复习题2023生物化学

本文格式为Word版，下载可任意编辑——复习题2023生物化学2023-9-13

一、解释名词

必需氨基酸、非编码氨基酸、氨基酸残基、亚基、简单蛋白、缀合蛋白、肽链、蛋白质的一级结构、蛋白质的二级结构、蛋白质的三级结构、蛋白质的四级结构、蛋白质的等电点、Edman降解

二、简答问题

1.简述蛋白质一级结构的解析方法。2.简述蛋白质N-端序列分析方法。

3.简述常用于肽链裂解的蛋白酶有哪些？有哪些特征？4.比较由蛋白质水解获得氨基酸的方法与特征？5.阐述蛋白质定性和定量分析的方法和原理？

三、思考题

某一条肽链经酸水解后，分析其组成成分含5种氨基酸，其N-端十分简单环化。经CNBr处理后得到以游离的碱性氨基酸，Pauly反应呈阳性。若用胰蛋白酶作用则得到两个肽段；其一为坂口反应阳性，另一个在280nm有强的光吸收，并呈Millon氏阳性反应。求此肽的氨基酸排列顺序，并指出它的等电点（pI）应当是大于、等于或小于pH7。

2023-9-20

一、解释名词

肽平面、拉氏构象图、蛋白质的二级结构/三级结构/四级结构、模体（motif）、结构域、超二级结构、蛋白质折叠、蛋白质分子伴侣、蛋白质的变形与复性、蛋白质组、蛋白质组学

二、简答问题

1．稳定蛋白质三维结构的作用力主要有哪些？

2．比较蛋白质的二级结构/三级结构/四级结构的异同？

3．影响蛋白质的二级结构稳定性的主要因素有哪些？请说明理由。4．蛋白质产生四级结构的意义是什么？5．蛋白质折叠的基本规律？三、思考题

1．试描述蛋白质折叠的全过程。2．蛋白质的变形与复性有何异同？3．蛋白质组学研究的内容和基本方法？

4．疯牛病是有病毒引起的传染性疾病，你是否同意？请说明理由。

5．已知分子量为240000的蛋白质多肽链的一些节段是?螺旋，而另一些节段是??折

叠，其分子展开长度为????X10-5cm。试问该肽分子中?螺旋和??折叠的百分率。

四、?翻译成中文?

Proteinsarelargebiomolecules,ormacromolecules,consistingofoneormorelongchainsofaminoacidresidues.Proteinsperformavastarrayoffunctionswithinorganisms,includingcatalysingmetabolicreactions,DNAreplication,respondingtostimuli,andtransportingmoleculesfromonelocationtoanother.Proteinsdifferfromoneanotherprimarilyintheirsequenceofaminoacids,whichisdictatedbythenucleotidesequenceoftheirgenes,andwhichusuallyresultsinproteinfoldingintoaspecificthree-dimensionalstructurethatdeterminesitsactivity.

2023-10-11

一、解释名词

电泳、等电聚焦电泳、双向电泳、离子交换层析、疏水作用层析、亲和层析、聚焦层析、凝胶过滤层析、沉降系数二、简答问题

1.SDS是何含义，其基本原理是什么？有哪些应用？2.在蛋白质一级结构分析中，如何定位二硫键？

3.依制备用离心机的转速，如何划分低速、高速和超速离心机？4.多肽固相合成的基本原理是什么？

三、思考题

1.试描述蛋白质分开和纯化的常用方法和纯化方案设计的基本思路。2.如何鉴定得到的蛋白质是已经纯化的？

3.如何鉴定得到的蛋白质的分子量？如何区分是单体蛋白或寡聚蛋白？4.凝胶过滤和SDS-凝胶电泳有何不同？?

四、?翻译成中文?

Proteinpurificationpurpose?

ThepurposeofProteinpurificationiseitherpreparativeoranalytical.Preparativepurificationsaimtoproducearelativelylargequantityofpurifiedproteinsforsubsequentuse.Examplesincludethepreparationofcommercialproductssuchasenzymes(e.g.lactase),nutritionalproteins(e.g.soyproteinisolate),andcertainbiopharmaceuticals(e.g.insulin).Analyticalpurificationproducesarelativelysmallamountofaproteinforavarietyofresearchoranalyticalpurposes,includingidentification,quantification,andstudiesoftheprotein'sstructure,post-translationalmodificationsandfunction.Pepsinandureasewerethefirstproteinspurifiedtothepointthattheycouldbecrystallized.Purificationstrategies

Choiceofastartingmaterialiskeytothedesignofapurificationprocess.Inaplantoranimal,aparticularproteinusuallyisn'tdistributedhomogeneouslythroughoutthebody;differentorgansortissueshavehigherorlowerconcentrationsoftheprotein.Useofonlythetissuesororganswiththehighestconcentrationdecreasesthevolumesneededtoproduceagivenamountofpurifiedprotein.Iftheproteinispresentinlowabundance,orifithasahighvalue,scientistsmayuserecombinantDNAtechnologytodevelopcellsthatwillproducelargequantitiesofthedesiredprotein(thisisknownasanexpressionsystem).Recombinantexpressionallowstheproteintobetagged,e.g.byaHis-tag,

tofacilitatepurification,whichmeansthatthepurificationcanbedoneinfewersteps.Inaddition,recombinantexpressionusuallystartswithahigherfractionofthedesiredproteinthanispresentinanaturalsource.

Ananalyticalpurificationgenerallyutilizesthreepropertiestoseparateproteins.First,proteinsmaybepurifiedaccordingtotheirisoelectricpointsbyrunningthemthroughapHgradedgeloranionexchangecolumn.Second,proteinscanbeseparatedaccordingtotheirsizeormolecularweightviasizeexclusionchromatographyorbySDS(sodiumdodecylsulfate-polyacrylamidegelelectrophoresis)analysis.Proteinsareoftenpurifiedbyusing2Dandarethenanalysedbypeptidemassfingerprintingtoestablishtheproteinidentity.Thisisveryusefulforscientificpurposesandthedetectionlimitsforproteinarenowadaysverylowandnanogramamountsofproteinaresufficientfortheiranalysis.Thirdly,proteinsmaybeseparatedbypolarity/hydrophobicityviahighperformanceliquidchromatographyorreversed-phasechromatography.

Usuallyaproteinpurificationprotocolcontainsoneormorechromatographicsteps.Thebasicprocedureinchromatographyistoflowthesolutioncontainingtheproteinthroughacolumnpackedwithvariousmaterials.Differentproteinsinteractdifferentlywiththecolumnmaterial,andcanthusbeseparatedbythetimerequiredtopassthecolumn,ortheconditionsrequiredtoelutetheproteinfromthecolumn.Usuallyproteinsaredetectedastheyarecomingoffthecolumnbytheirabsorbanceat280nm.

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2023-10-18

一、解释名词

别构效应、别构蛋白、别构剂、协同效应、波尔效应、分子病二、简答问题

血红蛋白正协同效应的两种模型是什么？

镰刀状细胞贫血病(sickle-cellanemia）的分子机制H+、CO2和BPG对血红蛋白结合氧的影响及机制蛋白质进化的四种情形

三、思考题

试比较肌红蛋白和血红蛋白结构和功能的异同。试描述肌肉收缩的分子机制。

以血红蛋白结合氧的机制为例，阐述蛋白质结构与功能的关系?

四、?翻译成中文?

Proteinstructureisthethree-dimensionalarrangementofatomsinaproteinmolecule.Proteinsarepolymers—specificallypolypeptides—formedfromsequencesofaminoacids,themonomersofthepolymer.Asingleaminoacidmonomermayalsobecalledaresidue(chemistry)indicatingarepeatingunitofapolymer.Proteinsformbyaminoacidsundergoingcondensationreactions,inwhichtheaminoacidsloseonewatermoleculeperreactioninordertoattachtooneanotherwithapeptidebond.Byconvention,achainunder30aminoacidsisoftenidentifiedasapeptide,ratherthanaprotein.[1]Tobeabletoperformtheirbiologicalfunction,proteinsfoldintooneormorespecificspatialconformationsdrivenbyanumberofnon-covalentinteractionssuchashydrogenbonding,ionicinteractions,VanderWaalsforces,andhydrophobicpacking.To

understandthefunctionsofproteinsatamolecularlevel,itisoftennecessarytodeterminetheirthree-dimensionalstructure.Thisisthetopicofthescientificfieldofstructuralbiology,whichemploystechniquessuchasX-rayc