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2、数据库一、常用外文摘要数据库南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室常用外文摘要数据库常用外文摘要数据库PubMedEMBaseEngineering Village 2Web of ScienceScopusBIOSIS PreviewSciFinder Scholar南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室 PubMedPubMed概况概况网址： (com; org; net)由美国国立医学图书馆（National Library of Medicine - NLM）国家生物技术信息中心（National Center for

3、 Biotechnology Information - NCBI）向因特网用户提供免费MEDLINE检索服务(自1997-6-26起)南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室收录80多个国家5000多种生物医学期刊的题录与文摘，是世界上最权威的医学数据库。现有1809年以来的2700多万篇文献的记录(其中MEDLINE记录2300万多条)最近5年每年增加100多万条文献记录全部记录中有82%以上的文献为英文；2000年以来的记录中超过92%的文献为英文；收录中文刊60余种（我校学报被收录） 。 PubMedPubMed概况概况南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学

4、教研室PubMedPubMed的外部链接功能的外部链接功能 提供NCBI开发的分子生物学数据库的链接，如Nucleotide、Protein、Genome、OMIN、Structure、Taxonomy等。提供美国国立医学图书馆多种资源的链接提供相关文献（RELATED ARTICLES）的链接提供其它外部资源的链接，如生物医学期刊网站全文链接、NCBI资源。南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室外部链接南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室二、认识二、认识PubMed文献文献南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室检索练习与演示检索练习与演

5、示问题：砒霜是什么？有什么特点与作用？砒霜（三氧化二砷，白砷）：arsenic trioxide, white arsenic，As2O3利用PubMed数据库检索有关砒霜的文献南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室作者作者AU题名题名TI来源来源SO PubMedPubMed题录题录南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室三、三、PubMedPubMed检索特点检索特点南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室 PubMedPubMed检索特点检索特点检索运算符AND、NOT、OR必须大写。(vitamin c OR zinc) AND com

6、mon cold支持截词检索（*），但对词组无效。如bacter*, 可以检出以bacter为词干的单词bacteria、bacterium等最多600个单词。截词检索时，系统的自动词语匹配功能和MeSH自动扩展功能将不再被执行，如：heart attack* 将不映射到 MeSH 词 Myocardial Infarction。南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室PubMedPubMed检索特点检索特点强制检索：双引号 或限定字段 endocrine disruption （内分泌干扰） endocrine disruption注意：所有的 、*、 ( )、- 都必须是英

7、文状态下输入。南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室PubMedPubMed常用字段常用字段指定字段检索：检索词指定字段检索：检索词字段名称字段名称 或或 检索词检索词字段标识符字段标识符Affiliation AD （机构地址）（机构地址）Author AU（作者）（作者）：姚开泰（yao kai tai - yao kt, yao kaitai - yao k）； tan jau 与 tan jau 不同 Language LA（文献语种）（文献语种）：chinese la 或 chi la （前3个字母） MeSH

8、 Terms MH（主题词）（主题词）：自动扩展下位主题词；如需关闭该功能，使用mh:noexp南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室 PubMedPubMed常用字段常用字段Publication Date DP （出版日期）：（出版日期）：1998/03dp; 1998dp; 1996:1998dp; 1998/01:1998/04 dp Publication Type PT（文献类型）：（文献类型）：reviewptTitle TI （文献题名）（文献题名）Text Words TW （文本词）（文本词） ：包括Title, Abstract, MeSH Terms,

9、 MeSH Subheadings, Chemical Substance Names, Personal Name as Subject 等 字段Title/Abstract TIAB （题名与摘要）（题名与摘要）南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室检索练习检索练习检索珠江医院医护人员发表的论文检索珠江医院医护人员发表的论文 （zhujiang hospital; zhu jiang hospital ）检索珠江医院肝胆外科方驰华教授发表的论文检索珠江医院肝胆外科方驰华教授发表的论文检索珠江医院医护人员检索珠江医院医护人员2005年以来发表的英文年以来发表的英文论文论文南

10、方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室四、四、PubMedPubMed基本检索功能基本检索功能南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室检索练习与演示检索练习与演示2000年10月4日美国食品药物管理局（FDA）批准以砒霜（三氧化二砷）治疗某种类型的白血病用砒霜治疗的白血病名称是：acute promyelocytic leukemia（APL，急性早幼粒细胞白血病）砒霜(三氧化二砷，白砷)：arsenic trioxide, white arsenic，As2O3利用PubMed数据库检索有关砒霜治疗白血病

11、的文献南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室自由词检索自由词检索在检索框中键入一到多个单词，如键入：vitamin c AND common cold hepatitis b AND (diagnosis OR therapy) 检索词可出现于PubMed各记录中的标题、摘要等全部可检索字段。南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室自由词检索自由词检索南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室自由词检索自由词检索南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室检索细节（检索细节（Search Details）南方医科大学医学情报学教研室南

12、方医科大学医学情报学教研室转换后的检索转换后的检索式式可进行修改可进行修改南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室常用过滤器（常用过滤器（FiltersFilters）用于对检索结果作进一步限定文本获取（Text availability）、出版日期（Publication dates）、物种（Species）、文献类型（ Article types）、语种（Languages）、年龄（Ages）、性别（Sex） 、文献子集限定（Subsets）、期刊类别（Journal categories）、检索字段（Search fields）各种过滤器可以单独或组合使用南方医科大学医学

13、情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室在左侧点击勾选在左侧点击勾选所需过滤器，检所需过滤器，检索结果下方同时索结果下方同时提示已激活的过提示已激活的过滤器，检索结果滤器，检索结果相应发生变化。相应发生变化。南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室 每次检索可以选择多个过滤器每次检索可以选择多个过滤器。 再次点击已勾选的过滤器将取再次点击已勾选的过滤器将取消该过滤器；如需取消全部过滤消该过滤器；如需取消全部过滤器，可点击器，可点击“Clear all”。如不取。如不取消，将对后续检索一直起作用。消，将对后续检索一直起作用。

14、南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室点击点击“Show additional filters”可选择需要在左可选择需要在左侧显示的其他过滤器。侧显示的其他过滤器。南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室作者检索作者检索检索时姓用全称，名用首字母。检索时姓用全称，名用首字母。2002年以年以来的文献可以用姓名全拼形式查找。来的文献可以用姓名全拼形式查找。作者姓名书写格式作者姓名书写格式1. 西方人姓名书写格式：First name、Middle Name、Last name。美国肯尼迪总统名为： John Frank Kenedy，Kenedy为Last na

15、me（姓）。Frank为Middle name，比较少看到，多看到 John F. Kenedy，中间名缩写了。如果看到姓名中间有逗号，则逗号前一定是姓。如： Kenedy, John F. 南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室作者检索作者检索作者姓名作者姓名书写格式书写格式2. 中国人姓名格式：Last name、First name。如：钟世镇，就有如下拼写形式可供检索：Shi-zhen Zhong； Shi zhen ZhongZhong shi-zhen； Zhong，shi zhenZhong，shi-zhen zhong szShizhen Zhong，zhon

16、g shizhenzhong s南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室期刊检索期刊检索检索时可输入期刊全名，如：molecular biology of the cell，系统自动转换为mol biol cell Journal；也可输入期刊标准缩写形式（如：mol biol cell）或期刊的ISSN（国际标准出版物编号，如：1059-1524）。 如果期刊名是一个单词或恰好是MeSH词表中的词，如Gene Therapy、Science、Cell等，则必须在刊名后加ta（期刊名称字段标识符），也可使用so。南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室期刊检索期

17、刊检索如果杂志全名中包括括弧或方括号，键入时应该予以取消，例如杂志名为：J Hand Surg Am，检索时应转成：J Hand Surg Am。中文期刊，用汉语拼音：Nan fang yi ke da xue xue baoBeijing da xue xue baoZhonghua nei ke xue za zhi南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室五、五、 PubMedPubMed高级检索功能高级检索功能南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室高级检索高级检索南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室高级检索高级检索检索史中的检索式序号

18、可检索史中的检索式序号可代替检索式参与逻辑运算代替检索式参与逻辑运算南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室检索举例检索举例姚开泰院士2001年以前发表的有关鼻咽癌（nasopharyngeal cancer）方面的文献分析 姚开泰， 2001年以前， nasopharyngeal cancer南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室六、六、PubMedPubMed检索结果的处理检索结果的处理南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室检索结果的处理检索结果的处理显示格式 (Display Settings)结果排序 (Display Setting

19、s - Sort by)保存为本地文件(1万篇) (Send to File)导入文献管理软件(200篇) (Send to Citation manager)发送至电子邮箱 (Send to E-mail)南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室（一）显示格式设置（一）显示格式设置（Display Settings）南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室显示格式显示格式Abstract格式格式南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室显示格式显示格式MEDLINE格式格式导入导入NoteE

20、xpress等文献等文献管理软件的必选格式管理软件的必选格式南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室（二）将检索结果保存为本地文件（二）将检索结果保存为本地文件南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室（三）将检索结果导入文献管理软件（三）将检索结果导入文献管理软件如记录数量超过如记录数量超过200条，则条，则只能通过只能通过Send to File进行进行南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室（四）将检索结果发送到邮箱（四）将检索结果发送到邮箱南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室七、七、PubMedPubMed主题词检索南方

21、医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室MeSH (Medical Subject Headings) PubMed记录中的医学主题词(MeSH)是由标引员为PubMed中的Medline文献所人工指定的词。 例：ascorbic acid是MeSH Terms，而vitamin c则不是。标引员使用能恰当描述文章内容的最相关MeSH词。通常一篇文章可有多个MeSH词。南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室PubMed能自动地为输入的检索词寻找相应的MeSH词用户利用一个MeSH词能找出所有有关该主题的文献 不同拼写：leukemia(s), leukaemia(

22、s)leukemia同义词：tumor(s), tumour(s), cancer(s),neoplasm(s) neoplasmsMeSH (Medical Subject Headings) 南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室MeSHMeSH词独有特征词独有特征主要MeSH词(MAJOR TOPIC): MeSH term as main subject of the article (*)次要MeSH词扩展(EXPLODE)：chosen MeSH term and all more specific underlying MeSH terms副主题词(SUBHEA

23、DINGS)南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室SubHeadings SubHeadings 副主题词副主题词对一个主题词的多个方面进行修饰限定的词，又称限定词。目前有82个副主题词（2015年底MeSH词表修订时剔除了副主题词diagnostic use）并非每个主题词都能和82个副主题词组配。南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室主题词等级排列，检索时可以将包含其下位词的文献都检索出来。一个主题词可以同时处在不同类目下南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室可选用的副主题词南方医

24、科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室检索有关糖尿病（检索有关糖尿病（Diabetes ）流行病学方面的文献。流行病学方面的文献。第一步：输入检索词。第一步：输入检索词。南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室第二步：确定主题词第二步：确定主题词南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室第三步：确定副主题词第三步：确定副主题词南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室第四步：发送到检索框第四步：发送到检索框并检索并检索南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室检索结束检索结束南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学

25、教研室八、八、MyNCBIMyNCBI个性化服务个性化服务南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室MyNCBIMyNCBI个性化服务个性化服务n 存储检索式，定期发送最新相关文献。n 设定检索过滤器，使检索结果更加个性化。n 存储检索结果文献。南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室注册注册My NCBIMy NCBI账号账号南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室1. 1. 存储检索式存储检索式南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室2. 2. 设定检索过滤器设定检索过滤器南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室每个账号可对每个账号可对PubMed设置设置15个过滤器，对其他数据个过滤器，对其他数据库可设置