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文档简介
生存分析
张俊辉
2011.11.22
生存分析中的几个基本概念“死亡”事件——失败事件(failureevent)生存时间(survivaltime):完全数据、截尾数据、截尾死亡概率(mortalityprobability)
生存概率(survivalprobability)生存率(survivalrate)中位生存时间(mediansurvivaltime)
(一)死亡事件(deathevent)
又称失效事件(failureevent)或终点事件。死亡事件是一个广义的概念,不单是指通常意义下的生物体死亡,而是泛指标志某种处理措施失败或失效的特征事件。(二)生存时间(survivaltime):指观察到的存活时间。生存时间是一个广义概念,不单是指通常意义下生物体的存活时间,而是泛指研究者所关心的某现象的持续时间。生存时间的两种类型完全数据(completedata):指从观察起点到发生死亡事件所经历的时间。截尾数据(censoreddata):简称截尾值(censoredvalue),又称删失值或终检值。生存时间观察过程的截止不是由于死亡事件,而是由于其他原因引起的,称为截尾(censored)。截尾的原因包括失访、退出和终止。截尾数据指从观察起点到截尾所经历的时间。死亡概率:指在某单位时段开始时存活的个体在该时段内死亡的可能性大小。生存概率
:指某单位时段开始时存活的个体到该时段结束时仍存活的可能性大小。生存率:指观察对象活过tk时刻的概率。生存率也是一个广义概念,研究者定义的死亡事件不同,其含义也不同,可以是缓解率或有效率。中位生存时间又称半数生存期,是指生存率为0.5时对应的生存时间,表示有50%的观察对象可活这么长时间。主要内容1.未分组资料数据的生存分析
(Kaplan-Meier过程)2.分组资料数据的生存分析
(LifeTables过程)3.生存曲线的比较
(log-rankTest)未分组资料的生存分析特点:每个观察个体都有一个生存时间例15.1某医师采用手术疗法治疗12例宫颈癌患者,随访时间(月)记录如下:1,2,4,5,7,8+,11,15,18,33+,36,38+。试估计各时点生存率及其标准误、各时点总体生存率的95%置信区间、中位生存时间,并绘制生存曲线。
未分组资料的生存分析乘积极限法——由Kaplan-Meier于1958年首先提出,又称Kaplan-Meier法(简记为KM法)
SPSS操作步骤:设置两个变量:生存时间(time)
结局(status):死亡=1,截尾=0SPSS操作步骤:AnalyzeSurvivalKaplan-MeierTime框选入时间变量timeStatus框选入结局变量statusDefineEvent(定义死亡事件的取值)按钮Singlevalue框输入1
ContinueOptions按钮勾选Survivaltables(生存分析表)默认
Meanandmediansurvival(均数和中位数)默认
Survival(生存曲线图)
ContinueOK结果解释生存曲线表平均生存时间(mean)和中位生存时间(median)生存曲线分组资料的生存分析例15.2某医师对110例原发性肺癌患者确诊后进行随访,得资料见表15.3第(2)栏~第(4)栏,试估计各时点生存率及其标准误、各时点总体生存率的95%置信区间、中位生存时间,并绘制生存曲线。寿命表法SPSS操作步骤设置3个变量:时间time(采用组段的下限)
结局status(死亡=1,截尾=0)
频数fSPSS操作步骤指定频数变量fDataWeightCases
选中WeightcasesbyFrequencyvariable框:选入fSPSS操作步骤AnalyzeSurvivalLifeTablesTime框:选入时间变量timeDisplayTimeIntervals框:输入10by1Status框:选入结局变量statusDefineEvent按钮:SingleValue框输入1ContinueOptions按钮勾选Lifetables、SurvivalContinueOK
结果解释此为SPSS作的分组资料的生存率曲线,为阶梯型曲线。
注意:分组资料绘制的生存曲线应该是折线连接,因为估计的是时段右点的生存率。因此需要对该曲线进行编辑。通过点击右键进行编辑:
Charteditor→elements(format)→InterpolationLine
并删掉短线,可得到折线形生存率曲线如下图:对数秩检验例15.3某临床医生将22例肺癌患者随机分成两组,分别采用化疗和放化疗联合治疗,从缓解出院日开始随访,随访时间(月)如下,试比较化疗和放化疗联合治疗的疗效是否有差别。化疗组1,2,3,5,6,9+,11,13,16,26,37+放化疗联合组10,11+,14,18,22,22,26,32,38,40+,42+SPSS操作步骤设置3个变量:时间time
结局status(死亡=1,截尾=0)
组别groupSPSS操作步骤:AnalyzeSurvivalKaplan-MeierTime框选入时间变量timeStatus框选入结局变量statusDefineEvent按钮Singlevalue框输入1
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