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文档简介

西北农林科技大学农学院教案2015——2016学年第1学期教研室遗传学课程名称生物信息学授课对象种科系2013级本科生授课教师童维职称职务讲师教材名称《生物信息学》2015年6月2日《生物信息学》课程教案章节名称:第四章蛋白质序列分析第二节蛋白质一维、二维序列分析课堂讲授(1),实践课(1)教学时数1教学目标：1. 掌握蛋白质一维序列分析的方法2. 掌握蛋白质二维序列分析的方法授课内容要点:请同学简要回顾上节课讲述的蛋白质常规分析方法：Sequencealignment:BLAST,FASTA,Clustalw…PredictingAntigenicPeptides:antigenic…PredictpI/MW:ComputepI/Mw,Isotopident…Proteinsolubilityprediction:PROSO,…Transmembraneproteinprediction:TMHMMSignalpeptideprediction:SignalPEnzymaticsites:restrictSequenceextract,translate,etc:extractseq,seqret……导入：向同学们提问：给你一个未知蛋白质，你会如何开展分析？蛋白质一维序列分析；蛋白质二维序列分析；蛋白质三维序列分析；蛋白质一维序列分析：两两序列比对:BLAST;Fasta;多重序列比对:Clustw…蛋白质二维序列分析：向同学们提问，并展开讨论：为何要进行蛋白质二维序列（或蛋白质保守结构域分析，proteinmotif）分析？当前蛋白质二维序列分析的方法：Interpro,COG等，进行演示。向同学们提问，Interpro数据库中proteinmotif本身是如何形成？布置学生课后作业（下节课解答）：搜索小麦抗条锈病的相关蛋白质，用所学到的方法进行蛋白质序列分析。教学重点：1. 掌握蛋白质一维序列分析方法；2. 掌握蛋白质二维序列分析；教学难点：1.理解蛋白质保守结构域的概念；2. 如何进行蛋白质保守结构域（二维结构）的预测教学方法：讲授，多媒体+板书课堂讨论题、思考题、作业：1.同学们得到一个未知蛋白质后，如何开展分析？2.为何要进行蛋白质二维序列（或蛋白质保守结构域分析，proteinmotif）分析？3.Interpro数据库中proteinmotif数据本身是如何形成？参考资料（含参考书、文献等）：《基础生物信息学及应用》，蒋彦等，清华大学出版社《生物信息学—基因和蛋白质分析的使用指南》，李衍达，清华大学出版社《生物信息学》，赵国屏，科学出版社《生物信息学手册》，郝柏林，上海科学技术出版社备注:1.通过向同学们提问“得到一个未知蛋白质后，你会如何开展分析？”，让学生思索、展开讨论，引入本节授课内容。2.重点让学生掌握蛋白质一维、二维序列分析方法；3.让同学思索：可应用COG，

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