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文档简介
ICS59.080
W59
备案号:62065-2019DB21
辽宁省地方标准
DB21/T3084—2018
羽绒制品中鹅绒的鉴别
PCR法和实时荧光PCR法
IdentificationofGooseDownFiberinFeatherandDownProducts
-PCRmethodandreal-timefluorescencePCRmethod
DB21/T3084—2018
羽绒制品中鹅绒的鉴别PCR法和实时荧光PCR法
1范围
本标准规定了羽绒制品中鹅绒的PCR和实时荧光PCR鉴别方法。
本标准适用于羽绒制品。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文
件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法
3术语和定义
3.1聚合酶链式反应polymerasechainreaction
一种模拟天然DNA复制的体外扩增法,在DNA聚合酶催化下,以母链DNA为模板,以特定引物
为延伸起点,以4种单核苷酸(dNTP)为底物,通过变性—退火—延伸的循环反应,使极少量的DNA
的特定片段,在短短几小时内扩增上百万倍。
3.2实时荧光PCRreal-timefluorescencepolymerasechainreaction
在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过曲线对未
知模板进行定量或定性分析的方法。
4缩略语
下列缩略语适用于本文件。
bp:碱基对(basepair)
Ct值:每个反应管内的荧光信号达到设定的阈值时所经历的循环数(cyclethreshold)
DNA:脱氧核糖核酸(deoxyribonuleicacid)
DTT:二硫疏糖醇
dNTP:脱氧核苷酸三磷酸(deoxyribonucleosidetriphosphate)
5原理
用试剂盒法或其他等效DNA提取法提取样品中的DNA。针对鹅的线粒体DNA序列设计引物和探
针,通过单PCR、实时荧光PCR技术,对DNA中的鹅成分分别进行特异性扩增,根据实验结果,判
定样品中是否含有鹅绒。
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DB21/T3084—2018
6试剂
6.1实验用水应符合GB/T6682中一级水的规格。
6.2组织和毛发提取试剂盒TaKaRaMiniBESTUniversalGenomicDNAExtractionKitVer.5.0(TaKaRa
Code.9765)。参见附录A中A.1。
6.3PremixExTaq™(ProbeqPCR)(TaKaRaCode.RR390A)参见附录A中A.2。
6.4100%乙醇。
6.5溴化乙锭溶液。
6.6DNALaddarMarker。
7设备与器具
7.1PCR仪
7.2实时荧光定量PCR仪
7.3电泳装置
7.4凝胶成像仪
7.5冰箱:4℃~20℃
7.6天平:精度为0.0001g
7.7分析研磨机
7.8微孔干浴器或水浴锅
7.9瞬时离心机
7.10涡旋混合器
7.111.5mL磁分离架
7.12微量可调移液器:0.1μL~2.5µL,1µL~10µL,2µL~20µL,10µL~100µL,20µL~200µL,
100µL~1000µL。
7.131.5mL离心管,2.0mL离心管
7.14PCR薄壁管
7.15实时荧光PCR光学反应管
7.16超净工作台
8取样
从羽绒服或其他羽绒制品的不同部位取样,混合均匀后,再取约1g试样。
9制样
将样品剪碎,经分析研磨机打散混匀,再次尽量剪碎至2mm以下,再次用分析研磨机混匀。
10DNA的提取
10.1组织裂解
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称取约5mg试样,放入2mL离心管中,每个样平行提取2管,加入180µL的缓冲液GL(Buffer
GL)、20µL的蛋白酶K(ProteinaseK)和10µL的核糖核酸酶A(RNaseA,10mg/mL),于56℃
水浴温浴至组织完全裂解3小时。如残存纤维状组织无法完全裂解,裂解之后先12,000rpm离心2分
钟,去除杂质之后再进行后续操作。向裂解液中加入200µL缓冲液GB(BufferGB)和200µL100%
乙醇,充分吸打混匀。
注:温浴时可时常将样品取出进行振荡或吸打以加速裂解。
10.2将核酸纯化柱(SpinColumn)安置于收集管(CollectionTube)上,溶液移至核酸纯化柱中,12,000
rpm离心2分钟,弃滤液。
10.3将500µL的缓冲液WA(BufferWA)加入至核酸纯化柱中,12,000rpm离心1分钟,弃滤液。
10.4将700µL的缓冲液WB加入至核酸纯化柱中,12,000rpm离心1分钟,弃滤液。
10.5确认缓冲液WB中已经加入了指定体积的100%乙醇。
10.6沿核酸纯化柱管壁四周加入缓冲液WB,这样有助于完全冲洗沾附于管壁上的盐份。
10.7重复操作步骤4。
10.8将核酸纯化柱安置于收集管上,12,000rpm离心2分钟。
10.9将核酸纯化柱安置于新的1.5mL的离心管上,在核酸纯化柱膜的中央处加入50µL~200µL的
灭菌水或洗脱液(ElutionBuffer),室温静置5分钟。
10.10将灭菌蒸馏水或洗脱液加热至65℃使用时有利于提高洗脱效率。
10.1112,000rpm离心2分钟洗脱DNA。如需获得更大收量,可将离下液重新加入到核酸纯化柱膜的
中央或再加入50L~200µL的灭菌水或洗脱液,室温静置5分钟后,12,000rpm离心2分钟洗脱DNA。
11DNA的鉴别
11.1质量控制
进行PCR、实时荧光PCR鉴别时设置阳性对照、阴性对照和空白对照。阳性对照:扩增鹅成分时
用鹅绒DNA。阴性对照:扩增鹅成分时用非鹅绒DNA,空白对照:实验用水。
11.2PCR法
11.2.1引物
所用引物信息见表1。
表1PCR扩增所用引物
扩增成分引物名称引物序列退火温度/℃产物大小/bp
Goose-cytb-F5’-GCTACTAGCCATACACTAC-3’60.3375
鹅
Goose-cytb-R5’-GTTGGATTGTCTACTGAGA-3’60.0375
11.2.2PCR反应体系
premixExTaq(2×)12.5µL,10µmol/L引物各1µL,DNA模板2µL,ddH2O8.5µL
11.2.3反应条件
95℃,30s;95℃,5s,退火温度(见表1),60℃,30s,40个循环。
注:不同仪器可根据仪器要求将反应参数作适当调整。
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11.2.4PCR产物的检测
将适量5×TBE稀释成0.5×TBE溶液,配制2.0%琼脂糖凝胶,取15µLPCR产物,点样进行电泳,
并加DNAmarker点样以判断PCR产物的片段大小。电压大小根据电泳槽长度来确定,一般控制在3
V/cm~5V/cm长度,电泳时间根据溴酚蓝的移动位置来确定。电泳结束后,将凝胶置溴化乙锭溶液(10
µg/µL)中浸泡30min。用凝胶成像系统观察、拍照、记录与分析电泳结果。
11.2.5PCR结果及判断
阳性对照出现预期大小的扩增条带,阴性对照和空白对照均未出现条带;待测样品未出现预期大小
的扩增条带,判断结果为阴性。待测样品出现预期大小的扩增条带,判断结果为可疑阳性,需进一
步确证。
11.2.6结果确证实验
可疑阳性结果的采用实时荧光PCR法进行确证。
11.3实时荧光PCR法
11.3.1引物及探针
所用的引物、探针见表2。
表2实时荧光PCR所用引物、探针
扩增成分引物名称引物序列退火温度/℃产物大小/bp
Goose-cytb-F5’-GCTACTAGCCATACACTAC-3’60.3375
鹅Goose-cytb-R5’-GTTGGATTGTCTACTGAGA-3’60.0375
Goose-cytb-P5’-(FAM)CGCAGACACTTCACTCGCCT(Eclipse)-3’70.0375
11.3.2PCR反应体系
PremixExTaq(2×)12.5µL,PremixExTaq(2×)12.5µL,PrimerF(10µM)1µL,Primer
R(10µM)1µL,Probe(5µM)1µL,DNA×2µL,dH2O7.5µL,×Negativecontrol反应时,加入
RNasefreedH2O,×Positive反应时,做2个平行样。
11.3.3PCR反应条件
95℃,30s;95℃,5s,退火温度(见表2),60℃,30s,40个循环。
注:不同仪器可根据仪器要求和PremixExTaqTM使用说明书将反应参数作适当调整。
11.3.4结果分析
反应结束后,应设置无效基线范围,基线范围选择在3~15个循环,如果有强阳性样本,应根据实
际情况调整基线范围。阈值设置原则以基线刚好超过正常阴性对照扩增曲线的最高点,且Ct值=40为
准。设置阈值后,分析样品的检测结果。
11.3.5结果判断
待测样品鹅成分检测Ct值大于或等于40,内参照基因检测Ct值在23~30之间者,阴性对照、阳性
对照和空白对照结果正常者,则可判定该样品未检出鹅源性DNA成分。
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待测样品鹅成分检测Ct值小于或等于36,内参照基因检测Ct值在20~30之间者,阴性对照、阳性
对照和空白对照结果正常者,则可判定该样品检出鹅源性DNA成分。
待测样品鹅成分检测Ct值在36~40之间,应重做实时荧光PCR扩增。再次扩增后的结果Ct值仍小
于40者,且阴性对照、阳性对照和空白对照结果正常,则可判定该样品检出鹅源性DNA成分;再次
扩增后结果Ct值大于40,且阴性对照/阳性对照和空白对照结果正常,可判定该样品未检出鹅源性DNA
成分。
11.4结果表述
该样品未检出鹅源性DNA成分,
该样品检出鹅源性DNA成分。
12防止污染的措施
检测过程中防止交叉污染的措施参照GB/T19495.2。
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AA
附录A
(资料性附录)
试剂盒
A.1试剂盒TaKaRaMiniBESTUniversalGenomicDNAExtractionKitVer.5.0(TaKaRaCode.9765)
组成(50次)
本试剂盒分试剂PartI与PartII两部分。
PartI-20℃保存
蛋白酶K(proteinaseK,20mg/mL)1mL
核糖核酸酶A(RNaseA,10mg/mL)0.5mL
PartII室温(15-25℃)保存
缓冲液GL(BufferGL)×112mL
缓冲液GB(BufferGB)×112mL
缓冲液WA(BufferWA)×128mL
缓冲液WB(BufferWB)×224mL
洗脱液(elutionbuffer)14mL
离心管(SpinColumns)50支
收集管(Collectiontubes)50支
A.2试剂盒PremixExTaq™(ProbeqPCR)(TaKaRaCode.RR390A)
组成(50µL反应×200次)
PremixExTaq(ProbeqPCR)(2×Conc.)×11.0mL×5支
ROXReferenceDye(50×Conc.)×2200µL×1支
ROXReferenceDyeII(50×Conc.)×2200µL×1支
非商业性声明:附录A所列参考试剂盒仅为提供参考,并不涉及商业目的,鼓励标准使用者尝试使
用不同厂家或型号的试剂盒及试剂。
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BB
附录B
(资料性附录)
扩增产物序列
鹅扩增产物序列(375bp)
Attcctagccatgcactactcaccagacgcctcaaccgccttttcatcaatcgcccacatcactcgagacgtaaattatggctga
atcatccgctaccttcacgccaatggcgcctcaatattctttatctgcctcttcctacacatcgggcgaggcctatattacggatcatt
tctctactcagaaacctgaaacatcggcattatcctcctgcttgcaactatagcaacagccttcataggctatgtcctcccgtgaggcc
aaatatcattctgaggggccacagtaattacaaacttactatccgccatcccatacattgggacagacctagttcaatgaatctgagga
ggctactcagtagacagtcccac
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参考文献
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