧酸循环又叫柠檬酸循环或Krebs循环。由草酰乙酸和乙酰CoA的乙酰基缩合生成柠檬酸开始,经一系列反应又生成草酰乙酸的循环过程。三羧酸酶循环一周进行两次脱羧反应和四次脱氢反应,1分子的乙酰基被氧化生成2分子CO2、3分子的NADH+H+、1分子的FADH2和1分子的GTP。三羧酸循环是由德国科学家HansKrebs于1937年提出,生物化学领域的重大成就(当时还没有同位素示踪法)。Krebs于1953年获得诺贝尔奖。第五十一页,共八十五页。一、反应历程分为3个阶段,共8步反应:a-酮戊二酸草酰乙酸柠檬酸异柠檬酸琥珀酸辅酶A琥珀酸延胡索酸苹果酸乙酰辅酶A1.柠檬酸合成酶2.顺乌头酸酶3.异柠檬酸脱氢酶4.-酮戊二酸脱氢酶5.琥珀酸硫激酶6.琥珀酸脱氢酶7.延胡索酸酶8.苹果酸脱氢酶第五十二页,共八十五页。H2O草酰乙酸
OCH3-C-SCoACoASHH2O柠檬酸合成酶顺乌头酸酶1.柠檬酸生成阶段顺乌头酸酶第一步反应不可逆,柠檬酸合成酶是三羧酸循环的第一个限速酶。重要抑制剂:氟乙酸(机理:柠檬酸合成酶催化氟乙酰CoA与草酰乙酸发生缩合作用生成氟柠檬酸,阻碍TCA循环)。应用:有毒植物叶子中含有氟乙酸;杀虫剂;灭鼠药。第五十三页,共八十五页。2.氧化脱羧阶段CO2NAD+
NADH+H+
异柠檬酸脱氢酶NAD+
NADH+H+CO2-酮戊二酸脱氢酶GDP+PiGTPCoASH琥珀酸硫激酶
异柠檬酸脱氢酶具有脱氢和脱羧两种功能,脱羧反应需要Mn2+;ADP是激活剂;ATP和NADH是抑制剂。是TCA循环的又一个限速酶,此步反应为一分界点,之前为三羧酸转化,之后为二羧酸变化。
三羧酸循环中唯一一次底物水平磷酸化。GTP可直接利用,也可在二磷酸核苷激酶催化下,将高能磷酸键转移给ADP,从而生成ATP。α-酮戊二酸脱氢酶系特性:1)包含三种酶(α-酮戊二酸脱羧酶、硫辛酸琥珀酰转移酶和二氢硫辛酸脱氢酶)和六种辅助因子(TPP、硫辛酸、CoASH、FAD、NAD+、Mg2+)。2)限速酶:受ATP、NADH和琥珀酰辅酶A的抑制。第五十四页,共八十五页。3.草酰乙酸再生阶段草酰乙酸FADFADH2琥珀酸脱氢酶H2O延胡索酸酶NAD+NADH+H+苹果酸脱氢酶可进入下一个循环第五十五页,共八十五页。二、三羧循环的化学计量和能量计量1.总反应式:
CH3COSCoA+3NAD++FAD+GDP+Pi+2H2O2CO2+CoASH+3NADH+3H+
+FADH2+GTP能量“现金”:1GTP
能量“支票”:3NADH
1FADH2兑换率1:39ATP兑换率1:22ATP1ATP12ATP2.三羧酸循环的能量计量第五十六页,共八十五页。是有机体获得生命活动所需能量的主要途径;是糖、脂、蛋白质等物质代谢和转化的中心枢纽;形成多种重要的中间产物。三、三羧循环的生物学意义第五十七页,共八十五页。第七节呼吸链与氧化磷酸化一、呼吸链1.概念及位置呼吸链又叫电子传递体系或电子传递链,它是代谢物上的氢原子被脱氢酶激活脱落后,经过一系列的传递体,最后传递给被激活的氧原子,而生成水的全部体系。在真核生物细胞内,它位于线粒体内膜上,原核生物中,它位于细胞膜上。线粒体第五十八页,共八十五页。2.呼吸链的组成NADH辅酶Q(CoQ)Fe-SCytc1O2CytbCytcCytaa3琥珀酸等黄素蛋白(FAD)黄素蛋白(FMN)细胞色素类铁硫蛋白(Fe-S)铁硫蛋白(Fe-S)NADH(还原型辅酶)黄素蛋白酶类(flavoproteins,FP)铁-硫蛋白类(iron—sulfurproteins)辅酶Q(ubiquinone,亦写作CoQ)细胞色素类(简写作Cyt)第五十九页,共八十五页。(1)NADH:还原型辅酶它是由NAD+接受多种代谢产物脱氢得到的产物。NADH所携带的高能电子是线粒体呼吸链主要电子供体之一。第六十页,共八十五页。(2)黄素蛋白酶类以FAD或FMN为辅基,酶蛋白为膜的组成蛋白,递氢机理:FAD(FMN)+2HFAD(FMN)H2如NADH脱氢酶、琥珀酸脱氢酶第六十一页,共八十五页。(3)铁-硫蛋白类含铁硫络合物的蛋白,又称非血红铁蛋白。通过铁的价态变化而传递电子。第六十二页,共八十五页。(4)辅酶Q是电子传递链上唯一的非蛋白组分,是脂溶性小分子化合物。位于膜双脂层中,能在膜脂中自由泳动。第六十三页,共八十五页。(5)细胞色素类是含铁的电子传递体,辅基为铁卟啉的衍生物,铁原子处于卟啉环的中心,构成血红素。各种细胞色素的辅基结构略有不同。线粒体呼吸链中主要含有细胞色素a,a3、b,c和c1等。cytb和cytc1、cytc在呼吸链中的中为电子传递体,a和a3以复合物物存在,称细胞色素氧化酶,其分子中除含Fe外还含有Cu,可将电子传递给氧,因此亦称其为末端氧化酶。Cytc和c1细胞色素氧化酶传递电子机理:
+e+eFe3+Fe2+Cu2+Cu+-e-e
第六十四页,共八十五页。3.电子传递链的顺序及其抑制剂H2O12O2O2-MH2还原型代谢底物FMNFMNH2CoQH2CoQNAD+NADH+H+2Fe2+2Fe3+
细胞色素b-c-c1-aa3
FeS2H+M氧化型代谢底物FADH2呼吸链电子传递和水的生成2eH2OFADFADH2琥珀酸
FeS2Fe2+2Fe3+
细胞色素b-c1-c-aa3CoQH2CoQ12O2O2-2H+延胡索酸2eNADH呼吸链电子传递和水的生成第六十五页,共八十五页。111111电子传递链的抑制剂第六十六页,共八十五页。二、氧化磷酸化作用1.氧化磷酸化的概念2.磷氧比(P/O)的概念3.电子传递链中生成ATP的部位4.氧化磷酸化的偶联机理5.氧化磷酸化的解偶联和抑制第六十七页,共八十五页。1.氧化磷酸化
代谢物在生物氧化过程中释放出的自由能用于合成ATP,即ADP+Pi→ATP)这种氧化放能和ATP生成(磷酸化)相偶联的过程称氧化磷酸化。类别有底物水平磷酸化、电子传递水平磷酸化。ADP+PiATP+H2O生物氧化过程中释放出的自由能第六十八页,共八十五页。底物水平磷酸化是在被氧化的底物上发生磷酸化作用。即底物被氧化的过程中,形成了某些高能磷酸化合物的中间产物,通过酶的作用可使ADP生成ATP。电子传递体系磷酸化是指当电子从NADH或FADH2经过电子传递体系(呼吸链)传递给氧形成水时,同时伴有ADP磷酸化为ATP的全过程。通常所说的氧化磷酸化是指电子传递体系磷酸化。电子传递体系磷酸化第六十九页,共八十五页。2.磷氧比(P/O)呼吸过程中无机磷酸(Pi)消耗量和分子氧(O2)消耗量的比值称为磷氧比。由于在氧化磷酸化过程中,每传递一对电子消耗一个氧原子,而每生成一分子ATP消耗一分子Pi,因此P/O的数值相当于一对电子经呼吸链传递至分子氧所产生的ATP分子数。NADHFADH2O212H2OH2O例实测得NADH呼吸链:P/O~3ADP+PiATP实测得FADH2呼吸链:P/O~2O2122e-2e-ADP+PiATPADP+PiATPADP+PiATPADP+PiATP第七十页,共八十五页。3.电子传递链中生成ATP的部位(1)电子传递链的顺序电子传递链中各组分的顺序由还原电位。决定电子传递方向:(还原电位)低高第七十一页,共八十五页。半反应ΔE0’(V)2H++2eH2-0.41NAD++2H++2eNADH+H+
-0.32FMN+2H++2eFMNH2-0.30FAD+2H++2eFADH2-0.06CoQ+2H++2eCoQH20.04(或0.10)Cytb(Fe3+)+eCytb(Fe2+)0.07Cytc1(Fe3+)+eCytc1(Fe2+)0.23Cytc(Fe3+)+eCytc(Fe2+)0.25Cyta(Fe3+)+eCyta(Fe2+)0.29Cyta3(Fe3+)+eCyta3(Fe2+)0.55O2+2H++2eH2O0.82电子传递链各组分的标准氧化还原电位第七十二页,共八十五页。
ΔG0’=-nFΔE0’合成ATP需自由能51.6KJ/mol,经计算可以得知,NADP呼吸链上有三个部位可以满足这个条件,FADH2呼吸链上有两个部位可以满足。(2)ATP产生的部位NADHCoQ:ΔG0’=-2×96.5×0.33=-63.7KJ/molCocCytc1:ΔG0’=
-2×96.5×0.31=-59.8KJ/molCyta3O2:ΔG0’=
-2×96.5×0.58=-111.9KJ/mol第七十三页,共八十五页。4.氧化磷酸化的偶联机理(1)能量偶联假说
1953年EdwardSlater
化学偶联假说
1964年PaulBoyer构象偶联假说1961年PeterMitchell化学渗透假说1978年获诺贝尔化学奖(2)ATP合成的机制第七十四页,共八十五页。化学渗透假说
(chemiosmotichypothasis)
电子传递的自由能驱动H+从线粒体基质跨过内膜进入到膜间隙,从而形成H+跨线粒体内膜的电化学梯度,这个梯度的电化学势(ΔH+)驱动ATP的合成。内膜F0F1ATP酶e-ADP+Pi底物H+ATPH+H+H+基质膜间隙电子传递链第七十五页,共八十五页。化学渗透假说原理示意图4H+2H+2H+4H+NADH+H+2H+2H+2H+
ADP+PiATP高质子浓度H2O2e-__________质子流线粒体内膜磷酸化
氧化
+++++++++第七十六页,共八十五页。H2O2H+CytcCytcCytcQFMNFeSFeSCytc1CytbKCytbrCytaFeSCyta32e-
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