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文档简介
基因重组和基因工程
GeneticRecombinationandGeneticEngineering第十四章目录第一节
DNA的重组
DNARecombination
DNA重组接合作用(conjugation)转化作用(transformation)转导作用
(transduction)转座
(transposition)同源重组(homologousrecombination)位点特异的重组(site-specificrecombination)发生在同源序列间的重组称为同源重组(homologousrecombination),又称基本重组。是最基本的DNA重组方式,通过链的断裂和再连接,在两个DNA分子同源序列间进行单链或双链片段的交换。以E.coli的同源重组为例,了解同源重组机制的Holliday模型。一、同源重组(二)转化作用通过自动获取或人为地供给外源DNA,使细胞或培养的受体细胞获得新的遗传表型,称为转化作用(transformation)。
(三)转导作用当病毒从被感染的(供体)细胞释放出来、再次感染另一(供体)细胞时,发生在供体细胞与受体细胞之间的DNA转移及基因重组即为转导作用(transduction)。四、转座重组由插入序列和转座子介导的基因移位或重排称为转座(transposition)。插入序列(insertionsequences,IS)组成:二个分离的反向重复(invertedrepeats,IR)序列特有的正向重复序列一个转座酶(transposase)编码基因
IRTransposaseGeneIR发生形式:保守性转座(conservativetransposition)复制性转座(duplicativetransposition)(一)插入序列转座转座子(transposons)——可从一个染色体位点转移到另一位点的分散重复序列。
转座子组成:反向重复序列转座酶编码基因抗生素抗性等有用的基因IRIRTransposaseGene有用基因(二)转座子转座第二节
重组DNA技术DNARecombinationTechnique相关概念DNA克隆工具酶目的基因基因载体基本原理重组DNA技术与医学的关系本节主要内容一、重组DNA技术相关概念克隆(clone)来自同一始祖的相同副本或拷贝的集合。(一)DNA克隆DNA克隆应用酶学的方法,在体外将各种来源的遗传物质(同源的或异源的、原核的或真核的、天然的或人工的DNA)与载体DNA接合成一具有自我复制能力的DNA分子——复制子(replicon),继而通过转化或转染宿主细胞,筛选出含有目的基因的转化子细胞,再进行扩增提取获得大量同一DNA分子,也称基因克隆或重组DNA(recombinantDNA)。生物技术工程:
基因工程、蛋白质工程、酶工程、细胞工程等目的①分离获得某一感兴趣的基因或DNA②获得感兴趣基因的表达产物(蛋白质)基因工程(geneticengineering)
——实现基因克隆所用的方法及相关的工作称基因工程,又称重组DNA工艺学。(二)工具酶限制性核酸内切酶DNA聚合酶Ⅰ逆转录酶T4DNA连接酶碱性磷酸酶末端转移酶
TaqDNA聚合酶重组DNA技术中常用的工具酶工具酶功能限制性核酸内切酶识别特异序列,切割DNADNA连接酶催化DNA中相邻的5´磷酸基和3´羟基末端之间形成磷酸二酯键,使DNA切口封合或使两个DNA分子或片段连接DNA聚合酶Ⅰ合成双链cDNA分子或片段连接缺口平移制作高比活探针DNA序列分析填补3´末端Klenow片段又名DNA聚合酶I大片段,具有完整DNA聚合酶I的5
3
聚合、35
外切活性,而无53
外切活性。常用于cDNA第二链合成,双链DNA3末端标记等反转录酶合成cDNA替代DNA聚合酶I进行填补,标记或DNA序列分析多聚核苷酸激酶催化多聚核苷酸5´羟基末端磷酸化,或标记探针末端转移酶在3´羟基末端进行同质多聚物加尾碱性磷酸酶切除末端磷酸基限制性核酸内切酶定义限制性核酸内切酶(restrictionendonuclease,RE)是识别DNA的特异序列,并在识别位点或其周围切割双链DNA的一类内切酶。GGATCCCCTAGGGCCTAGGATCCG+BamHⅠ作用与甲基化酶共同构成细菌的限制修饰系统,限制外源DNA,保护自身DNA。分类Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ(基因工程技术中常用Ⅱ型)第一个字母取自产生该酶的细菌属名,用大写;第二、第三个字母是该细菌的种名,用小写;第四个字母代表株;用罗马数字表示发现的先后次序。命名HindⅢ属
系
株序Haemophilusinfluenzaed株流感嗜血杆菌d株的第三种酶Ⅱ类酶识别序列特点——
回文结构(palindrome)
切口:平端切口、粘端切口GGATCCCCTAGGBamHⅠGTCCAGGCCTAGGATCCG+GGATCCCCTAGGHindⅡGTCGACCAGCTGGACCTG+平端切口粘端切口(四)基因载体定义为携带目的基因,实现其无性繁殖或表达有意义的蛋白质所采用的一些DNA分子。常用载体质粒DNA噬菌体DNA病毒DNA克隆载体(cloningvector)为使插入的外源DNA序列被扩增而特意设计的载体称为克隆载体。表达载体(expressionvector)为使插入的外源DNA序列可转录翻译成多肽链而特意设计的载体称为表达载体。载体的选择标准能自主复制;具有两个以上的遗传标记物,便于重组体的筛选和鉴定;有克隆位点(外源DNA插入点),常具有多个单一酶切位点,称为多克隆位点;分子量小,以容纳较大的外源DNA。1.质粒
(plasmid)特点能在宿主细胞内独立自主复制;带有某些遗传信息,会赋予宿主细胞一些遗传性状。λ噬菌体DNA改造系统λgt系列(插入型,适用cDNA克隆)EMBL系列(置换型,适用基因组克隆)2.噬菌体(phage)
M13噬菌体DNA改造系统(含lacZ基因)M13mp系列pUC系列3.粘性质粒(cosmid)酵母人工染色体(yeastartificialchromosome,YAC)细菌人工染色体(bacterialartificialchromosome,BAC)动物病毒DNA改造的载体(如腺病毒,腺病毒相关病毒,逆转录病毒)其他二、重组DNA技术基本原理基本原理目的基因的获取DNA导入受体菌外源基因与载体的连接克隆载体的选择和构建重组体的筛选克隆基因的表达
以质粒为载体的DNA克隆过程目录(一)目的基因的获取1.化学合成法要求:已知目的基因的核苷酸序列或其产物的氨基酸序列。2.基因组DNA文库(genomicDNAlibrary)3.cDNA文库(cDNAlibrary)4.聚合酶链反应(polymerasechainreaction,PCR)(见第22章)(三)外源基因与载体的连接1.粘性末端连接方式:(1)同一限制酶切位点连接(2)不同限制酶切位点连接配伍末端连接非配伍末端连接(二)克隆载体的选择和构建2.平端连接适用于:限制性内切酶切割产生的平端粘端补齐或切平形成的平端目的基因载体限制性内切酶限制性内切酶T4DNA连接酶15ºC重组体载体自连目的基因自连目录受体菌条件安全宿主菌限制酶和重组酶缺陷处于感受态(competent)
导入方式转化(transformation)转染(transfection)感染(infection)(四)重组DNA导入受体菌(五)重组
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