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文档简介

1、第一章蛋白质1、必需氨基酸( essential amino acid )必需氨基酸指的是人体自身不能合成或合成速度不能满足人体需要,必须从食物中摄取的氨基酸。分别是:赖氨酸、色氨酸、苯丙氨酸、 蛋氨酸、苏氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、缬氨酸。2、等电点(isoelectric point,pl)在某一 PH的溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势及成都相等,称为间性离子,呈 电中性,此时溶液的 PH称为该氨基酸的等电点。3、模体(motif)在蛋白质分子中,可发现 2个或者3个具有二级结构的肽段,在空间上相互接近,形成一 个特殊的空间构象,并具有相应的功能,被称为模体4、结构域(domain )

2、分子量较大的蛋白质常可折叠成多个结构较为紧密的区域, 其功能,称为结构域该区域具有独立的构象,并各行5、蛋白质的变性(protein denaturation)在某些物理和化学因素作用下,蛋白质的空间构象被破坏,间结构,从而导致其理化性质的改变和生物活性的丧失, 的变性。即有序的空间结构变成无序的空 但是一级结构没有改变称为蛋白质6、蛋白质的复性(p rotein ren aturatio n ):若蛋白质变性程度较轻, 功能,称为复性去除变性因素后,有些蛋白质仍可恢复或部分恢复其原有的构象和7、亚基(subunit):在蛋白质的四级结构中, 连,成为一定的空间结构。有二个或二个以上具有独立的

3、三级结构的多肽链,彼此借次级键相具有独立三级结构的多肽链单位,称为亚基或亚单位,8、别构效应(变位效应,allosteric effect ):蛋白质空间构象的改变伴随其功能的变化,称为变构效应。具有变构效应的蛋白质称为变构蛋白,常有四级结构,例如血红蛋白。(书上)凡蛋白质分子因与某种小分子物质相互作用发生构象改变,因而改变了这种蛋白质与其它分子进行反应的能力,这一现象称为变构作用。( PPT 上)9 分子病(molecular disease ) 由于遗传物质(DNA)的突变,导致其编码的蛋白质分子的氨基酸序列异常,而引起其功能 改变的遗传性疾病。第二章核酸1 .核酸的变性(denatura

4、tion )在某些理化因素作用下,DNA分子互补碱基对之间氢键断裂,DNA双螺旋打开,变为单链。2 .退火(annealing ) 变性DNA在适当条件下,两条互补链可重新恢复天然的双螺旋结构,这一现象称退火,又 称复性。3 .分子杂交( molecular hybridization )不同来源的核酸变性后合并在一起进行复性。只要这些核酸分子的核苷酸序列中含有可以形成碱基互补配对的序列,彼此之间即可形成局部双链,即所谓的杂化双链(heterodu plex)。这个过程叫杂交或核酸分子杂交。4. 解链温度(melting temperature, Tm)在解链过程中,紫外吸光度的变化A260达

5、到最大变化值的一半时所对应的温度称为Tm第三章酶1 .变构酶(allosteric enzyme )使酶发生一些小分子物质能够与酶的活性中心以外的调节部位或亚基以非共价键形式结合, 变构而改变其催化活性,这种酶称为变构酶2 .同工酶(isozyme ) 指催化相同的化学反应,但酶蛋白的分子结构、理化性质乃至免疫学性质不同的一组酶3 .酶原(zymogen ) 有些酶在细胞内合成或初分泌,或在其发挥催化功能前只有酶的无活性前体, 必须在一定条 件下,这些酶的前体水解开一个或者几个特定的肽键, 致使构想发生改变,表现出酶的活性, 这种无活性酶的前体称为酶原。4 .活性中心(active cente

6、r )酶分子中的必需基团相对集中,组成具有特定空间结构的区域,转化为产物。能与底物特异结合并将底物5米氏常数(Km )Km是当酶促反应速度为最大反应速度一半时的底物浓度。单位:mol/L。6 变构调节(allosteric regulation )一些小分子物质能够与酶的活性中心以外的调节部位或亚基以非共价键形式结合, 象发生改变,使酶的活性改变,这种现象称为变构调节使酶的构7 酶的化学修饰 Chemical modification酶蛋白肽链上的一些基团可与某种化学基团发生可逆的共价结合,从而改变酶的活性。称为酶的化学修饰(Chemical modification )或共价修饰 (cova

7、lent modification)8 必需基团(essential group )酶分子中与催化作用直接相关、不可缺少的化学基团。(催化基团、结合基团)9全酶holoenzyme :即酶蛋白与辅助因子。酶蛋白和辅助因子单独存在都不具有酶活性,只有全酶具有酶活性。10 酶(enzyme)是由活细胞产生,对其底物具有高度催化效能和高度专一性,能在细胞内外起同样催化作用的一类生物催化剂。第四章糖代谢1. 糖异生 gluconeogenesis从非糖物质(乳酸、甘油、生糖氨基酸)转变为葡萄糖或者糖原的过程称为糖异生2. 糖酵解(glycolysis )与无氧氧化(an aerobic oxidati

8、 on )称为糖在机体缺氧条件下, 葡萄糖经一系列酶促反应生成丙酮酸进而还原生成乳酸的过程, 降解,亦称为无氧氧化3. 有氧氧化(Aerobic Oxidation )葡萄糖或糖原在有氧条件下彻底氧化成H2O和CO2,同时释放出能量的过程,这是糖氧化的主要方式。1. 必需脂肪酸(essential fatty acid)人体必需但自身不能合成或合成不足, 生四烯酸。2. 酮体(ketone body)第五章脂代谢必须依赖食物供给的脂肪酸,如亚油酸、亚麻酸和花肝细胞通过脂酸 3-氧化产生的大量乙酰 化为被称为酮体的化合物,包括乙酰乙酸,COA除通过氧化生成 ATP供能外,还在线粒体内转3-羟丁酸

9、,丙酮。3 .脂肪动员(fat mobilization)储存在脂肪细胞中的脂肪, 被脂酶逐步水解为游离脂酸及甘油,并释放入血以供其他组织氧化利用的过程。4. 脂肪酸的伊氧化(oxidation of fatty acid )脂酰CoA进入线粒体基质后,从脂酰基的3碳原子开始,经过脱氢、加水、再脱氢、硫解CoA。等4步连续反应,脂酰基断裂产生1分子乙酰CoA和1分子比原来少两个碳原子的脂酰第六章生物氧化1. 生物氧化(biological oxidation )物质在生物体内进行氧化称生物氧化,主要指糖、脂肪、蛋白质等在体内分解时逐步释放能量,最终生成 CO2和H20的过程。2 氧化磷酸化(o

10、xidative phosphorylation)氧化磷酸化(oxidative phos phorylatio n)是指代谢物氧化脱氢,经线粒体电子呼吸链传递释放能量,偶联驱动 ADP磷酸化生成ATP的过程,又称为偶联磷酸化。3 氧化呼吸链(oxidative respiratory chain)代谢物脱下的成对氢原子(2H )通过多种酶和辅酶所催化的氧化还原反应逐步传递,最终 与氧结合生成水,释放的能量驱动ATP生成.这一系列酶和辅酶称为电子传递链(electrontransfer chain)。它与细胞摄取氧的呼吸过程相关,故又称呼吸链(respiratory chain)4.底物水平磷

11、酸化(substrate-level phosphorylation)ATP物质在生物氧化过程中,常生成一些含有高能键的化合物,而这些化合物可直接偶联 或GTP的合成,这种产生 ATP等高能分子的方式称为底物水平磷酸化第七章氨基酸代谢1. 一碳单位(one carb on unit )某些氨基酸代谢中产生的含有一个碳原子的基团。包括:甲基,甲烯基,甲炔基,甲酰基, 亚氨甲基等2.必需氨基酸(esse ntial ami no)体内不能合成,必需由食物供给的氨基酸,包括:缬、亮、异亮、苯丙、色、蛋、苏、赖3.腐败作用(putrefaction):未被吸收的氨基酸及未被消化的蛋白质在大肠菌中的代谢

12、作用。第八章核酸代谢1.从头合成途径(de novo synthesis pathway):利用磷酸核糖、氨基酸、二氧化碳等简单物质为原料,经过一系列酶促反应,合成核苷酸的途径。2.补救合成途径(salvage synthesis pathway):利用体内游离的嘌呤或嘌呤核苷,经过简单的反应,合成核苷酸的过程,称为补救合成/重新利用途径。第九章物质代谢的联系和调节1.共价修饰(covale nt modificati on )酶蛋白肽链上某些氨基酸残基在其它酶的催化下发生共价修饰, 为酶的化学修饰。修饰形式:乙酰化、甲基化、腺苷化及磷酸化等, 修饰形式从而引起酶活性的改变,称 磷酸化是最常见

13、的重要2.变构调节(allosteric regulation )小分子化合物与酶蛋白的调节亚基或调节部位进行非共价结合, 酶的活性。变构调节不引起酶的构型变化,不涉及共价键变化。引起酶构象变化,从而改变3.代谢调节 Regulation of Metabolism机体根据内外环境的变化调节各种物质代谢通路的强度、方向和速度。4.动态平衡 Dyn amic Equilibrium体内物质不断更新、适时补充,通过一定的调节机制保持代谢的动态平衡, 的堆积和缺乏。以防止中间产物5.化学修饰 Chemical Modification酶蛋白肽链上某些氨基酸残基在其它酶的催化下发生共价修饰,从而引起酶

14、活性的改变, 称为酶的化学修饰。修饰形式:乙酰化、甲基化、腺苷化及磷酸化等,磷酸化是最常见的重要 修饰形式6.关键酶(key enzyme):代谢途径中,催化单向/不可逆/非平衡反应的酶,其活性决定代谢 途径的方向。关键酶常位于代谢途径的第一步骤或分叉点。7.限速酶(rate-limitingenzyme):催化代谢途径中速度最慢步骤的酶,它的活性决定代谢途 径的总速度。限速酶常位于代谢调节的枢纽步骤。inducer)(rep ressor)8.诱导(in duction ):使酶的生成增多增快,加速酶合成的化合物称为诱导剂(9.阻遏(repression ):使酶的生成减少减慢,减少酶合成的

15、化合物称为阻遏剂第十章DNA的生物合成1 .中心法则(the central dogma ) 是指遗传信息从 DNA传递给RNA,再从RNA传递给蛋白质,即完成遗传信息的转录和翻译 的过程。也可以从 DNA传递给DNA,即完成DNA的复制过程。2 .半保留复制(semi-conservative replication)DNA复制时,母链DNA解开为两股单链,各自作为模板按碱基配对规律,合成与模板互补 的子链。子代 DNA, 一股链从亲代完整地接受过来,另一股链则完全重新合成。两个子代DNA都和亲代DNA碱基序列一致。这种复制方式称为半保留复制(semi-conservativereplica

16、tion)。逆转录(reverse transcription )RNA为模板合成DNA的过程称为逆转录4.冈崎片段(Okazaki fragment )在DNA复制中存在不连续的片段,这种不连续复制的fragment )DNA片段称作冈崎片段(Okazaki5. 弓 I发体(Primosome)解旋酶、拓扑异构酶引物酶 和引物 以及单链结合蛋白形成的复合体称为引发体(P rimosome)第一章RNA的生物合成1 .启动子(Promoter )是位于转录起始点上游的一段DNA序列,是RNA聚合酶的识别和结合部位。在转录调控中起着重要作用。2.外显子(exon )在断裂基因及初级转录产物中出现

17、,并表达为成熟RNA的核酸序列。3.内含子(intron )隔断基因的线性表达,在剪接过程中被去除的核酸序列。4. RNA 编辑(RNA editing)遗传信息在RNA水平发生改变,由一个基因产生不止一种蛋白质的加工方式。5.核酶(ribozyme)具有催化活性的 RNA6.转录作用( DNA-de pen de nt RNA syn thesis)在RNA聚合酶催化下,以 DNA为模板,以4种三磷酸核苷( 料进行的RNA聚合反应。ATP, GTP, CTP, UTP ) 为原7.终止子(terminator)在基因单位中,具有停止转录作用的部位,包括GC富集区和AT富集区,也称终止子。8.

18、转录因子 tran scri pti onal factor, TF反式作用因子中,直接或间接结合 RNA聚合酶的,称为转录因子(tran scri pti onal factors, TF) 。9.剪接作用(mRNA splicing)剪切hnRNA中内含子序列,将各外显子序列连接为成熟mRNA的过程。10.不对称转录(asymmetric transcription)DNA片段转录时,双链 DNA中只有一条链作为转录的模板,这种转录方式称为不对称转录11.模板链(tem pl ate stra nd )指导RNA合成的DNA链12.编码链(coding strand )与模板链互补的另一条

19、 DNA链。无转录功能,其序列与转录的RNA序列相同。13.转录泡(transcription bubble)由DNA双链(打开约17bp ) ,RNA聚合酶与新合成的 RNA链局部形成的结构.14.单顺反子一条mRNA模板只含有一个翻译起始点和一个终止点,因而一个基因编码一条多肽链或 RNA链,每个基因转录有各自的调节元件。15.多顺反子在原核细胞中,通常是几种不同的mRNA连在一起,相互之间由一段短的不编码蛋白质的间隔序列所隔开,这种 mRNA叫做多顺反子mRNA。这样的一条mRNA链含有指导合成几 种蛋白质的信息。第十二章 蛋白质的生物合成1.核糖体循环(Ribosome Cycle)蛋

20、白质翻译过程中, 核糖体大小亚基聚合完成肽链起始、延长及终止过程后解离, 它们还可以再聚合成完整的核糖体,开始新的肽链合成,循环往复。2 .分子伴侣 (molecular chaperone)是细胞内一类保守蛋白质,可识别肽链的非天然构象, 促进各功能域和整体蛋白质的正确折叠3. 信号肽(sig nal pep tide)各种新生分泌型蛋白的 N端有保守的氨基酸序列第十三章基因表达调控1.基因(Gene)负载特定遗传信息的 DNA片段,包括:DNA编码序列、非编码调节序列和内含子序列。2. 管家基因(housekeeping gene )生物体某些基因产物在整个生命过程中都是需要的或必不可少的

21、,物体的几乎所有细胞中持续表达这类产物的编码基因在生3. 诱导( induction )基因表达水平在特定环境中增高的现象,这类基因叫可诱导基因4. 阻遏( repression )基因对环境信号应答表现为表达水平降低,这类基因叫可阻遏基因5. 操纵子( operon )由功能相关的一组基因在染色体上串联, 共同构成的一个转录单位。 一个操纵子只含一个启 动序列及数个可转录的编码基因6. 顺式作用元件 (cis-acting element)可影响自身基因表达活性的 DNA 序列7. 增强子( enhancer )远离转录起始位点(130kb),决定基因的特异性表达,增强启动子转录活性的其发挥

22、作用的方式通常与方向、距离无关DNA 序列。8. 沉默子 silencer某些基因的负性调节元件,当其结合特异蛋白因子时,对基因转录起阻遏作用。有些序列既可作为正性、又可作为负 性调节元件发挥顺式调节作用DNA9. 反式作用因子 (trans-acting factors)指能直接或间接地识别或结合在各类 顺式作用元件 核心序列上参与调控靶基因转录效率的 蛋白质。10. 基因 组( Genome )指来自一个生物体的一整套遗传物质, 对原核生物与噬菌体来说, 它们的基因组就是单个环 状染色体所含的全部基因, 对于真核生物而言, 基因组是指一个生物体的染色体所包含的全 部 DNA11. 基因表达

23、( Gene Expression )指细胞 在生命过程中,把储存在 DNA 顺序中 遗传信息 经过转录和翻译,转变成具有 生物 活 性的蛋白质分子。第十三章 基因工程与基因重组1. 基因工程(genetic engineering )是将外源基因通过体外重组后导入受体细胞内, 译表达的操作。使这个基因能在受体细胞内复制、转录、翻1. 重组 DNA 技术(recombinantDNAtechnique )在体外重新组合脱氧核苷酸( DNA)分子,并使它们在适当的细胞中增殖的遗传操作。1.限制性核酸内切酶(restriction en do nuclease):存在于细菌体内,能够识别和切割双链

24、DNA内部特定核苷酸序列的一类核酸酶。1.聚合酶链反应(P CR)在反应体系中加入模板 DNA、dNTP、特别设计的特异引物及耐热的DNA聚合酶(常用Taq酶),经多次变性、退火、延伸循环反应,使目的DNA呈指数合成的过程1. cDNA 文库(cDNA library)以mRNA为模板,利用反转录酶合成与 mRNA互补的DNA,再复制成双链cDNA片段,与 适当载体连接后转入受体菌,这些受体菌包含了所有cDNA信息,总称cDNA文库。常用于筛选编码蛋白质的结构基因。1. 基因组 DNA 文库(genomic DNA library)利用限制性核酸内切酶将组织或细胞染色体DNA切割后,与适当载体连接后转入受体菌,这些受体菌包含了所有基因组DNA信息,总称基因组 DNA文库第十五章细胞信息转导1.第二信使(secondary messenger)在细胞内传递信息的小分子物质,女口: Ca2+、DAG、IP3、Cer (神经酰胺)、cAMP、cGMP、花生四烯酸及其代谢产物等。2.G 蛋白(gua ny late binding p rote in是一

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