《生物信息学》课程教学大纲 2

“生物信息学”课程教学大纲英文名称：IntroductiontoMedicalBioinformatics课程编码：BASM3062学时：32（理论学时：16；实验学时：16）学分：1.5适用对象：XXX医学实验班。先修课程：分子生物学、计算机网络基础使用教材及参考书：1.楚雍烈.医用生物信息学概论.西安：陕西科学技术出版社，2005.2.DavidW.Mount.Bioinformatics:sequenceandgenomeanalysis.NewYork:ColdSpringHarborLaboratory.2004一、课程性质和目的性质：基础理论目的：使学生了解生物信息学的基本理论知识和技术。掌握生物信息学网络资源、数据库和常用分析工具的使用。二、课程内容简介生物信息学是一门新兴的交叉学科，是推动生物医学发展的重要基础，是面向宗濂实验班学生的选修课。本课程分理论教学和上机实习两部分。理论教学从生物医学研究的应用角度出发，介绍生物信息学的产生基础、基本概念、研究内容，主要生物信息学网络资源、生物信息学关键技术、生物大分子的分析方法和医学研究中相关的生物信息学数据库和分析工具。上机实习使学生实际操作应用生物信息学网络资源、数据库和常用分析工具。三、教学基本要求1．要求学生掌握生物信息学的基本理论知识和基本概念，熟悉生物信息学的相关技术方法，特别是分子生物学中常用的关键技术及常用软件。2．要求学生熟悉生物信息学的常用网络资源，掌握生物信息学常用数据库和分析工具的使用。四、教学内容及安排第一章绪论掌握生物信息学和医学信息学的概念和研究内容熟悉生物信息学和医学信息学的重要性了解信息学基础、生物信息学和医学信息学的产生和发展

教学安排及教学方式教学环节学时分配课后环节（请打“√”）章节数授课实验上机讨论作业自学综合大作业其他12

第二章生物大分子序列及结构信息相关实验技术熟悉DNA，genome，mRNA，EST，cDNA，蛋白质序列测定技术了解蛋白质和核酸结构分析技术教学安排及教学方式教学环节学时分配课后环节（请打“√”）章节数授课实验上机讨论作业自学综合大作业其他22

第三章生物信息学和医学信息学的计算机、网络基础熟悉生物信息学和医学信息学中的计算机基础知识了解生物信息学和医学信息学中的互联网基础知识、互联网浏览和文件传输教学安排及教学方式教学环节学时分配课后环节（请打“√”）章节数授课实验上机讨论作业自学综合大作业其他322

第四章生物信息学和医学信息学资源检索工具熟悉生物信息学和医学信息学的网络资源来源及分类、文献数据库检索了解生物信息学和医学信息学资源的通用检索工具、专业搜索引擎教学安排及教学方式教学环节学时分配课后环节（请打“√”）章节数授课实验上机讨论作业自学综合大作业其他422

第五章序列联配（sequencealignment）熟悉序列联配的概念、种类和目的了解序列联配的算法教学安排及教学方式教学环节学时分配课后环节（请打“√”）章节数授课实验上机讨论作业自学综合大作业其他52第六章生物信息学中心和数据库熟悉重要的生物信息学中心、主要数据库、分析工具教学安排及教学方式教学环节学时分配课后环节（请打“√”）章节数授课实验上机讨论作业自学综合大作业其他624

第七章核酸的生物信息学分析熟悉序列同源性、系统发生树分析、酶切位点及PCR引物设计了解RNA二级结构、基因预测和表达调控分析教学安排及教学方式教学环节学时分配课后环节（请打“√”）章节数授课实验上机讨论作业自学综合大作业其他724

第八章蛋白质结构与功能分析熟悉蛋白质的序列分析、二级结构与理化特性分析了解蛋白质的高级结构、功能预测、功能域的判定