《生物化学》第1章蛋白质化学

1、膜膜蛋蛋白白膜蛋白起运输作用膜蛋白起运输作用抗体AntibodyAb 8、控制细胞生长、分化：、控制细胞生长、分化： 生长因子、阻遏蛋白生长因子、阻遏蛋白9、毒蛋白、毒蛋白： 植物、微生物、昆虫所分泌植物、微生物、昆虫所分泌10、许多蛋白在凝血作用、通透作用、许多蛋白在凝血作用、通透作用、 营养作用、记忆活动等方面起重要作用。营养作用、记忆活动等方面起重要作用。中文名称英文名称符号与缩写 分子量侧链结构类型丙氨酸 AlanineA 或 Ala 89.079CH3-脂肪族类精氨酸 ArginineR 或 Arg 174.188HN=C(NH2)-NH-(CH2)3- 碱性氨基酸类天冬酰胺 Asp

2、aragineN 或 Asn 132.104H2N-CO-CH2-酰胺类天冬氨酸 Aspartic acidD 或 Asp 133.089HOOC-CH2-酸性氨基酸类半胱氨酸 CysteineC 或 Cys 121.145HS-CH2-含硫类谷氨酰胺 GlutamineQ 或 Gln 146.131H2N-CO-(CH2)2-酰胺类谷氨酸 Glutamic acid E 或 Glu 147.116HOOC-(CH2)2-酸性氨基酸类甘氨酸 GlycineG 或 Gly 75.052H-脂肪族类组氨酸 HistidineH 或 His 155.141N=CH-NH-CH=C-CH2-|_|碱性

3、氨基酸类异亮氨酸 IsoleucineI 或 Ile 131.160CH3-CH2-CH(CH3)-脂肪族类亮氨酸 LeucineL 或 Leu 131.160(CH3)2-CH-CH2-脂肪族类赖氨酸 LysineK 或 Lys 146.17H2N-(CH2)4-碱性氨基酸类 蛋氨酸 MethionineM 或 Met 149.199 CH3-S-(CH2)2-含硫类苯丙氨酸 PhenylalanineF 或 Phe 165.177Phenyl-CH2-芳香族类脯氨酸 ProlineP 或 Pro 115.117-N-(CH2)3-CH-|_|亚氨基酸丝氨酸 SerineS 或 Ser 10

4、5.078HO-CH2-羟基类苏氨酸 ThreonineT 或 Thr 119.105CH3-CH(OH)-羟基类色氨酸 TryptophanW 或 Trp 204.213Phenyl-NH-CH=C-CH2-|_|芳香族类酪氨酸TyrosineY 或 Tyr 181.1764-OH-Phenyl-CH2-芳香族类缬氨酸 ValineV 或 Val 117.133CH3-CH(CH2)-脂肪族类甘氨酸 丙氨酸 缬氨酸 亮氨酸 异亮氨酸 丝氨酸脯氨酸苏氨酸半胱氨酸甲硫氨酸类别类别氨基酸氨基酸非极性氨基酸非极性氨基酸甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、苯丙氨

5、酸、脯氨酸亮氨酸、苯丙氨酸、脯氨酸极性氨基酸极性氨基酸极性中性氨基酸极性中性氨基酸色氨酸、酪氨酸、丝氨酸、半胱氨酸、色氨酸、酪氨酸、丝氨酸、半胱氨酸、蛋氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、苏氨酸蛋氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、苏氨酸酸性氨基酸酸性氨基酸天冬氨酸、谷氨酸天冬氨酸、谷氨酸碱性氨基酸碱性氨基酸赖氨酸、精氨酸、组氨酸赖氨酸、精氨酸、组氨酸Gly, GAla, AVal, VLeu, LMet, MIle, IPhe, F; Tyr, Y; Trp, WSer, SThr, TCys, CPro, PAsn, NGln, QLys, K; Arg, R; His, HAsp, D; Glu, E类别氨

6、基酸亲水性氨基酸D, E, H, K, Q, R, S, T, 羟脯氨酸, 焦谷氨酸疏水性氨基酸A, F, I, L, M, P, V, W, Y, -氨基丁酸, -氨基丙氨酸, 正亮氨酸未定类C和G3 按其亲水性、疏水性可分为：按其亲水性、疏水性可分为：羟脯氨酸（胶原蛋白）鸟氨酸（甲状腺蛋白）pH1pH 11pH6pH1pH 11pH6An acidic amino acid pI=(pK1+pKR)/2A basic amino acid pI=(pKR+pK2)/2R-R+R K1=RH+ R+K2=R+R-H+ K1 K2 =R+=RH+ R K2K1R-=H+ RH+ K1=R K2

7、H+ H+ 2570nm570nm440nmPro(Hy-Pro) 鉴定多肽或蛋白质的鉴定多肽或蛋白质的N-末端氨基酸末端氨基酸弱碱性弱碱性NCSNHCHCOR2NCHCOR1HHNHS:CCHCOR1HNNHCHCOR2SNHCNHOCR1CHNH2CHCOR2NCOCHNHSCR1 CCNCCNCCNCCNCC H2C HC H2C H2C H2C O O-O HC O2HC H2C O N H2O HC H3H3N+OOOOHHHHHHHHHSerValTyrAspGlnC H3N-端C-端肽键NHCOCH2NHCOCHNHCOCH3CHCHOHCH2OHCHHNCNHCHCNHCH2C

8、COCHNHHOCH2NHNHCHCHCH3CH2CH3COOOOCH2CH2SOOH鹅膏覃碱的化学结构 +H3N-Tyr-Gly-Gly-Phe-Met-COO- +H3N-Tyr-Gly-Gly-Phe-Leu-COO- Met-脑啡肽脑啡肽 Leu-脑啡肽脑啡肽CysTyrILeGlnAsnCysProLeuGlyNH2SS牛催产素CysTyrGlnAsnCysProSSPheArgGlyNH2牛加压素活性肽活性肽SerGlyTyrAlaLeuH2NCHCROHNCHCROORnCCHHNOHn-1N-端氨基酸 C-端氨基酸ORnCCHH2NOHH2NCHCRONHNH2+H+NH2NH

9、2氨基酸酰肼C-端氨基酸血红蛋白四级结构蛋白质结构有不同的组织层次： a盐键（离子键盐键（离子键 ） b氢键氢键 c疏水相互作用力疏水相互作用力 d 范德华力范德华力 e二硫键二硫键 f 酯键酯键氢键、范德华力、疏水相互作用力、盐键，均为氢键、范德华力、疏水相互作用力、盐键，均为次级键次级键氢键、范德华力虽然键能小，但数量大氢键、范德华力虽然键能小，但数量大疏水相互作用力对维持三级结构特别重要疏水相互作用力对维持三级结构特别重要盐键数量小盐键数量小二硫键对稳定蛋白质构象很重要，二硫键越多，二硫键对稳定蛋白质构象很重要，二硫键越多，蛋白质分子构象越稳定蛋白质分子构象越稳定离子键离子键氢键氢键范德

10、华力范德华力疏水相互作用力疏水相互作用力左手和右手螺旋左手和右手螺旋n蛋白质分子多为右手蛋白质分子多为右手 -螺旋。螺旋。 稳定性与氨基酸组稳定性与氨基酸组成有关成有关 在有在有pro处断处断裂裂 同种电荷的氨同种电荷的氨基酸处断裂基酸处断裂Four models of the helix, showing different aspectsof its structure.肌红蛋白三级结构甘油醛3-P脱氢酶结构域蚯蚓血红蛋白的结构域四个螺旋。免疫球蛋白VL的结构域丙糖异构酶血红蛋白:2个亚基和2个亚基。一级结构与分子进化一级结构与分子进化 （依据细胞色素（依据细胞色素c建立的系统发生树）建立的系统发生树）超滤透析l 不同的蛋白质分子，由于其分子表面的极不同的蛋白质分子，由于其分子表面的极性基团的种类、数目以及排布的不同，其水性基团的种类、数目以及排布的不同，其水化层厚度不同，故盐析