疾病基因组学ppt课件.ppt

疾病基因组学,基因组计划的应用,疾病基因组学疾病的分子机制疾病的分子诊断疾病的分子治疗,疾病的分子机制病原、病理和预后疾病的易感性遗传与环境的影响,分子诊断：疾病的预测,药物耐受性，疾病的分型。,分子治疗：药物靶,基因治疗,分子诊断病原体检测疾病相关基因的鉴定、克隆药物的敏感性、耐受性分子治疗药物基因组学基因靶标与药物开发个性化治疗,分子诊断技术-病原体检测,病原体：引起疾病的微生物和寄生虫的统称寄生性生物病毒、衣原体、立克次氏体、支原体、细菌、螺旋体、真菌、寄生虫正常微生物群、条件致病微生物IgnazSemmelweis,IgnazSemmelweis18181865匈牙利医学家母亲的救星发现了产褥热的病因，并采用防腐剂进行预防，取得显著效果产褥热主要病原菌：葡萄球菌，链球菌，大肠杆菌，肺炎双球菌,感染人的微生物超过400种，人一生可能受到150种以上的病原体感染口、鼻、咽、消化道、泌尿生殖道、皮肤自身免疫力病原体致病性的强弱侵入数量,大肠杆菌,.,禽流感病毒(H5N1)avianinfluenzaAvirus,单链RNA病毒,人类免疫缺陷病毒(HIV)（humanImmunodeficiencyvirus）,逆转录病毒（单链RNA病毒）,乙型肝炎病毒（HBV）,开环部分双链DNA病毒,乙型肝炎流行病学,乙肝病毒分型及YMDD突变临床检测乙型病毒肝炎-由乙型肝炎病毒所引起的肝脏炎型损害，全球约有3.5亿乙肝病毒携带者，我国有60的人群感染过乙肝病毒（HBV），其中乙肝病毒携带者占总人口的10HBV10个亚型国际公认的慢性乙肝抗病毒治疗药物：干扰素和核苷类药物，拉米夫定,YMDD突变,Met-ATGYMDDVal-GTGYVDDIle-ATTATCYIDDATA,突变影响了与拉米夫定的结合，造成HBV对拉米夫定敏感性下降。,拉米夫定治疗HBV感染治疗过程与YMDD变异关系,引自JVirol.Metods1999；83：181-187,基因多位点检测系统检测出野生毒株中共存的低滴定度拉米夫定耐药病毒株及时改变用药-阿地福韦，减少有耐药性的病毒株引起症状恶化,back,人类疾病大致分为三类：（一）单基因病（二）多基因病（三）获得性基因病,基因病：以基因组学为基础，从疾病和健康的角度考虑，人类疾病大多直接或间接地与基因相关。,分子诊断技术-疾病相关基因的鉴定,疾病相关基因的鉴定与克隆,（一）检测人类基因变异或突变（二）疾病时基因组差异表达分析（三）染色体制图定位及疾病相关基因克隆,取受检者血液、口腔黏膜或其它细胞样品提取DNA、PCR扩增待测基因片段确定待测基因的基因型基因测序SNP分型凝胶电泳预测相应疾病的患病风险，分析不同药物体内代谢强弱,（一）检测人类基因变异或突变,单链构象多态性(SSCP)限制性片段长度多态性(RFLP)变性梯度电泳(DGGE)单核苷酸多态性（SNPs）,单核苷酸多态性（singlenucleotidepolymorphism,SNP）,在人类两个个体之间大约每5001000bp就有一个碱基差异，如果一个碱基位置发生的变异在0.1以上的人群存在，这个位点就被定义为SNP位点。,寡核苷酸杂交分析SNP和等位基因特异寡核苷酸杂交,（二）疾病时基因组差异表达分析,某一疾病或综合征基因组与正常基因组表达差异的比较。,DNA芯片检测的差异表达谱,（三）染色体制图定位及疾病相关基因克隆,疾病基因定位：染色体原位杂交、染色体畸形分析、连锁分析疾病相关基因的克隆：已掌握疾病相关基因或及其产物的确切信息已掌握与疾病可能相关的基因预测资料对疾病相关基因毫无所知,疾病相关基因克隆策略：功能基因克隆候选基因克隆定位基因克隆定位-候选基因克隆,back,通过基因易感性的分析，确认特定疾病的好发性人群，对该人群进行生活或饮食方式的干预，促进其健康。通过对药物代谢相关基因的SNP检测，阐明不同患者间药物代谢及药效差别的遗传基础，根据不同患者的遗传背景施以优化治疗方案美国：药物副作用而入院的患者达200万人，因药物副作用而死亡的人数达10万人，占死亡原因的第4位,心脑血管疾病相关易感基因位点检测高发病率、高死亡率、高致残率、高复发率，发病率和死亡率高居首位，36%早预防、早发现、早治疗才是防止心血管疾病的关键,心脑血管疾病遗传易感性多基因检测内容,个体化营养指导多基因检测内容,肿瘤遗传易感性多基因检测内容,代谢与免疫相关疾病遗传易感性多基因检测内容,个体化用药指导多基因检测内容,基因组学与肿瘤病因学,致癌因子引起DNA损伤，可引起突变，如果关键基因功能改变，导致细胞异常增殖而发生肿瘤。,鉴定隐性癌基因（肿瘤抑制基因anti-oncogenes）和显性癌基因oncogenesOncogenes：编码的产物与细胞的肿瘤性转化有关的基因。它以显性的方式作用，对细胞生长起阳性作用，并促进细胞转化。它的发现可追溯到动物致癌病毒的研究anti-oncogenes：抑制细胞增殖和肿瘤发生的作用。许多肿瘤中发现抑癌基因的两个等位基因缺失或失活，失去细胞增生的阴性调节因素，从而对肿瘤细胞的转化和异常增生起作用。隐性作用性质抑癌基因失活与癌基因活化制图策略，鉴定标志物,肿瘤基因组解剖工程，基因重排常导致癌基因失活,/,分子诊断-临床诊断领域发展的热点，发展速度最快的市场2010年，全球体外诊断规模逾400亿美元；中国体外诊断市场150亿人民币2014年，全球的体外诊断市场规模预计达500亿美元，中国的体外诊断市场达到350亿元美国、欧洲、日本占据大部分的市场份额2009年，分子诊断占体外诊断的9.6%左右全球分子诊断发展速度达到10%；中国达20%，,分子诊断的应用临床各科的诊断：肿瘤、感染、遗传，74%体检中心技术服务中心第三方检测机构微生物的快速检测市场2004年，集中在传染病诊断、移植分子配型2008年，肿瘤敏感性检测、遗传病筛查与诊断2012年，肿瘤个性化治疗、昂贵药物治疗监测、药物代谢基因组学等未来的发展趋势：POC检测、法医、人群健康筛查与体检、重大疾病预警与诊断、公众分子基因档案建立,全球约有500多家分子诊断相关企业分子诊断技术提供商：LifeTechnologies、Agilent、Affymetrix、Gen-Pr