基因组测序技术和基因识别完整版ppt课件

1、基因组测序技术和基因识别主要内容 一、基因组测序技术 二、基因识别一、基因组测序技术 大规模DNA测序技术使全基因组的测序成为能够。 现有测序仪所能测得的序列长度有限，普通500-1000bp。而基因组序列长度远大于此，必需经过以下过程才干测得：打碎测序拼接鸟枪法杂交测序法1、鸟枪法 鸟枪法shotgun method,也称霰弹法。将DNA分子打碎，得到长度在500-1000bp之间的小片段，对这些片段测序，然后根据他们之间的关系进展拼接，得到最终目的序列。序列片段覆盖待测序列序列片段覆盖待测序列序列片段之间也存在着相互覆盖或者重叠。序列片段之间也存在着相互覆盖或者重叠。 目的序列目的序列序列

2、碎片序列碎片拼接过程 以每个片段为顶点，在每个顶点之间画有向边，有向边的权值代表交叠的字符d 得到三发送个数，方向由交叠序列前片段指向后片段。AGGTCCTAAAAGGTCCTAAAAGGTCCTAAAAGGTCCTAAA1341113拼接过程 查找能顺箭头方向依次经过各顶点的一切通路中权值之和最大的，即为拼接后的序列。1 adbc，权值82 bcad，权值73 badc，权值54 cadb，权值105 dbca，权值8拼接结果：AGGTCCTAAA最大权的哈密顿途径问题Hamilton tour problemAGGTCCTAAAAGGTCCTAAA1341113abcd2、杂交测序法 杂交

3、测序法sequencing by hybridization，SBH 根本原理是：构建基因微阵列microarray，也称基因芯片，gene chip，让待测序列与其反响，然后由反响获得的信息确定待测序列的部分序列，最后根据这些部分序列重构目的序列。 基因微阵列microarray，也称基因芯片，gene chip，将高密度DNA片段阵列以一定的陈列方式使其附着在基片上而构成。AA AT AG AC TA TT TG TC GA GT GG GC CA CT CG CCAAATAGACTATTTGTCGAGTGGGCCACTCGCCGCACCTGAACTGCACT目的序列：CGTGACT 互补

4、序列：GCACTGA 由测出的部分序列：GCAC、ACTG、CTGA、CACT，可以重构目的序列的互补序列GCACTGA ，从而得到目的序列 CGTGACT 。 可用求最大权值的哈密顿途径的方法求解。 也可用欧拉途径的方法求解，该算法较省时。3、拼接软件 Phred、Phrap、Consed Sequencher ContigExpress1aggtcc2taaa3agg4tcctaaa二、基因识别二、基因识别 基因组基因组genome是指一个生物体、细胞或病毒是指一个生物体、细胞或病毒的整套基因。的整套基因。 基因组学基因组学genomics以基因组分析为手段，研以基因组

5、分析为手段，研讨基因组的构成、时序表达方式和功能，并提供有讨基因组的构成、时序表达方式和功能，并提供有关生物物种及其细胞功能的进化信息。关生物物种及其细胞功能的进化信息。 功能基因组学研讨基因和非编码序列生物学功能。功能基因组学研讨基因和非编码序列生物学功能。 比较基因组学经过生物物种基因组之间的比较，研比较基因组学经过生物物种基因组之间的比较，研讨基因的功能。讨基因的功能。 基因识别是识别基因识别是识别DNA序列上的具有生物学特序列上的具有生物学特征的片段，是基因组研讨的根底。征的片段，是基因组研讨的根底。 基因识别是生物信息学领域里的一个重要研基因识别是生物信息学领域里的一个重要研讨内容讨

6、内容 基因识别问题，在近几年遭到广泛的注重基因识别问题，在近几年遭到广泛的注重 当人类基因组研讨进入一个系统测序阶段时，当人类基因组研讨进入一个系统测序阶段时，急需可靠自动的基因组序列翻译解释技术，急需可靠自动的基因组序列翻译解释技术，以处置大量已测定的但未知功能或未经注释以处置大量已测定的但未知功能或未经注释的的DNA序列序列 1、原核基因识别、原核基因识别 原核基因特点：基因密度高、简单绝大原核基因特点：基因密度高、简单绝大多数不含内含子。其重点在于识别编码多数不含内含子。其重点在于识别编码区域区域非翻译区域非翻译区域untranslated regions, UTR 编码区域两端的编码区

7、域两端的DNA，有一部分被转录，但是不被翻译，这一，有一部分被转录，但是不被翻译，这一部分称为非翻译区域部分称为非翻译区域 5UTR-基因上游区域的非翻译区域基因上游区域的非翻译区域 3UTR-基因下游区域的非翻译区域基因下游区域的非翻译区域 对于任何给定的核酸序列单链DNA或mRNA，根据密码子的起始位置，可以按照三种方式进展解释。 例如，序列ATTCGATCGCAA 这三种阅读顺序称为阅读框reading framesCAA A ATTCGATCGATTCGATCGCAAATTCGATCGCA132一个开放阅读框一个开放阅读框ORF,open reading frame是一个没有是一个没有

8、终止编码的密码子序列。终止编码的密码子序列。原核基因识别义务的重点是识别开放阅读框，或者说识别长原核基因识别义务的重点是识别开放阅读框，或者说识别长的编码区域。的编码区域。基于基因密码子特性的识别方法基于基因密码子特性的识别方法区分编码区域与非编码区域的一种方法区分编码区域与非编码区域的一种方法是检查终止密码子的出现频率是检查终止密码子的出现频率 终止密码子出现的期望次数为：终止密码子出现的期望次数为： 每每21个个 64/3密码子出现一次终止密码子密码子出现一次终止密码子 根本思想：根本思想：假设可以找到一个比较长的序列，其相应的密码子序列假设可以找到一个比较长的序列，其相应的密码子序列不含

9、终止密码子，那么这段序列能够就是编码区域。不含终止密码子，那么这段序列能够就是编码区域。根本算法：根本算法：扫描给定的扫描给定的DNA序列，在三个不同的阅读框中寻觅较序列，在三个不同的阅读框中寻觅较长的长的ORF。遇到终止密码子以后，回头寻觅起始密。遇到终止密码子以后，回头寻觅起始密码子。码子。这种算法过于简单，不适宜于处置短的这种算法过于简单，不适宜于处置短的ORF或者交叠或者交叠的的ORF。 识别编码区域的另一种方法是分析各种密码子出现识别编码区域的另一种方法是分析各种密码子出现的频率的频率 将一个随机均匀分布的将一个随机均匀分布的DNA序列翻译成氨基酸序列翻译成氨基酸序列，那么在氨基酸序

10、列中上述序列，那么在氨基酸序列中上述3种氨基酸出现的种氨基酸出现的比例应该为比例应该为6:4:1例如，亮氨酸、丙氨酸、色氨酸分别有例如，亮氨酸、丙氨酸、色氨酸分别有6个、个、4个和个和1个密码子个密码子但是在真实的氨基酸序列中，上述比例并不但是在真实的氨基酸序列中，上述比例并不正确正确这阐明这阐明DNA的编码区域并非随机的编码区域并非随机 假设在一条假设在一条DNA序列中曾经找到一切的序列中曾经找到一切的ORF，那么可以利用密码子频率进一步区分编码那么可以利用密码子频率进一步区分编码ORF和和非编码非编码ORF 利用这种方法，可以计算一个利用这种方法，可以计算一个ORF成为编码区域成为编码区域

11、的能够性。的能够性。基于编码区域碱基组成特征的识别方法基于编码区域碱基组成特征的识别方法编码序列与非编码序列在碱基组成上有区别编码序列与非编码序列在碱基组成上有区别单个碱基的组成比例单个碱基的组成比例多个碱基的组成多个碱基的组成经过统计分析识别编码序列经过统计分析识别编码序列2 2、真核基因识别问题、真核基因识别问题 真核基因远比原核基因复杂：一方面，真核基因的编码区域是非延续的，编码区域被分割为假设干个小片段。另一方面，真核基因具有更加丰富的基因调控信息，这些信息主要分布在基因上游区域。 基因识别根本思绪基因识别根本思绪 找出基因两端的功能区域找出基因两端的功能区域:转录启动区转录启动区 终

12、止区终止区 在启动区下游位置寻觅翻译起始密码子在启动区下游位置寻觅翻译起始密码子 识别转录剪切位点识别转录剪切位点剪切给体位点剪切给体位点剪切接受体位点剪切接受体位点 各种不同的方法有不同的顺应面，而不同的方法有时可以结合起来以提高基因识别的准确率。 关键问题是如何提高一个识别算法的敏感性sensitivity，Sn和特异性specificity，Sp。 3 3、基因识别的主要方法、基因识别的主要方法两大类识别方法：两大类识别方法：从头算方法或基于统计的方法从头算方法或基于统计的方法根据蛋白质编码基因的普通性质和特征进展识别，经过根据蛋白质编码基因的普通性质和特征进展识别，经过统计值区分外显子

13、、内含子及基因间区域统计值区分外显子、内含子及基因间区域 基于同源序列比较的方法基于同源序列比较的方法利用数据库中现有与基因有关的信息如利用数据库中现有与基因有关的信息如EST序列、蛋序列、蛋白质序列，经过同源比较，协助发现新基因。白质序列，经过同源比较，协助发现新基因。最理想的方法是综合两大类方法的优点，开发混合算法。最理想的方法是综合两大类方法的优点，开发混合算法。 基因识别方法有基因识别方法有 ： 1基于规那么的系统基于规那么的系统 2 语义学方法语义学方法 3 线性区分分析线性区分分析LDA 4 决策树决策树 5 动态规划动态规划 6 隐马尔柯夫模型隐马尔柯夫模型 7 剪切对比陈列剪切

14、对比陈列 spliced alignment4、基因识别程序引见表表5.7 基因识别程序及访问地址基因识别程序及访问地址HP主页；主页；ES效力器；效力器；WSweb效力器；效力器；CL客户客户/效力器协议；效力器协议；EX有可执行代码；有可执行代码；SC有源代码有源代码表表5.8 各程序的性能比较敏感性各程序的性能比较敏感性(1)被预测出的真实编码核酸的被预测出的真实编码核酸的%；敏感性敏感性(2)被正确识别出的编码外显子的被正确识别出的编码外显子的%；特异性特异性(1)预测出的编码核酸为真实编码核酸的预测出的编码核酸为真实编码核酸的%；特异性特异性(2)预测出外显子为真实外显子的预测出外显

15、子为真实外显子的%Genscan访问：/GENSCAN.html以核酸序列SEQ5作综合分析为例SEQ5SEQ5seq51 gaattccagg ttggaggggc ggcaacctcc tgccagcctt caggccactc tcctgtgcct 61 gccagaagag acagagcttg aggagagctt gaggagagca ggaaaggtgg aacattgctg 121 ctgctgctca ctcagttcca caggtgggag gaacagcagg gcttagagtg ggggtcattg 181 tgcagatggg aaaac

16、aaagg cccagagagg ggaagaaatg cctaggagct accgagggca 241 ggcgacctca accacagccc agtgctggag ctgtgagtgg atgtagagca gcggaatatc 301 cattcagcca gctcagggga aggacagggg ccctgaagcc aggggatgga gctgcaggga 361 agggagctca gagagaaggg gaggggagtc tgagctcagt ttcccgctgc ctgaaaggag 421 ggtggtacct actcccttca cagggtaact gaa

17、tgagaga ctgcctggag gaaagctctt 481 caagtgtggc ccaccccacc ccagtgacac cagcccctga cacgggggag ggagggcagc 541 atcaggaggg gctttctggg cacacccagt acccgtctct gagctttcct tgaactgttg 601 cattttaatc ctcacagcag ctcaacaagg tacataccgt caccatcccc attttacaga 661 tagggaaatt gaggctcgga gcggttaaac aactcacctg aggcctcaca g

18、ccagtaagt 721 gggttccctg gtctgaatgt gtgtgctgga ggatcctgtg ggtcactcgc ctggtagagc 781 cccaaggtgg aggcataaat gggactggtg aatgacagaa ggggcaaaaa tgcactcatc 841 cattcactct gcaagtatct acggcacgta cgccagctcc caagcaggtt tgcgggttgc 901 acagcggagc gatgcaatct gatttaggct tttaaaggat tgcaatcaag tgggacccac 961 tagcct

19、caac cctgtacctc ccctcccctc cacccccagc agtctccaaa ggcctccaac 1021 aaccccagag tgggggccat gtatccaaag aaactccaag ctgtatacgg atcacactgg 1081 ttttccagga gcaaaaacag aaacagcctg aggctggtca aaattgaacc tcctcctgct 1141 ctgagcagcc tagggggcag actaagcaga gggctgtgca gacccacata aagagcctac 1201 tgtgtgccag gcacttcacc

20、cgaggcactt cacaagcatg cttgggaatg aaacttccaa 1261 ctctttggga tgcaggtgaa acagttcctg gttcagagag gtgaagcggc ctgcctgagg 1321 cagcacagct cttctttaca gatgtgcttc cccacctcta ccctgtctca cggcccccca 1 tgccagcctg acggttgtgt ctgcctcagt catgctccat ttttccatcg ggaccatcaa 1441 gagggtgttt gtgtctaagg ctgactgggt aactttgg

21、at gagcggtctc tccgctccga 1501 gcctgtttcc tcatctgtca aacgggctct aacccactct gatctcccag ggcggcagta 1561 agtcttcagc atcaggcatt ttggggtgac tcagtaaatg gtagatcttg ctaccagtgg 1621 aacagccact aaggattctg cagtgagagc agagggccag ctaagtggta ctctcccaga 1681 gactgtctga ctcacgccac cccctccacc ttggacacag gacgctgtgg tt

22、tctgagcc 1741 aggtacaatg actcctttcg gtaagtgcag tggaagctgt acactgccca ggcaaagcgt 1801 ccgggcagcg taggcgggcg actcagatcc cagccagtgg acttagcccc tgtttgctcc 1861 tccgataact ggggtgacct tggttaatat tcaccagcag cctcccccgt tgcccctctg 1921 gatccactgc ttaaatacgg acgaggacag ggccctgtct cctcagcttc aggcaccacc 1981 ac

23、tgacctgg gacagtgaat cgtaagtatg cctttcactg cgaggggttc tggagaggct 2041 tccgagctcc ccatggccca ggcaggcagc aggtctgggg caggaggggg gttgtggagt 2101 gggtatccgc ctgctgaggt gcagggcaga tggagaggct gcagctgagc tcctattttc 2161 ataataacag cagccatgag ggttgtgtcc tgtttcccag tcctgcccgg tcccccctcg 2221 gtacctcctg gtggata

24、cac tggttcctgt aagcagaagt ggatgagggt gtctaggtct 2281 gcagtcctgg caccccagga tgggggacac cagccaagat acagcaacag caacaaagcg 2341 cagccatttc tttctgtttg cacagctcct ctgtctgtcg ggggctcctg tctgttgtct 2401 cctataagcc tcaccacctc tcctactgct tgggcatgca tctttctccc cttctataga 2461 tgaggaggtt aaggttcaga gaggggtggg g

25、aggaacgcc ggctcacatt ctccatcccc 2521 tccagatatg accaggaaca gacctgtgcc agcctcagcc ttacatcaaa atgggcctcc 2581 ccatgcaccg tggacctctg ggccctcctg tcccagtgga ggacaggaag ctgtgagggg 2641 cactgtcacc cagggctcaa gctggcattc ctgaataatc gctctgcacc aggccacggc 2701 taagctcagt gcgtgattaa gcctcataac cctccaaggc agttac

26、tagt gtgattccca 2761 ttttacagat gaggaagatg gggacagaga ggtgaataac tggccccaaa tcacacacca 2821 tccataattc gggctcaggc acctggctcc agtccccaaa ctcttgaacc tggccctagt 2881 gtcactgttt ctcttgggtc tcaggcgctg gatggggaac aggaaacctg ggctgaactt 2941 gaggcctctc tgatgctcgg tgacttcaga cagttgctca acctctctgt tctcttgggc

27、3001 aaaacatgat aacctttgac ttctgtcccc tcccctcacc ccacccgacc ttgatctctg 3061 aagtgttgga aggatttaat ttttcctgca ctgagttttg gagacaggtc aaaaagatga 3121 ccaaggccaa ggtggccagt ttcctataga acgcctctaa aagacctgca gcaatagcag 3181 caagaactgg tattctcgag aacttgctgc gcagcaggca cttcttggca ttttatgtgt 3241 atttaatttc

28、acaatagctc tatgacaaag tccacctttc tcatctccag gaaactgagg 3301 ttcagagagg ttaagtaact tgtccaaggt cacacagcta atagcaagtt gacgtggagc 3361 aatctggcct cagagccttt aattttagcc acagactgat gctcccctct tcatttagcc 3421 aggctgcctc tgaagttttc tgattcaaga cttctggctt cagctttgta cacagagatg 3481 attcaatgtc aggttttgga gcgaa

29、atctg tttaatccca gacaaaacat ttaggattac 3541 atctcagttt tgtaagcaag tagctctgtg atttttagtg agttatttaa tgctctttgg 3601 ggctcaattt ttctatctat aaaatagggc taataatttg caccttatag ggtaagcttt 3661 gaggacagat tagatgatac ggtgcctgta aaacaccagg tgttagtaag tgtggcaatg 3721 atggtgacgc tgaggctgtg tttgcttagc atagggttag

30、 gcagctggca ggcagtaaac 3781 agttggataa tttaatggaa aatttgccaa actcagatgc tgttcactgc tgagcaggag 3841 ccccttcctg ctgaaatggt cctggggagt gcagcaggct ctccgggaag aaatctacca 3901 tctctcgggc aggagctcaa cctgtgtgca ggtacaggga gggcttcctc acctggtgcc 3961 cactcatgca ttacgtcagt tattcctcat ccctgtccaa aggattcttt tctc

31、cattgt 4021 acagctatga agctagtgct caaagaagtg aagtcattta ccccaggccc cctgccagta 4081 agtgacaggg cctggtcaca cttgggttta tttattgccc agttcaacag gttgtttgac 4141 cataggcgag attctcttcc ctgcaccctg ccgggttgct cttggtccct tattttatgc 4201 tcctgggtag aaatggtgcg agattaggca gggagtggac gcttccctgt ccctggcccc 4261 gcaa

32、agagtg ctcccacctg ccccgatccc agaaatgtca ccatgaagcc ttcattcttt 4321 tggtttaaag cttggcctca gtgtccgtac accatggggt ccttggccag atggcgactt 4381 tctcctctcc agtcgccctc ccaggcacta gcttttagga gtgcagggtg ctgcctctga 4441 tagaagggcc aggagagagc aggttttgga gacctgatgt tataaggaac agcttgggag 4501 gcataatgaa cccaacatg

33、a tgcttgagac caatgtcaca gcccaattct gacattcatc 4561 atctgagatc tgaggacaca gctgtctcag ttcatgatct gagtgctggg aaagccaaga 4621 cttgttccag ctttgtcact gacttgctgt atagcctcaa caaggccctg accctctctg 4681 ggcttcaaac tcttcactgt gaaaggagga aaccagagta ggtgatgtga caccaggaaa 4741 gatggatggg tgtgggggaa tgtgctcctc cca

34、gctgtca ccccctcgcc accctccctg 4801 caccagcctc tccacctcct ttgagcccag aattcccctg tctaggaggg cacctgtctc 4861 gtgcctagcc atgggaattc tccatctgtt ttgctacatt gaacccagat gccattctaa 4921 ccaagaatcc tggctgggtg caggggctct cgcctgtaac cccagcactt tgggaggcca 4981 aggcaggcgg atcaagaggt caggagttca agacctgcct ggccaaca

35、cg gtgaaacctc 5041 agctctacta aaaatacaaa aattagccag gcgtggtggc acacgcctgt aatcccagct 5101 atttgggaag ctgagacaga agaatttctt gaacccggga ggtggaggtt tcagtgagcc 5161 gagatcacgc cactgcactc caccctggcg gataaagcga gactctgtct caaaaaaaac 5221 ccaaaaacct atgttagtgt acagagggcc ccagtgaagt cttctcccag ccccactttg 52

36、81 cacaactggg gagagtgagg ccccaggacc agaggattct tgctaaaggc caagtggata 5341 gtgatggccc tgccaggcta gaagccacaa cctctggccc tgaggccact cagcatattt 5401 agtgtcccca ccctgcagag gcccaactcc ctcctgacca ctgagccctg taatgatggg 5461 ggaatttcca taagccatga aggactgcac aaagttcagt tgggagtgaa agagaaatta 5521 aagggagatg ga

37、aatataca gcactaattt tagcaccgtc ttcagttcta acaacactag 5581 ctagctgaag aaaatacaaa catgtattat gtaatgtgtg gtctgttcca tttggattac 5641 ttagaggcac gagggccaag gagaaaggtg gtggagagaa accagctttg cacttcattt 5701 gttgctttat tggaaggaaa cttttaaaag tccaaggggg ttgaagaatc tcaatatttg 5761 ttatttccag ctttttttct ccagttt

38、ttc atttcccaaa ttcaaggaca cctttttctt 5821 tgtattttgt taagatgatg gttttggttt tgtgactagt agttaacaat gtggctgccg 5881 ggcatattct cctcagctag gacctcagtt ttcccatctg tgaagacggc aggttctacc 5941 tagggggctg caggcaggtg gtccgaagcc tgggcatatc tggagtagaa ggatcactgt 6001 ggggcagggc aggttctgtg ttgctgtgga tgacgttgac t

39、ttgaccatt gctcggcaga 6061 gcctgctctc gctggttcag ccacaggccc caccactccc tattgtctca gccccgggta 6121 tgaaacatgt attcctcact ggcctatcac ctgaagcctt tgaatttgca acacctgcca 6181 acccctccct caaaagagtt gccctctcta gatccttttg atgtaaggtt tggtgttgag 6241 acttatttca ctaaattctc atacataaac atcactttat gtatgaggca aaatga

40、ggac 6301 cagggagatg aatgacttgt cctggctcat acacctggaa agtgacagag tcagattaga 6361 tcctaggtct atctgaagtt aaaagaggtg tcttttcact tcccacctcc tccatctact 6421 ttaaagcagc acaaacccct gctttcaagg agagatgagc gtctctaaag cccctgacag 6481 caagagccca gaactgggac accattagtg acccagacgg caggtaagct gactgcagga 6541 gcatca

41、gcct attcttgtgt ctgggaccac agagcattgt ggggacagcc ccgtctcttg 6601 ggaaaaaaac cctaagggct gaggatcctt gtgagtgttg ggtgggaaca gctcccagga 6661 ggtttaatca cagcccctcc atgctctcta gctgttgcca ttgtgcaaga tgcatttccc 6721 ttctgtgcag cagtttccct ggccactaaa tagtgggatt agatagaagc cctccaaggg 6781 ctccagcttg acatgattct

42、tgattctgat ctgacccgat tctgataatc gtgggcaggc 6841 ccattcctct tcttgtgcct cattttcttc ttttgtaaaa caatggctgt accatttgca 6901 tcttagggtc attgcagatg aaagtgttgc tgtccagagc ctgggtgcag gacctagatg 6961 taggattctg gttctgctac ttcctcagtg acattgaata gctgacctaa tctctctggc 7021 tttggtttct tcatctgtaa aagaaggata ttagc

43、attag cacctcacgg gattgttaca 7081 agaaagcaat gaattaacac atgtgagcac ggagaacagt gcttggcata tggtaagcac 7141 tacgtacatt ttgctattct tctgattctt tcagtgttac tgatgtcggc aagtacttgg 7201 cacaggctgg tttaataatc cctaggcact ttcacgtggt gtcaatccct gatcactggg 7261 agtcatcatg tgccttgact cgggcctggc ccccccatct ctgtcttgca

44、 ggacaatgcc 7321 gtcttctgtc tcgtggggca tcctcctgct ggcaggcctg tgctgcctgg tccctgtctc 7381 cctggctgag gatccccagg gagatgctgc ccagaagaca gatacatccc accatgatca 7441 ggatcaccca accttcaaca agatcacccc caacctggct gagttcgcct tcagcctata 7501 ccgccagctg gcacaccagt ccaacagcac caatatcttc ttctccccag tgagcatcgc 7561

45、 tacagccttt gcaatgctct ccctggggac caaggctgac actcacgatg aaatcctgga 7621 gggcctgaat ttcaacctca cggagattcc ggaggctcag atccatgaag gcttccagga 7681 actcctccgt accctcaacc agccagacag ccagctccag ctgaccaccg gcaatggcct 7741 gttcctcagc gagggcctga agctagtgga taagtttttg gaggatgtta aaaagttgta 7801 ccactcagaa gcct

46、tcactg tcaacttcgg ggacaccgaa gaggccaaga aacagatcaa 7861 cgattacgtg gagaagggta ctcaagggaa aattgtggat ttggtcaagg agcttgacag 7921 agacacagtt tttgctctgg tgaattacat cttctttaaa ggtaaggttg ctcaaccagc 7981 ctgagctgtt tcccatagaa acaagcaaaa atatttctca aaccatcagt tcttgaactc 8041 tccttggcaa tgcattatgg gccatagca

47、a tgcttttcag cgtggattct tcagttttct 8101 acacacaaac actaaaatgt tttccatcat tgagtaattt gaggaaataa tagattaaac 8161 tgtcaaaact actgacgctc tgcagaactt ttcagagcct ttaatgtcct tgtgtatact 8221 gtatatgtag aatatataat gcttagaact atagaacaaa ttgtaataca ctgcataaag 8281 ggatagtttc atggaacata ctttacacga ctctagtgtc cca

48、gaatcag tatcagtttt 8341 gcaatctgaa agacctgggt tcaaatcctg cctctaacac aattagcttt tgacaaaaac 8401 aatgcattct acctctttga ggtgctaatt tctcatctta gcatggacaa aataccattc 8461 ttgctgtcag gtttttttag gattaaacaa atgacaaaga ctgtggggat ggtgtgtggc 8521 atacagcagg tgatggactc ttctgtatct caggctgcct tcctgcccct gaggggtt

49、aa 8581 aatgccaggg tcctgggggc cccagggcat tctaagccag ctcccactgt cccaggaaaa 8641 cagcataggg gaggggaggt gggaggcaag gccaggggct gcttcctcca ctctgaggct 8701 cccttgctct tgaggcaaag gagggcagtg gaggcaagcc aggctgcagt cagcacagct 8761 aaagtcctgg ctctgctgtg gccttagtgg gggcccaggt ccctctccag ccccagtctc 8821 ctccttct

50、gt ccaatgagaa agctgggatc aggggtccct gaggcccctg tccactctgc 8881 atgcctcgat ggtgaagctc tgttggtatg gcagagggga ggctgctcag gcatctgcat 8941 ttcccctgcc aatctagagg atgaggaaag ctctcaggaa tagtaagcag aatgtttgcc 9001 ctggatgaat aactgagctg ccaattaaca aggggcaggg agccttagac agaaggtacc 9061 aaatatgcct gatgctccaa ca

51、ttttattt gtaatatcca agacaccctc aaataaacat 9121 atgattccaa taaaaatgca cagccacgat ggcatctctt agcctgacat cgccacgatg 9181 tagaaattct gcatcttcct ctagttttga attatcccca cacaatcttt ttcggcagct 9241 tggatggtca gtttcagcac cttttacaga tgatgaagct gagcctcgag ggatgtgtgt 9301 cgtcaagggg gctcagggct tctcagggag gggactc

52、atg gtttcttatt ctgctacact 9361 cttccaaacc ttcactcacc cctggtgatg cccaccttcc cctctctcca ggcaaatggg 9421 agagaccctt tgaagtcaag gacaccgagg aagaggactt ccacgtggac caggtgacca 9481 ccgtgaaggt gcctatgatg aagcgtttag gcatgtttaa catccagcac tgtaagaagc 9541 tgtccagctg ggtgctgctg atgaaatacc tgggcaatgc caccgccatc t

53、tcttcctgc 9601 ctgatgaggg gaaactacag cacctggtaa atgaactcac ccacgatatc atcaccaagt 9661 tcctggaaaa tgaagacaga aggtgattcc ccaacctgag ggtgaccaag aagctgccca 9721 cacctcttag ccatgttggg actgaggccc atcaggactg gccagagggc tgaggagggt 9781 gaaccccaca tccctgggtc actgctactc tgtataaact tggcttccag aatgaggcca 9841 c

54、cactgagtt caggcagcgc cgtccatgct ccatgaggag aacagtaccc agggtgagga 9901 ggtaaaggtc tcgtccctgg gaacttccca ctccagtgtg gacactgtcc cttcccaata 9961 tccagtgccc aaggcaggga cagcagcacc accacacgtt ctggcagaac caaaaaggaa 10021 cagatgggct tcctggcaaa ggcagcagtg gagtgtggag ttcaagggta gaatgtccct 10081 ggggggacgg ggga

55、agagcc tgtgtggcaa ggcccagaaa agcaaggttc ggaattggaa 10141 cagccaggcc atgttcgcag aaggcttgcg tttctctgtc actttatcgg tgctgttaga 10201 ttgggtgtcc tgtagtaagt gatacttaaa catgagccac acattagtgt atgtgtgtgc 10261 attcgtgatt atgcccatgc cctgctgatc tagttcgttt tgtacactgt aaaaccaaga 10321 tgaaaataca aaaggtgtcg ggttc

56、ataat aggaatcgag gctggaattt ctctgttcca 10381 tgccagcacc tcctgaggtc tctgctccag gggttgagaa agaacaaaga ggctgagagg 10441 gtaacggatc agagagccca gagccagctg ccgctcacac cagaccctgc tcagggtggc 10501 attgtctccc catggaaaac cagagaggag cactcagcct ggtgtggtca ctcttctctt 10561 atccactaaa cggttgtcac tgggcactgc caccag

57、cccc gtgtttctct gggtgtaggg 10621 ccctggggat gttacaggct gggggccagg tgacccaaca ctacagggca agatgagaca 10681 ggcttccagg acacctagaa tatcagagga ggtggcattt caagcttttg tgattcattc 10741 gatgttaaca ttctttgact caatgtagaa gagctaaaag tagaacaaac caaagccgag 10801 ttcccatctt agtgtgggtg gaggacacag gagtaagtgg cagaaataat cagaaaagaa 10861 aacacttgca ctgtggtggg tcccagaaga acaagaggaa tgctgtgcca tgc