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1、医学信息检索 第一章 概述第二章 检索的基本知识第三章 常用的生物医学数据库第四章 网络检索工具 第一节 文献概述 第二节 检索概述 第一章 概述 一、概念 二、类型 第一节 文献概述 一、概念信息(Information)知识(Knowledge)情报(Information/Intelligence)文献(Literature/Document) 信息 英国科学家波普尔(K.Popper)认为信息可以分成三大类:第一类是有关客观物质世界的信息,即信息是事物存在方式及其运动规律、特点的外在表现形式;第二类是有关人类主观精神世界的信息,它反映人类所感受的事物运动状态及其变化方式,处于意识和思维

2、状态的信息;第三类是有关概念世界的信息,它反映人类所表述的事物运动状态及其变化方式,用语言、文字、图像、影视数据等各种载体来表示。 信息知识 国际经济合作与发展组织(OECD)在1996年发表的以知识为基础的经济报告中将知识分成:知道是什么的知识(Know-what)知道为什么的知识(Know-why)知道怎么做的知识(Know-how)知道谁有知识(Know-who) 信息知识情报 情报为交流对象的有用的知识,是知识的一部分,是进入人类社会交流系统的运动着的知识。 它具有三个基本属性:知识性传递性效用性 信息知识未被认识的知识情报未被激活的知识未被传递的知识科学研究情报服务 信息知识情报文献

3、思维加工记录 根据国家标准文献著录总则,文献的定义为:记录有知识的一切载体联系手段实质内容外在形式 二、类型(一)按文献加工的深度分类 一次文献 二次文献 三次文献 零次文献 一次文献 即原始文献(Primary Literature),指文献作者以本人的研究成果为基本素材撰写而成的。 如,期刊论文、技术报告、学位论文等。 特点: 创造性 新颖性 系统性 二次文献 将量大、无序、分散的一次文献收集起来,进行加工、整理、简化和排序,形成检索一次文献线索的新的文献形式。 如,大多数的检索工具 特点:浓缩性 汇集性 系统性 检索性 三次文献 是综合一、二次文献,将有关内容进行系统整理,“浓缩”而成的

4、新的文献形式。一般是在充分研究现有相关文献的基础上,综述已取得的进展或存在的问题,或加评论、分析,或预测发展趋势,可使读者不必大量阅读一次文献,就可了解当前的研究水平,动态,是属于经过高度智力加工的高层次信息产品。 特点:信息含量高 综合性强 参考价值大 三次文献三次文献根据不同需要而分为两大类:1. 期刊文献型,即期刊中的综述性文献。 常有如下字样出现: review(综述) comment(评论) advance(进展) progress(进展) updated trend(最新趋势)等;2. 图书文献型,即通常所说的参考工具书。 如,百科全书、年鉴、手册、指南、辞典等。 零次文献 非出版

5、型文献,指未经情报加工直接记录在载体上的原始信息。 如,实验数据记录、原始调查、观测记录资料等。 特点:零散性 不成熟性 客观性 口头交流的信息也属于零次文献 研究活动(实验、观察、思考) 信息的直接记录或传递 零次文献(创造知识的素材) 将知识以文字等形式固化 一次文献(初始的知识产品) 将分散的文献序列化 二次文献(一次文献的替代品)将知识重新组合,使知识序列化 三次文献(浓缩的新的信息产品) 二、类型(二)按文献的载体分类 印刷型 缩微型 视听型 机读型 二、类型(二)按文献的载体分类 印刷型 缩微型 视听型 机读型 二、类型(三)按出版形式分类 图书 期刊 特种文献 是指一些记录的知识

6、比较系统、成熟的文献。一般都有固定的装祯,并通过出版发行。 在每一种正式出版的图书的版权页或其他明显部位标有一个国际标准书号ISBN(International Standard Book Number),是一种国际通行的出版物代码,代表某种特定图书的某一版本。ISBN的唯一性和专指性使读者有可能利用它通过某些检索系统查询某种特定图书。 如: ISBN 7-5383-0276-X 科学图书组号出版者号书名号校验号 医学书籍最常用的是如下几类:教科书专科参考书专著系列丛书工具书 如我国高等医药院校规划教材内科学 主要是供医学生系统学习医学知识之用。 其结构和编排系统性和逻辑性较强,内容以较为成熟

7、的最基本的理论知识为主,但论述的详细程度和深度有限,可用以帮助构建最基本的知识结构。 教科书 和教科书结构相似,但内容丰富得多, 如: 黄家驷外科学 诸福棠实用儿科学 主要是供专业人员学习参考。 专科参考书 以某一专门领域、某一疾病或一个专题为中心的科学著作。 如,国内出版的实用高血压 骨质疏松学 风湿病学 专著往往不是按照学科体系,而是围绕一个专题来组织相关知识,因此论述较为详尽、深入,有利于专业人员在某一领域知识的深化。 专著 往往围绕一个中心论题或针对某一特定读者群进行编辑。它所包含的每一本书,都是一部独立完整的著作。 如,国外出版的几种病理学系列丛书: Current Topics i

8、n Pathology, Major Problems in Pathology 这类丛书一般卷数甚多,每一卷都相当于一本专著。 系列丛书 主要指百科全书、年鉴、手册、指南等一类不是用来系统学习,而是供遇到问题时查找,在编排上往往采用条目式。 如, 中国医学科学年鉴 中国医学百科全书工具书 期刊 期刊概况 期刊的主要类型 期刊中文献变化规律 期刊的评价 期刊概况 期刊(Periodical,Journal)是一种定期或不定期出版的连续出版物,有固定的名称、版式和编辑出版单位,有连续的年、卷、期号、出版日期,每期有多篇文章。 与图书相比,科技期刊内容专深新颖,出版周期短,传播面广,连续性强,能较

9、快地反映科技发展的水平和动态,是科技人员最重视的一类资料。 世界上最早的期刊1665年1月5日创刊的“Journal des Scavans”(学者杂志)世界上第一种医学期刊16711829年由解剖学家Thomas Bartholin编辑,丹麦哥本哈根皇家医学会发行的“Acta Medical et Phiolsophica Medical Journal”(医学和哲学学报)中国最早的医学期刊:1887年创刊的英文版“Chinese Medical Journal”(中华医学杂志)和1915年创刊的中文版中华医学杂志期刊概况 期刊用卷(Volume, Vol.)和期(Number, No.或I

10、ssue)作连续出版的标识。对一定期限内(一般为一年)出版的期刊划分为一卷或几卷,每卷再分为若干期。卷号自创刊开始累计,期号在一卷内连续计数。 国际标准连续出版物编码ISSN(International Standard Serial Number)是国际上用于识别连续出版物的国际标准化编码系统。每一种经过申请的出版物都可得到一个固定不变的标准号码。ISSN具有专指性,可用于查询特定的期刊。 如:ISSN 0317-8471(前7位是期刊代号,末位是校验码) 国内统一刊号:地区号+报刊登记号+中图法分类号 如:CN41-1105/R(眼科新进展)期刊概况 非法期刊简单说是指违反某国、某地区新闻

11、出版条例、法规的期刊。国家新闻出版总署与扫黄打非办先后公布了数批非法期刊。非法期刊往往具有录用率高、发表快、不能开正规发票等特点。因此,了解非法期刊的类型以及非法期刊的识别方法是非常必要的。期刊概况 非法期刊的类型 根据国家新闻出版总署的期刊出版管理条例中的相关原则,非法期刊大致有以下几种:非法境外期刊 目前国家新闻出版总署也将香港、澳门和台湾等地区出版的期刊纳入境外期刊。国内出版的非法境外期刊主要来自香港,其主办单位有:“中华临床医药学会”、“国际出版集团”、“中华国际会”等。它们在香港注册,却主要在大陆地区非法征稿、出版。这类期刊在国际上没有任何影响力,专门以搞有偿发表为目的。期刊概况 刊

12、号严重错误或杜撰刊号的期刊 公开发行的合法期刊必须同时具备国际标准连续出版物编码ISSN(International Standard Serial Number)和国内统一刊号CN。ISSN由连字符连接两组4位数字构成,前7位是期刊代号,末位是校验码;CN包括地区号、报刊登记号(范围为1000 -5998)和中图法分类号。ISSN和CN二者缺一即可判断为非法期刊。非法期刊的两种刊号往往都是杜撰出来的。期刊概况 合法期刊制造的非法期刊 这主要是指正规期刊在正刊之外办的增刊、专刊、专辑等。根据期刊出版管理规定第三十四条规定,期刊可以在正常刊期之外出版增刊。每种期刊每年可以出版两期增刊,但必须获得

13、许可和增刊准印号。增刊内容必须符合正刊的业务范围,其开本必须和正刊一致,并且要在封面上标明“增刊”字样。但是, 不少合法期刊每年都出数本增刊,增刊规模远超正刊,比正刊厚得多,且往往未获得增刊许可证。增刊发表的论文与正刊相比往往质量不高,多不被评审机构认同。期刊概况 非学术期刊办的学术版 例如科普杂志办的学术版。这类刊物以做有偿发表为主,但往往没有得到期刊主管部门的批准,而是悄悄办的额外期刊,也不随原刊一同发行,其目的是向发表论文的作者收取版面费,搞盈利创收。这类期刊也属于非法期刊。期刊概况 非法期刊的识别 通常情况下,可以利用刊号常识来判断非法期刊。除此之外,还可以用以下方法进行识别。直接向期

14、刊所在地的新闻出版部门询问期刊的合法性 以下为全国各省市的期刊地区代号:北京 ll, 上海 3l, 湖北 42, 云南 53,天津 l2,江苏 32,湖南 43,西藏 54,河北 l3,浙江 33,广东 44,陕西 61,山西 l4,安徽 34,广西 45,甘肃 62,内蒙古 l5,福建 35,海南 46,青海 63,辽宁 2l,江西 36,重庆 50,宁夏 64,吉林 22,山东 37,四川 5l,新疆 65,黑龙江 23,河南 4l,贵州 52。如果一本期刊的地区代码超出以上范围,则肯定是非法期刊。但是,目前不少非法期刊在扫黄打非活动后“汲取教训”,将错误刊号改得非常逼真而难以辨认,这时就

15、可以直接向其刊号的所属地的新闻出版部门询问真实性。期刊概况 国际刊号效验法 按国际标准ISO3297规定,一个国际标准刊号由以“1SSN”为前缀的8位数字(两段4位数字,中间以一个连字符“”相连)组成。在前缀ISSN与数字之间应空一个字距。如:西南教育的国际刊号为1SSN 18101198,其中前7位为单纯的数字序号,最后一位为校验位,其数值根据前7位数字依次以82加权之和,以11为模数计算得到。期刊概况 国际刊号效验法 国际标准刊号(ISSN)校验位数字的计算方法如下(以西南教育为例):(1)1SSN的前7位数字为基数,如1810119;(2)取82为各位数的加权因子,8765432;(3)

16、对应各位相乘得:8 56 6 0 4 3 18;(4)乘积相加:8+56+6+O+4+3+1895;(5)以模11除和数95/11得8余7;(6)以11减去余数117得4;(7)将所得余数加到1SSN的第八位(校验位)检验即可准确判断该期刊是否为合法期刊。西南教育ISSN的最后以为是8,而余数为 4,则可判断该刊为非法期刊。再如中心理卫生杂志的ISSN为10006729,依次计算为:8000+24+21+4=57,57除11得5余2,1129,与效验位(ISSN最后一位)9相符合,则为合法期刊。但是,一旦非法期刊刊号的杜撰者也知道了这一效验法,就能制造出符合效验规则的国际刊号,这时向当地新闻出

17、版部门查询才是最准确的方法了。期刊概况 期刊网络查询法 一是期刊目录查询,如“中国中文核心期刊”,“国家期刊奖目录”,“中国期刊方阵目录”等,一般的,知名期刊都曾获得过一些国家的奖项。作者投稿最好选择知名期刊投,不要轻易投一些陌生期刊。二是数据库查询法。目前国内有五大学术期刊数据库:清华大学中国知网的中国期刊全文数据库、中国医学科学院信息研究所开发研制的中国生物医学文献数据库、中国人民解放军医学图书馆数据库研究部研制开发的中文生物医学期刊数据库、由万方数据股份有限公司研制的万方数据资源系统以及维普资讯网的中文科技期刊全文数据库,但该数据库目前还收录了不少非法期刊,准确性较前4种低。非法期刊是不

18、允许收录与广告的。一般的,作者对期刊感到陌生,对期刊名称感到古怪的才有需要进行相关的查询,一些知名学术期刊往往都是众所周知的。网络查询法可以将部分非法期刊拒之门外,在必要的时候才向新闻出版部门核实,以便节省人力财力。期刊概况 按内容多学科综合性期刊专科性期刊按功能学术性期刊科普性期刊快报、简讯性期刊检索性期刊综述性期刊按刊期周刊 旬刊 半月刊 月刊 双月刊 季刊半年刊 年刊科技期刊的主要类型 ScienceNature PNAS中国科学科学通报LancetBMJN Engl J Med JAMA中华医学杂志多学科综合性期刊如:自然科学医学如:中华内科杂志 中华心血管病杂志 糖尿病专科性期刊 按

19、内容多学科综合性期刊专科性期刊按功能学术性期刊科普性期刊快报、简讯性期刊检索性期刊综述性期刊按刊期周刊 旬刊 半月刊 月刊 双月刊 季刊半年刊 年刊科技期刊的主要类型 快报、简讯性期刊:学术性期刊上的论文一般篇幅较长,作者或出版商为使一些科学研究成果及早与读者见面,将论文压缩成比文摘稍长的短文,以“快报”(short report)或“简报”brief communication)等形式提前出版。此类期刊国外较多见。综述性期刊:这类期刊一般只选择性刊载综述性文献,刊名多含有Review(综述)字样。 按内容多学科综合性期刊专科性期刊按功能学术性期刊科普性期刊快报、简讯性期刊检索性期刊综述性期刊

20、按刊期周刊 旬刊 半月刊 月刊 双月刊 季刊半年刊 年刊科技期刊的主要类型 布拉德福定律 文献集中分散规律; 齐普夫定律 各种词汇、术语在科技文献中出现的频率; 洛特卡定律 学科领域著者数量与所写论文数量的分布规律; 巴尔顿-凯普勒方程、普赖斯指数 文献随时间增长和老化的规律; 加菲尔德定律 文献之间相互引证的规律。科技期刊中文献的变化规律 布拉德福定律布拉德福(Samue Clement Bradford,1878-1948), 英国文献学家和化学家。布拉德福定律 如果将科学杂志按其刊载某个学科主题的论文数量,以递减顺序排列起来,就可以在所有这些期刊中区分出载文率最高的“核心”部分和包含着与

21、核心部分同等数量论文的随后几区,这时核心区和后继各区中所含的期刊数成1:a:a2: 的关系(a1)。 也就是说,按期刊刊载某个学科论文的数量的大小来划分区域,可见,大量与该学科有关的论文,刊登在少量的期刊上,这个区域称为“核心区”,在这一区域的少量的学术期刊,称“核心期刊”,与此同时,有关这一学科的文章也在其它杂志上发表,这就产生了文献集中与分散的现象。 区 期刊数量 论文数量核心区 6 420相关区1 36 420相关区2 216 420布拉德福定律 所谓核心期刊,是指刊载某学科文献数量大,被引用率和利用率较高,学术水平较高和实用性较强的部分学术期刊。 核心期刊是指刊载某学科文献数量大,文摘

22、率、引文率和使用率均高的那种部分高质量的期刊。布拉德福定律 文献引证规律加菲尔德定律 在学术期刊中,学术文献之间并不是彼此孤立存在的,而是相互关联,有着千丝万缕的联系。在文献引用与被引用当中形成了一种规律,即科技文献的引证关系链。这一规律由美国著名的情报学家加菲尔德(Eugene Garfield)首次发现,并基于这个基本原理由当时他主持的美国科学情报研究所创建了“Science Citation Index”(科学引文索引)这一著名的检索工具。 某人某刊某篇文献引用另一人另一刊另一文献来源作者来源期刊来源文献被引作者被引期刊被引文献citing文献引证规律加菲尔德定律来源文献Citing被引

23、文献Cited 某人某刊某篇文献引用另一人另一刊另一文献来源作者来源期刊来源文献被引作者被引期刊被引文献citing他人citingciting他人S C I 四大检索系统(四大索引)SCI 科学引文索引 (Science Citation Index) EI 工程索引(Engineering Index)ISTP 科技会议录索引 (Index to Scientific and Technical Proceedings)ISR 科学评论索引 (Index to Scientific Reviews) 1.影响因子(Impact Factor,IF) 是国际上通用的期刊评价指标。 定义: 用

24、某刊的被引用次数除以该刊刊载的论文数。 计算方法: 该刊前两年发表论文在统计当年被引用的总数 该刊前两年发表的论文的总数 学术期刊的评价指标 计算1996年Science的影响因子C1=1995年发表的文献在1996年被引用的次数=24189(次)C2=1994年发表的文献在1996年被引用的次数=25170(次)A1=1995年发表的文献数=1037(篇)A2=1994年发表的文献数=1054(篇)则:IF=(C1+C2)/(A1+A2) =(24189+25170)/(1037+1054) = 23.605(次/篇) 被引频次(被引次数):A刊前两年被引频次为100(发文100篇)B刊前两

25、年被引频次为90 (发文50篇) 影响因子( Impact Factor):A刊:IF=100/100=1B刊:IF=90/50=1.8BAAB 影响因子(IF)表示期刊中每篇文献的平均被引证程度。 由于它是一个相对统计量,所以可公平地评价和处理大期刊和小期刊由于发文量不同所带来的偏差。 一般来说,某刊影响因子越大,则说明它的被引用率越高,学术作用也越大。 SCI收录期刊的平均影响因子约为1左右,其中影响因子最高者达48.9,我国被SCI收录的期刊的影响因子多小于1,与发达国家还有较大的差距。根据美国ISI公布的2001年的期刊的影响因子,中国两种英文版科技期刊的影响因子首次超过1,这两种期刊

26、是细胞研究IF为2.102和世界胃肠病学杂志IF为1.445 2.即时指数(Immediacy Index) 也称即时指标或当年指标,是指期刊文献当年被引用的程度。 计算方法: 当年某种期刊所发表的论文被引用总次数 该刊当年发表论文的总数 实际上也就是某刊最新一年的影响因子,数值越高,表明该刊所载论文被引用的速度越快,论文的影响力也就越大。即时指数可用来表示某种期刊揭示科学上研究热点的快慢程度,可以在一定程度上说明期刊的学术质量。学术期刊的评价指标 学术期刊的评价工具ISI(美国科学情报研究所):Journal Citation Reports(期刊引用报告,JCR) 北京大学图书馆:中文核心

27、期刊要目总览 学术期刊的评价工具Journal Citation Reports(期刊引用报告,JCR) SCI由美国科学情报研究所(ISI)出版,是一套综合性(包括医学)检索工具,收录60多个国家1945年以后的期刊。从1975年开始每年发行上一年的期刊引用报告(Journal Citation Reports,简称JCR)。JCR是美国科学情报研究所继编辑出版SCI之后,又出版的另一种新型期刊评价分析工具。从1975年开始,JCR成为SCI索引中的一个新的组成部分,以后逐渐单独成册,按年度出版,并有光盘版和网络版。目前,JCR已涵盖自然科学和社会科学6600多种期刊参考文献的引用数据,包括

28、总被引频次、影响因子、即年指标、被引半衰期等重要指标,并可按任一指标进行排序。 学术期刊的评价工具Journal Citation Reports(期刊引用报告,JCR) 由于SCI的网络版(Science Citation Index Expanded,简称SCIE)期刊数量多,涉及多达170多个学科领域,期刊质量和影响力存在很大的差距,因此,很难以IF评价不同学科领域的期刊学术水平。针对这种情况,为了更科学地对期刊的学术水平进行评价,中国科学院文献情报中心组织相关学科资深专家根据JCR每年公布的期刊引证报告数据,将该年期刊按照学科方式分成四个区。一区期刊被认定为学术质量最高,其他依次排序为二区、三区和四区。中国科学院文献情报中心的2012年JCR期刊分区报告将6428种期刊分为数学、物理、化学、地学、地学天文、生物学、农林科学、医学、工程技术、环境科学、管理科学、社会科学和综合性期刊13大类。 学术期刊的评价工具中文核心期刊要目总览 由北京大学图书馆与北京地区高

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