Hyperchem学习.ppt

1、Hyperchem学习,小组成员： 胡非非 王珊珊 张鹏程 杨素 邓超 张春洪 花木兴 李庆湖 龙继亮,概况：,HyperChem用户界面的介绍 讨论如何使用工具、菜单和菜单项建立、编辑、显示和操纵分子,学习内容：,打开打开、关闭某一文件，使用标签和分子效果图 基本绘图和编辑画图、选择、复制及删除原子连接 创建小分子的2D和3D模型绘制和编辑2D图将其转 为3D模型 交换、旋转、缩放分子移动和操纵分子 测量结构属性测量和调整分子几何结构 创建一个多肽创造生物聚合物，学会使用氨基酸和 酸数据库,*打开文件,FileOpenHyperchemSamplesc60.hin,*使用laber,Disp

2、layLabels,*使用不同Moleculer Renderings,DisplayRendering Balls,一、打开,二、基本绘图和编辑,Drawing Atoms Drawing Bonds Selecting Atoms Selecting Groups of Atoms Deleting Atoms Copying Atoms to the Clipboard,*画原子,BuildDefault Element Properties Ok,*画原子,Ok工作区左键,*连接,将鼠标移动至某一画好的碳原子上，按住鼠标将其拖至另一相连的碳原子上边，放开鼠标，则：,*选择原子,Sele

3、ctAtomsTurn off Multiple Selections 将鼠标移动至想要的原 子或者其他原子上面则 可对相应原子进行选择,*多原子的选择,SelectTurn off Select Sphere同时点击鼠标的左右键，圈出想要的多个原子SelectTurn on Multiple Selections同时点击鼠标的左右键放开鼠标,*删除原子,将鼠标移动至 点击左键 选择所要删除的原子或者键型右击鼠标,*复制原子到Clipboard,将鼠标移动至 点击左键 将鼠标移动至某一原子或键型，点击左键,三、小分子的2D和3D模型,1，画2D图 2，保存文件 3，改变键型连接 4，制作苯环

4、5，标记原子 6，编辑个人原子 7，调用模型生成器,*画2D图,BuildTurn on Arbitray ValenceTurn off Explicit HydrogensDefault ElementElement Table选择原子 画图如下,*保存文件,FileSave As 保存,*改变键型连接,将鼠标移动至需要修改键型的原子上面，左击鼠标同时移动至另一个原子上面，则,*制作苯环,用鼠标单击环形结构中的任一原子，则可画出苯环,*标记原子,DisplayLabels SymbolOK ,*编辑个人原子,双击鼠标左键Element Table选择原子关闭Element Table将鼠标

5、移动至想要编辑的原子上面，单击左键，则该原子变为自己后面所选原子，如,*选用模型生成器,BuildAdd H and Model Build 如果没有显示相应原子，则进入 DisplayShow Hydrogens,四、交换、旋转、缩放分子,XY轴工具的使用 Z轴工具的使用 缩放工具的使用 定心和缩放 XY轴旋转 Z轴旋转 Z轴剪辑,*XY轴工具的使用,工作区移动鼠标，则所画图像随着移动双击 输入XY轴的变化量 如： OK,*Z轴工具的使用,DisplayRendering Vector and Line Options Turn on Perspective 移动鼠标 确定 ,*缩放工具的使

6、用,按着鼠标左键移动鼠标,*定心和缩放,Display,Select to Fit,恢复原来大小,*XY轴转换,移动鼠标,可进行XY轴的旋转,*Z轴的旋转,将鼠标移动至工作区，则可以对分子进行旋转,*Z轴的剪辑,双击,移动两侧红框部分 注意观察变化,OK,五、测量结果属性,创建2D结构 编辑此结构 建立3D框架 查看某个原子 键长 键角测量,*创建2D结构,*编辑此结构,双击环状结构,Build,Default Element,N,将一个 碳原子换成氧原子，同时点击DISPLAY 接着点击Labers 选择Symbol,*建立3D框架,BuildTurn off Explicit Hydrog

7、ens双击,*查看某个原子,Select关闭Atoms和Multiple Seltctions,点击氧原子,注意此处,*键长,单击碳氧键,键长表示在此处,*键长测量,SelectTurn on Multiple Selections右击鼠标（选中所有原子）左击鼠标两个原子,原子间距离显示在状态栏,*键角测量,按住鼠标左键从碳原子拖到氢原子，接着放开鼠标则,键角显示,六、创建多肽,Amino Acids对话框的使用 创建一个多肽 创建一个两性分子 位点专一诱变,*Amino Acids对话框的使用,DatabasesAmino Acids,构造 折叠 折叠片 折叠,不同氨基酸结构,Ala为丙氨酸 Val为缬氨酸 Gly为甘氨酸,*创建一个多肽,进入Amino Acids选择Beta Sheet 选择两个以上氨基酸建立肽链 关闭Amino Acids DisplayLabels确认Atoms和Redidues选择的是NoneOK,*创建一个两性分子,EditRotate Databases,调整X Y Z轴的数据点击OK,Make Zwitterion,*位点专一诱变,DisplayLabels在