转录调控考核试题及答案

转录调控考核试题一、选择题1.小麦做转录组通常建议测序数据量为[单选题]*4G6G8G10G√2.水稻叶片做转录组建议最少测多少数据量[单选题]*10Ｘ6G√20X10G30X12G3.转录组测序差异表达基因通路富集分析数据库[多选题]*GO√NRPfamSwissportKEGG√4.转录组测序单个样本RNA总量最低要求[单选题]*0.5ug√1ug1.5ug2ug答案解析：农学样本1ug、医学样本0.5ug5.无参转录组序列拼接软件[单选题]*ClusterVelvetTrinity√Blast6.RNA产品研究的种类包括哪些[多选题]*mRNA√LncRNA√rRNAtRNAcircRNA√sRNA√7.以下哪个方向可以通过百迈客转录组进行研究[多选题]*发育调控√环境适应√基因定位变异位点查找基因组注释√8.以下关于生物学重复说法正确的是[单选题]*对同一个样本检测三次对同一个样本取样三次对三个样本取样三次√对三个样本取样一次，再检测三次9.动物个体样本做转录组，建议生物学重复为[单选题]*135√71010.转录组可以同时测到mRNA、lncRNA、circRNA的建库方式是[单选题]*去rRNA，非链特异性建库sRNA建库普通转录组建库去rRNA，链特异性建库√11.影响有参转录组比对效率的因素的是[多选题]*基因组组装质量√测序质量√数据污染√测序物种与参考基因组亲缘关系√12.有参转录比对效率低于（）时，建议更换基因组或改做无参[单选题]*50.00%60.00%70.00%√80.00%90.00%13.所研究物种有参考基因组时，必须按找有参进行分析。[单选题]*正确错误√14.做完转录组一定要进行Q-PCR验证，一般选择验证多少个差异基因[单选题]*0~55~1015~25√30~5060起15.Q-PCR与有参转录组分析结果的吻合度因在（）以上为宜[单选题]*40.00%50.00%60.00%√70.00%80.00%16.Q-PCR与转录组分析结果吻合度较低，可能的原因有[多选题]*实验所用样本弄混√没有使用转录组同一批样本进行Q-PCR验证√验证的差异基因表达量较低√验证的差异基因差异不显著√计算方法不对√17.以下属于转录组高级分析的是[多选题]*可变剪切分析WGCNA分析√GO富集分析K均值聚类分析√KEGG富集分析18.以下关于Unigene和转录本的区别说法正确的是[多选题]*Unigene是triniy组装的转录本√Unigene是组装得到的该基因的最长转录本√Unigene是转录本的子集√转录本是Unigene的一部分转录本就是Unigene19.转录组差异分析的筛选标准默认为[单选题]*FoldChange≥2且FDR＜0.01√FoldChange≥2或FDR＜0.01FoldChange≥1且FDR＜0.01FoldChange≥1且FDR＜0.05FoldChange≥2且FDR＜0.0520.转录组差异分析的默认的筛选标准为FoldChange≥2且FDR＜0.01，此参数不可改变。[单选题]*正确错误√21.转录组差异分析的默认的筛选标准为FoldChange≥2且FDR＜0.01，以下哪种方式可以实现快速修改。[单选题]*反馈给售后技术支持指导客户在云上分析√反馈给运营经理修改反馈给大区经理修改22.转录组差异分析时按FoldChange≥2且FDR＜0.01的标准进行筛选，发新差异基因较少，应该调整的参数是？[多选题]*FDR调小FDR调大√FoldChange调大FoldChange调小√23.转录组差异分析时FDR不建议选（）以上[单选题]*0.010.05√0.10.51224.转录组差异分析时FoldChange建议选（）以上[单选题]*11.52√2.53425.以下不属于无参转录组Unigene注释的数据库的是[单选题]*GOKEGGNRSWISS-PROTNCBI√COG答案解析：对的26.整合了基因组、化学和系统功能信息的数据库，旨在揭示生命现象的遗传与化学蓝图的数据库是[单选题]*GOKEGG√NRSWISS-PROTTrEMBL27.经过注释的蛋白质序列数据库，数据库中的蛋白质功能经过了实验验证，注释是精确的；[单选题]*GOKEGGNRSWISS-PROT√TrEMBL28.注释信息最全面，注释基因最多的数据库[单选题]*GOKEGGNR√SWISS-PROTTrEMBL29.circRNA对mRNA直接调控作用（）[单选题]*正调控负调控正负调控√不调控30.全转录组测序技术适用条件[多选题]*有参考基因组√发高分文章√发多篇文章√关注RNA之间调控关系√31.全转录组我们最多推荐构建几种文库（）[单选题]*12√345答案解析：链特异性、链非特异性32.miRNA对靶基因调控作用（）[多选题]*植物内，碱基完全互补匹配，降解mRNA表达√动物内，部分碱基互补匹配，抑制mRNA表达√正调控负调控不调控33.去除rRNA的建库方式可以检测的RNA有（）[多选题]*circRNA√miRNAmRNA√lncRNA√rRNA34.lncRNA适用的物种[单选题]*有参考基因组的物种√无参考基因组的物种有参无参均可有转录组信息的物种以上均是35.以下哪些属于lncRNA特征[多选题]*长度大于200nt的非编码RNA√高度保守性具有组织特异性以及时空特性√呈封闭环状结构36.转录组组织样本收集方法正确的是[多选题]*采样后-20℃保存采样后液氮速冻4h，转入-20℃保存采样后液氮速冻4h，转入-80℃保存√采样后-80℃保存采样后液氮长期保存√37.下列属于PB全长转录组和普通转录组的区别的是[多选题]*全长转录组可获得全长转录本√可以更准确的分析融合基因、APA分析及AS分析√基于转录本水平进行定量，寻找差异转录本，分析更精细不需要跑Race扩全长，可以直接进行功能方面的验证√38.下列属于ONT全长转录组和普通转录组的区别的是[多选题]*全长转录组可获得全长转录本√可以更准确的分析融合基因、APA分析及AS分析√基于转录本水平进行定量，寻找差异转录本，分析更精细不需要跑Race扩全长，可以直接进行功能方面的验证√39.以下关于转录调控联合分析的意义正确的是[多选题]*实验设计多元化√系统性和延续性更强√文章的分析内容丰富√更有利于发高分文章√更有利于调控机制的挖掘√40.筛选差异表达circRNA的常规参数为|log2（FC）|___[单选题]*≥1√≥2≥0≥441.筛选差异表达circRNA的常规参数为FDR___[单选题]*≤0.001≤0.01√≤0.05≤0.142.筛选差异表达mRNA的常规参数为|log2（FC）|___[单选题]*≥1√≥2≥0≥443.筛选差异表达mRNA的常规参数为FDR___[单选题]*≤0.001≤0.01√≤0.05≤0.144.小RNA测序，一般推荐的数据量是（）[单选题]*10M√20M5M30M45.环状RNA最主要且研究较多的作用机制是（）[单选题]*竞争性结合miRNA√直接作用于mRNA，抑制其翻译调控蛋白质功能直接作用于lncRNA,影响其可变剪接46.植物全转录组常规的RIN值要求为（）[单选题]*≥7.5√≥8≥7≤7≤347.植物sRNA测序常规的RIN值要求为（）[单选题]*≥7.5√≥8≥7≤7≤348.植物mRNA测序常规的RIN值要求为（）[单选题]*≥7.5≥8≥7≥6≥6.5√49.获取最全lncRNA信息的文库构建的方式（）[单选题]*去rRNA并链特异建库√调取polyA建库去rRNA非链特异建库线性RNA消化处理建库50.普通转录组的文库构建的方式（）[单选题]*去rRNA并链特异建库调取polyA建库√去rRNA非链特异建库线性RNA消化处理建库51.只检测circRNA文库构建的方式（）[单选题]*去rRNA并链特异建库调取polyA建库去rRNA非链特异建库线性RNA消化处理建库√52.ONT全长客户关注低丰度Isoform，推荐数据量（）[单选题]*4G6G10G12G√答案解析：低丰度要提高测序量。53.可进行混样测序的是（）[单选题]*PB全长ONT全长都可以√答案解析：都可以混样测序54.circRNA去除rRNA的建库方式一般测序数据量是（）[单选题]*植物≥6G，动物≥8G植物≥8G，动物≥6G植物≥12G，动物≥16G√植物≥16G，动物≥12G55.miRNA在哪一层面发挥调控作用[单选题]*转录水平转录后水平√蛋白互作水平表观水平56.在百迈客云有参转录分析平台的个性化分析基因挖掘中，搜索类型除了功能关键词和基因序列，还有（）[单选题]*SNP位点基因ID√数据库ID基因位置答案解析：可以通过基因id检索57.百迈客云平台主要的功能模块有（）[多选题]*分析平台√工具√数据库√文章√学术圈√视频√58.以下研究哪些可以应用转录组测序（）[多选题]*不同花色风信子研究√小鼠胚胎发育研究√水稻的耐低温研究√病毒侵染烟草研究√答案解析：转录水平上有差异的皆可研究59.以下哪些情况不适合lncRNA测序（）[多选题]*有参考基因组的物种无参考基因组的物种√有转录组信息的物种√有全长转录组信息的物种√答案解析：lnc只适用于有参物种60.全长转录组可以做的分析？（）[多选题]*可变剪切√融合基因√基因家族√非编码RNA√61.全长转录组平台有（）[多选题]*illluminaNovseq6000PromethION√IyrsRSII√62.ONT通量最大平台是哪一个（）[单选题]*PromethION√GridIONMinIONFlongle63.Nanopore数据信号识别模式（）[单选题]*电信号√荧光信号答案解析：ONT是电信号识别进行测序64.Nanopore测序特点？（）[多选题]*长度长√碱基修饰信息√DNA/RNA直接测序√实时可分析√65.ONT全长转录组平台RNA建库方式（）？[单选题]*PCR-cDNAdirectcDNAPCR-RNA√direcRNA66.Pacbio全长转录组滚环多少次以上被认为是CCS（）？[单选题]*1次2次3次√4次答案解析：矫正圈数3次以上被识别为CCS序列67.无参转录组获取基因的方式（）?[单选题]*基因组GFF文件Trinity组装得到Unigene√答案解析：无参转录组只有组装得到Unigene才能得到基因信息68.NanoporeR9芯片一次读取多少个碱基的信号？[单选题]*65√4369.Nanopore单碱基准确性是多少？转录组数据校正后准确性是多少？[多选题]*85.00%√99.00%99.90%√99.99%70.百迈客ONT全长转录组平台有哪些（）？[多选题]*MinON√GridionX5√PromethION√SequelII71.百迈客PB全长转录组平台有哪些（）？[多选题]*Sequel√PromethIONRSIISequelII√72.miRNA特点（）?[多选题]*长度约20-24nt√组织特异性√阶段特异性√73.ONT-RNA送样质量要求（）?[多选题]*1.8<OD260/280<2.0√1.8<OD260/230<2.02.0<OD260/230<2.2√1.8<OD260/230<2.074.全转录组应用方向（）？[多选题]*生长发育√环境适应√免疫互作√突变表型√75.circRNA主流作用机制（）？[多选题]*作为miRNA海绵吸附√与蛋白结合√自身翻译蛋白√76.下列哪个技术在百迈客可以做病毒鉴定（）？[单选题]*sRNA√lncRNAcircRNAmRNA77.Nanopore全长转录组，如果客户关注可变剪接，你应该推荐至少多少数据量？[单选题]*2G4G6G√78.Nanopore全长转录组产品的优势在哪里？[多选题]*可在转录本水平进行准确定量√可进行结构方面的分析，例如可变剪接分析、APA分析、融合基因分析√可同时对lncRNA进行定量√Direct-RNA建库方式可以同时进行转录本的定量和RNA甲基化修饰分析√79.下列对Nanopore全长转录组产品可以在转录本水平进行准确定量，而Illumina测序不行的理解正确的是？[多选题]*二代RNA-seq测序读长最多只有150bp,当Read正好比对到转录本共享的exon区域时，便无法区分Read的来源转录本。√三代测序无需拼接准确获取一个基因的多种全长转录本表达信息。√二代RNA-seq在识别复杂转录本isoform方面存在固有限制，需要对短reads进行拼接并利用生物信息学手段对其进行分析，可能会存在拼接错误或者是拼接不完整，不能准确鉴定复杂转录本,更不用谈定量。√低丰度转录本由于其表达丰度低，二代测序的短reads极少测到该转录本特异性reads，最终出现该低丰度转录本假阴性结果，表达丰度低并不一定没有作用，而三代测序只要测到一条合格reads即可证明其存在，并对其结构进行准确分析。√80.以下哪些是PB全长转录组的应用方向（）？[多选题]*基因结构√完善基因组注释√辅助后续研究√结合二代进行基因定量√81.以下哪些是miRNA的作用机制（）？[多选题]*翻译抑制√mRNA的降解√靶向负调控mRNA√靶向负调控其他非编码RNA√82.lncRNA长度是大于（）nt?[单选题]*100200√30040083.以下哪些是lncRNA的功能（）？[多选题]*转录沉默√转录激活√染色体修饰√核内运输√84.以下哪些是lncRNA的特点（）？[多选题]*保守性低√保守性高具有组织特异性以及时空特性√在细胞内外丰度不同√85.lncRNA的分类（）？[多选题]*反义长链非编码RNA√内含子非编码RNA√基因间区的lncRNA√正义长链非编码RNA√86.以下是circRNA特点是（）？[多选题]*没有线性RNA稳定对核酸酶不敏感√呈封闭环状√不易降解√87.以下哪些是全长转录组的优势（）？[多选题]*短平快：材料的获取和试验的实施较容易进行，基本不需要进行分子实验即可发表文章，因此从测序分析到文章发表周期短；√性价比高：所测即所得，无需Race实验扩全长，节约大量经费、时间；无参物种获得全长转录本序列，可作为后续转录组项目的参考序列；√基因结构研究利器：可准确鉴定可变剪接、可变多聚腺苷酸化、融合基因和基因家族等；√研究热点：随着测序平台和分析技术的成熟，越来越多的研究采用三代全长转录组阐释科学问题，三代全长转录组已然成为热点研究对象。研究物种从模式生物向经济作物、药用植物、水产、动物和昆虫等转移，研究物种更加丰富。√88.二代测序数据质量值Q30的意思是（）[单选题]*碱基错误率1%碱基错误率0.1%√碱基错误率0.01%89.无参转录组序列组装中N50的意思是（）[单选题]*组装转录本的平均长度组装转录本按长度从小到大排序，加到总长度的1/2时的序列长度√组装转录本总长度的1/290.在组装转录本筛选lncRNA时，编码潜能预测的工具和数据库有（）[多选题]*CPC√CNCI√Pfam√CPAT√SWISS-PROT91.BMKlncRNA靶基因预测的方法有（）[多选题]*根据lncRNA与gene的位置关系预测顺式靶基因√通过样本间lncRNA与mRNA的表达量相关性分析方法来预测lncRNA的反式靶基因√在lncRNA靶基因数据库中搜索92.如某老师二代双端测序的数据量要求为6G，以下正确的是（）[单选题]*双端R1，R2数据量各为6G双端R1和R2总数据量为6G√93.二代转录组测序reads比对到参考基因组时，大部分reads应该比对到基因组的哪个区域？[单选题]*intergenticintronexon√5‘UTR3’UTR94.百迈客在二代转录组表达量归一化时使用的量化标准为（）[单选题]*FPKM√RPKMTPMCPM95.GO数据库中对通路的二级功能分类包括（）[多选题]*BP√CC√MF√AR96.关于ORF和CDS正确的是（）[多选题]*CDS是基因中实际翻译出蛋白质序列√ORF是指位于起始密码子和终止密码子之间的核苷酸序列区域。√所有CDS都是ORF√不是所有的ORF都是CDS√97.有参转录组分析中基因结构分析主要包含（）[多选题]*新的可变剪接预测√SNP（InDel）分析√基因结构优化分析√新基因发现√98.有参转录组分析中文库质量评估的内容包括（）[多选题]*mRNA片段化随机性检验√插入片段长度检验√转录组测序数据饱和度检验√99.转录组进行样品的重复性评估时使用的评估指标为（）[单选题]*皮尔逊相关系数√斯皮尔曼相关系数肯德尔相关性系数100.转录组中构建蛋白互作网络的数据库是（）[单选题]*NRSWISS-PROTTrEMBLSTRING√101.无参转录组进行reads组装方式正确的是（）[单选题]*同物种的测序样品合并组装√各样品分别组装生物学重复样品合并组装102.百迈客在miRNA表达量归一化时使用的量化标准为（）[单选题]*FPKMRPKMTPM√CPM103.WGCNA分析在云平台上要求样本数要大于多少？[单选题]*3个4个5个√6个104.转录组差异分析时有生物学重复样品和没有生物学重复样品的差异分析软件分别是（）[单选题]*DEseq2、EBseq√EBseq、DEseq2105.在callSNP时，人类全基因组的ti（转换）/tv（颠换）ratio约为（）[单选题]*3左右0.5-12.0-2.2√106.样品的测序深度计算方式为（）[单选题]*reads数/参考基因组大小碱基数/参考基因组大小√107.老师想要比对结果可视化，一般推荐的软件为（）[单选题]*ucscgenomebrowsersamtoolsIGV√108.cleandata是rawdata经过哪些过滤步骤得到的？[多选题]*去除含有接头的Reads√去除质量值Q≤10的碱基数占整条Read的50%以上的Reads√去除N的比例大于10%的Reads√109.miRNA进行靶基因预测时，植物和动物分别用的软件为（）[单选题]*miRanda、TargetFinderTargetFinder、miRanda√110.转录组的文库构建流程顺序为（）[多选题]*连接接头√样品检测√PCR富集√mRNA富集、反转录√末端修复、3'加A√文库质控、上机检测√111.转录组表达量数据格式为（）？[单选题]*FPKM√TPMCPMCounts112.转录组计算差异基因用的表达量数据格式为（）？[单选题]*FPKMTPMCPMCounts√113.转录组进行WGCNA分析时样本数和样本重复要求是什么（）?[单选题]*不少于5个样本，每个样本不少于3个生物学重复√不少于3个样本，每个样本不少于5个生物学重复不少于5个样本，每个样本不少于5个生物学重复不少于3个样本，每个样本不少于3个生物学虫谷114.有参转录组的建库类型（）？[单选题]*第一条链特异性建库第二条链特异性建库非链特异性√去线性链特异性建库115.全长转录组RNA总量为（）?[单选题]*3ug√20ug30ug40ug116.获取最全lncRNA信息的文库构建的方式（）?[单选题]*去rRNA并链特异建库√调取polyA建库去rRNA非链特异建库117.ceRNA是指团结在以（）为核心的RNA调控网络周围？[单选题]*mRNAmiRNA√lncRNAcircRNA118.以下哪些物种适合做全转录组（）？[多选题]*有参考基因组物种√无参考基因组物种普通二代转录组研究的比较多，对基因功能比较清楚√研究非编码RNA与基因的转录调控关系√119.以下哪些是对全转录组的客户定位（）？[多选题]*经费相对比较充足√有二代转录组研究基础或一定的了解√关注非编码RNA与基因的转录调控关系√希望发表5分以上的文章√120.以下哪些是Pacbio全长转录组的关键技术（）？[多选题]*ZMW孔√DNA聚合酶和荧光标记dNTP√全长cDNA合成√BluePippin筛选目的片段√121.病毒样本在百迈客可以做哪个产品（）?[单选题]*lncRNAsRNA√circRNAmRNA122.sRNA有哪些类型（）？[多选题]*microRNA√piRNA√NatRNA√phasiRNA√123.二代测序相比较三代测序来说有哪些劣势（）？[多选题]*无法获得基因全长√多倍体或杂合物种（无参）转录本拼接错误率高√无参转录组的定量准确性偏低√无法准确检测可变剪接位点√无法准确检测融合基因√124.全长转录组在给客户推荐数据量的时候应该考虑哪些（）？[多选题]*基因组大小√是否为多倍体√是否关注低丰度转录本定量√是否关注结构方面的研究√125.Pacbio全长转录组数据下机之后分析中如何获取全长（）？[多选题]*生成CCS序列并polish√全长序列的识别√isoform水平聚类得到一致性序列√126.Pacbio全长转录组下机数据是（）格式？[单选题]*fastqfast5bam√fasta127.下列哪些软件可用于lncRNA的预测（）？[单选题]*CPCCNCICPATpfam以上都是√128.Nanopore全长转录组下机数据且用于后续分析是（）格式？[单选题]*fastq√fast5bamfasta129.利用Asprofile进行可变剪切分析时,需要对组装得到的gtf文件先进行处理后再分析,处理gtf用到的工具是（）？[单选题]*cufflinksuffcomparecuffmerge√cuffquant130.Nanopore全长转录组在计算差异基因时利用的表达量数据类型是（）？[单选题]*FPKMCPMCounts√TPM131.PB2+3利用二代辅助定量计算差异基因时利用的表达量数据类型是（）？[单选题]*Counts√FPKMCPMTPM132.Nanopore全长转录组基因表达量数据格式为（）？[单选题]*FPKMCPM√CountsTPM133.如何判断一条序列是全长序列（）？[单选题]*有5'端测序引物有3‘端测序引物有5‘、3’端测序引物有5‘、3’端测序引物和polyA尾巴√134.全长转录组分析中如何保证转录本准确性（）？[多选题]*通过一致性序列CCSreads保证数据一定准确性√全长转录本分类后的聚类√通过非全长转录本对全长转录本进行进一步校正√如果有二代转录组数据，可以进一步对全长转录组数据进行校正√135.下列关于全长转录组进行混样测序时说法正确的是[单选题]*建议混样不超过6个√建议混样越多越好不能混样136.如果老师特别关注可变剪切，需要多少数据量合适[单选题]*2G4G6G√137.Pacbio可以做到定量[单选题]*正确错误√答案解析：PB不能定量，零模波导孔的利用率不是100%，历史测了很多次，准确率提高了，但是数据量不是饱和的，所以不能定量138.我们公司有多台三代仪器，包括ONT和Pacbio[单选题]*正确√错误139.有参转录组分析审核报告时要求最低的比对效率是多少[单选题]*50.00%65.00%√70.00%85.00%答案解析：合同无要求，报告交付要求65%140.跟客户探讨样品准备的时候需要注意的是[多选题]*时间点√组织部位√处理方法√物种基因组情况√141.二代转录组的测序方案是什么[单选题]*SE50PE250PE150√PE300142.二代转录组建库打断的片段大小为多少[单选题]*350bp150bp450bp270bp√143.对于谈二代转录组项目遇到价格竞争怎么办[多选题]*推次账号来竞争√拼价格获取总样品数申请去申请价格√了解客户经费情况√144.目前，百迈客可以做代谢与哪些产品的联合分析[多选题]*转录组√GWAS蛋白组√微生物多样性√145.差异倍数log2FC>1代表FC大于几及差异倍数为几[单选题]*12√34146.数据质控时，保证Q30达到多少？[单选题]*0.750.80.85√0.9147.客户手里的材料表型很明显，但材料是杂合的，并不影响客户做转录组的结果[单选题]*对√错148.云平台上的“与转录组联合分析”只能用在百迈客测的数据进行免费联合分析[单选题]*对√错149.全长转录组有几种测序平台[多选题]*PacBio√IlluminaNanopore√BGI150.Nanopore的碱基判读是依据什么产生？[单选题]*电流信号√荧光信号151.Nanopore测序有什么优势？[多选题]*无需扩增，无碱基偏好性√可以定量√低丰度转录本可以被检测到√鉴定到的全长转录本多√152.PacBio全长转录组报告可否上云？[单选题]*可以√不可以答案解析：目前报告与结果数据已经可以推云，只是没有对应个性化分析153.pb全长转录组为什么要同时做二代录组[单选题]*没办法定量√二代用来纠错三代数据二代转录组更加准确154.pb全长转录组是否是HIFI模式[单选题]*是√不是155.pb全长转录组单cell可以产出多少数据？（下机数据）[单选题]*100G200G300G√400G156.PB全长转录组单cell可以大概得到多少CCS[单选题]*1-2G√20G左右50G200G157.PB全长转录组包cell一个cell可以测几个样本？（每个样本测60G数据量）[单选题]*2345√158.ONT全长转录组能检测到的可变剪接有几种？[单选题]*575或7√159.PB和ONT全长转录组哪个能做到转录本准确定量呢？[单选题]*PBONT√PB和ONTillumina160.如果老师研究物种没有参考基因组，优先推荐做哪种转录组？[单选题]*PB2+3√PBONT161.二代转录组目前主流的建库测序的文库是什么？[单选题]*PE100PE150√PE250SE50答案解析：二代双端测序，PE150文库162.二代转录组如果老师研究的基因表达丰度很低，一般推荐数据量多少？[单选题]*4G6G8G10G√答案解析：转录组通常6G，但是基因丰度比较低的话，建议推荐测10G163.老师觉得转录组的整体结果里面差异基因比较少，想多找一些差异基因，下面哪些调整参数是正确的？[多选题]*增加FC值减少FC值√FDR值改为0.01FDR值改为0.05√164.百迈客ONT全长转录组的建库方式是？[单选题]*directcDNAPCRRNA.PCRcDNA√directRNA165.ONT说的cleandata是一致性序列去冗余之后的吗[单选题]*是不是√答案解析：不是，cleandata就是原始数据去除了接头序列，polyA等信息166.分析数据的时候，可变剪切结果是否也要结合表达数据[单选题]*是√不是答案解析：可变剪切是从结构上分析基因的一个变化情况，表达量是分析不同可变剪切体的具体表达，二者结合去分析，可以将问题分析的更透彻167.对于无参物种做全长转录组，我们首推的是PB2+3，对于有参的物种，怎么推荐平台做全长转录组？[多选题]*若参考基因组质量不好，推荐PB2+3√参考基因组可以用的，老师关注转录本定量，推荐ONT√参考基因组可以用的，老师关注可变剪切，推荐ONT答案解析：关注可变剪切的话，推PB168.PB全长转录组三代也是需要做生物学重复吗？[单选题]*是不是√答案解析：三代做一个混样就可以，作为参考169.ONT目前主推的是6G数据量，是否可以满足？[单选题]*是√不是答案解析：对于大部分中高丰度转录本都可以了170.关于smallRNA测序，以下说法错误的是？[单选题]*先天链特异性单碱基精确切胶PE50测序√不用凑样，快速上机171.关于链特异性建库流程，以下顺序正确的是？1.采用去除rRNA的方式去除rRNA。2.合成第一条cDNA链，然后在合成第二条链时候加入dUTP代替dTTP。3.使用USER酶消化掉第二条链，只保留第一条链。4.3‘端加加A，加接头。5.PCR扩增，Illumina测序。[单选题]*1234512435√1423523145172.全转录组可以得到几种RNA的分析结果？[单选题]*1234√173.全转录组构建哪几种文库？[多选题]*circRNA文库lncRNA文库√mRNA文库sRNA文库√174.全转录组可以获得几份分析报告？[单选题]*1334√175.lncRNA可以预测哪几种靶向关系？[多选题]*lncRNA--mRNA√lncRNA--miRNA√lncRNA--circRNA以上都是176.miRNA可以预测哪几种靶向关系？[单选题]*miRNA--mRNAmiRNA--lncRNAmiRNA--circRNA以上都是√177.circRNA可以预测哪几种靶向关系？[多选题]*circRNA--mRNA√circRNA--miRNA√circRNA--lncRNA以上都是178.去核糖体文库构建circRNA的特点是？[多选题]*可以同时比较circRNA和其它线性RNA分子的特点√鉴定的circRNA更准确circRNA检出的效率更高高峰度circRNA检出效果和去线性文库相当√179.为什么不建议客户选择低丰度表达基因进行PCR验证[单选题]*低表达基因序列不准确低表达基因未测到饱和，定量不准确√以上都是180.全转录组可以构建的调控网络有？[多选题]*ceRNA网络√共表达相关性网络√蛋白互作网络√转录因子调控网络√181.lncRNA预测靶基因的方式有？[单选题]*顺式靶基因预测：上下游100kb范围内反式靶基因预测：序列互补原理以上都是√182.非编码RNA的核酸送样要求总量是多少？[单选题]*1ug√2ug3ug4ug183.非编码RNA在植物中的应用有？[多选题]*调控开花的时间√调节生殖器官的发育√对非生物和生物胁迫的响应√参与组织器官发育调控√184.非编码RNA在动物中的应用有？[多选题]*免疫调节√疾病发生√性别控制√肌肉发育√185.miRNA可以获得哪些miRNA?[单选题]*已知miRNA新miRNA以上都是√186.转录因子相关的分析内容有哪些？[单选题]*转录因子预测转录因子结合位点分析以上都是√187.Pacbio是否可以分析无参考基因组物种？[单选题]*是√不是188.ONT全长转录组是否可以分析无参考基因组物种？[单选题]*是不是√189.ONT全长转录组是否可以结合二代转录组联合分析？[单选题]*是不是√190.小基因组Pacbio推荐的数据量一般为多少G?[单选题]*20G√40G60G80G191.我们公司HI-C互作有哪些优势？[单选题]*拥有独家专利的建库分析流程，高酶切效率可以获取更多的互作位点，分析结果准确可靠拥有丰富的项目经验，不同类型物种及样本处理方式建库成功率高达90%以上有多篇成功案例以上都是√192.HI-C互作是否可以接收冻存样本？[单选题]*是√否193.HI-C互作优先建议客户提供什么类型样本？[单选题]*新鲜样本√冻存样本194.HI-C互作推荐动物的组织样量是多少？[单选题]*1ug2ug√3ug4ug195.HI-C互作推荐的细胞量是多少？[单选题]*10^610^7√10^810^9196.HI-C互作推荐的真菌送样量是多少？[单选题]*1ug√2ug3ug4ug197.HI-C互作推荐的植物送样量是多少？[单选题]*1ug2ug3ug4ug√198.HI-C互作使用的植限制性内切酶是几碱基酶？[单选题]*四碱基酶√五碱基酶六碱基酶199.HI-C互作使用的植限制性内切酶是什么？[单选题]*DpnII√HindⅢ200.HI-C互作可以获得全基因组范围内所有的互作区域？[单选题]*是√否201.HI-C互作可以分析哪些三维结构？[单选题]*A/BcompartmentsTAD分析Loop分析以上都是√202.HI-C互作分析到loop结构最少需要达到多少分辨率？[单选题]*10K√20K30K40K203.HI-C互作分析到loop结构最少需要多少深度？[单选题]*50X100X150X√200X204.HI-C互作的测序平台是？[单选题]*Illumina√PacbioNanopore205.HI-C互作可以和其他哪些组学进行联合分析？[多选题]*ATAC-seq√ONT全长转录组√RNA-seq√qPCR√206.无参物种是否可以做HI-C互作？[单选题]*是否√207.HI-C互作的应用场景有?[多选题]*抗逆胁迫√性别分化√数量品质√种间比较√208.ATAC-Seq数据处理指标中N（%）的标准是多少？[单选题]*≤10≤5√≤15≤2209.ATAC-Seq中的peak结果指标，要求peak数目为多少？[单选题]*≥10000√≥15000≥20000≥5000210.ATAC-Seq中碱基质量Q30标准是？[单选题]*≥85≥80√≥90≥95211.ATAC-Seq一般情况下，推荐数据量是多少？[单选题]*100Mreads150Mreads50Mreads√30Mreads212.ATAC-Seq实验原理是?[单选题]*Tn5酶切√连接酶213.ATAC-Seq主要研究那部分染色质？[单选题]*全部染色质闭合染色质开放染色质√214.ATAC-Seq的是用Illumina平台测序的吗？[单选题]*是√不是215.ATAC-Seq差异Peak分析默认的筛选标准为FoldChange≥1.5且FDR＜0.05[单选题]*是√不是216.百迈客ATAC-Seq的产品的优势有？[多选题]*灵敏性高√有ATAC-seq+转录组联合分析的流程√实验重复性好√217.代谢组能检测到分子量多大的物质[单选题]*500以下1000以下√1500以下2000以下全都能检测218.代谢组检测的仪器平台可以分为哪几类[单选题]*色谱和质谱气相和液相气质和液质√TOF和QQQ219.普通非靶代谢组需要多少个生物学重复[多选题]*临床样本n≥10临床样本n≥30√动物样本n≥6动物样本n≥10√植物和微生物n≥3个植物和微生物n≥6个√220.目前代谢组学技术的局限？[多选题]*对未知物的鉴定√多平台数据整合√检测物种限制√研发出可供查询的标准数据库√代谢组学与其他组学数据的整合√221.普通非靶向代谢组能定性到多少种物质？[单选题]*几百种约1000种√几万种全都能检测222.以下哪些样品可以做代谢组？[多选题]*牛血清√小鼠粪便√重金属处理的水体√四膜虫化石风干的中药材√拟南芥根系上√223.提供某几个物质的标准品，针对性做绝对定量[单选题]*普通非靶（LC/GC）靶标代谢组√顶空进样非靶标植物高通量靶标动物高通量靶标224.动植物或微生物样本，没有明确的研究目标[单选题]*普通非靶（LC/GC）√靶标代谢组顶空进样非靶标植物高通量靶标动物高通量靶标225.研究细菌在特定培养条件下基础代谢的情况[单选题]*普通非靶（LC/GC）√靶标代谢组顶空进样非靶标植物高通量靶标动物高通量靶标226.研究牛体内脂质合成与降解情况[单选题]*普通非靶（LC/GC）靶标代谢组脂质非靶√植物高通量靶标动物高通量靶标227.泛泛的看看样品中脂质的变化情况[单选题]*普通非靶（LC/GC）靶标代谢组脂质非靶√植物高通量靶标动物高通量靶标228.肠道内所产生的短链脂肪酸含量变化[单选题]*普通非靶（LC/GC）短链脂肪酸代谢√脂质非靶植物高通量靶标动物高通量靶标229.我公司目前关于定量蛋白质产品有哪些[多选题]*Label-free√iTRAQ胶条鉴定PRM√乙酰化TMT√230.关于label-free，以下描述正确的是[多选题]*每个样品分别上机进行检测√适用于大样本量√无需同位素标记，成本低√周期相对较短√231.目前我们蛋白组学应用的是Thermo公司的哪种平台[多选题]*Q-exactive√5600TripleTOFQ-exactiveHF√D.Lumos232.进行蛋白搜库时，我们首先的数据库是[单选题]*uniprot数据库（或NCBI）选择所研究物种同批样品转录组数据构建的蛋白库√uniprot数据库（或NCBI）选择任意物种uniprot数据库（或NCBI）选择近源物种233.对于筛选得到的差异蛋白可以采用以下哪些手段进行下游的验证实验[多选题]*2DPRM√Westernblot√ELISA√234.在进行定量蛋白组学研究的时候，以下哪种样品需要去除高峰度蛋白[多选题]*动物组织血清√血浆√细胞235.下列物质代谢组不能检测的是[多选题]*农药残留（四环素）蛋白质√微生物多样性√色氨酸236.以下关于代谢组上机检测说法正确的是[单选题]*同一批次实验允许分批次检测同一批次实验必须同一批次检测√同一批次实验可以分2次上机检测同一组重复实验同批次上机检测即可237.代谢组中物质分离主要用的技术是[单选题]*色谱技术√质谱技术238.代谢组中物质分离可用GC进行，该技术主要是利用物质的哪些特点进行分离的[多选题]*沸点差异√熔点差异极性差异√吸附性质差异√两相中的分配系数239.代谢组中物质分离可用LC进行，该技术主要是利用物质的哪些特点进行分离的[单选题]*沸点差异熔点差异极性差异吸附性质差异两相中的分配系数√240.下列关于靶向代谢组学方法描述错误的是[多选题]*只能对少数已知代谢物进行定性和定量检测既可以检测已知物质，也可以检测未知代谢物√灵敏度高，定量准确√灵敏度低，定量不准确241.下列关于非靶向代谢组学方法描述错误的是[多选题]*可以检测数百至数千种代谢物质√既可以检测已知物质，也可以检测未知代谢物√定量和定性准确性相对较差√灵敏度高，定量和定性准确性较为准确242.细胞样本做代谢组送样重复说法正确的是[单选题]*每组不少于1个重复每组不少于3个重复√每组不少于2个重复可以不做重复243.百迈客可以做的蛋白质组学包括[多选题]*蛋白双向电泳iTRAQ√TMT√lab-free√PRM√DIA√244.定量蛋白质组学中需要用同位素标记的是[多选题]*iTRAQ√TMT√lab-freePRMDIA245.以下属于PRM产品优势的是[多选题]*无需抗体√需要抗体辅助无物种限制√只部分物种适用一次检测多个定量指标√246.以下哪些可以作为筛选差异代谢物的条件（）？[多选题]*均值差异倍数√t检验√VIP√247.质谱仪包括以下哪几个部分（）？[多选题]*样品引入√离子源√质量分析器√检测器√248.TMT最多可同时标记（）个样品？[单选题]*481016√249.TMT方案设计的原则有（）？[多选题]*生物学重复可分批上机√不同组织部位不要放在一组标记中检测√需要比较的差异分组放在一组标记中√不同物种间需要比较的话可以搭桥250.iTRAQ与TMT的不同点是（）？[单选题]*实验原理实验流程标记试剂种类√实验过程中需要酶解251.对于筛选得到的差异蛋白可以采用以下哪些手段进行下游的验证实验？（）[多选题]*2DPRM√Westernblot√ELISA√252.关于TMT实验以下描述正确的有（）？[多选题]*需要标记试剂进行标记√实验过程中需要进行酶解和液相分组√样品单独上机进行检测不需要去除高峰度蛋白253.以下哪些样本类型不能承诺指标（）？[多选题]*坚硬组织（树皮、毛发、老化皮肤、骨组织、支架、昆虫壳组织、贝壳、钙化组织）√含高丰度蛋白的体液（血液、尿液、唾液、脑脊髓液、卵泡液、细胞或菌类培养基上清）√含高丰度蛋白的组织或细胞（卵细胞、肌肉组织、肌细胞相关组织、种子）√蛋白较少的组织或细胞（动物精子细胞、老化叶片、植物茎、果肉）√微生物√藻类（细菌真菌通常覆盖度60%以上）√254.不同物种不同组织间差异蛋白比较，建议老师做什么（）？[单选题]*label-free√itraqTMT255.相同物种不同组织间差异蛋白比较，建议老师做什么（）？[单选题]*label-free√itraqTMT256.搭桥能解决itraq/TMT不同物种不同组织差异蛋白不能比较的问题吗（）？[单选题]*能不能√257.搭桥能解决itraq/TMT相同物种不同组织差异蛋白不能比较的问题吗（）？[单选题]*能不能√258.代谢组目前的检测技术主要有哪些？（）[单选题]*LC-MSLC-MS、GC-MS、NMR√GC-MSNMR259.以下哪种说法是正确的？（）[单选题]*代谢组可以分批送样检测后合并结果客户在其他公司测的代谢原始数据都可以在百迈客进行重新鉴定普通非靶LC-MS是相对定量√顶空非靶是绝对定量260.普通非靶LC-MS适用于哪些客户？（）[多选题]*没有明确的研究目标,希望比较样品中代谢物的差异,缩小研究范围√转录组+代谢组联合分析锁定关键通路中的基因和代谢物√希望检测数量较多的物质,能够覆盖大部分种类的物质√初级代谢物√相对定量√261.蛋白质组学可以用来发现什么（）？[多选题]*蛋白质的表达水平√亚细胞定位√翻译后的修饰√蛋白与蛋白相互作用√262.蛋白质修饰组学分几个馏份吗？（）[单选题]*123√4263.蛋白质组学的生物学重复如