认识PubMed让它融入您的科研

1、认识PubMed 让它融入您的科研学科馆员：周成效主要内容一、 认识PubMed二、 PubMed 检索入门三、PubMed高级检索四、PubMed医学主题词表检索五、PubMed其他功能六、PubMed个性化服务Web of Science您的选择？Google ScholarPubMedScopusScirus一、认识PubMed/一、认识PubMedPubMed与NCBI数据库的关系图一、认识PubMed标引质量高更新速度快信息量大使用方便选择PubMed的n个理由一、认识PubMedPubMedABDCMedlineOldMedlineIn Process CitationsRecor

2、d supplied by publisher一、认识PubMedOLDMEDLINE: 收录了19501965年间的美国医学索引（IM）中的题录。In Process Citations :是临时性的数据库，收录准备进行标引的题录和文摘信息，每天都在接受新的数据，进行文献的标引和加工，每周把加工好的数据加入到Medline中，同时从In Process Citations库中删除。In Process Citations中的记录标有PubMed - in process的标记。Record supplied by publisher：出版商将期刊文献信息电子版提供给PubMed后，每条记录都

3、标有PubMed-as supplied by publisher的标记，这些记录每天都在不停地向In Process Citations库中传送，加入到In Process Citations后，原有的标记将改为PubMed- in process的标记。Medline：是美国国立医学图书馆（U.S.National Library of Medicine）最重要的书目文摘数据库，内容涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健和基础医学。收录了全世界70多个国家和地区的5000余种生物医学期刊，书目文摘条目1500万余条，时间起自1966年。标有PubMed - indexed for ME

4、DLINE的标记一、认识PubMed检索提问区文献匹配临床咨询特定主题咨询期刊检索主题检索高级检索一、认识PubMed2.1 单著者检索2.1.1 键入著者姓氏全称和名字的首字母全写或缩写 如: Alving c Fauci as koltilil s Geneau Wong julia s Ryan, james2.1.2 利用高级检索中的“Author”检索, 选下拉选项定位二、PubMed检索入门2.3.1直接输入您所要检索的关键词或主题词, 英文单词或短语（大写或小写均可）, 词汇自动转换功能进行检索，并将检索结果直接显示在主页下方。 如: sleep walking cause2.2

5、 著者与主题联合检索2.2.1 直接输入作者姓名与主题词, 不用AND 如: dodick dw migraine2.3 单主题检索二、PubMed检索入门2.4 期刊检索2.4.1 输入期刊名，ISSN，Medline jounal title abbreviation 如: molecular biology of the cell cellta 1087-01562.4.2 用single citation matcher中的期刊名称检索2.4.3 用journal database检索二、PubMed检索入门2.5 日期或日期范围检索2.5.1 日期的录入格式为YYYY/MM/DD2.

6、6 检索期刊子集（辑）2.6.1 检索词AND jsubset 数据库首字母。可供检索的期刊子库有3种，分别使用进行限定。 Abridged Index Medicus(有120种重要核心医学期刊) Dental Nursing 如：neoplasms AND jsubseta二、PubMed检索入门2.7 检索带文摘的记录2.7.1 检索词AND has abstract, 要注意的是在1975年前出版的文章，其MEDLINE记录中没有文摘 如: liver cancer AND has abstract二、PubMed检索入门2.8.1 布尔逻辑运算符(AND, OR, NOT) 如：On

7、cology AND (treatment OR research )2.8.2 截词符( * ) 如: bacter*2.8.3 词组检索 ( “ ”) 如: “Single cell”2.8.4 通配符( ? ) 如: “en?oblast”2.8 组配/截词/短语检索二、PubMed检索入门2.9 PubMed检索字段标识二、PubMed检索入门1默认SUMMARY（简要格式）显示2可标记后点击Display Settings键3默认每页显示20条4最多一次可保存10000条记录5可用浏览器的打印功能2.10 PubMed检索结果显示及处理二、PubMed检索入门二、PubMed检索入门

8、2.11 PubMed基本检索举例Clinical cancer research 2009diabete AND jsubsetn“embryonic stem cell*”swine flu* OR swine influ* OR H1N1 OR SIV二、PubMed检索入门 1明确所要检索的内容。 先分析这一问题中的关键词语，主要由维生素C，和普通感冒构成。即VITAMIN C和COMMON COLD。 2分析所要检索的两个相关词语的关系。 根据我们的日常生活经验，可以将两个关键词之间的关系定义为“AND”, 在检索框内键入“VITAMIN C” AND COMMON COLD2.12

9、 PubMed基本检索演示检索课题一 维生素C对于普通感冒的防治作用二、PubMed检索入门检索课题二 检索2000-2005年以后有关Crohn病药物治疗研究的文献Crohn DiseasemhAND drug therapy sh AND 2000：2005 edat二、PubMed检索入门2.12 PubMed基本检索演示君欲善其事必先利其器三、PubMed高级检索检索事半功倍Clipboard HistoryPreview/IndexLimitsDetails检索框三、PubMed高级检索明确你所要检索的关键概念及词语，即关键字考虑到关键字的类似说法，即有可能出现的同义词检索要诀通过限

10、定等，精炼你的检索范围通过布尔（BOOLEAN）运算来提高你的效率多向有经验的人求教PubMed三、PubMed高级检索 3.1 Limit在这里可以进行以下设定： 将搜索范围设定在一个特定的域。将搜索范围设定在特定的年龄组、性别组、人类或动物学范围。也可以将搜索限定在某一语种出版的或某一特定的文章类型,如综述 设定只搜索包含摘要的文献。设定搜索Entrez数据库或Publication数据库。设定搜索范围为PubMed数据库的某一子数据库（如Abridged Index Medicus 或AIDS相关的条目）。 需要注意的是：限制了出版物类型、年龄、人或动物、性别中的任何一项，检索将只在Me

11、dline中进行检索（因为这些特征限制只有Medline中才有）。三、PubMed高级检索在三方面选择:Journal GroupTopicsMore Subsets出版物类型选择语种选择年龄选择性别选择人或动物实验选择三、PubMed高级检索在按下Preview按钮之后，我们可以进行的设定有：在显示条目之前显示所查到的文献数。随时通过增加查询单词来修改查询方案。 在特定的搜索域中向方案里加入查询词。从Index中查看并选择词语来修改查询方案。在你修改查询时查看方案。注：preview预览检索方案在pubmed新版已归入search history中显示3.2 Preview/Index三、P

12、ubMed高级检索看到最近100次的查询结果。如果两次查询内容相同，PubMed会将头一次的去除。当点击 Clear History可以将History中的所有内容清除3.3 History三、PubMed高级检索3.4 Clipboard贴板可以帮助你保存或查看在一个或多个查询中选择的条目。可以打印、保存、订购剪贴板中的内容。条目复选框选中，单击“send to clipboard”就可以将其加入剪贴板中。剪贴板中最大的储存数是500条。剪贴板中的内容在8小时内没有任何操作，将会自动消失。三、PubMed高级检索 3.5 Details 即在提问框中键入的检索词被PubMed自动地转换成了哪

13、些词，并使用了什么样的检索规则和检索语法。三、PubMed高级检索Result区显示检索结果的记录总数，点击这个数字，可回到检索结果显示屏Translation区显示检索词转换的详细情况Database区显示检索的数据库User Query 区显示用户键入的检索词或检索式对检索策略进行编辑三、PubMed高级检索文献太多，如何保证查全和查准？四、PubMed医学主题词表检索何为MeSH？MeSH是Medical Subject Headings的缩略词，即医学主题词，是用规范化的医学术语来描述生物医学概念。论述文献中心的主题词称主要主题词论述主题某一方面的内容的词称为副主题词 Mesh词表帮助

14、您！4.1 MeSH Database的运用四、PubMed医学主题词表检索四、PubMed医学主题词表检索词义解释四、PubMed医学主题词表检索副主题词四、PubMed医学主题词表检索四、PubMed医学主题词表检索四、PubMed医学主题词表检索主题词之间的逻辑关系选择四、PubMed医学主题词表检索检出结果限定在主要主题词可提高查准率限制扩展检索，只需检索单个主题词四、PubMed医学主题词表检索四、PubMed医学主题词表检索在 MeSH Database 中查找关键词 ?如何联合检索两个 MeSH Terms ?如何在 MeSH Database 中利用副主题检索 ?4.2 MeS

15、H检索实例演示四、PubMed医学主题词表检索4.2 MeSH检索实例演示例一nosebleed例二measles outbreaks例三measles outbreaks statistics四、PubMed医学主题词表检索五、PubMed其他功能实现单篇文章的一对一检索实现多篇文章的一次性检索一次最多可检索PubMed中100条文献纪录, 获得文献的PMID选择相应类别选择检索范围检索结果更加贴近临床的需要五、PubMed其他功能限定于各类不同的医学临床主题进行检索五、PubMed其他功能实现PubMed与核酸和蛋白质序列数据库、基因组数据库、分类学数据、图书等数据库之间的多向链接,多向查

16、询五、PubMed其他功能与PubMed建立联系的网站，如某篇文献所对应期刊的出版商，文献全文、相关数据库及网站等。五、PubMed其他功能五、PubMed其他功能eUtils(Entrez Programming Utilities) 通过eUtils 这个程序设计模块, 可以通过我们自己设计的应用程序平台, 获取NCBI 数据库的数据, 从而实现这些数据资源的深度开发使用。实现自动化的大批量的从Entrez数据库下载数据。并且提供了几种常用的语言以供选择，像Perl, Python, Java, 和 C+等。五、PubMed其他功能免费期刊的获取PubMed提供了免费全文期刊网址 Pubm

17、ed Central /向作者索要作者主页五、PubMed其他功能六、PubMed的个性化服务保存检索式(生成URL或HTML实现共享)检索结果的分类过滤特定功能的参数设置六、PubMed的个性化服务经由2000多位专家学者的评价推荐，提供目前世界上最重要的生物学论文资讯及研究趋势。特色是收录每篇具有科学价值的文献，而考虑这些文献在哪在些期刊里发表PubMed里检索出最核心的文献Faculty of 1000与pubmed的完美结合六、PubMed的个性化服务PubMed快速检索功能的实现NCBI Search Toolkit安装NCBI Search Toolkit划词右击直接进行pubme

18、d检索六、PubMed的个性化服务PubMed其实还有更加丰富多彩的内容等着你去挖掘查阅各种健康疾病相关的主题，医药信息。还有一部非常完善的在线医学词典。此外，你还可以浏览到很多有用的健康新闻。六、PubMed的个性化服务GoPubMed是德国Transinsight公司和德国德累斯顿大学合作，利用生物信息学相关知识开发的一个可以对PubMed检索结果进行探索、分析的工具。六、PubMed的个性化服务四个“W”分析功能六、PubMed的个性化服务时间分析国家分析六、PubMed的个性化服务城市分析刊物分析六、PubMed的个性化服务作者分析主题分析六、PubMed的个性化服务研究态势地区分布图六、PubM