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文档简介

1、合同书本协议甲方委托乙方就(单位简称)(数量)(物种)细菌框架图测序分析进行专项技术服务,并支付相应的技术服务报酬。各方经过平等协商,在真实、充分地表达各自意愿的基础上,根据中华人民共和国协议法的规定,达成如下协议,并由各方共同恪守。第一条定义:除非另有商定,本协议使用的下列术语应具有如下界定的含义:“协议”或“本协议”:指本协议正文和其附件,共同构成协议整体并相互补充;“交付成果”:指乙方根据本协议规定交付的服务成果,包括文库、测序数据或分析结果等;“技术障碍”:指在乙方现有条件下无法克服的技术问题,包括但不限于因协议商定的技术方法、技术路线、履行协议所使用的设备、仪器、软件等自身的缺陷或局

2、限性、生物特性、生物个体差异性等致使的无法克服的技术问题;标题:仅为方便参考而设,不影响本协议的说明和意义。第二条甲方委托乙方进行技术服务的内容如下:建库测序前样品的质检乙方对甲方样品进行样品检测,样品质检标准见附件;若样品不满足质检标准,乙方根据经验会给甲方提供合理建议,由甲方最终确认是否继续实验或是重新提供样品,乙方对于实验的最终结果不承担责任。技术服务内容及目标样品检测合格后,构建DNA测序文库进行建库测序,并取得测序数据。乙方采取以下技术路线进行细菌基因组框架图测序分析:样品制备上机测序生物信息数据分析。技术服务的方式最终提交测序数据和项目结题报告。分析结果具体包括以下几个方面内容具体

3、分析内容备注分析内容1、数据质控2、基因组组装;3、基因组情况评估4、基因组组分分析:号码基因预测;重复序列注释;非号码RNA预测;假基因分析5、基因功能注释:通用数据库注释:GO, KEGG, KOG, Swiss-prot, Nr, pfam;专用数据库注释:CAZyme,ARDB,PHI,VFDB;信号肽预测、跨膜蛋白、转运蛋白、分泌蛋白分析售后服务甲方可以在分析履行日后的三个月内针对原有数据、结果、分析方法等方面的疑问咨询乙方,乙方在一个月内给甲方提供整理分析类服务,三个月内提供问题解答服务,咨询范围只限于协议中的服务内容。注:乙方提供给甲方的分析内容以协议为准,任何口头承诺均无效。第

4、三条乙方应按下列要求履行技术服务工作:技术服务地点:xxxx生物科技有限公司技术服务期限:60天(不包括高级分析和定制分析时间)技术服务进度:乙方在收到甲方样品及样品信息单后开始样品检测,DNA样品检测合格且预付款到位后的45个工作日内履行样品制备、全部测序反应及相应的信息分析;乙方在甲方认可项目结题报告且尾款到位后的5个工作日内向甲方提供项目所有原始数据和分析结果;甲乙各方沟通或等待对方反馈所花费的时间不包括在50个工作日内。技术服务质量:履行预估大小为M的细菌基因组框架图测序,总测序深度不低于100X。第四条为保证乙方有效进行技术服务工作,甲方应当向乙方提供下列工作条件和协作事项:提供技术

5、资料文件资料和工作条件:甲方一次性提供乙方要求的DNA或菌体(确定样本类型)样本,且达到乙方样品标准,具体标准见附件;甲方需详细填写样品信息单,寄送样品时必须随同样品寄送纸质版信息单,并同时发送电子版给乙方。因样品信息单填写不完整、填写错误或不及时发送造成的检测错误、项目延期等后果,均由甲方承担;依照第五条的条款商定支付乙方服务费用。甲方提供上述工作条件和协作事项的时间及方式:在本协议签订5天内,以书面和电子邮件两种形式提供样品信息单。其他:无第五条甲方向乙方支付技术服务报酬及支付方式为:技术服务费总额为:人民币贰拾万元整(200,000.00);技术服务费由甲方分期(一次或分期)支付乙方。具

6、体支付方式和时间如下:协议生效的5个工作日之内,甲方把相当于协议金额的80%预付款人民币拾陆万元整(160,000.00)转入乙方帐户;履行全部项目且达到协议指标要求后,乙方5个工作日内提交项目结题报告,甲方把相当于协议金额的20%尾款人民币肆万元整(40,000.00)转入乙方帐户;乙方协议盖章后,在邮寄协议时,预付款发票与协议一起邮寄。开具单位与协议中甲方名称保持一致,发票开具内容为测序技术服务费;如因甲方样品不合格而造成协议终止,乙方向甲方收取实际已发生费用:样品检测费用¥200.00/样本/次。如协议继续,每个样品免费检测2次,超出的部分,依照¥200.00/样本/次收费;若甲方需要乙

7、方进行样品提取,则甲方需要向乙方支付提取费用¥200.00/样本。乙方开户银行名称、办公地址和帐号为:开户银行:中国xx银行股份有限公司xx顺义支行帐号: 00203276第六条各方确定因履行本协议应遵守的保密义务如下:甲方:保密内容: 未经乙方书面同意,甲方不得将本项目的任何技术资料文件资料等涉及乙方秘密的信息泄漏给第三方;涉密人员范围: 除乙方外的所有人员或单位;保密期限:自协议生效日起3年;泄密责任:违反协议商定,擅自将关于技术资料文件资料或涉及乙方秘密的技术引用、发表或提供给第三方,应支付数额为报酬总额100的违约金,并且承担由此带给乙方的所有经济损失。乙方:保密内容: 未经甲方的书面

8、同意,乙方不得将本项目的任何研究材料等涉及甲方科研内容或成果的相关资料文件资料泄露给第三方;涉密人员范围: 除甲方外的所有人员或单位;保密期限:自协议生效日起3年;泄密责任:违反协议商定、擅自将关于资料文件资料或涉及甲方研究内容或本项目的研究成果引用,发表或提供给第三方,应支付数额为报酬总额100的违约金,并且承担由此带给甲方的所有经济损失。在不涉及泄漏技术秘密及科研内容、研究成果的前提下,乙方可以将本协议用于技术服务协议的认定。第七条本协议的变更必须由各方协商一致,并以书面形式确定:但有下列情形之一的,一方可以向另一方提出变更协议权利与义务的请求,另一方应当在 15个工作日内予以答复;逾期未

9、予答复的,视为同意:甲方提供的工作条件不符合乙方要求,但甲方坚持要求履行协议;因不可克服的技术障碍致使协议无法正常履行。第八条各方确定以下列标准和方式对乙方的技术服务工作成果进行验收:乙方履行技术服务工作的形式:最终提交所有原始数据,分析结果及项目结题报告;技术服务工作成果的验收标准:达到第三条第4点的质量标准;技术服务工作成果的验收方法:甲方通过对乙方提供的测序数据及分析结果进行书面或邮件确认;验收的时间和地点:年月日,xx。第九条各方确定成果归属依照以下方式:在本协议有效期内,甲方利用乙方提交的技术服务工作成果所履行的新的技术成果,归甲(甲、双)方所有。在本协议有效期内,乙方利用甲方提供的

10、技术资料文件资料和工作条件所履行的新的技术升级与软件开发,归乙(乙、双)方所有。第十条各方确定,按以下商定承担各自的违约责任:如因甲方样品、资料文件资料不合格或未能及时到位等原因致使的项目延误等损失由甲方承担责任;如因乙方原因未能及时履行项目,由乙方承担责任。乙方应及时与甲方沟通协商项目延期方式;样品经检测不合格,若甲方仍坚持进行项目,则甲方需按正常价格付费,乙方将不保证商定的技术指标。由此而造成的损失,乙方不承担责任;签约各方理解,生物技术服务带有不确定性和技术风险。如因不可克服的技术障碍致使本项目未能履行,签约各方协商后中止项目,依照乙方实际已履行的工作量计算费用,各方各承担50%的损失;

11、如因不可抗拒的客观因素致使的项目延误或未能继续履行时,各方各承担已发生成本费用的50%。不可抗力包括地震、洪水、战争、军事行动、法律或政府政策等相关因素。第十一条各方确定,在本协议有效期内,甲方指派为甲方项目联系人,乙方指派为乙方项目联系人。项目联系人承担以下责任:项目进展的及时沟通;项目进行过程中遇到问题共同沟通协调解决;及时提供协议各方所必须的工作条件。一方变更项目联系人的,应当及时以书面形式通知另一方。未及时通知并影响本协议履行或造成损失的,应承担相应的责任。第十二条各方确定,出现下列情形,致使本协议的履行成为不必要或不可能的,可以解除本协议:发生不可抗力;因对方违约使协议未能继续履行或

12、没有必要继续履行且征得对方同意。第十三条各方因履行本协议而发生的争议,应协商、调解解决。协商、调解不成的,确定按以下第1种方式处理:提交xx仲裁委员会仲裁;依法向人民法院起诉。第十四条与履行本协议关于的下列技术资料文件,经各方以书面方式确认后,为本协议的组建部分:附件DNA测序样品要求及注意事项第十五条各方商定本协议其他相关事项为:数据提交在项目过程中造成或产生的数据和相关生物信息分析结果资料文件,如小于20G乙方可提供云盘下载;大于20G的数据,由甲方提供移动硬盘,乙方提供移动硬盘传输服务。数据保存为方便甲方测序数据的使用,乙方承诺在最终数据提供后,继续保留数据3个月,若甲方未在届满期前书面

13、提出继续保留数据,乙方将在届满期后自动删除;如甲方在届满期前书面提出继续保存数据,则需签订补充协议并根据实际存储数据量与存储时间进行计费。样品保存为方便甲方样品管理,乙方承诺在提交项目结题报告和数据提交后,继续保留数据3个月,若甲方未在届满期前书面提出返还样品,乙方将在届满期后自动处理;如甲方在届满期前书面提出返还样品,则需填写样品返还信息表并提交给相应的客服人员进行样品返还事宜。第十六条本协议一式6份,具有同等法律效力。由甲、乙各方各持3 份。第十七条本协议经各方法定代表人或项目联系人签字盖章后生效,声明:xx法定代表人xx委托宋军行使协议审批权和签署权。甲方:(盖章)法定代表人委托代理人:

14、(签名)年月日乙方:(盖章)法定代表人委托代理人:(签名)年月日登记机关审查登记栏:经办人: 技术协议登记机关(专用章) 年 月 日附件DNA测序样品要求及注意事项样品要求:样本类型样品量(单次)样品质量DNA浓度50ng/L总量2g(Qubit)OD260/280=1.7-2.2;260吸收峰正常;主带清晰,无降解或轻度降解;无蛋白质、RNA污染或肉眼可见的杂质污染。菌体细菌基因组送样量:体积2ml菌液类:挑取单菌落于一定体积(50-100 mL)液体培养基中适宜温度下培养过夜,至菌体处于旺盛生长的对数生长期(此时菌液 OD600一般达0.6-0.8),而后转入无菌的 50 mL离心管,用

15、parafilm 膜封好,外层用塑胶袋包裹以防止管子破裂液体渗漏,冰袋或干冰寄送。菌体类:将依照以上方法培养好的菌液,2)将适量体积的菌液转移至2 mL 旋盖尖底离心管(无菌,无核酸酶)中,于室温下14000 X g 离心1 min,弃尽培养基,将细菌沉淀迅速置于液氮中冷冻3-4小时,然后转移至-80或液氮中长期保存;用 parafilm 膜封好样品管管口,若放置于50mL离心管中或封口袋中,里面添加棉花等固定(切勿在 50 mL 管内或其他支撑物内加入液氮等危险品),干冰运输。平板类:涂布平板培养的微生物,用 parafilm 膜封好,外层用塑胶袋包裹,以平板方式活菌送样即可;寄送时添加海绵

16、或泡沫做减震处理,常温或冰袋寄送。电泳要求:主带清晰,无降解或轻度降解,无蛋白或多糖污染。(请尽量保证DNA片段的完整性,距送样日最近的电泳结果)合格样品如下图:19329bp19329bp7743bp4254bp3472bp6223bp6223bp样品信息:请附加一份详细的样品信息单,尽可能涵盖上述样品要求的所有信息和图片。提取及检测注意事项:DNA提取:请尽量使用新鲜的纯培养菌液或菌落(确保无杂菌污染,且处于对数生长中期最佳)提取DNA。请使用专用的细菌或真菌DNA提取试剂盒,以取得足量且高纯度DNA样品。DNA检测:琼脂糖电泳上样量:200-500ng,若上样体积较小建议用ddH2O补至5 l。Marker:DNA/HindIII或其它有20Kb以上条带的DNA Ladder。琼脂糖凝胶

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