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文档简介
1、蛋白质免疫印迹技术及常见问题分析张绍进Western Blot简介Western Blot一般流程Western Blot常见问题分析Western Blot 简介:印迹法(blotting)是指将样品转移到固相载体上,而后利用相应的探测反应来检测样品的一种方法。1975年,Southern建立了将DNA转移到硝酸纤维素膜(NC膜)上,并利用DNARNA杂交检测特定的DNA片段的方法,称为Southern印迹法。而后人们用类似的方法,对RNA和蛋白质进行印迹分析,对RNA的印迹分析称为Northern印迹法,对单向电泳后的蛋白质分子的印迹分析称为Western印迹法,对双向电泳后蛋白质分子的印
2、迹分析称为Eastern印迹法。Western Blot 基本原理Western Blot 优点 高分辨率的电泳技术 特异敏感的抗原-抗体反应 1-5ng中等大小的靶蛋白Western Blot 流程蛋白样品的制备SDS转膜封闭一抗杂交二抗杂交底物显色通过有机溶剂或水溶法制备总蛋白水溶液提取法 针对水、稀盐、稀酸或碱溶液中的蛋白质。稀盐和缓冲系统的水溶液对蛋白质稳定性好、溶解度大、是提取蛋白质最常用的溶剂 。有机溶剂提取法 对于分子中非极性侧链较多的蛋白质可用有机溶剂提取,包括乙醇、丙酮和丁醇等。通过层析或电洗脱法制备目的蛋白蛋白样品的提取蛋白样品的变性2SDS上样缓冲液:DTT可临用前以1:
3、4比例混合加入,亦可全部配好分装,-20冻存。按1:1比例与蛋白质样品混合,95100加热515min,冰上冷却后再上样,上样量一般为20-25l,总蛋白量2050g。1M Tris-HCl(pH6.8)10 ml1M DTT20 mlSDS4 g甘油20 ml溴酚蓝0.2 g总体积100ml100mM Tris-HCl(pH6.8)200mM DTT4%SDS0.2%溴酚兰20%甘油ddH2OSDS:阴离子去污剂 变性剂氨基酸侧链与SDS充分结合形成带负电荷的蛋白质-SDS胶束。蛋白质-SDS胶束所带的负电荷大大超过了蛋白质分子原有的电荷量,消除了不 同分子之间原有的电荷差异。与强还原剂一起
4、使蛋白分子氢键、疏水键打开,使蛋白质分子线性化。蛋白质-SDS胶束的特点:(1)具有相同的形状,形状像一个长椭圆棒(2)平均1g 蛋白质结合1.4g SDS(3)短轴对不同的蛋白质亚基-SDS胶束基本上是相同的(4)长轴的长度则与亚基分子量的大小成正比SDS 是在蛋白质样品中加入SDS和含有巯基乙醇的样品处理液,SDS是一种很强的阴离子表面活性剂,它可以断开分子内和分子间的氢键,破坏蛋白质分子的二级和三级结构。强还原剂巯基乙醇(或二硫苏糖醇,DTT)可以断开二硫键破坏蛋白质的四级结构。使蛋白质分子被解聚成肽链形成单链分子。解聚后的侧链与SDS充分结合形成带负电荷的蛋白质-SDS复合物。蛋白质分
5、子结合SDS阴离子后,所带负电荷的量远远超 过了它原有的净电荷,从而消除了不同种蛋白质之间所 带净电荷的差异。蛋白质的电泳迁移率主要决定于亚基 的相对分子质量,而与其所带电荷的性质无关。【SDS基本原理】凝胶成分丙烯酰胺和N,N-亚甲双丙烯酰胺 SDS配胶的Tris缓冲液TEMED过硫酸铵Tris-甘氨酸电泳缓冲液聚丙烯酰胺凝胶的聚合方式:单体:丙烯酰胺(Acr);交联剂:甲叉双丙烯酰胺(Bis); 催化剂:过硫酸胺或核黄素(AP);加速剂:四甲基乙二胺(TEMED);产物:三维网状结构凝胶聚丙烯酰胺凝胶聚合机理是通过提供氧游离基(free radicals)的催化,使体系发生氧化还原作用(c
6、atalyst-redox systems)来完成的。催化体系主要有化学催化(APTEMED)和光化学催化(核黄素TMTED)体系。凝胶浓度与蛋白分离范围凝胶浓度()线性分离范围(KD)1512-431016-687.536-945.057-212SDS浓缩胶(5% Acrylamide)及分离胶配方表:/thread-20726-1-1.html 不连续电泳: 作用缓冲液PH凝胶浓度浓缩胶使蛋白样品浓缩pH6.8Tris-Cl低,2-5%分离胶使蛋白样品分离pH8.8Tris-Cl高,根据蛋白大小电泳缓冲液:pH8.3 Tris-甘氨酸系统。灌制分离胶 隔绝空气ddH2O0.1%SDS:8%
7、灌制积层胶 插入梳子 Staking gelSeparating gel转移膜的选择最常用于Western Blot的转移膜主要是硝酸纤维素(Nitrocellulose,NC)膜和聚偏二氟乙烯 (Polyvinylidene Fluoride, PVDF)膜,此外也有用尼龙膜、DEAE纤维素膜做蛋白印迹。尼龙膜和NC膜的特点相似,主要用于核酸杂交。各种膜的详细特点介绍:/bio101/2008/21461_2.htm湿转系统丽春红染色 蛋白带出现后,于室温用去离子水漂洗硝酸纤 维素滤膜,换水几次。印度墨汁染色 只用于放射性标记抗体或放射性标记A蛋白探 针的Western印迹过程。 转膜后检测
8、(此步可以省略)封闭为避免作为检测试剂的特异性第一抗体与膜发生非特异性结合,使非特异性背景提高,需对膜上的潜在结合位点进行封闭处理。5%脱脂奶粉或BSA(室温孵育1h)Western Blot 膜封闭液(生物试剂公司)Tween-20的作用:减少非特异性吸附,不影响抗体与抗原的结合。一抗、二抗孵育把NC膜放在密闭塑料袋或者培养皿中,根据膜面积以0.1mL/cm2的量加入一抗溶液,摇床上平缓摇动,于室温孵育1-2小时或4过夜。回收一抗溶液,用TBST漂洗膜3次,每次10min。加入用封闭液配制的二抗,摇床上缓慢摇动,于室温孵育1-2小时或4过夜。 回收一抗溶液,用TBST漂洗膜3次,每次10mi
9、n。最后用TBS漂洗膜2次,每次10min。二抗与底物反应显色辣根过氧化物酶法(HRP)碱性磷酸酶法(AP)化学发光显色法(HRP)膜解吸方法(膜的重复利用) 通过加热和去污剂进行解吸 原理:组合使用去污剂和加热使抗体解离,适用于任何化学发光底物系统。酸解吸 原理:使用低pH改变抗体结构从而使结合位点失活,从而将抗体与抗原分离,适用于任何化学发光底物系统。Western Blot结果分析目的蛋白的灰度值除以内参的灰度值以校正误差,所得结果代表某样品的目的蛋白相对含量。Western Blot结果分析软件Gel-Pro Analyzer 4 绿色版(附动画演示教程)/thread-44929-1
10、-1.html Western Blot常见问题分析SDS电泳胶不平?凝胶漏液?胶板洗刷干净加入AP和TEMED的量要合适加入试剂后摇匀,使其充分混合,防止部分胶块聚合不均匀温度合适,受热不均匀导致胶聚合不均匀两块玻璃板底部要对齐条带比正常的窄?“微笑”或“倒微笑”条带?凝胶聚合不均匀,灌胶时候尽量混合均匀,动作轻缓拔梳子要迅速,清洗加样孔要小心,以免把上样带扭曲样品盐浓度过高会挤压其他条带导致宽窄不一,纯化样品,调整盐浓度胶板底部有气泡会影响电泳效果,应赶走气泡。同时注意电泳槽装置是否合适SDS电泳转膜及抗体检测凝胶肿胀或卷曲?条带歪斜或漂移?单个或多个白点?转膜缓冲液过热? 可将凝胶在转膜
11、之前放到转膜缓冲液中浸泡5-10min电转仪长期使用导致海绵变薄,“三明治”结构不紧凑导致。可在两块海绵之间垫上少许普通的草纸确保膜和胶块之间没有气泡缓冲液中离子浓度太低,电流或电压太高。转膜过程注意降温转移到膜上的蛋白很少蛋白分子量 10KD蛋白的等电点 9SDS浓度不合适凝胶太厚 原因对策蛋白分子量10KD时,减少转膜时间;使用小孔径的膜更换高pH值Buffer在阴极buffer中加入0.005 - 0.01% SDS 可提高转膜效率延长转膜时间膜没有均匀浸湿膜或者缓冲液污染封闭不充分抗体与封闭剂出现交叉反应抗体浓度过高 原因对策转膜前用100%甲醇将膜完全浸湿拿取膜与吸水纸时要戴手套,更换新鲜转膜缓冲液检测一抗、二抗与封闭剂是否有交叉反应杂交前检测一抗、二抗的工作浓度背景太高杂交信号很弱抗体保存不当抗原不充足膜的漂洗过度 原因对策抗体长期保存应在70,使用前做效价检测增加蛋白上样量,做已知标准量蛋白的对照减少漂洗的时间和次数一抗不是唯一特异的二抗出现非特异结合 原因对策制备单克隆抗体或者重新选取合成抗原多肽的位点设立不加一抗,只加二抗的平行对照来检测二抗是否有非特异结合出现非特异带Further Readings生物秀Western
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